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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8626#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1204 fasta sequence
[GATTTGGACTATGTTAACCAACGAAATGAGTTCATTGTTCGTGCTGATAAAGATCCGTTACTTCAAGAAATAAGGAATAAACTAGACAATTTGGAGGAAAGAATTCGAGATGAATTTAGACGTTGTGCAAAAATACTGAACTTGGAACAGAATAAATCTATCAAGTTGGAAAGCAATGAGTTACATGGATATTTTATGCGTGTCACACTCAAGGATGAAAAATGTTTAAGAGGACTGAAAACATTTGAAATTTTGGACACACAAAAAGGTGGTGTACGTTTTCGTAATAAACAAATGACTTCATTAACTGAAACTTATGCCGAAGTGAAACAAGAATATAATGGATTACAAGAAGTGGTTGTGCATCAAGTTGTCTGTGCCGCAGCTACTTATCTGGAGCCTATTAATCAATTGAATGAAACCACTGCGTTCTTGGATGTTATTGTTAGCCTTGCTATCGCTGCTATCTCATCTTCAGGTGTATCGTATATTCGTCCGAAAATTCTCTCTGAAGATAATGGTCGTATTATTTTAAAAGAAGCACGTCATCCATGTTTGGAAATGCAAGATCGAGTCAGTGTTATTCCAAATGATATACATCTTGAACGTGGTAAACAAATATTTCTAATTATTACTGGTCCGAATATGGGTGGCAAGTCAACTTATATACATAGTGTTGCTGTTATTGTAGCTATGGCTCAAATTGGCAGCTTTGTTCCGTGTTCATATGCAGAAATTATGCCAGTCGATGCTATTATGGCACGTGTTGGTCCGGCTGATTATCAATCCTCGTGATGTATCTACATTTCTAGCAGAAATGCTTGAAACTTCATCTGTTTTACGATCGGTCACACGAAATTCACTTGTCATTATCGATGAATTAGGACGTGGCACATCAACATATGATGGATTTGGACTAGCATGGGCGGTTGCCTCATTTTTAGCTAGTCCTGAAGTTGGTTGTTTCGGTTTATTTGCCACACATTTTCATGAATTAACCAGTTTAGCATATTATATGCCCAAACGTGTAGCTAATCTACGAGTTTTATGCAATGTATCAAACGACAAGGAAATCGTTGAAAATAAAGAATCTGAAACAAAAGTTACTATGTTATATAAAGTTGAGGCTGGCGTATGCAGTCGTAGTTATGGTCTAGACGTTGCTCGTCTTGCAGGGCTACCGATAGAAGTAATTAAACAAGCT]
[-] EMBL CD091279 [GATTTGGACTATGTTAACCAACGAAATGAGTTCATTGTTCGTGCTGATAAAGATCCGTTACTTCAAGAAATAAGGAATAAACTAGACAATTTGGAGGAAAGAATTCGAGATGAATTTAGACGTTGTGCAAAAATACTGAACTTGGAACAGAATAAATCTATCAAGTTGGAAAGCAATGAGTTACATGGATATTTTATGCGTGTCACACTCAAGGATGAAAAATGTTTAAGAGGACTGAAAACATTTGAAATTTTGGACACACAAAAAGGTGGTGTACGTTTTCGTAATAAACAAATGACTTCATTAACTGAAACTTATGCCGAAGTGAAACAAGAATATAATGGATTACAAGAAGTGGTTGTGCATCAAGTTGTCTGTGCCGCAGCTA ]
[-] EMBL CD060227 [ TAAACAAATGACTTCATTAACTGAAACTTATGCCGAAGTGAAACAAGAATATAATGGATTACAAGAAGTGGTTGTGCATCAAGTTGTCTGTGCCGCAGCTACTTATCTGGAGCCTATTAATCAATTGAATGAAACCACTGCGTTCTTGGATGTTATTGTTAGCCTTGCTATCGCTGCTATCTCATCTTCAGGTGTATCGTATATTCGTCCGAAAATTCTCTCTGAAGATAATGGTCGTATTATTTTAAAAGAAGCACGTCATCCATGTTTGGAAATGCAAGATCGAGTCAGTGTTATTCCAAATGATATACATCTTGAACGTGGTAAACAAATATTTCTAATTATTACTGGTCCGAATATGGGTGGCAAGTCAACTTATATACATAGTGTTGCTGTTATTGTAGCTATGGCTCAAATTGGCAGCTTTGTTCCGTGTTCATATGCAGAAATTATGCCAGTCGATGCTATTATGGCACGTGTTGGTCCGGCTGATTATCAATCCTCGTGA ]
[-] EMBL CD060226 [ TTAACTGAAACTTATGCCGAAGTGAAACAAGAATATAATGGATTACAAGAAGTGGTTGTGCATCAAGTTGTCTGTGCCGCAGCTACTTATCTGGAGCCTATTAATCAATTGAATGAAACCACTGCGTTCTTGGATGTTATTGTTAGCCTTGCTATCGCTGCTATCTCATCTTCAGGTGTATCGTATATTCGTCCGAAAATTCTCTCTGAAGATAATGGTCGTATTATTTTAAAAGAAGCACGTCATCCATGTTTGGAAATGCAAGATCGAGTCAGTGTTATTCCAAATGATATACATCTTGAACGTGGTAAACAAATATTTCTAATTATTACTGGTCCGAATATGGGTGGCAAGTCAACTTATATACATAGTGTTGCTGTTATTGTAGCTATGGCTCAAATTGGCAGCTTTGTTCCGTGTTCATATGCAGAAATTATGCCAGTCGATGCTATTATGGCACGTGTTGGTCCGGCTGATGATC ]
[-] EMBL CD182318 [ CTTGGATGTTATTGTTAGCCTTGCTATCGCTGCTATCTCATCTTCAGGTGTATCGTATATTCGTCCGAAAATTCTCTCTGAAGATAATGGTCGTATTATTTTAAAAGAAGCACGTCATCCATGTTTGGAAATGCAAGATCGAGTCAGTGTTATTCCAAATGATATACATCTTGAACGTGGTAAACAAATATTTCTAATTATTACTGGTCCGAATATGGGTGGCAAGTCAACTTATATACATAGTGTTGCTGTTATTGTAGCTATGGCTCAAATTGGCAGCTTTGTTCCGTGTCCATATGCAGAAATTATGCCAGTCGATGCTATTATGG ]
[-] EMBL CD136496 [ TTGGATGTTATTGTTAGCCTTGCTATCGCTGCTATCTCATCTTCAGGTGTATCGTATATTCGTCCGAAAATTCTCTCTGAAGATAATGGTCGTATTATTTTAAAAGAAGCACGTCATCCATGTTTGGAAATGCAAGATCGAGTCAGTGTTATTCCAAATGATATACATCTTGAACGTGGTAAACAAATATTTCTAATTATTACTGGTCCGAATATGGGTGGCAAGTCAACTTATATACATAGTGTTGCTGTTATTGTAGCTATGGCTCAAATTG ]
[-] EMBL CD060225 [ AACAAATATTTCTAATTATTACTGGTCCGAATATGGGTGGCAAGTCAACTTATATACATAGTGTTGCTGTTATTGTAGCTATGGCTCAAATTGGCAGCTTTGTTCCGTGTTCATATGCAGAAATTATGCCAGTCGATGCTATTATGGCACGTGTT GTCCGG TGATga ]
[+] EMBL CD190340 [ ACTTATATACATAGTGTTGCTGTTATTGTAGCTATGGCTCAAATTGGCAGCTTTGTTCCGTGTTCATATGCAGAAATTATGCCAGTCGATGCTATTATGGCACGTGTTGGTGCGGCTGATTATCAAT GTCGTGGTGTATCTACATTTCTAGCAGAAATGCTTGAAACTTCATCTGTTTTACGATCGGTCACACGAAATTCACTTGTCATTATCGATGAATTAGGACGTGGCACATCAACATATGATGGATTTGGACTAGCATGGGCGGTTGCCTCATTTTTAGCTAGTCCTGAAGTTGGTTGTTTCGGTTTATTTGCCACACATTTTCATGAATTAACCAGTTTAGCATATTATATGCCCAAACGTGTAGCTAATCTACGAGTTTTATGCAATGTATCAAACGACAAGGAAATCGTTGAAAATAAAGAATCTGAAACAAAAGTTACTATGTTATATAAAGTTGAGGCTGGCGTATGCAGTCGTAGTTATGGTCTAGACGTTGCTCGTCTTGCAGGGCTACCGATAGAAGTAATTAAACAAGCT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||