cluster # 8604

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8604 cluster # 8604 Sequences # 7 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8604#0 length = 989 sequences # 7
consensusID : consensus_8604#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 989
fasta sequence
                              [GTTAAATAAGCTA-TAATGGTGAAACTAAATGGTGGCTGGGCACCACAATGGGTTGTACTGGACCA-AAATCTTTAATTTCAGTCCGAAGTAACCTTACTTTTCTTGACCTGACTGTACAACAAATCGAGAGACTAAACAATGAATACGGAACTAATATTCCCTTGGTTCTGATGAATTCCTTCAATACACATACTGAAACTGAAAAGGTTTTACGCAAATATCAGCAAGTTAATGTTCAAATTTTGACATTTTTACAAAGCTGCTATCCTCGTCTGAATCGAGAGTCATTACTTCCTATTGCTAAATGTGCTGGTCAAGAAAGTCATGACTCTGGAACAAAGACTTCTAAAGATATGAACTATAATCCTGAAGAATGGTATCCTCCTGGACATGGTGATTTCTATCGTAGTTTTGTTGCTTGTGGATTAGCTGAGAAAATGATAGCTATTGGTAAACAATGGGTTTTCATGTCAAATATTGATAATCTTGGGGCAACTGTTGATCTAAATATTCTAAATTTTTTGATGAATAAAGAATTTCATTGTGGCAAACAATCCCCAGAGTTTGTTATGGAAGTAACTGATAAAACACGAGCTGATGTTAAAGGTGGCACATTAACACAATATCGTGGACATCTAAGACTTTTAGAATTAGCTCAGGTCCCTGAAGAACATGTTGATGATTTCGCTAGTGTACGAACATTTAAGATATTTAATACTAATAATCTTTGGATTGATTTACAAGCTTTGCATCGTAGTGTTAAACAAAAAACTCTACAAATGGAAATCATAGTCAATCCTAAAACTTTAGATTCCGGTACGAATATATTACAATTGGAAGAGGCTGCAGGGGCTGCTATCAAGTCATTTAATGGTGCTTTCGGTGTTAATGTTCCACGAAGTCGTTTCCTACCAGTTAAAACTACTTCAGATTTATTGTTAGTAATGTCTAATTTATATGTATTAGATNGGTGGAAGTTTATCATTGTC]

[+] EMBL CD167552             [GTTAAATAAGCTAGTAATGGTGAAACTAAATGGTGGCTGGGCACCACAATGGGTTGTACTGGACCA AAATCTTTAATTTCAGTCCGAAGTAACCTTACTTTTCTTGACCTGACTGTACAACAAATCGAGAGACTAAACAATGAATACGGAACTAATATTCCCTTGGTTCTGATGAATTCCTTCAATACACATACTGAAACTGAAAAGGTTTTACGCAAATATCAGCAAGTTAATGTTCAAATTTTGACATTTTTACAAAGCTGCTATCCTCGTCTGAATCGAGAGTCATTACTTCCTATTGCTAAATGTGCTGGTCAAGAAAGTCATGACTCTGGAACAAAGACTTCTAAAGATATGAACTATAATCCTGAAGAATGGTATCCTCCTGGACATGGTGATTTCTATCGTAGTTTTGTTGCTTGTGGATTAGCTGAGAAAATGATAGCTATTGGTAAACAATGGGTTTTCATGTCAAATATTGATAATCTTGGGGCAACTGTTGATCTAAATATTCTAAATTTTTTGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD167545             [   AAATAAGCTA TAATGGTGAAACTAAATGGTGGCTGGGCACCACAATGGGTTGTACTGGACCA AAATCTTTAATTTCAGTCCGAAGTAAACTTACTTTTCTTGACCTGACTGTACAACAAATCGAGAGACTAAACAATGAATACGGAACTAATATTCCCTTGGTTCTGATGAATTCCTTCAATACACATACTGAAACTGAAAAGGTTTTACGCAAATATCAGCAAGTTAATGTTCAAATTTTGACATTTTTACAAAGCTGCTATCCTCGTCTGAATCGAGAGTCATTACTTCCTATTGCTAAATGTGCTGGTCAAGAAAGTCATGACTCTGGAACAAAGACTTCTAAAGATATGAACTATAATCCTGAAGAATGGTATCCTCCTGGACATGGTGATTTCTATCGTAGTTTTGTTGCTTGTGGATTAGCTGAGAAAATGATAGCTATTGGTAAACAATGGGTTTTCATGTCAAATATTGATAATCTTGGGGCAACTGTTGATCTAAATATTCTAAATTTTTTGATGAATAAAGAATTTCATTGTGGCAAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD188955             [                                                ATGGGTTGTACCGGACCA AAATCTTTAATTTCAGTCCGAAGTAACCTTACTTTTCTTGACCTGACTGTACAACAAATCGAGAGACTAAACAATGAATACGGAACTAATATTCCCTTGGTTCTGATGAATTCCTTCAATACACATACTGAAACTGAAAAGGTTTTACGCAAATATCAGCAAGTTAATGTTCAAATTTTGACATTTTTACAGAGCTGCTATCCTCGTCTGAATCGAGAGTCATTACTTCCTATTGCTAAATGTGCTGGTCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD065856             [                                                      TGTACCGGACCACAAATCTTTAATTTCAGTCCGAAATAACCTTACTTTTCTTGACCTGACTGTACAACAAATCGAGAGACTAAACAATGAATACGGAACTAATATTCCCTTGGTTCTGATGAATTCCTTCAATACACATACTGAAACTGAAAAGGTTTTACGCAGATATCAGCAAGTTAATGTTCAAATTTTGACATTTTTACAAAGCTGCTATCCTCGTCTGAATCGAGAGTCATTACTTCCTATTGCTAAATGTGCTGGTCAAGACAGTCATGACTCTGGAACAAAGACTTCTAAAGATATGAACTATAATCCTGAAGAATGGTATCCTCCTGGACATGGTGATTTCTATCGTAGTTTTGTTGCTTGTGGATTAGCTGAGAAAATGATAGCTATTGGTAAACAATGGGTTTTCATGTCAAATATTGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD080618             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATAATCCTGAAGAATGGTATCCTCCTGGACATGGTGATTTCTATCGTAGTTTTGTTGCTTGTGGATTAGCTGAGAAAATGATAGCTATTGGTAAACAATGGGTTTTCATGTCAAATATTGATAATCTTGGGGCAACTGTTGATCTAAATATTCTAAATTTTTTGATGAATAAAGAATTTCATTGTGGCAAACAATCCCCAGAGTTTGTTATGGAAGTAACTGATAAAACACGAGCTGATGTTAAAGGTGGCACATTAACACAATATCGTGGACATCTAAGACTTTTAGAATTAGCTCAGGTCCCTGAAGAACATGTTGATGATTTCGCTAGTGTACGAACATTTAAGATATTTAATACTAATAATCTTTGGATTGATTTACAAGCTTTGCATCGTAGTGTTAAACAAAAAACTCTACAAATGGAAATCATAGTCAATCCTAAAACTTTAGATTCCGGTACGAATATATTACAATTGGAAGAGGCTGCAGGGGCTGCTATCAAGTCATTTAATGGTGCTTTCGGTGTTAATGTTCCACGAAGTCGTTTCCTACCAGTTAAAACTACTTCAGATTTATTGTTAGTAATGTCTAATTTATATGTATTAGATNGGTGGAAGTTTATCATTGTC]
[+] EMBL CD192211             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGGTAAACAATGGGTTTTCATGTCAAATATTGATAATCTTGGGGCAACTGTTGATCTAAATATTCTAAATTTTTTGATGAATAAAGAATTTCATTGTGGCAAACAATCCCCATAGTTTGTTATGGAAGTAACTGATAAAACACGAGCTGATGTTAAAGGTGGCACATTAACACAATATCGTGGACATCTAAGACTTTTAGAATTAGCTCAGGTCCCTGAAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD077997             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TGATTTACAAGCTTTGCATCGTAGTGTTAAACAAAAAACTCTACAAATGGAAATCATAGTCAATCCTAAAACTTTAGATTCCGGTACGAATATATTACAATTGGAAGAGGCTGCAGGGGCTGCTATCAAGTCATTTAATGGTGCTTTCGGTGTTAATGTTCCACGAAGTCGTTTCCTACCAGTTAAAACTACTTCAGATTTATTGTTAGTAATGTCTAATTTATATGTATTAGAT GGTGGGAGTTTATCAT    ]




>consensus_8604#0
GTTAAATAAGCTATAATGGTGAAACTAAATGGTGGCTGGGCACCACAATGGGTTGTACTG
GACCAAAATCTTTAATTTCAGTCCGAAGTAACCTTACTTTTCTTGACCTGACTGTACAAC
AAATCGAGAGACTAAACAATGAATACGGAACTAATATTCCCTTGGTTCTGATGAATTCCT
TCAATACACATACTGAAACTGAAAAGGTTTTACGCAAATATCAGCAAGTTAATGTTCAAA
TTTTGACATTTTTACAAAGCTGCTATCCTCGTCTGAATCGAGAGTCATTACTTCCTATTG
CTAAATGTGCTGGTCAAGAAAGTCATGACTCTGGAACAAAGACTTCTAAAGATATGAACT
ATAATCCTGAAGAATGGTATCCTCCTGGACATGGTGATTTCTATCGTAGTTTTGTTGCTT
GTGGATTAGCTGAGAAAATGATAGCTATTGGTAAACAATGGGTTTTCATGTCAAATATTG
ATAATCTTGGGGCAACTGTTGATCTAAATATTCTAAATTTTTTGATGAATAAAGAATTTC
ATTGTGGCAAACAATCCCCAGAGTTTGTTATGGAAGTAACTGATAAAACACGAGCTGATG
TTAAAGGTGGCACATTAACACAATATCGTGGACATCTAAGACTTTTAGAATTAGCTCAGG
TCCCTGAAGAACATGTTGATGATTTCGCTAGTGTACGAACATTTAAGATATTTAATACTA
ATAATCTTTGGATTGATTTACAAGCTTTGCATCGTAGTGTTAAACAAAAAACTCTACAAA
TGGAAATCATAGTCAATCCTAAAACTTTAGATTCCGGTACGAATATATTACAATTGGAAG
AGGCTGCAGGGGCTGCTATCAAGTCATTTAATGGTGCTTTCGGTGTTAATGTTCCACGAA
GTCGTTTCCTACCAGTTAAAACTACTTCAGATTTATTGTTAGTAATGTCTAATTTATATG
TATTAGATNGGTGGAAGTTTATCATTGTC
clustalw multiple alignements is not computed in this case