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Schistosoma mansoni
cluster # 8612 cluster # 8612       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8612#0 length = 680 sequences # 7  

consensusID : consensus_8612#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 680
fasta sequence
                              [GCGGGAACATGTGATTTGATACCATGATGGATGTATTGGGTTTCAAAGTAGTGAAATCCACCTTATGATTAAACTTCTTCGTTTTGTTCTGTGGCTATCACCGTCGTCCACAGATCAAATATTTCCTAACTCAACAGGGTCCTCATATTACAT-GTCTT-CGAAG-CTGGTACC-TGGAAAGAACAAATCCGGATTGCAAGACTATTTTATTTTGCTATTTCTACTGATTTAAAACTTCGGTTTTTTAATGTTGAGGAATCGTGTGTGCTTAGCTGCTATCGGAGTTATTCCGTTAATTTTAATCACATTTTTCCTTGTCTTCGATGTGTGCGGTGAACACTGTCACAATGACGTCTTTTTGGAGGCTAAACTTGGTAAACCCTCTTATGCTAGATGGGTGAATACGTCAATTACTTTAATCTGCTCTGGAAAAGGATATACGAGTGTTATGTGGTATTCTGTGCGGAAGGTTTACAAAATGGCTATTGGATGTCTTAAAAACGAACATAGGCAGTTACAGTTAGATTGGTTTCCTAATGTTCCTGAAATAATTGCTACTTACGTTTCATATGAAAAGCGAATTCGTCAAGTGTGTATATTTTCTTTATCAAATGGAATTCTATCTTCCGGGGTTTCAGTAGAAGAACTAAATGATCAATCAGTTGATATGATGCTGACTACGA]

[+] EMBL CD123977             [GCGGGAACATGTGATTTGATACCATGATGGATGTATTGGGTTTCAAGGTAGTGAAATCCACCTTATGATTAAACTTCTTCGTTTTGTTCTGTGGCTATCACCGTCGTCCACAGATCAAATATTTCCTAACTCAACAGGGTCCTCATATTACAT GTCTT CGAAG CTGGTACC TGGAAAGAACAAATCCGGATTGCAAGACTATTTTATTTTGCTATTTCTACTGATTTAAAACTTCGGTTTTTTAATGTTGAGGAATCGTGTGTGCTTAGCTGCTATCGGAGTTATTCCGTTAATTTTAATCACATTTTTCCTTGTCTTCGATGTGTGCGGTGAACACTGTCACAATGACGTCTTTTTGGAGGCTAAACTTGGTAAACCCTCTTATGCTAGATGGGTGAATACGTCAATTACTTTAATCTGCTCTGGAAAAGGATATACGGGTGCTATGTGGTATTCTGTGCCGGAGGTTTACAA                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD124002             [GCGGGAACATGTGACCTGATACCATGATGGATGCATTGGGATTCAAAGTAGTGAAACTCACCTCATGATTAAACTTCTTCACTTAGGTCTGAGGCTATCACCGTCGTTCACGGATCAAATATTTGCTAACTCAACAGGGTCCTCATATTACATAGTCTTCCCAAGCCTGGAACCTTGGAAAGAGCAAATCCGGATTGCAAGACTATTTTATTTTGCTATTTCTACTGATTTAAAACTTCGGTTTTTTAATGTTGAGGAATCGTGTGTGCTTATCTGCTATCGGAGTTATTCCGTTAATTTTAATCACATTTTTCCTTGTCTTCGATGTGTGCGGTGAACACTGTCACAATGACGTGTTTTTGGAGGCTAAACTTGGTAAACCCTCTTATGCTAGATGGGTGAATACGTCAATTACTTTAATCTGCTCTGGTAAAGGATATACTAGTGTTATGTGGTATTCTGTGCGTACTGCTTACATAATGGCTATTGAATGTC                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD123995             [GCGGGAACATGTGATTTGATACCATGATGGATGTATTGGGTTTCAAAGTAGTGAAATCCACCTCATGATTAAACTTCTTCGTTTTGTTCTGTGGCTATCACCGTCGTCCACAGATCAAATATTTCCTAACTCAACAGGGTCCTCATATTACAT GTCTT CGAAG CTGGTACC TGGAAAGAACAAATCCGGATTGCAAGACTATTTTATTTTGCTATTTCTACTGATTTAAAACTTCGGTTTTTTAATGTTGAGGAATCGTGTGTGCTTAGCTGCTATCGGAGTTATTCCGTTAATTTTAATCACATTTTTCCTTGTCTTCGATGTGTGCGGTGAACACTGTCACAATGACGTCTTTTTGGAGGCTAAACTTGGTAAACCCTCTTATGCTAGATGGGTGAATACGTCAATTACTTTAATCTGCTCTGGAAAAGGATATACGAGTGTTATGTGGTATTCTGTGCGGAAGGTTTACAAAATGGCTATTGGATGTC                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD153964             [                                     GGGTTTCAAAGTAGTGAAATCCACCTTATGATTAAACTTCTTCGTTTTGTTCTGTGGCTATCACCGTCGTCCACAGATCAAATATTTCCTAACTCAACAGGGTCCTCATATTACAT GTCTT CGAAG CTGGTACC TGGAAAGAACAAATCCGGATTGCAAGACTATTTTATTTTGCTATTTCTACTGATTTAAAACTTCGGTTTTTTAATGTTGAGGAATCGTGTGTGCTTAGCTGCTATCGGAGTTATTCCGTTAATTTTAATCACATTTTTCCTTGTCTTCGATGTGTGCGGTGAACACTGTCACAATGACGTCTTTTTGGAGGCTAAACTTGGTAAACCCTCTTATGCTAGATGGGTGAATACGTCAATTACTTTAATCTGCTCTGGAAAAGGATATACGAGTGTTATGTGGTATTCTGTGCGGAAGGTTTACAAAATGGCTATTGGATGTCTTANAAACGAACATAGGCAGTTACAGTTAGATTGGTTTCCTAATGTTCCTGAAATAATTGCTACTTACGTTTCATATGAAAAGCGAATTCGTCAAGTGTGTATATTTTCTTTAT                                                                           ]
[+] EMBL CD165559             [                                                                                                                       TATTTCCTAACTCAACAGGGTCCTCATATTACAT GTCTT CGAAG CTGGTACC TGGAAAGAACAAATCCGGATTGCAAGACTATTTTATTTTGCTATTTCTACTGATTTAAAACTTCGGTTTTTTAATGTTGAGGAATCGTGTGTGCTTAGCTGCTATCGGAGTTATTCCGTTAATTTTAATCACATTTTTCCTTGTCTTCGATGTGTGCGGTGAACACTGTCACAATGACGTCTTTTTGGAGGCTAAACTTGGTAAACCCTCTTATGCTAGATGGGTGAATACGTCAATTACTTTAATCTGCTCTGGAAAAGGATATACGAGTGTTATGTGGTATTCTGTGCGGAAGGTTTACAAAATGGCTATCGGATGTCTTAAAAACGAACATAGGCAGTTACAGTTAGATTGGTTTCCTAATGTTCCTGAACTAATTGCTACTTACGTTTCATATGACAAGCGAATTCGTCAAGTG                                                                                           ]
[+] EMBL CD094116             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTGCGGTGAACACTGTCACAATGACGTCTTTTTGGAGGCTAAACTTGGTAAACCCTCTTATGCTAGATGGGTGAATACGTCAATTACTTTAATCTGCTCTGGAAAAGGATATACGAGTGTTATGTGGTATTCTGTGCGGAAGGTTTACAAAATGGCTATTGGATGTCTTAAAAACGAACATAGGCAGTTACAGTTAGATTGGTTTCCTAATGTTCCTGAAATAATTGCTACTTACGTTTCATATGAAAAGCGAATTCGTCAAGTGTGTATATTTTCTTTATCAAATGGAATTCTATCTTCCGGGGTTTCAGTAGAAGAACTAAATGATCAATCAGTTGATATGATGCTGACTACGA]
[-] EMBL CD195519             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTTTTGGAGGCTAAACTTGGTAAACCCTCTTATGCTAGATGGGTGAATACGTCAATTACTTTAATCTGCTCTGGAAAAGGATATACGAGTGTTATGTGGTATTCTGTGCGGAAGGTTTACAAAATGGCTATTGGATGTCTTAAAAACGAACATAGGCAGTTACAGTTAGATTGGTTTCCTAATGTTCCTGAAATAATTGCTACTTACGTTTCATATGAAAAGCGAATTCGTCAAGTGTGTATATTTTCTTTATCAAATGGAATTCTATCTTCCGGGGTTTCAGTAGAAGAACTAAATGATCAATCAGT                    ]


>consensus_8612#0 GCGGGAACATGTGATTTGATACCATGATGGATGTATTGGGTTTCAAAGTAGTGAAATCCA CCTTATGATTAAACTTCTTCGTTTTGTTCTGTGGCTATCACCGTCGTCCACAGATCAAAT ATTTCCTAACTCAACAGGGTCCTCATATTACATGTCTTCGAAGCTGGTACCTGGAAAGAA CAAATCCGGATTGCAAGACTATTTTATTTTGCTATTTCTACTGATTTAAAACTTCGGTTT TTTAATGTTGAGGAATCGTGTGTGCTTAGCTGCTATCGGAGTTATTCCGTTAATTTTAAT CACATTTTTCCTTGTCTTCGATGTGTGCGGTGAACACTGTCACAATGACGTCTTTTTGGA GGCTAAACTTGGTAAACCCTCTTATGCTAGATGGGTGAATACGTCAATTACTTTAATCTG CTCTGGAAAAGGATATACGAGTGTTATGTGGTATTCTGTGCGGAAGGTTTACAAAATGGC TATTGGATGTCTTAAAAACGAACATAGGCAGTTACAGTTAGATTGGTTTCCTAATGTTCC TGAAATAATTGCTACTTACGTTTCATATGAAAAGCGAATTCGTCAAGTGTGTATATTTTC TTTATCAAATGGAATTCTATCTTCCGGGGTTTCAGTAGAAGAACTAAATGATCAATCAGT TGATATGATGCTGACTACGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)