Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8615 cluster # 8615       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8615#0 length = 1530 sequences # 7  

consensusID : consensus_8615#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1530
fasta sequence
                              [AGCGAGATGTTTGGTTGTCAACTGCACCAACTGAACCACTTACTCATTGGTATCAGGTGCGTTGTCTTTTGGGAACACCATTATTTGTTCAAGAAGGTCAGTCACTTAATGGACGTGTTGCTATGCATGCTAATTCTAGACAATCCTATGATGTTCAAATCGAATTGATAGTTCCTGGGAGTGAAACAAAGATTGTGAATAGTTTAGATTTGAAAAATCCACACTTTCGATATAATGGATATCCTCCAGCACCACCGCCTGGTTCACATGTTCGTTCACCGACGGAAACATATTATGCTAACCTGTGCGCACAACAGCAACAACAACAACAAATGGAGATGCAACCACAAACTATGGTCAATAATGGTAATCCTATATCATTAGCTGCAGCGGCGGCTGCGGTTGTTGGTGGCGTTGGTATGCCTAATAACAATAGTGGACAAATAAATTATCGAAATAGTCCTGTTTATACAATGAATCAAGCGACTGGATTTCTTGCTGCCACTGGTTCAATTCCAAATATTGTTCAAACAATCCCTTTAGCAGTTGCCAACGATAATCTATTACAAAATCAATCACATTCTATGCAATTATCTCCTCAACCAGTTAATCAATCTTCACTAGAATTCGGTCGTTTTATAACGTCAAATAATTCTCAGATTGCTTCTTCAATGCTTAGATCAGTAAACATTCCTTCAGCTACTCCCGTTATTGAACCTTTGACAAATGTTTCTGGTAGTGGAATTCCTACAAATGAGTCTGTGTACTACAACCCTGTTATTAGTTCGAATTTCGGAGACTCCTGTTTCGCGATGAATAATGTGGTTAATCCTAGCAAAAACTGGAATTCAGGAATACATCAGGAGTAATTCGGACCTCTTTATTACCGTTATAGTCGGCGGTTATGATTCTATATATGTAAGGATTAATTATTATATAATCGTTCGTTGTGTGTACACAGTAAAACAACATCTTTTTTAATATCTATCTATATATAAACCTTTTGCATTTTCGTAAAGTATTCTAATGTTTTGATGGGAATTGTGTTTTTTTTTTTATTGTGCATCTATTTATCATATTCCAATCTTATGTGTTCTATGTAAAAGTAAAAATAAGGACAGTTATATTGTTTACGCTTCTATCTTATTCACTCTA-CATATATACGCACTCAAACTGATTCACGCACAGTCAGTCATTATAGGTAACATATTCTCATTGTTCTTTATCATCATTCACACTAAATTATCTATGAAATTCTTGGTGAAACAATTGTGAAAGGATAATGATTACAAGAAACGAGGCCGAAAAAAAACACTTTCTTATTTCACTCTTCATCTTTATGTGCGCGGTCAATCAAGATGATCACCTCTGTTTATCAACTGTATTGTTGTGTTTGTGTATATTTGCACAGATCGGAATGACAGGTGAATTCAATGAATACTCAATCTTAACATGAGTGCTGCCTATAAGAATAAAAGAAGTTCTTGTTAACTATGAATTAATGGAGCTTGTCTGTTTTTTCTTCTTGTG]

[-] EMBL CD155363             [AGCGAGATGTTTGGTTGTCAACTGCACCAACTGAACCACTTACTCATTGGTATCAGGTGCGTTGTCTTTTGGGAACACCATTATTTGTTCAAGAAGGTCAGTCACTTAATGGACGTGTTGCTATGCATGCTAATTCTAGACAATCCTATGATGTTCAAATCGAATTGATAGTTCCTGGGAGTGAAACAAAGATTGTGAATAGTTTAGATTTGAAAAATCCACACTTTCGATATAATGGATATCCTCCAGCACCACCGCCTGGTTCACATGTTCGTTCACCGACGGAAACATATTATGCTAACCTGTGCGCACAACAGCAACAACAACAACAAATGGAGATGCAACCACAAACTATGGTCAATAATGGTAATCCTATATCATTAGCTGCAGCGGCGGCTGCGGTTGTTGGTGGCGTTGGTATGCCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD124757             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aCAACAACAACAACAAATGGAGATGCAACCACAAACTATGGTCAATAATGGTAATCCTATATCATTAGCTGCAGCGGCGGCTGCGGTTGTTGGTGGCGTTGGTATGCCTAATAACAATAGTGGACAAATAAATTATCGAAATAGTCCTGTTTATACAATGAATCAAGCGACTGGATTTCTTGCTGCCACTGGTTCAATTCCAAATATTGTTCAAACAATCCCTTTAGCAGTTGCCAACGATAATCTATTACAAAATCAATCACATTCTATGCAATTATCTCCTCAACCAGTTAATCAATCTTCACTAGAATTCGGTCGTTTTATAACGTCAAATAATTCTCAGATTGCTTCTTCAATGCTTAGATCAGTAAACATTCCTTCAGCTACTCCCGTTATTGAACCTTTGACAAATGTTTCTGGTAGTGGAATTCCTACAAATGAGTCTGTGTACTACAACCCTGTTATTAGTTCGAATTTCGGAGACTCCTATTTCGCGATGAATAATGTGGTTAATCCTAGCAAAAACTGGAATTCAGGAATACATCAGGAGTAATTCGGACCTCTTTATTACCGTTATAGTCGGCGGTTATGATTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD066343             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGGTCAATAATGGTAATCCTATATCATTAGCTCCAGCGGCGTCTACGGTTGTTGGTGGCGTTGGTATGCCTAATAACAATAGTGGACAAATAAATTATCt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD139765             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TATGCAATTATCTCCTACACCAGGTAATCAATCTTCACTAGAATGCGGCCGGTTTATAACGGCAAATAATCATCAGATTGCTTCTTCAACGCTTAGATCAGTAAACATTCCTTCAGCTACTCCCGTTATTGAACCTTTGACAAATGTTTCTGGTAGTGGAATTCCTACAAATGAGTCTGTGTACTACAACCCTGTTATTAGTTCGAATTTCGGAAACTCCTGTTTCACGATGAATAATGTGGTTAATCCTAGCAAAAACTGGga                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD124587             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TAATCAATCTTCACTAGAATTCGGTCGTTTTATAACGTCAAATAATTCTCAGATTGCTTCTTCAATGCTTAGATCAGTAAACATTCCTTCAGCTACTCCCGTTATTGAACCTTTGACAAATGTTTCTGGTAGTGGAATTCCTACAAATGAGTCTGTGTACTACAACCCTGTTATTAGTTCGAATTTCGGAGACTCCTGTTTCGCGATGAATAATGTGGTTAATCCTAGCAAAAACTGGAATTCAGGAATACATCAGGAGTAATTCGGACCTCTTTATTACCGTTATAGTCGGCGGTTATGATTCTATATATGTAAGGATTAATTATTATATAATCGTTCGTTGTGTGTACACAGTAAAACAACATCTTTTTTAATATCTATCTATATATAAACCTTTTGCATTTTCGTAAAGTATTCTAATGTTTTGATGGGAATTGTGTTTTTTTTTTTATTGTGCATCTATTTATCATATTCCAATCTTATGTGTTCTATGTAAAAGTAAAAATAAGGACAGTTATATTGTTTACGCTTCTATCTTATTCACTCTA CATATATACGCACTCAAACTGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD087709             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tctgcccgcAAGGATTAATTATTATATAATCGTTCGTTGTGTGTACACAGTAAAACAACATCTTTTTTAATATCTATCTATATATAAACCTTTTGCATTTTCGTAAAGTATTCTAATGTTTTGATGGGAATTGTG TTTTTTTTTTATTGTGCATCTATTTATCATATTCCAATCTTATGTGTTCTATGTAAAAGTAAAAATAAGGACAGTTATATTGTTTACGCTTCTATCTTATTCACTTTACCATATATACGCACTCAAACTGATTCACGCACAGTCAGTCATTATAGGTAACATATTCTCATTGTTCTTTATCATCATTCACACTAAATTATCTATGAAATTCTTGGTGAAACAATTGTGAAAGGATAATGATTACAAGAAACGAGGCCGAAAAAAAACACTTTCTTATTTCACTCTTCAT                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD139809             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ctCTAAATTATCTATGAAATTCTTGGTGAAACAATTGTGAAAGGATAATGATTACAAGAAACGAGGCCGAAAAAAAACACTTTCTTATTTCACTCTTAATCTTTATGTGCGCGGTCAATCAAGATGATCACCTCTGTTTATCAACTGTATTGTTGTGTTTGTGTATATTTGCACAGATCGGAATGACAGGTGAATTCAATGAATACTCAATCTTAACATGAGTGCTGCCTATAAGAATAAAAGAAGTTCTTGTTAACTATGAATTAATGGAGCTTGTCTGTTTTTTCTTCTTGTG]


>consensus_8615#0 AGCGAGATGTTTGGTTGTCAACTGCACCAACTGAACCACTTACTCATTGGTATCAGGTGC GTTGTCTTTTGGGAACACCATTATTTGTTCAAGAAGGTCAGTCACTTAATGGACGTGTTG CTATGCATGCTAATTCTAGACAATCCTATGATGTTCAAATCGAATTGATAGTTCCTGGGA GTGAAACAAAGATTGTGAATAGTTTAGATTTGAAAAATCCACACTTTCGATATAATGGAT ATCCTCCAGCACCACCGCCTGGTTCACATGTTCGTTCACCGACGGAAACATATTATGCTA ACCTGTGCGCACAACAGCAACAACAACAACAAATGGAGATGCAACCACAAACTATGGTCA ATAATGGTAATCCTATATCATTAGCTGCAGCGGCGGCTGCGGTTGTTGGTGGCGTTGGTA TGCCTAATAACAATAGTGGACAAATAAATTATCGAAATAGTCCTGTTTATACAATGAATC AAGCGACTGGATTTCTTGCTGCCACTGGTTCAATTCCAAATATTGTTCAAACAATCCCTT TAGCAGTTGCCAACGATAATCTATTACAAAATCAATCACATTCTATGCAATTATCTCCTC AACCAGTTAATCAATCTTCACTAGAATTCGGTCGTTTTATAACGTCAAATAATTCTCAGA TTGCTTCTTCAATGCTTAGATCAGTAAACATTCCTTCAGCTACTCCCGTTATTGAACCTT TGACAAATGTTTCTGGTAGTGGAATTCCTACAAATGAGTCTGTGTACTACAACCCTGTTA TTAGTTCGAATTTCGGAGACTCCTGTTTCGCGATGAATAATGTGGTTAATCCTAGCAAAA ACTGGAATTCAGGAATACATCAGGAGTAATTCGGACCTCTTTATTACCGTTATAGTCGGC GGTTATGATTCTATATATGTAAGGATTAATTATTATATAATCGTTCGTTGTGTGTACACA GTAAAACAACATCTTTTTTAATATCTATCTATATATAAACCTTTTGCATTTTCGTAAAGT ATTCTAATGTTTTGATGGGAATTGTGTTTTTTTTTTTATTGTGCATCTATTTATCATATT CCAATCTTATGTGTTCTATGTAAAAGTAAAAATAAGGACAGTTATATTGTTTACGCTTCT ATCTTATTCACTCTACATATATACGCACTCAAACTGATTCACGCACAGTCAGTCATTATA GGTAACATATTCTCATTGTTCTTTATCATCATTCACACTAAATTATCTATGAAATTCTTG GTGAAACAATTGTGAAAGGATAATGATTACAAGAAACGAGGCCGAAAAAAAACACTTTCT TATTTCACTCTTCATCTTTATGTGCGCGGTCAATCAAGATGATCACCTCTGTTTATCAAC TGTATTGTTGTGTTTGTGTATATTTGCACAGATCGGAATGACAGGTGAATTCAATGAATA CTCAATCTTAACATGAGTGCTGCCTATAAGAATAAAAGAAGTTCTTGTTAACTATGAATT AATGGAGCTTGTCTGTTTTTTCTTCTTGTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)