cluster # 8598

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Schistosoma mansoni
cluster # 8598 cluster # 8598 Sequences # 7 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8598#0 length = 629 sequences # 7
consensusID : consensus_8598#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 629
fasta sequence
                              [ATAAAATCAAGAAGTAAACTTTCTTTCATTGTTTTTCTTAAGTAGTTTAAGATGATTTTTTCAATAATGCAATTTACATGATAAAAAGTAAATTAAAATCTTTTGAAAGTATTTCTTAATGGAGCCGAACTAATTTATTGTTTTAATATCCTATCCGAAAAAGAAAATAATTTTAATTTTCTTTAATTGTCATTGTTGTTACGTTTCAGCTAGAAAATGTCATCGGAATTGATAAAAGAAATGAATAATTCTGTTACTTTGCATTGAAACGTTTTT-TGTAAAAGTTGAAAAAAAATTCTTACTTATATGAATTGTGTCTTCAAGGGATTTAGATAACCTACTTAAGTTACCATTGGATACTGACAATGGAATACAGATATGAGTGGTTTTTTGTTTCAATGTTTTACTCGTTATTATAAATACTTGTCTACCTTAGGATGTGTCTAGACTTCACTTGATATGAAATTTAGACATTGTATTATTTGTATTAAATGTTTTGCTAAAACTTCAATGAGTTTTTGGCTGACAGGTACATATCCTGTTTTAGTGGTTGTTAATGATGTAAATAATTTAAG-TTTTGTGTTTCTGTAAAGATTGTCGTGATTATGTTA-GGGATTGNGTGTTAATAT]

[+] EMBL CD088528             [ATAAAATCAAGAAGTAAACTTTCTTTCATTGTTTTTCTTAAGTAGTTTAAGATGATTTTTTCAATAATGCAATTTACATGATAAAAAGTAAATTAAAATCTTTTGGAAGTATTTCTTAATGGAGCCGAACTAATTTATTGTTTTAATATCCTATCCGAAAAAGAAAATAATTTTAATTTTCTTTAATTGTCATTGTTGTTACGTTTCAGCTAGAAAATGTCATCGGAATTGATAAAAGAAATGAATAATTCTGTTACTTTGCATTGAAACGTTTTT TGTAAAAGTTGAAAAAAAATTCTTACTTATATGAATTGTGTCTTCAAGGGATTTAGATAACCTACTTAAGTTACCATTGGATACTGACAATGGAATACAGATATGAGTGGTTTTTTGTTTCAATGTTTTACTCGTTATTATAAATACTTGTCTACCTTAGGATGTGTCTAGACTTCACTTGATATGAAATTTAGACATTGTATTATTTGTATTAAATGTTTTGCTAAAACTTCAATGAGTTTTTGGCTGACAGGTACATATCCTGTTTTAGTGGTTGTTAATGATGTAAATAATTTAAGTTTTTGTGNTTCTGTAAAGATTGTCGTGATTATGTTAGGGGATGGNGGGNTAATA ]
[+] EMBL CD088556             [ATAAAATCAAGAAGTGAACTTTCTTTCATTGTTTTTCTTAAGTAGTTTAAGATGATTTTTTCAATAATGCAATTTACATGATAAAAAGTAAATTAAAATCTTTTGTAAGTATTTCTTAATGGAGCCGAACTAATTTATTGTTTTAATATCCTATCCGAAAAAGAAAATAATTTTAATTTTCTTTAATTGTCATTGTTGTTACGTTTCAGCTAGAAAATGTCATCGGAATTGATAAAAGAAATGAATAATTCTGTTACTTTGCATTGAAACGTTTTT TGTAAAAGTTGAAAAAAAATTCTTACTTATATGAATTGTGTCTTCAAGGGATTTAGATAACCTACTTAAGTTACCATTGGATACTGACAATGGAATACAGATATGAGTGGTTTTTTGTTTCAATGTTTTACTCGTTATTATAAATACTTGTCTACCTTAGGATGTGTCTAGACTTCACTTGATATGAAATTTAGACATTGTATTATTTGTATTAGATGTTTTGCTAAAACTTCAATGAGTTTTTGGCTGACAGGTACATATCCTGTTTTAGTGGTTGTTAATGATGTANATAATTTAAG TTNTGTGTTTCTGTNAAGATTGTCGTGATTATGTTA GGGATTGGGTGTTAATA ]
[+] EMBL CD088559             [ATAAAATCAAGAAGTAAACTTTCTTTCATTGTTTTTCTTAAGTAGTTTAAGATGATTTTTTCAATAATGCAATTTACATGATAAAAAGTAAATTAAAATCTTTTGAAAGTATTTCTTAATGGAGCCGAACTAATTTATTGTTTTAATATCCTATCCGAAAAAGAAAATAATTTTAATTTTCTTTAATTGTCATTGTTGTTACGTTTCAGCTAGAAAATGTCATCGGAATTGATAAAAGAAATGAATAATTCTGTTACTTTGCATTGAAACGTTTTT TGTAAAAGTTGAAAAAAAATTCTTACTTATATGAATTGTGTCTTCAAGGGATTTAGATAACCTACTTAAGTTACCATTGGATACTGACAATGGAATACAGATATGAGTGGTTTTTTGTTTCAATGTTTTACTCGTTATTATAAATACTTGTCTACCTTAGGATGTGTCTAGACTTCACTTGATATGAAATTTAGACATTGTATTATTTGTATTANATGGTNTGCTANAACTTCAATGAGTTNTTGGCTGACAGGT                                                                                                    ]
[+] EMBL CD088496             [ATAAAATCAAGAAGTAAACTTTCTTTCATTGTTTTTCTTAAGTAGTTTAAGATGATTTTTTCAATAATGCAATTTACATGATAAAAAGTAAATTAAAATCTTTTGAAAGTATTTCTTAATGGAGCCGAACTAATTTATTGTTTTAATATCCTATCCGAAAAAGAAAATAATTTTAATTTTCTTTAATTGTCATTGTTGTTACGTTTCAGCTAGAAAATGTCATCGGAATTGATAAAAGAAATGAATAATTCTGTTACTTTGCATTGAAACGTTTTT TGTAAAAGTTGAAAAAAAATTCTTCCTTATATGAATTGTGTCTTCAAGGGATTTAGATAACCTACTTAAGTTACCATTGGATACTGACAATGGAATACAGATATGAGTGGTTTTTTGTTTCAATGTTTTACTCGTTATTATAAATACTTGTCTACCTTAGGATGTGTCTAGACTTCACTTGATATGAAATTTAGACATTGTATTATTTGTATTAAATGTTTTGCTAAAACTTCAATGAGTTTTTGGCTGACAGGTACATATCCTGTTTTAGTGGTTGGTAATGATGTANATAATTTAAG TTTTGTGT                                               ]
[+] EMBL CD088590             [ATAGAATCAAGAAGTAAACTTTCTTTCATTGTTTTTCTTAAGTAGTTTAAGATGATTTTTTCAATAATGCAATTTACATGATAAAAAGTAAATTAAAATCTTTTGAAAGTATTTCTTAATGGAGCCGAACTAATTTATTGTTTTAATATCCTATCCGAAAAAGAAAATAATTTTAATTTTCTTTAATTGTCATTGTTGTTACGTTTCAGCTAGAAAATGTCATCGGAATTGATAAAAGAAATGAATAATTCTGTTACTTTGCATTGAAACGTTTTTGTGTAAAAGTTGAAAAAAAATTCTTctaa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD088503             [ TAAAATCAAGAAGTAAACTTTCTTTCATTGTTTTTCTTAAGTAGTTTAAGATGATTTTTTCAATAATGCAATNTACATGATAAAAAGTAAATTANAATCTTTTGAAAGTATTTCTTAATGGAGCCGAACTAATTTATTGTTTTAATATCCTATCCGAAAAAGAAAATAATTTTAATTTTCTTTAATTGTCATTGTTGTTACGTTTCAGCTAGAAAATGTCATCGGAATTGATAAAAGAAATGAATAATTCTGTTACTTTGCATTGAAACGTTTTT TGTAAAAGTTGAAAAAAAATTCTTACTTATATGAATTGTGTCTTCAAGGGATTTAGATAACCTACTTAAGTTACCATTGGATACTGACAATGGAATACAGATATGAGTGGTTTTTTGTTTCAATGTTTTACTCGTTATTATAAATACTTGTCTACCTTAGGATGTGTCTAGACTTCACTTGATATGAAATTTAGACATTGTATTATTTGTATTAAATGTTTTGCTAAAACTTCAATGAGTTTTTGGCTGACAGGTACATATCCTGTTTTAGTGGTTGTTAATGATGTAAATAATTTAAG TTTTGTGTTTCTGTAAAGATTGTCGTGATTATGTTA GGGATTGTGTGTTAATgt]
[+] EMBL CD152494             [                                                                                                                                                                       TAATTTTAATTTTCTTTAATTGTCATTGTTGTTACGTTTCAGCTAGAAAATGTCATCGGAATTGATAAAAGAAATGAATAATTCTGTTACTTTGCATTGAAACGTTTTT TGTAAAAGTTGAAAAAAAATTCTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]




>consensus_8598#0
ATAAAATCAAGAAGTAAACTTTCTTTCATTGTTTTTCTTAAGTAGTTTAAGATGATTTTT
TCAATAATGCAATTTACATGATAAAAAGTAAATTAAAATCTTTTGAAAGTATTTCTTAAT
GGAGCCGAACTAATTTATTGTTTTAATATCCTATCCGAAAAAGAAAATAATTTTAATTTT
CTTTAATTGTCATTGTTGTTACGTTTCAGCTAGAAAATGTCATCGGAATTGATAAAAGAA
ATGAATAATTCTGTTACTTTGCATTGAAACGTTTTTTGTAAAAGTTGAAAAAAAATTCTT
ACTTATATGAATTGTGTCTTCAAGGGATTTAGATAACCTACTTAAGTTACCATTGGATAC
TGACAATGGAATACAGATATGAGTGGTTTTTTGTTTCAATGTTTTACTCGTTATTATAAA
TACTTGTCTACCTTAGGATGTGTCTAGACTTCACTTGATATGAAATTTAGACATTGTATT
ATTTGTATTAAATGTTTTGCTAAAACTTCAATGAGTTTTTGGCTGACAGGTACATATCCT
GTTTTAGTGGTTGTTAATGATGTAAATAATTTAAGTTTTGTGTTTCTGTAAAGATTGTCG
TGATTATGTTAGGGATTGNGTGTTAATAT
clustalw multiple alignements is not computed in this case