These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8624#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 861 fasta sequence [CCTATGCTCCATTGGGAGTAACGGGCGTAAGTAAGTAAGATTTTTATGTTTGGAAAACTATCTTTATGCCCTTCATAATTTTCTCTTGTTAAATATTCATACAATCAACATATAAACGATTCTTATTATTCTTTCACATGTATTACTTTTCATTAATTGATATGACAAAGGAACAGAAAATAAATCGAGCAGCATAATGAATACAGTTGCACCAAATGGGATTCATCATTCTGCGACGATAAGTTCCTGATGAATCTACTTAACAGGATTCTCGAGTTGTTTTGTTAGATACGGGTTCTTCCAATGATTCACAGAATTTTGATGAAATTTCTCACAAAAATAAGAAAAATATGTTAGATGATGGCCAAAAACCTAATGCAATTTTGTTAGATGTTGATTTCCCTAGTGATTCATCATCTACTAATGGGATTCTTAATAAATNTGCTGAGAATGTCTCAGAAGATTCAGACCCTGGTGACTTCAAATCAAATGTCGTTCATCCTCACCATCTAGTCACTTTTAACGGATTCTCTATTCAGTGAGAAAAATATGTTTAAAATAAAGCCATCTATCAGTTCACCTGCTCTTGTGGATCAAGGTACATTGGTCGTAGCCAGCACTCGCTTTCAACTCGGATACGTGAACATGTCGCAGTTTGGTTATACAAGGATGAAAGGAAAGCAGTTAAGAGTTCTATACTTGAACACCTAATCGATTGTAATCATTCTGCGGATCCACAGTTTGATTTTAAGGTTGTTTATATGATTCGTTCAAATCTACTTAGATTTCTTCGTATGCGACTCCTAAAATTAGCCGAAGCTCTTACCATCTATGAGCTCAAACCACAAATATCCGTACAAA] [+] EMBL CD201989 [CCTATGCTCCATTGGGAGTAACGGGCGTAAGTAAGTAAGATTTTTATGTTTGGAAAACTATCTTTATGCCCTTCATAATTTTCTCTTGTTAAATATTCATACAATCAACATATAAACGATTCTTATTATTCTTTCACATGTATTACTTTTCATTAATTGATATGACAAAGGAACAGAAAATAAATCGAGCAGCATAATGAATACAGTTGCACCAAATGGGATTCATCATTCTGCGACGATAAGTTCCTGATGAATCTACTTAACAGGATTCTCGAGTTGTTTTGTTAGATACGGGTTCTTCCAATGATTCACAGAATTTTGATGAAATTTCTCACAAAAATAAGAAAAATATGTTAGATGATGGCCAAAAACCTAATGCAATTTTGTTAGATGTTGATTTCCCTAGTGATTCATCATCTACTAATGGGATTCTTAATAAATNTGCTGAGAATGTCTCAGAAGATTCAGACCCTGGTGACTTCAAATCAAATGTCGTTCATCCTCACCATCTAGTCACTTTTAACGGATCCTCTATTCAGTGAGAAAAATATGTTTAAAATAAAGCCATCTATC ] [-] EMBL CD202040 [ nTATGCTCCATTGGGAGTAACGGGCGTAAGTAAGTAAGATTTTTATGTTTGGAAAACTATCTTTATGCCCTTCATAATTTTCTCTTGTTAAATATTCATACAATCAACATATAAACGATTCTTATTATTCTTTCACATGTATTACTTTTCATTAATTGATATGACAAAGGAACAGAAAATAAATCGAGCAGCATAATGTATACAGTTGCACCAAATGGAATTCATCATTCTGCGACGATAAGTTCCTGATGAATCTACTTAACAGGATTCTCGAGTTGTTTTGCTAGATACGGGTTCTTCCAATGATTCACAGAATTTTGATGAAATTTCTCACAAAAATAAGAAAAATATGTTAGATGATGGTCAAAAACCTAATGCAATTTTGTTAGATGTTGATTTCCCTAGTGATTCATCATCTACTAATGGGATTCTTAATAAATTTGCTGAGAATGTCTCAGAAGATTCAGACCCTGGTGACTTCAAATCAAATGTCGTTCATCCTCACCATCTAGTCACTTTTAACGGATTCTCTATTCAGTGAGAAAAATATGTTTAAAATAAAGCCATCTATCA ] [-] EMBL CD066547 [ CAGAAGATTCAGACCCTGGTGACTTCAAATCAAATGTCGTTCATCCTCACCATCTAGTCACTTTTAACGGATTCTCTATTCAGTGAGAAAAATATGTTTAAAATAAAGCCATCTATCAGTTCACCTGCTCTTGTGGATCAAGGTACATTGGTCGTAGCCAGCACTCGCTTTCAACTCGGATACGTGAACATGTCGCAGTTTGGTTATACAAGGATGAAAGGAAAGCAGTTAAGAGTTCTATACTTGAACACCTAATCGATTGTAATCATTCTGCGGATCCACAGTTTGATTTTAAGGTTGTTTATATGATTCGTTCAAATCTACTTAGATTTCTTCGTATGCGACTCCTAAAATTAGCCGAAGCTCTTACCATCTATGAGCTCAAACCACAAATATCCGTACAAA] [-] EMBL CD066861 [ AGTGAGAAAAATATGTTTAAAATAAAGCCATCTATCAGTTCACCTGCTCTTGTGGATCAAGGTACATTGGTCGTAGCCAGCACTCGCTTTCAACTCGGATACGTGAACATGTCGCAGTTTGGTTATACAAGGATGAAAGGAAAGCAGTTAAGAGTTCTATACTTGAACACCTAATCGATTGTAATCATTCTGCGGATCCACAGTTTGATTTTAAGGTTGTTTATATGATTCGTTCAAATCTACTTAGATTTCTTAGTATGCGACTCCTAAAATTAGCCGAAGCTCTTACCATCTATGAGCTCAAACCACAAATATCCGTACAAA] [+] EMBL CD072607 [ ACATTGGTCGTAGCCAGCACTCGCTTTCAACTCGGATACGTGAACATGTCGCAGTTTGGTTATACAAGGATGAAAGGAAAGCAGTTAAGAGTTCTATACTTGAACACCTAATCGATTGTAATCAT ] [+] EMBL CD072652 [ ACATTGGCCGTAGCCAGCACTCGCTTTCAACTCGGATACGTGAACATGTCGCAGTTTGGTTATACAAGGATGAAAGGAAAGCAGTTAAGAGTTCTATACTTGAACACCTAATCGATTGTAATCAT ] [+] EMBL CD072605 [ ACATTGGTCGTAGCCAGCACTCGCTTTCAACTCGGATACGTGAACATGTCGCAGTTTGGTTATACAAGGATGAAAGGAAAGCAGTTAAGAGTTCTATACTTGAACACCTAATCGATTGTAATCAT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||