These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8615#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1530 fasta sequence [AGCGAGATGTTTGGTTGTCAACTGCACCAACTGAACCACTTACTCATTGGTATCAGGTGCGTTGTCTTTTGGGAACACCATTATTTGTTCAAGAAGGTCAGTCACTTAATGGACGTGTTGCTATGCATGCTAATTCTAGACAATCCTATGATGTTCAAATCGAATTGATAGTTCCTGGGAGTGAAACAAAGATTGTGAATAGTTTAGATTTGAAAAATCCACACTTTCGATATAATGGATATCCTCCAGCACCACCGCCTGGTTCACATGTTCGTTCACCGACGGAAACATATTATGCTAACCTGTGCGCACAACAGCAACAACAACAACAAATGGAGATGCAACCACAAACTATGGTCAATAATGGTAATCCTATATCATTAGCTGCAGCGGCGGCTGCGGTTGTTGGTGGCGTTGGTATGCCTAATAACAATAGTGGACAAATAAATTATCGAAATAGTCCTGTTTATACAATGAATCAAGCGACTGGATTTCTTGCTGCCACTGGTTCAATTCCAAATATTGTTCAAACAATCCCTTTAGCAGTTGCCAACGATAATCTATTACAAAATCAATCACATTCTATGCAATTATCTCCTCAACCAGTTAATCAATCTTCACTAGAATTCGGTCGTTTTATAACGTCAAATAATTCTCAGATTGCTTCTTCAATGCTTAGATCAGTAAACATTCCTTCAGCTACTCCCGTTATTGAACCTTTGACAAATGTTTCTGGTAGTGGAATTCCTACAAATGAGTCTGTGTACTACAACCCTGTTATTAGTTCGAATTTCGGAGACTCCTGTTTCGCGATGAATAATGTGGTTAATCCTAGCAAAAACTGGAATTCAGGAATACATCAGGAGTAATTCGGACCTCTTTATTACCGTTATAGTCGGCGGTTATGATTCTATATATGTAAGGATTAATTATTATATAATCGTTCGTTGTGTGTACACAGTAAAACAACATCTTTTTTAATATCTATCTATATATAAACCTTTTGCATTTTCGTAAAGTATTCTAATGTTTTGATGGGAATTGTGTTTTTTTTTTTATTGTGCATCTATTTATCATATTCCAATCTTATGTGTTCTATGTAAAAGTAAAAATAAGGACAGTTATATTGTTTACGCTTCTATCTTATTCACTCTA-CATATATACGCACTCAAACTGATTCACGCACAGTCAGTCATTATAGGTAACATATTCTCATTGTTCTTTATCATCATTCACACTAAATTATCTATGAAATTCTTGGTGAAACAATTGTGAAAGGATAATGATTACAAGAAACGAGGCCGAAAAAAAACACTTTCTTATTTCACTCTTCATCTTTATGTGCGCGGTCAATCAAGATGATCACCTCTGTTTATCAACTGTATTGTTGTGTTTGTGTATATTTGCACAGATCGGAATGACAGGTGAATTCAATGAATACTCAATCTTAACATGAGTGCTGCCTATAAGAATAAAAGAAGTTCTTGTTAACTATGAATTAATGGAGCTTGTCTGTTTTTTCTTCTTGTG] [-] EMBL CD155363 [AGCGAGATGTTTGGTTGTCAACTGCACCAACTGAACCACTTACTCATTGGTATCAGGTGCGTTGTCTTTTGGGAACACCATTATTTGTTCAAGAAGGTCAGTCACTTAATGGACGTGTTGCTATGCATGCTAATTCTAGACAATCCTATGATGTTCAAATCGAATTGATAGTTCCTGGGAGTGAAACAAAGATTGTGAATAGTTTAGATTTGAAAAATCCACACTTTCGATATAATGGATATCCTCCAGCACCACCGCCTGGTTCACATGTTCGTTCACCGACGGAAACATATTATGCTAACCTGTGCGCACAACAGCAACAACAACAACAAATGGAGATGCAACCACAAACTATGGTCAATAATGGTAATCCTATATCATTAGCTGCAGCGGCGGCTGCGGTTGTTGGTGGCGTTGGTATGCCT ] [+] EMBL CD124757 [ aCAACAACAACAACAAATGGAGATGCAACCACAAACTATGGTCAATAATGGTAATCCTATATCATTAGCTGCAGCGGCGGCTGCGGTTGTTGGTGGCGTTGGTATGCCTAATAACAATAGTGGACAAATAAATTATCGAAATAGTCCTGTTTATACAATGAATCAAGCGACTGGATTTCTTGCTGCCACTGGTTCAATTCCAAATATTGTTCAAACAATCCCTTTAGCAGTTGCCAACGATAATCTATTACAAAATCAATCACATTCTATGCAATTATCTCCTCAACCAGTTAATCAATCTTCACTAGAATTCGGTCGTTTTATAACGTCAAATAATTCTCAGATTGCTTCTTCAATGCTTAGATCAGTAAACATTCCTTCAGCTACTCCCGTTATTGAACCTTTGACAAATGTTTCTGGTAGTGGAATTCCTACAAATGAGTCTGTGTACTACAACCCTGTTATTAGTTCGAATTTCGGAGACTCCTATTTCGCGATGAATAATGTGGTTAATCCTAGCAAAAACTGGAATTCAGGAATACATCAGGAGTAATTCGGACCTCTTTATTACCGTTATAGTCGGCGGTTATGATTC ] [-] EMBL CD066343 [ TGGTCAATAATGGTAATCCTATATCATTAGCTCCAGCGGCGTCTACGGTTGTTGGTGGCGTTGGTATGCCTAATAACAATAGTGGACAAATAAATTATCt ] [+] EMBL CD139765 [ TATGCAATTATCTCCTACACCAGGTAATCAATCTTCACTAGAATGCGGCCGGTTTATAACGGCAAATAATCATCAGATTGCTTCTTCAACGCTTAGATCAGTAAACATTCCTTCAGCTACTCCCGTTATTGAACCTTTGACAAATGTTTCTGGTAGTGGAATTCCTACAAATGAGTCTGTGTACTACAACCCTGTTATTAGTTCGAATTTCGGAAACTCCTGTTTCACGATGAATAATGTGGTTAATCCTAGCAAAAACTGGga ] [-] EMBL CD124587 [ TAATCAATCTTCACTAGAATTCGGTCGTTTTATAACGTCAAATAATTCTCAGATTGCTTCTTCAATGCTTAGATCAGTAAACATTCCTTCAGCTACTCCCGTTATTGAACCTTTGACAAATGTTTCTGGTAGTGGAATTCCTACAAATGAGTCTGTGTACTACAACCCTGTTATTAGTTCGAATTTCGGAGACTCCTGTTTCGCGATGAATAATGTGGTTAATCCTAGCAAAAACTGGAATTCAGGAATACATCAGGAGTAATTCGGACCTCTTTATTACCGTTATAGTCGGCGGTTATGATTCTATATATGTAAGGATTAATTATTATATAATCGTTCGTTGTGTGTACACAGTAAAACAACATCTTTTTTAATATCTATCTATATATAAACCTTTTGCATTTTCGTAAAGTATTCTAATGTTTTGATGGGAATTGTGTTTTTTTTTTTATTGTGCATCTATTTATCATATTCCAATCTTATGTGTTCTATGTAAAAGTAAAAATAAGGACAGTTATATTGTTTACGCTTCTATCTTATTCACTCTA CATATATACGCACTCAAACTGAT ] [+] EMBL CD087709 [ tctgcccgcAAGGATTAATTATTATATAATCGTTCGTTGTGTGTACACAGTAAAACAACATCTTTTTTAATATCTATCTATATATAAACCTTTTGCATTTTCGTAAAGTATTCTAATGTTTTGATGGGAATTGTG TTTTTTTTTTATTGTGCATCTATTTATCATATTCCAATCTTATGTGTTCTATGTAAAAGTAAAAATAAGGACAGTTATATTGTTTACGCTTCTATCTTATTCACTTTACCATATATACGCACTCAAACTGATTCACGCACAGTCAGTCATTATAGGTAACATATTCTCATTGTTCTTTATCATCATTCACACTAAATTATCTATGAAATTCTTGGTGAAACAATTGTGAAAGGATAATGATTACAAGAAACGAGGCCGAAAAAAAACACTTTCTTATTTCACTCTTCAT ] [-] EMBL CD139809 [ ctCTAAATTATCTATGAAATTCTTGGTGAAACAATTGTGAAAGGATAATGATTACAAGAAACGAGGCCGAAAAAAAACACTTTCTTATTTCACTCTTAATCTTTATGTGCGCGGTCAATCAAGATGATCACCTCTGTTTATCAACTGTATTGTTGTGTTTGTGTATATTTGCACAGATCGGAATGACAGGTGAATTCAATGAATACTCAATCTTAACATGAGTGCTGCCTATAAGAATAAAAGAAGTTCTTGTTAACTATGAATTAATGGAGCTTGTCTGTTTTTTCTTCTTGTG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||