These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8608#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 542 fasta sequence [GCACATTAGAGTTTTATCGAAGTTTAGAAGATGAAATAACTCCTGCTGGTTTAGCATTTTTTCAGTCAGTCTGGGATGAAAGTGTGCGATCTTATTTTCGCTATAAACTTGACTCACCAGAACCAGTCTTTGAAATTCAATTCCCAGATGCTCGTTTGCCACCTCAACAGAAATTTCCAGTCGCTGATACATGGAATAAACCTCGTCGCCACCCTCAGGGTATTCCTTTGATAAGAGAAAGATATGGTGTGCACAGTGATGTATCTTTTGATGTATACTTGGATCGTTATCGAGATCGTAAAGAATTATACGAGGAGATAATTCACGAACGA-TTAGCAAATGAAGGTAATCCTCTTGATCCAGAAGAACCTCGTCGTAAAATATATGAATATCCAGCTGCTGTTCCGATTCCTCCAAAAATGCCTAGTTGGTGGGTCAAACAGGAAATGCAGCGT-CGCCTACGTCGTGGTAGGTGGAGAGAATTGAATGGACATGACGGTTAATTATCAGTTAATCACAAATAACTAGCTTCAGTTTAAGCC] [+] EMBL CD138504 [GCACATTAGAGTTTTATCGAAGTTTAGAAGATGAAATAACTCCTGCTGGTTTAGCATTTTTTCAGTCAGTCTGGGATGAAAGTGTGCGATCTTATTTTCGCTATAAACTTGACTCACCAGAACCAGTCTTTGAAATTCAATTCCCAGATGCTCGTTTGCCACCTCAACAGAAATTTCCAGTCGCTGATACATGGAATAAACCTCGTCGCCACCCTCAGGGTATTCCTTTGATAAGAGAAAGATATGGTGTGCACAGTGATGTATCTTTTGATGTATACTTGGATCGTTATCGAGATCGTAAAGAATTATACGAGGAGATAATTCACGAACGATTTAGC AATGAAGGTAAT ] [+] EMBL CD122007 [ CAGTCTTTGAAATTCAATTCCCAGATGCTCGTTTGCCACCTCAACAGAAATTTCCAGTCGCTGATACATGGAATAAACCTCGTCGCCACCCTCAGGGTATTCCTTTGATAAGAGAAAGATATGGTGTGCACAGTGATGTATCTTTTGATGTATACTTGGATCGTTATCGAGATCGTAAAGAATTATACGAGGAGATAATTCACGAACGA TTAGCAAATGAAGGTAATCCTCTTGATCCAGAAGAACCTCGTCGTAAAATATATGAATATCCAGCTGCTGTTCCGATTCCTCCAAAAATGCCTAGTTGGTGGGTCAAACAGGAAATGCAGCGTCCGCCTACGTCGTGGTACGTGGAGAGAATTGAATGGACATGACGGTTAATTATCAGTTAATCACAAATAACTAGCTTCAGTTTAAGCC] [+] EMBL CD122023 [ CAGTCTTTGAAATTCAATTCCCAGATGCTCGTTTGCCACCTCAACAGAAATTTCCAGTCGCTGATACATGGAATAAACCTCGTCGCCACCCTCAGGGTATTCCTTTGATAAGAGAAAGATATGGTGTGCACAGTGATGTATCTTTTGATGTATACTTGGATCGTTATCGAGATCGTAAAGAATTATACGAGGAGATAATTCACGAACGA TTAGCAAATGAAGGTAATCCTCTTGATCCAGAAGAACCTCGTCGTAAAATATATGAATATCCAGCTGCTGTTCCGATTCCTCCAAAAATGCCTAGTTGGTGGGTCAAACAGGAAATGCAGCGT CGCCTACGCCGTGGTAGGTGGAGAGAATTGAATGGACATGACGGTTAATTATCAGTTAATCACAAATAACTAGCTTCAGTTTAc ] [+] EMBL CD122011 [ CAGTCTTTGAAATTCAATTCCCAGATGCTCGTTTGCCACCTCAACAGAAATTTCCAGTCGCTGATACATGGAATAAACCTCGTCGCCACCCTCAGGGTATTCCTTTGATAAGAGAAAGATATGGTGTGCACAGTGATGTATCTTTTGATGTATACTTGGATCGTTATCGAGATCGTAAAGAATTATACGAGGAGATAATTCACGAACGA TTAGCAAATGAAGGTAATCCTCTTGATCCAGAAGAACCTCGTCGTAAAATATATGAATATCCAGCTGCTGTTCCGATTCCTCCAAAAATGCCTAGTTGGTGGGTCAAACAGGAAATGCAGCGT CGCCTACGTCGTGGTAGGTGGAGAGAATTGAATGGACATGACGGTTAATTATCAGTTAATCACAAATAACTAGCTTCAGTTTAA ] [+] EMBL CD122013 [ CAGTCTTTGAAATTCAATTCCCAGATGCTCGTTTGCCACCTCAACAGAAATTTCCAGTCGCTGATACATGGAATAAACCTCGTCGCCACCCTCAGGGTATTCCTTTGATAAGAGAAAGATATGGTGTGCACAGTGATGTATCTTTTGATGTATACTTGGATCGTTATCGAGATCGTAAAGAATTATACGAGGAGATAATTCACGAACGA TTAGCAAATGAAGGTAATCCTCTTGATCCAGAAGAACCTCGTCGTAAAATATATGAATATCCAGCTGCTGTTCCGATTCCTCCAAAAATGCCTAGTTGGTGGGTCAAACAGGAAATGCAGCGT CGCCTACGTCGTGGTAGGTGGAGAGAATTGAATGGACATGACGGTTAATTATCAGTTAATCACAAATAACTAGCTTCAGTTTAA ] [+] EMBL CD122055 [ CAGTCTTTGAAATTCAATTCCCAGATGCTCGTTTGCCACCTCAACAGAAATTTCCAGTCGCTGATACATGGAATAAACCTCGTCGCCACCCTCAGGGTATTCCTTTGATAAGAGAAAGATATGGTGTGCACAGTGATGTATCTTTTGATGTATACTTGGATCGTTATCGAGATCGTAAAGAATTATACGAGGAGATAATTCACGAACGA TTAGCAAATGAAGGTAATCCTCTTGATCCAGAAGAACCTCGTCGTAAAATATATGAATATCCAGCTGCTGTTCCGATTCCTCCAAAAATGCCTAGTTGGTGGGTCAAACAGGAAATGCAGCGT CGCCTACGTCGTGGTAGGTGGAGAGAATTGAATGGACATGACGGTTAATTATCAGTTAATCACAAATAACTAGCTTCAGTTTAA ] [-] EMBL CD121903 [ AGTCTTTGAAATTCAATTCCCAGATGCTCGTTTGCCACCTCAACAGAAATTTCCAGTCGCTGATACATGGAATAAACCTCGTCGCCACCCTCAGGGTATTCCTTTGATAAGAGAAAGATATGGTGTGCACAGTGATGTATCTTTTGATGTATACTTGGATCGTTATCGAGATCGTAAAGAATTATACGAGGAGATAATTCACGAACGA TTAGCAAATGAAGGTAATCCTCTTGATCCAGAAGAACCTCGTCGTAAAATATATGAATATCCAGCTGCTGTTCCGATTCCTCCAAAAATGCCTAGTTGGTGGGTCAAACAGGAAATGCAGCGT CGCCTACGTCGTGGTAGGTGGAGAGAATTGAATGGACATGACGGTTAATTATCAGTTAATCACAAATAACTAGCTTCAGTTTAAG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||