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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8633#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1481 fasta sequence
[TGTTTGTCGTTTTTCGAAATAGTACATTCGTCTTATCACATCAGAGATAACTCTCTCGTTCCTCCATACTCAAGTCCTCACTGGGTACCTTATGGATCAACGGTTATTGAGCCTCAGTTTGTACGCCTAACTTCCGATATAAAAAGTAGTCAAGGAGGTATTTTCAATATAAAACCTTTATTTGCTCGTGATTGGGAGGTGGTTATTTTGTTCCATGTTCATAGTCCCAAAACTCTGGTTGGTGATGGATTTGCTTTCTGGTATACTCAACATCCTCCTTCAAGTGGGCCAGCATTCGGTAGTAGAGATAAGTTCCGTGGGTTAGCCGTTTTCTTTGATACTTACGCTAATCAAAATGGTGAGCATAGTCATGAGCATCCTTATGTCAGTGCAATGATTAACGATGGATCTAAAAGCTATG-ATCATGATAAGGATGGAACTCTAA-C-TGAACTATCTGGTTGTTCATCTAATTTTCGTAATAATGACTACTCAATGGCCACAATTCGTTACGCTAATAACCAGTTGAAGGTTTCTTTGAAATATCAAGGTGCTGCAGATCCTGTAGATTGTTTCACAGTTGA-CGGAGTACGTTTACCCACTGGTTATTTTATTGGAGTTTCAGCCGCCACTGGTGACCTTTCAGATAATCACGACATATACTCTATTCATACCTATGAACTGGATGTTGGTCGAAAAGACGATCCGTTCGCTGACTTTTCTAAAATTGAACCATCAGCTGATCAGGAGGCTGCACCAAGAGCTCGAGTTGATGATACTCCACCATCGAGATTCAGCCGCGTAATCACATTATTTTCTTGGTTATTCATATTTGGACTTATTAGTGGCGGTGGATATATGGGCTATAAATACTACAAGAAGCGTCAGAGGCAAATGAAGCGATTCTATTAGTTAACAAATTTCAACTGATTATCACCGATTCCTCTTTAATTCTTTAGGAGAACTAATGGAAAACAATCTATTTTCAATAAACGGGCAGTGTATATTTACGGGTATTAGAAACTGGAGTCGTGACTACATCCTTTGTTTTTTTGAATGTTTATCTACACATTTTTTACAGATGATTTTTGTACTTGTTTTTACTACTGCTGGTCAATTAAAAGTGTTAAATATTTTTATTAACCTTATCAGTATGATGTTAGTATTTTTGTTTACCATGTCGGCCCTGATATTAGTAGTAGTAGATAATAATTTGTTAAACGATACAACGAATTGCAATATTTATTTTTGTTCAGTCCTTCTGGATCCTTATTTTTTAGGCCAGACAAACTACCCTGAAACGTTTTTTGCTGTAAAACTTTTGGTTATTCATATTTTCTTTTGTCGATAATCGTTAAACGTGTAAGAATTCAGTGTACTTTTTTCATTTTGGATATTTTCTTTACAACTATCATAAGATTTTTAATTTTTTTTTTATGGCGGTAAGAAGTTTTACATGATTGTGAAAAATAAATGTATTCATT]
[+] EMBL CD080322 [TGTTTGTCGTTTTTCGAAATAGTACATTCGTCTTATCACATCAGAGATAACTCTCTCGTTCCTCCATACTCAAGTCCTCACTGGGTACCTTATGGATCAACGGTTATTGAGCCTCAGTTTGTACGCCTAACTTCCGATATAAAAAGTAGTCAAGGAGGTATTTTCAATATAAAACCTTTATTTGCTCGTGATTGGGAGGTGGTTATTTTGTTCCATGTTCATAGTCCCAAAACTCTGGTTGGTGATGGATTTGCTTTCTGGTATACTCAACATCCTCCTTCAAGTGGGCCAGCATTCGGTAGTAGAGATAAGTTCCGTGGGTTAGCCGTTTTCTTTGATACTTACGCTAATCAAAATGGTGAGCATAGTCATGAGCATCCTTATGTCAGTGCAATGATTAACGATGGATCTAAAAGCTATG ATCATGATAAGGATGGAACTCTAA C TGAACTATCTGGTTGTTCATCTAATTTTCGTAATAATGACTACTCAATGGCCACAATTCGTTACGCTAATAACCAGTTGAAGGTTTCTTTGAAATATCAAGGTGCTGCAGATCCTGTAGATTGTTTCACAGTTGA CGGAGTACGTTTACCCACTGG ]
[+] EMBL AI976159 [ ACATTCGTCTTATCACATCAGAGATAACTCTCTCGTTCCTCCATACTCAAGTCCTCACTGGGTACCTTATGGATCAACGGTTATTGAGCCTCAGTTTGTACGCCTAACTTCCGATATAAAAAGTAGTCAAGGAGGTATTTTCAATATAAAACCTTTATTTGCTCGTGATTGGGAGGTGGTTATTTTGTTCCATGTTCATAGTCCCAAAACTCTGGTTGGTGATGGATTTGCTTTCTGGTATACTCAACATCCTCCTTCAAGTGGGCCAGCATTCGGTAGTAGAGATAAGTTCCGTGGGTTAGCCGTTTTCTTTGATACTTACGCTAATCAAAATGGTGAGCATAGTCATGAGCATCCTTATGTCAGTGCAATGATTAACGATGGATCTAAAAGCTATG ATCATGATAAGGATGGAACTCTAA C TGAACTATCTGGTTGTTCATCTAATTTTCGTAATAATGACTACTCAATGGC ]
[+] EMBL CD114112 [ cgagtGGTAGTAGAGATAAGTTCCGTGGGTTAGCCGTTTTCTTTGATACTTACGCTAATCAAAATGGTGAGCATAGTCATGAGCATCCTTATGTCAGGGCAATGATTAACGATGGATCTAAAAGCTATGTATCATGATAAGGATGGAACTCTAA C TGAACTATCTGGTTGTCCATCTAATTTTCGTAATAATGACTACTCAATGGCCACAATTCGTTACGCTAATAACCAGTTGAAGGTTTCTTTGAAATATCAAGGTGCTGCAGATCCTGTAGATTGTTTCACAGTTGA CGGAGTACGTTTACCCACTGGTTATTTTATTGGAGTTTCAGCCG ]
[-] EMBL CD190449 [ GTCATGAGCATCCTTATGTCAGTGCAATGATTAACGATGGATCTAAAAGCTATG ATCATGATAAGGATGGAACTCTAA C TGAACTATCTGGTTGTTCATCTAATTTTCGTAATAATGACTACTCAATGGCCACAATTCGTTACGCTAATAACCAGTTGAAGGTTTCTTTGAAATATCAAGGTGCTGCAGATCCTGTAGATTGTTTCACAGTTGA CGGAGTACGTTTACCCACTGGTTATTTTATTGGAGTTTCAGCCGCCACTGGTGACCTTTCAGATAATCACGACATATACTCTATTCATACCTATGAACTGGATGTTGGTCGAAAAGACGATCCGTTCGCTGACTTTTCTAAAATTGAACCATCAGCTGATCAGGAGGCTGCACCAAGAGCTCGAGTTGATGATACTCCACCATCGAGATTCAGCCGCGTAATCACATTATTTTCTTGGTTATTCATATTTGGACTTATTAGTGGCGGTGGATATATGGGCTAT ]
[+] EMBL CD060459 [ TCTAATCGTGAACTATCTGGTTGTTCATCTAATTTTCGTAATAATGACTACTCAATGGCCACAATTCGTTACGCTAATAACCAGTTGAAGGTTTCTTTGAAATATCAAGGTGCTGCAGATCCTGTAGATAGTTTCACAGTTGA CGGAGTACGTTTACCCACTGGTTATTTTATTGGAGTTTCAGCCGCCACTGGTGACCTTTCAGATAATCACGACATATACTCTATTCATACCTATGAACTGGATGTTGGTCGAAAAGACGATCCGTTCGCTGACTCTTCTAAAATTGAACCATCAGCTGATCAGGAGGCTGTACCAAGAGCTCGAGTTGATGATACTCCACCATCGAGATTCAGCCGCGTAATCACATTATTTTCTTGGTTATTCATATTTGGACTTATTAGTGGCGGTGGATATGTGGGCTATAAATACTACAAGAAGCGTCAGAGGCAAATGAAGCGATTCTATTAGTTAACAAATTTCAACTGATTATCACCGATTCGTCTTTAA ]
[+] EMBL CD063763 [ aagTGACCGGAGTACGTTTACCCACTGGTTATTTTATTGGAGTTTCAGCCGCCACTGGTGACCTTTCAGATAATCACGACATATACTCTATTCATACCTATGAACTGGATGTTGGTCGAAAAGACGATCCGTTCGCTGACTTTTCTAAAATTGAACCATCAGCTGATCAGGAGGCTGCACCAAGAGCTCGAGTTGATGATACTCCACCATCGAGATTCAGCCGCGTAATCACGTTATTTTCTTGGTTATTCATATTTGGACTTATTAGTGGCGGTGGATATATGGGCTATAAATACTACAGGAAGCGTCAGAGGCAAATGAAGCGATTCTATTAGTTAACAAATTTCAACTGATTATCACCGATTCCTCTTTAATTCTTTAGGAGAACTAATGGAAAACAATCTATTTTCAATAAACGGGCAGTGT ]
[-] EMBL CD074242 [ CAAATTTCAACTGATTATCACCGATTCCTCTTTAATTCTTTAGGAGAACTAATGGAAAACAATCTATTTTCAATAAACGGGCAGTGTATATTTACGGGTATTAGAAACTGGAGTCGTGACTACATCCTTTGTTTTTTTGAATGTTTATCTACACATTTTTTACAGATGATTTTTGTACTTGTTTTTACTACTGCTGGTCAATTAAAAGTGTTAAATATTTTTATTAACCTTATCAGTATGATGTTAGTATTTTTGTTTACCATGTCGGCCCTGATATTAGTAGTAGTAGATAATAATTTGTTAAACGATACAACGAATTGCAATATTTATTTTTGTTCAGTCCTTCTGGATCCTTATTTTTTAGGCCAGACAAACTACCCTGAAACGTTTTTTGCTGTAAAACTTTTGGTTATTCATATTTTCTTTTGTCGATAATCGTTAAACGTGTAAGAATTCAGTGTACTTTTTTCATTTTGGATATTTTCTTTACAACTATCATAAGATTTTTAATTTTTTTTTTATGGCGGTAAGAAGTTTTACATGATTGTGAAAAATAAATGTATTCATT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||