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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8623#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1280 fasta sequence
[ACAATACGGATAAAATTGTAGCTACAAAAACAAAGGAAGAGATATCTCTCGACAAAAAGTCACCCGACAGTGAAGTAATCCTTAGACACGGTCATGTTAGAACAATTCCTGCTACTGAGTTAGTACAACAACAGTTTATTGGCTCAGGAGCATTTGGAAAAGTTTATCGAGGTCTTTGGCGTGAACAAGATATTGCACTAAAAGTATTTGATCTAGCTACAAATCAGGTAGACAATGAAGCTTTGCATCTGTGCAGATTATCTCATCGGAACATTGTGAGATTTTATGGGATCTGTAGGTTAGACAACTCTAATTCCCCAGCACTTGTAATGGAATATGCTTATGGTGGTTCGCTGAACATGGTTCTCAACCAACGACCTTTATTAGGTCCCCTTGTTTTACTTGACTGGGCATTACAGATCGCTAGTGGAATGGCATATTTACATACAGATGCCAGAATTTGTCATCGAGATTTAAAATCATCTAACATTCTTATCAGAGAAGCTGTTCANAAACCATTTTCTCTAAATGAACTTCANAGGTGTACCCTATTGATAACTGATTTCGGAATGGCTTGTCGTTCTAGTCAACTTGCACCACAACAATCTAAATTAGGCACTGTTGCATATGCAGCTCCAGAAGTTTGTCGTCAAGAGGGATTTTCTTTCAAATCGGATATTTGGTCATATGGTGTTGTGTTATGGGAGTTGCTTACATTAGATATACCATTTCGTGCAATGGAGCAACCTAGATTATTGTTTATTATTGCAATGTATAATTATACTCTGTACGTACCACCAGGTGTTCCAGATCTCTTTGTCCAATTACTTAAAGATTGCTGGTCACCTACTCCTGATAGTAGACCTAAATTTGAAAATATTATGGCTCGACTTAAATCATGCAAAGATTGCAGTTTCGTCGATTTAGAACCTAGTGAATTAGCTCAAATTCAACAGAATTGGCGTGAACTTATAGCAGTCCACTATAAAGAAGAACAACAGACTGTAGCTGAAGCACTATCATCATCGTTCAGAAGTGGAAGTTTAGATTTTTCAACAGAACTTTTAACACAGCTGGAAATGTTACGTGATTATCGCGAATCTCTGGATAGGGTCAGAGCAGATTTAGTGGAAAAAGCCCATCAGCTTCATATAAAAGAAGAATTTGTAT-ATCGAGTGGCTGACACCATGGGTCAACATTTTATGTTTTTGGCTGTACTGGCTGCTAATCATTTTAAAGATCCTACTCATAAAATTCAAACTGCTCAACCTAAACCTCCT]
[+] EMBL CD170629 [ACAATACGGATAAAATTGTAGCTACAAAAACAAAGGAAGAGATATCTCTCGACAAAAAGTCACCCGACAGTGAAGTAATCCTTAGACACGGTCATGTTAGAACAATTCCTGCTACTGAGTTAGTACAACAACAGTTTATTGGCTCAGGAGCATTTGGAAAAGTTTATCGAGGTCTTTGGCGTGAACAAGATATTGCACTAAAAGTATTTGATCTAGCTACAAATCAGGTAGACAATGAAGCTTTGCATCTGTGCAGATTATCTCATCGGAACATTGTGAGATTTTATGGGATCTGTAGGTTAGACAACTCTAATTCCCCAGCACTTGTAATGGAATATGCTTATGGTGGTTCGCTGAACATGGTTCTCAACCAACGACCTTTATTAGGTCCCCTTGTTTTACTTGACTGGGCATTACAGATCGCTAGTGGAATGGCATATTTACATACAGATGCCAGAATTTGTCATCGAGATTTAAAATCATCTAACATTCTTATCAGAGAAGCTGTTCANAAACCATTTTCTCTAAATGAACTTCANAGGTGTACCCTATTGATAACTGATTTCGGAATGGCTTGTCGTTCTAGTCAACTTGCACCACAACAATCTAAATTAGGCACTGTTGCATATGCAGCTCCAGA ]
[+] EMBL CD170577 [ACAATACGGATAAAATTGTAGCTACAAAAACAAAGGAAGAGATATCTCTCGACGAAAAGTCACCCGACAGTGAAGTAATCCTTAGACACGGTCATGTTAGAACAATTCCTGCTACTGAGTTAGTACAACAACAGTTTATTGGCACAGGAGCATTTGGAAAAGTTTATCGAGGTCTTTGGCGTGAACAAGATATCGCACTAAAAGTATTTGATCTAGCTACAAATCAGGTAGACAATGAAGCTTTGCATCTGTGCAGATTATCTCATCGGAACATTGTGAGATTTTATGGGATCTGTAGGTTAGACAACTCTAATTCCCCAGCACTTGTAATGGAATATGCTTATGGTGGTTCGCTGAACATGGTTCTCAACCAACGACCTTTATTAGGTCCCCTTGTTTTACTTGACTGGGCATTACAGATCGCTAGTGGAATGGCATATTTACATACAGATGCCAGAATTTGTCATCGAGATTTAAAATCATCTAACATTCTTATCAGAGAAGCTGTTCAAAAACCATTNTCTCTAAATGAACTTCAAAGGTGTACCCTATTGATAACTGATTTCGGAATGGCTCGTCGNTCTAGCCAACTTGCACCACAACAATCT AATTANGCACTGTTGCATATGCAGCTCCAGA ]
[+] EMBL CD170656 [ACAATACGGATAAAATTGTAGCTACAAAAACAAAGGAAGAGATATCTCTCGACAAAAAGTCACCCGACAGAGAAGTAATCCTTAGACACGGTCATGTTAGAACAATTCCTGTTACTGAGTTAGTACAACAACAGTTTATTGGTTCAGGAGCATTTGGAAAAGTTTATCGAGGCCTTTGGCGTGAACAAGATATTGCACTAAAAGTATTTGATCTAACTACAAATCAGGTAGACAATGAAGCTCTGCATCTGTGCATATTATCTCATCGGAACATTGCGAGA ]
[+] EMBL CD161721 [ ACAACAATCTAAATTAGGCACTGTTGCATATGCAGCTCCAGAAGTTTGTCGTCAAGAGGGATTTTCTTTCAAATCGGATATTTGGTCATATGGTGTTGTGTTATGGGAGTTGCTTACATTAGATATACCATTTCGTGCAATGGAGCAACCTAGATTATTGTTTATTATTGCAATGTATAATTATACTCTGTACGTACCACCAGGTGTTCCAGATCTCTTTGTCCAATTACTTAAAGATTGCTGGTCACCTACTCCTGATAGTAGACCTAAATTTGAAAATATTATGGCTCGACTTAAATCATGCAAAGATTGCAGTTTCGTCGATTTAGAACCTAGTGAATTAGCTCAAATTCAACAGAATTGGCGTGAACTTATAGCAGTCCACTATAAAGAAGAACAACAGACTGTAGCTGAAGCACTATCATCATCGTTCAGAAGTGGAAGTTTAGATTTTTCAACAGAACTTTTAACACAGCTGGAAATGTTACGTGATTATCGCGAATCTCTGGATAGGGTCAGAGCAGATTTAGTGGAAAAAGCCCATCAGCTTCATATAAAAGAAGAATTTGTAT ATCGA ]
[+] EMBL CD181793 [ TATTGTTTATTATTGCAATGTATAATTATACTCTGTACGTACCACCAGGTGTTCCAGATCTCTTTGTCCAATTACTTAAAGATTGCTGGTCACCTACTCCTGATAGTAGACCTAAATTTGAAAATATTATGGCTCGACTTAAATCATGCAAAGATTGCAGTTTCGTCGATTTAGAACCTAGTGAATTAGCTCANATTCAACAGAATTGGCGTGAACTTATAGCAGTCCACTATTAAGAAGAAACACAGACTGTAGCTGAAGCACTATCATCATCGTTCAGAAGTGGAAGTTTAGATTTTTC ACAGAACTTTT ACACAGCTGGAAATG TACGTGA TATCGCGA ]
[+] EMBL CD066546 [ CCAGATCTCTTTGTTCAATTACTTAAAGATTGATGGTCACCTACTCCTGATAGTACACCTAAATTTGAACATATTATGGCTCGACTTAGATCATGCAAAGAT ]
[+] EMBL CD191866 [ CCTAGTGAATTAGCTCAAATTCAACAGAATTGGCGTGAACTTATAGCAGTCCACTATAAAGAAGAACAACAGACTGTAGCTGAAGCACTATCATCATCGTTCAGAAGTGGAAGTTTAGATTGTTCAACAGAACTTTTAACACAGCTGGAAATGTTACGTGATTATCGCGAATCTCTGGATAGGGTCAGAGCAGATTTAGTGGAAAAAGCCCATCAGCTTCATATAAAAGAGGAA TTGTATAATCGAGTGGCTGACACCATGGGTCAACATTTTATGTTTTTGGCTGTACTGGCTGCTAATCATTTTAAAGATCCTACTCATAAAATTCAAACTGCTCAACCTAAACCTCCT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||