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Schistosoma mansoni
cluster # 8608 cluster # 8608       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8608#0 length = 542 sequences # 7  

consensusID : consensus_8608#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 542
fasta sequence
                              [GCACATTAGAGTTTTATCGAAGTTTAGAAGATGAAATAACTCCTGCTGGTTTAGCATTTTTTCAGTCAGTCTGGGATGAAAGTGTGCGATCTTATTTTCGCTATAAACTTGACTCACCAGAACCAGTCTTTGAAATTCAATTCCCAGATGCTCGTTTGCCACCTCAACAGAAATTTCCAGTCGCTGATACATGGAATAAACCTCGTCGCCACCCTCAGGGTATTCCTTTGATAAGAGAAAGATATGGTGTGCACAGTGATGTATCTTTTGATGTATACTTGGATCGTTATCGAGATCGTAAAGAATTATACGAGGAGATAATTCACGAACGA-TTAGCAAATGAAGGTAATCCTCTTGATCCAGAAGAACCTCGTCGTAAAATATATGAATATCCAGCTGCTGTTCCGATTCCTCCAAAAATGCCTAGTTGGTGGGTCAAACAGGAAATGCAGCGT-CGCCTACGTCGTGGTAGGTGGAGAGAATTGAATGGACATGACGGTTAATTATCAGTTAATCACAAATAACTAGCTTCAGTTTAAGCC]

[+] EMBL CD138504             [GCACATTAGAGTTTTATCGAAGTTTAGAAGATGAAATAACTCCTGCTGGTTTAGCATTTTTTCAGTCAGTCTGGGATGAAAGTGTGCGATCTTATTTTCGCTATAAACTTGACTCACCAGAACCAGTCTTTGAAATTCAATTCCCAGATGCTCGTTTGCCACCTCAACAGAAATTTCCAGTCGCTGATACATGGAATAAACCTCGTCGCCACCCTCAGGGTATTCCTTTGATAAGAGAAAGATATGGTGTGCACAGTGATGTATCTTTTGATGTATACTTGGATCGTTATCGAGATCGTAAAGAATTATACGAGGAGATAATTCACGAACGATTTAGC AATGAAGGTAAT                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD122007             [                                                                                                                           CAGTCTTTGAAATTCAATTCCCAGATGCTCGTTTGCCACCTCAACAGAAATTTCCAGTCGCTGATACATGGAATAAACCTCGTCGCCACCCTCAGGGTATTCCTTTGATAAGAGAAAGATATGGTGTGCACAGTGATGTATCTTTTGATGTATACTTGGATCGTTATCGAGATCGTAAAGAATTATACGAGGAGATAATTCACGAACGA TTAGCAAATGAAGGTAATCCTCTTGATCCAGAAGAACCTCGTCGTAAAATATATGAATATCCAGCTGCTGTTCCGATTCCTCCAAAAATGCCTAGTTGGTGGGTCAAACAGGAAATGCAGCGTCCGCCTACGTCGTGGTACGTGGAGAGAATTGAATGGACATGACGGTTAATTATCAGTTAATCACAAATAACTAGCTTCAGTTTAAGCC]
[+] EMBL CD122023             [                                                                                                                           CAGTCTTTGAAATTCAATTCCCAGATGCTCGTTTGCCACCTCAACAGAAATTTCCAGTCGCTGATACATGGAATAAACCTCGTCGCCACCCTCAGGGTATTCCTTTGATAAGAGAAAGATATGGTGTGCACAGTGATGTATCTTTTGATGTATACTTGGATCGTTATCGAGATCGTAAAGAATTATACGAGGAGATAATTCACGAACGA TTAGCAAATGAAGGTAATCCTCTTGATCCAGAAGAACCTCGTCGTAAAATATATGAATATCCAGCTGCTGTTCCGATTCCTCCAAAAATGCCTAGTTGGTGGGTCAAACAGGAAATGCAGCGT CGCCTACGCCGTGGTAGGTGGAGAGAATTGAATGGACATGACGGTTAATTATCAGTTAATCACAAATAACTAGCTTCAGTTTAc   ]
[+] EMBL CD122011             [                                                                                                                           CAGTCTTTGAAATTCAATTCCCAGATGCTCGTTTGCCACCTCAACAGAAATTTCCAGTCGCTGATACATGGAATAAACCTCGTCGCCACCCTCAGGGTATTCCTTTGATAAGAGAAAGATATGGTGTGCACAGTGATGTATCTTTTGATGTATACTTGGATCGTTATCGAGATCGTAAAGAATTATACGAGGAGATAATTCACGAACGA TTAGCAAATGAAGGTAATCCTCTTGATCCAGAAGAACCTCGTCGTAAAATATATGAATATCCAGCTGCTGTTCCGATTCCTCCAAAAATGCCTAGTTGGTGGGTCAAACAGGAAATGCAGCGT CGCCTACGTCGTGGTAGGTGGAGAGAATTGAATGGACATGACGGTTAATTATCAGTTAATCACAAATAACTAGCTTCAGTTTAA   ]
[+] EMBL CD122013             [                                                                                                                           CAGTCTTTGAAATTCAATTCCCAGATGCTCGTTTGCCACCTCAACAGAAATTTCCAGTCGCTGATACATGGAATAAACCTCGTCGCCACCCTCAGGGTATTCCTTTGATAAGAGAAAGATATGGTGTGCACAGTGATGTATCTTTTGATGTATACTTGGATCGTTATCGAGATCGTAAAGAATTATACGAGGAGATAATTCACGAACGA TTAGCAAATGAAGGTAATCCTCTTGATCCAGAAGAACCTCGTCGTAAAATATATGAATATCCAGCTGCTGTTCCGATTCCTCCAAAAATGCCTAGTTGGTGGGTCAAACAGGAAATGCAGCGT CGCCTACGTCGTGGTAGGTGGAGAGAATTGAATGGACATGACGGTTAATTATCAGTTAATCACAAATAACTAGCTTCAGTTTAA   ]
[+] EMBL CD122055             [                                                                                                                           CAGTCTTTGAAATTCAATTCCCAGATGCTCGTTTGCCACCTCAACAGAAATTTCCAGTCGCTGATACATGGAATAAACCTCGTCGCCACCCTCAGGGTATTCCTTTGATAAGAGAAAGATATGGTGTGCACAGTGATGTATCTTTTGATGTATACTTGGATCGTTATCGAGATCGTAAAGAATTATACGAGGAGATAATTCACGAACGA TTAGCAAATGAAGGTAATCCTCTTGATCCAGAAGAACCTCGTCGTAAAATATATGAATATCCAGCTGCTGTTCCGATTCCTCCAAAAATGCCTAGTTGGTGGGTCAAACAGGAAATGCAGCGT CGCCTACGTCGTGGTAGGTGGAGAGAATTGAATGGACATGACGGTTAATTATCAGTTAATCACAAATAACTAGCTTCAGTTTAA   ]
[-] EMBL CD121903             [                                                                                                                            AGTCTTTGAAATTCAATTCCCAGATGCTCGTTTGCCACCTCAACAGAAATTTCCAGTCGCTGATACATGGAATAAACCTCGTCGCCACCCTCAGGGTATTCCTTTGATAAGAGAAAGATATGGTGTGCACAGTGATGTATCTTTTGATGTATACTTGGATCGTTATCGAGATCGTAAAGAATTATACGAGGAGATAATTCACGAACGA TTAGCAAATGAAGGTAATCCTCTTGATCCAGAAGAACCTCGTCGTAAAATATATGAATATCCAGCTGCTGTTCCGATTCCTCCAAAAATGCCTAGTTGGTGGGTCAAACAGGAAATGCAGCGT CGCCTACGTCGTGGTAGGTGGAGAGAATTGAATGGACATGACGGTTAATTATCAGTTAATCACAAATAACTAGCTTCAGTTTAAG  ]


>consensus_8608#0 GCACATTAGAGTTTTATCGAAGTTTAGAAGATGAAATAACTCCTGCTGGTTTAGCATTTT TTCAGTCAGTCTGGGATGAAAGTGTGCGATCTTATTTTCGCTATAAACTTGACTCACCAG AACCAGTCTTTGAAATTCAATTCCCAGATGCTCGTTTGCCACCTCAACAGAAATTTCCAG TCGCTGATACATGGAATAAACCTCGTCGCCACCCTCAGGGTATTCCTTTGATAAGAGAAA GATATGGTGTGCACAGTGATGTATCTTTTGATGTATACTTGGATCGTTATCGAGATCGTA AAGAATTATACGAGGAGATAATTCACGAACGATTAGCAAATGAAGGTAATCCTCTTGATC CAGAAGAACCTCGTCGTAAAATATATGAATATCCAGCTGCTGTTCCGATTCCTCCAAAAA TGCCTAGTTGGTGGGTCAAACAGGAAATGCAGCGTCGCCTACGTCGTGGTAGGTGGAGAG AATTGAATGGACATGACGGTTAATTATCAGTTAATCACAAATAACTAGCTTCAGTTTAAG CC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)