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Schistosoma mansoni
cluster # 8624 cluster # 8624       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8624#0 length = 861 sequences # 7  

consensusID : consensus_8624#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 861
fasta sequence
                              [CCTATGCTCCATTGGGAGTAACGGGCGTAAGTAAGTAAGATTTTTATGTTTGGAAAACTATCTTTATGCCCTTCATAATTTTCTCTTGTTAAATATTCATACAATCAACATATAAACGATTCTTATTATTCTTTCACATGTATTACTTTTCATTAATTGATATGACAAAGGAACAGAAAATAAATCGAGCAGCATAATGAATACAGTTGCACCAAATGGGATTCATCATTCTGCGACGATAAGTTCCTGATGAATCTACTTAACAGGATTCTCGAGTTGTTTTGTTAGATACGGGTTCTTCCAATGATTCACAGAATTTTGATGAAATTTCTCACAAAAATAAGAAAAATATGTTAGATGATGGCCAAAAACCTAATGCAATTTTGTTAGATGTTGATTTCCCTAGTGATTCATCATCTACTAATGGGATTCTTAATAAATNTGCTGAGAATGTCTCAGAAGATTCAGACCCTGGTGACTTCAAATCAAATGTCGTTCATCCTCACCATCTAGTCACTTTTAACGGATTCTCTATTCAGTGAGAAAAATATGTTTAAAATAAAGCCATCTATCAGTTCACCTGCTCTTGTGGATCAAGGTACATTGGTCGTAGCCAGCACTCGCTTTCAACTCGGATACGTGAACATGTCGCAGTTTGGTTATACAAGGATGAAAGGAAAGCAGTTAAGAGTTCTATACTTGAACACCTAATCGATTGTAATCATTCTGCGGATCCACAGTTTGATTTTAAGGTTGTTTATATGATTCGTTCAAATCTACTTAGATTTCTTCGTATGCGACTCCTAAAATTAGCCGAAGCTCTTACCATCTATGAGCTCAAACCACAAATATCCGTACAAA]

[+] EMBL CD201989             [CCTATGCTCCATTGGGAGTAACGGGCGTAAGTAAGTAAGATTTTTATGTTTGGAAAACTATCTTTATGCCCTTCATAATTTTCTCTTGTTAAATATTCATACAATCAACATATAAACGATTCTTATTATTCTTTCACATGTATTACTTTTCATTAATTGATATGACAAAGGAACAGAAAATAAATCGAGCAGCATAATGAATACAGTTGCACCAAATGGGATTCATCATTCTGCGACGATAAGTTCCTGATGAATCTACTTAACAGGATTCTCGAGTTGTTTTGTTAGATACGGGTTCTTCCAATGATTCACAGAATTTTGATGAAATTTCTCACAAAAATAAGAAAAATATGTTAGATGATGGCCAAAAACCTAATGCAATTTTGTTAGATGTTGATTTCCCTAGTGATTCATCATCTACTAATGGGATTCTTAATAAATNTGCTGAGAATGTCTCAGAAGATTCAGACCCTGGTGACTTCAAATCAAATGTCGTTCATCCTCACCATCTAGTCACTTTTAACGGATCCTCTATTCAGTGAGAAAAATATGTTTAAAATAAAGCCATCTATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD202040             [ nTATGCTCCATTGGGAGTAACGGGCGTAAGTAAGTAAGATTTTTATGTTTGGAAAACTATCTTTATGCCCTTCATAATTTTCTCTTGTTAAATATTCATACAATCAACATATAAACGATTCTTATTATTCTTTCACATGTATTACTTTTCATTAATTGATATGACAAAGGAACAGAAAATAAATCGAGCAGCATAATGTATACAGTTGCACCAAATGGAATTCATCATTCTGCGACGATAAGTTCCTGATGAATCTACTTAACAGGATTCTCGAGTTGTTTTGCTAGATACGGGTTCTTCCAATGATTCACAGAATTTTGATGAAATTTCTCACAAAAATAAGAAAAATATGTTAGATGATGGTCAAAAACCTAATGCAATTTTGTTAGATGTTGATTTCCCTAGTGATTCATCATCTACTAATGGGATTCTTAATAAATTTGCTGAGAATGTCTCAGAAGATTCAGACCCTGGTGACTTCAAATCAAATGTCGTTCATCCTCACCATCTAGTCACTTTTAACGGATTCTCTATTCAGTGAGAAAAATATGTTTAAAATAAAGCCATCTATCA                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD066547             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CAGAAGATTCAGACCCTGGTGACTTCAAATCAAATGTCGTTCATCCTCACCATCTAGTCACTTTTAACGGATTCTCTATTCAGTGAGAAAAATATGTTTAAAATAAAGCCATCTATCAGTTCACCTGCTCTTGTGGATCAAGGTACATTGGTCGTAGCCAGCACTCGCTTTCAACTCGGATACGTGAACATGTCGCAGTTTGGTTATACAAGGATGAAAGGAAAGCAGTTAAGAGTTCTATACTTGAACACCTAATCGATTGTAATCATTCTGCGGATCCACAGTTTGATTTTAAGGTTGTTTATATGATTCGTTCAAATCTACTTAGATTTCTTCGTATGCGACTCCTAAAATTAGCCGAAGCTCTTACCATCTATGAGCTCAAACCACAAATATCCGTACAAA]
[-] EMBL CD066861             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AGTGAGAAAAATATGTTTAAAATAAAGCCATCTATCAGTTCACCTGCTCTTGTGGATCAAGGTACATTGGTCGTAGCCAGCACTCGCTTTCAACTCGGATACGTGAACATGTCGCAGTTTGGTTATACAAGGATGAAAGGAAAGCAGTTAAGAGTTCTATACTTGAACACCTAATCGATTGTAATCATTCTGCGGATCCACAGTTTGATTTTAAGGTTGTTTATATGATTCGTTCAAATCTACTTAGATTTCTTAGTATGCGACTCCTAAAATTAGCCGAAGCTCTTACCATCTATGAGCTCAAACCACAAATATCCGTACAAA]
[+] EMBL CD072607             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACATTGGTCGTAGCCAGCACTCGCTTTCAACTCGGATACGTGAACATGTCGCAGTTTGGTTATACAAGGATGAAAGGAAAGCAGTTAAGAGTTCTATACTTGAACACCTAATCGATTGTAATCAT                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD072652             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACATTGGCCGTAGCCAGCACTCGCTTTCAACTCGGATACGTGAACATGTCGCAGTTTGGTTATACAAGGATGAAAGGAAAGCAGTTAAGAGTTCTATACTTGAACACCTAATCGATTGTAATCAT                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD072605             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACATTGGTCGTAGCCAGCACTCGCTTTCAACTCGGATACGTGAACATGTCGCAGTTTGGTTATACAAGGATGAAAGGAAAGCAGTTAAGAGTTCTATACTTGAACACCTAATCGATTGTAATCAT                                                                                                                                        ]


>consensus_8624#0 CCTATGCTCCATTGGGAGTAACGGGCGTAAGTAAGTAAGATTTTTATGTTTGGAAAACTA TCTTTATGCCCTTCATAATTTTCTCTTGTTAAATATTCATACAATCAACATATAAACGAT TCTTATTATTCTTTCACATGTATTACTTTTCATTAATTGATATGACAAAGGAACAGAAAA TAAATCGAGCAGCATAATGAATACAGTTGCACCAAATGGGATTCATCATTCTGCGACGAT AAGTTCCTGATGAATCTACTTAACAGGATTCTCGAGTTGTTTTGTTAGATACGGGTTCTT CCAATGATTCACAGAATTTTGATGAAATTTCTCACAAAAATAAGAAAAATATGTTAGATG ATGGCCAAAAACCTAATGCAATTTTGTTAGATGTTGATTTCCCTAGTGATTCATCATCTA CTAATGGGATTCTTAATAAATNTGCTGAGAATGTCTCAGAAGATTCAGACCCTGGTGACT TCAAATCAAATGTCGTTCATCCTCACCATCTAGTCACTTTTAACGGATTCTCTATTCAGT GAGAAAAATATGTTTAAAATAAAGCCATCTATCAGTTCACCTGCTCTTGTGGATCAAGGT ACATTGGTCGTAGCCAGCACTCGCTTTCAACTCGGATACGTGAACATGTCGCAGTTTGGT TATACAAGGATGAAAGGAAAGCAGTTAAGAGTTCTATACTTGAACACCTAATCGATTGTA ATCATTCTGCGGATCCACAGTTTGATTTTAAGGTTGTTTATATGATTCGTTCAAATCTAC TTAGATTTCTTCGTATGCGACTCCTAAAATTAGCCGAAGCTCTTACCATCTATGAGCTCA AACCACAAATATCCGTACAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)