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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8634#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1128 fasta sequence
[GATGCTGATGATTATAATGAAAATGATATTGAAAATACCGGATTCAATGAAACCAATAAATTAAAGGATATTAAACTTAATCTCACTGTACCAGACACTATAACAAGTTGGAGAGCATCAGCTTATTGTACAACAAAAGAGAATGGTCTATGGATTGGTGAACCACAAATTTTAACTGTGACTATGCCATTTTATACAGAGATAACTTTACCAAAAGAAATGAAACGTGGTGAGATTCTACACATCCCCATAAGTGTATTTGTTTTAGATAGAAAATATTTAAATCCCACCGATGACAATTTCAATAAAACAGAATGTTATGAAACTTCTGTTAGAATACAAGTAAATAATAGTGAATGGTTAATAACTACATCAAATGAATTTACTAATTGTCTGTGTTCTGGTCAAAAGATCACTTATCTAGTTGGTTTATTACCACAACAATTAGGTCAATTAAATGTTACTGTTGAAGCATTTGCTATTAGAAATAGTGAATTTTGTGGACTCATTCAAACAAATGATAATGGTAATAGTTTGACATTTGAATCAAATAAAACAGAAATGAAAACTAATCAATCGAAATTATTATCCGATAAAATGATTCGTCAAATCAATGTAATACCTGAAGGTATTCAACAAGAAACAACTCTTAGTGATATTGTTTGTTTAAATGAACAACAAACTACATCAACGCGTCATTTTCAATTTACTTTACCTGATCATATTATAAAAGATTCATTTCATAGTTATATATCATATAGTGATGAAGTGTTAGGACCAGCATTAGTTAATTTAGATAGCCTTATACGTTTACCAACTGGTTGTGGTGAACAAAATATGGTATTAGTAGCACCAAATGTCTATATATTAGATTATTTAAAATCTACACCAAATATTGGAATAAATGACAATAAAGAGAAATATATAGAATCAGCTAAATCTCACATTATACCCGGTTATTATCAACAAATGAAATATCGTCGAGATGATGGATCATTTTCTGCATTCGGTAAATCTGATAAAGAAGGAAGTACATGGTTAACAGCATTTGTACTACGTGTATTTGCTAAAGCTTACAGACTACAACCGAATTTAAGCATTGATTGGAATAATTTATTTAACGGTGCT]
[+] EMBL CD192614 [GATGCTGATGATTATAATGAAAATGATATTGAAAATACCGGATTCAATGAAACCAATAAATTAAAGGATATTAAACTTAATCTCACTGTACCAGACACTATAACAAGTTGGAGAGCATCAGCTTATTGTACAACAAAAGAGAATGGTCTATGGATTGGTGAACCACAAATTTTAACTGTGACTATGCCATTTTATACAGAGATAACTTTACCAAAAGAAATGAAACGTGGTGAGATTCTACACATCCCCATAAGTGTATTTGTTTTAGATAGAAAATATTT ]
[+] EMBL CD117061 [ TTTACCAAAAGAAATGAAACGTGGTGAGATTCTACACATCCCCATAAGTGTATTTGTTTTAGATAGAAAATATTTAAATCCCACCGATGACAATTTCAATAAAACAGAATGTTATGAAACTTCTGTTAGAATACAAGTAAATAATAGTGAATGGTTAATAACTACATCAAATGAATTTACTAATTGTCTGTGTTCTGGTCAAAAGATCACTTATCTAGTTGGTTTATTACCACAACAATTAGGTCAATTAAATGTTACTGTTGAAGCATTTGCTATTAGAAATAGTGAATTTTGTGGACTCATTCAAACAAATGATAATGGTAATAGTTTGACATTTGAATCAAATAAAACAGAAATGAAAACTAATCAATCGAAATTATTATCCGATAAAATGATTCGTCAAATCAATGTAATACCTGAAGGTATTCAACAAGAAACAACTCTTAGTGATATTGTTTGTTTAAATGAACAACAAACTACATCAACGCGTCATTTTC ]
[+] EMBL CD117078 [ TTTACCAAAAGAAATGAAACGTGGTGAGATTCTACACATCCCCATAAGTGTATTTGTTTTAGATAGAAAATATTTAAATCCCACCGATGACAATTTCAATAAAACAGAATGTTATGAAACTTCTGTTAGAATACAAGTAAATAATAGTGAATGGTTAATAACTACATCAAATGAATTTACTAATTGTCTGTGTTCTGGTCAAAAGATCACTTATCTAGTTGGTTTATTACCACAACAATTAGGTCAATTAAATGTTACTGTTGAAGCATTTGCTATTAGAAATAGTGAATTTTGTGGACTCATTCAAACAAATGATAATGGTAATAGTTTGACATTTGAATCAAATAAAACAGAAATGAAAACTAATCAATCGAAATTATTATCCGATAAAATGATTCGTCAAATCAATGTAATACCTGAAGGTATTCAACAAGAAACAACTCTTAGTGATATTGTTTGTTTAAATGAACAACAAACTACATCAACGCGTCATTTTC ]
[+] EMBL CD117923 [ TTATTACCACAACAATTAGGTCAATTAAATGTTACTGTTGAAGCATTTGCTATTAGAAATAGTGAATTTTGTGGACTCATTCAAACAAATGATAATGGTAATAGTTTGACATTTGAATCAAATAAAACAGAAATGAAAACTAATCAATCGAAATTATTATCCGATAAAATGATTCGTCAAATCAATGTAATACCTGAAGGTATTCAACAAGAAACAACTCTTAGTGATATTGTTTGTTTAAATGAACAACAAACTACATCAACGCGTCATTNTCAATTTACTTTACCTGATCATATTATAAAAGATTCATTTCATAGTTATATATCATATAGTGATGAAGTGTTAG ]
[+] EMBL CD117851 [ TTATTACCACAACAATTAGGTCAATTAAATGTTACTGTTGTAGCATTTGCTATTAGAAATAGTGAATTTTGTGGACTCATTCAAACAAATGATAATGGTAATAGTTTGACATTTGAATCAAATAAAACAGAAATGAAAACTAATCAATCGAAATTATTATCCGATAAAATGATTCGTCAAATCAATGTAATACCTGAAGGTATTCAACAAGAAACAACTCTTAGTGATATTGTTTGTTTAAATGAACAACAAACTACATCAACGCGTCATTTTCAATTTACTTTACCTGATCATATTATAAAAGATTCATTTCATAGTTATATATCATATAGTGATGAAGTGTTACGACCAGCATTAGTTA ]
[+] EMBL CD117833 [ AATAAAACAGAAATGAGAACTAATCAATCGAAATTATTATCCGATAAAATGATTCGTCAAATCAATGTAATACCTGAAGGTATTCAACAAGAAACAACTCTTAGTGATATTGTTTGTTTAAATGAACAACAAACTACATCAACGCGTCATTTTCAATTTACTTTACCTGATCATATTATAAAAGATTCATTTCATAGTTATATATCATATAGTGATGAAGTGTTAGGACCAGCATTAGTTAATTTAGATAGCCTTATACGTTTACCAACTGGTTGTGGTGAACAAAATATGGTATTAGTAGCACCAAATGTCTATATATTAGATTATTTAAAATCTACACCAAATATTGGAATAA ]
[+] EMBL CD117809 [ GTTGTGGTGAACAAAATATGGTATTAGTAGCACCAAATGTCTATATATTAGATTATTTAAAATCTACACCAAATATTGGAATAAATGACAATAAAGAGAAATATATAGAATCAGCTAAATCTCACATTATACCCGGTTATTATCAACAAATGAAATATCGTCGAGATGATGGATCATTTTCTGCATTCGGTAAATCTGATAAAGAAGGAAGTACATGGTTAACAGCATTTGTACTACGTGTATTTGCTAAAGCTTACAGACTACAACCGAATTTAAGCATTGATTGGAATAATTTATTTAACGGTGCT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||