Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8644 cluster # 8644       Sequences # 7       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8644#0 length = 544 sequences # 7  
consensusID : consensus_8644#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 544
fasta sequence 
                              [TCAGTCCATTTCGAAGGAATTCATCATAACCATCTTCACAGTCTACTACTCCATCACAAAACTTGTCTCTTCTAAACATTGTTGTGAACCACATGGTCGAAAACCTGGAGCACAAACTTCTTGAACGTATAGTTTTGCATAACCTTTGCTATAACCGTCTGTACACATGTAAGATATATTATGATCGAATCGA-CCAACATCTTTAACGATTAACAAAGCTCTACCACCATTCGTTCCTATTACCTCTTCTTTACCAGAA-CGTAAATCTTGACGATCTGTACGCATCCAGAATACTTTACCACCTTTCATACCAGTAATTGTAGATAATTCACATAGAAATTGTACAGTTG-TTCCAGG-ACGTG-CTTTAACC-TC-TTCAGG-AGTTAC-AGT-CAAATC-TCTTATTTTAACAATTAA-TTTAGCCGTATCCTTTAAATTTAATGCTCTACATACATAGAAACCTTCATGATATTTTTGTACATTCATAATACTTAAAAATGATGTGGATGGTGTTGTATCAGGATTATCAATTTTAACATCATTATGTAAA]

[+] EMBL CD126735             [TCAGTCCATTTCGAAGGAATTCATCATAACCATCTTCACAGTCTACTACTCCATCACAAAACTTGTCTCTTCTAAACATTGTTGTGAACCACATGGTCGAAAACCTGGAGCACAAACTTCTTGAACGTATAGTTTTGCATAACCTTTGCTATAACCGTCTGTACACATGTAAGATATATTATGATCGAATCGA CCAACATCTTTAACGATTAACAAAGCTCCACCACCATTCGTTCCTATTACCTCTTCTTTACCAGAA CGTAAATCTTGACGATCTGTACGCATCCAGAATACTTTACCACCTTTCATACCAGTAATTGTAGATAATTCACATAGAAATTGTACAGTTG TTCCAGG ACGTG CTTTAACC TC TTCAGG AGTTAC AGT CAAATC TCTTATTTTAACAATTAA TTTAGCCGTATCCTTTAAATTTAATGCTCTACATACATAGAAACCTTCATGATATTTTTGTACATTCATAATACTTAAAAACGATGTGAATGG                                        ]
[-] EMBL CD067215             [                                                            ctTTGTCTCTTTTAAACATTGTTGTGAACCACATGGTCGAAAACCTGGGGCACAAACTTCTTGAACGTATAGTTTTGCATAACCTTTGCTATAACCGTCTGTACACATGTAAGATATATTATGATCGAATCGA CCAACATCTTTAACGATTAACAAAGCTCTACCACCATTCGTTCCTATTACCTCTTCTTTACCAGAA CGTAAATCTTGACGATCTGTACGCATCCAGAATACTTTACCACCTTTCATACCAGTAATTGTAGATAATTCACATAGAAATTGTACAGTTG TTCCAGG ACGTG CTTTAACC TC TTCAGG AGTTAC AGT CAAATC TCTTATTTTAACAATTAA TTTAGCCGTATCCTTTAAATTTAATGCTCTACATACATAGAAACCTTCATGATATTTTTGTACATTCATAATACTTAAAAATGATGTGGATGGTGTTGTATCAGGATTATCAATTTTAACATCATTATGTAAA]
[-] EMBL CD067221             [                                                                                                                                  AGTTTTGCATAACCTTTGCTATAACCGTCTGTACACATGTAAGATATATTATGATCGAAACGA CCAACATCTTTAACGATTAACAAAGCTCTACCACCATTCGTTCCTATTACCTCTTCTTTACCAGAA CGTAAATCTTGACGATCTGTACGCATCCAAAATACTTTACCACCTTTCATACCAGTAATTGTAGATAATTCACATAGAAATTGTACAGTTG TTCCAGG ACGTG CTTTAACC TC TTCAGG AGTTAC AGT CAAATC TCTTATTTTAACAATTAA TTTAGCCGTATCCTTTAAATTTAATGCTCTACATACATAGAAACCTTCATGATATTTTTGTACATTCATAATACTTAAAAATGATGTGGATGGTGTTGTATCAGGATTATCAATTTTAACATCATTATGTAAA]
[+] EMBL CD126730             [                                                                                                                                                                                     TGATCGAATCGATCCAACATCTTTAACGATTAACAGAGCTCTACCACCATTCGTTCCTATTACCTCTTCTTTACCAGAA CGTAAATCTTGACGATCTGTACGCATCCAGAATACTTTACCACCTTTCATACCAGTAATTGTAGATAATTCACATAGAAATTGTACAGTTG TTCCAGG ACGTG CTTTAACC TC TTCAGG AGTTAC AGT CAAATC TCTTATTTTAACAATTAA TTTAGCCGTATCCTTTAAATTTAATGCTCTACATACATAGAAACCTTCACGATATTTTTGTACATTCATAATACTTAAAAATGATGTGAATGG                                        ]
[-] EMBL CD066993             [                                                                                                                                                                                                                      CAAAGCTCTACCACCATTCGTTCGTATTACCTCTTCTTTACCAGAA CGTAAATCTTGACGATCTGTACGCATCCAGAATACTTTACCACCTTTCATACCAGTAATTGTAGATAATTCACATAGAAATTGTACAGTTG TTCCAGG ACGTG CTTTAACC TC TTCAGG AGTTAC AGT CAAATC TCTTATTTTAACAATTAA TTTAGCCGTATCCTTTAAATTTAATGCTCTACATACATAGAAACCTTCATGATATTTTTGTACATTCATAATACTTAAAAATGATGTGGATGGTGTTGTATCAGGATTATCAATTTTAACATCATTATGTAAA]
[+] EMBL CD166824             [                                                                                                                                                                                                                                                  ACCTCTTCTTTACCAGAAGCGTAAATCTTGACGATCTGTACGCATCCAGAATACTTTACCACCTTTCATACCAGTAATTGTAGATAATTCACATAGAAATTGTACAGTTG TTCCAGG ACGTG CTTTAACC TC TTCAGG AGTTAC AGT CAAATC TCTTATTTTAACAATTAA TTTAGCCGTATCCTTTAAATTTAATGCTCTACATACATAGAAAC                                                                                         ]
[-] EMBL CD067412             [                                                                                                                                                                                                                                                                  AA CGTAAATCTTGACGATCTGTACGCATCCAGAATACTTTACCACCTTTCATACCAGTAATTGTAGATAATTCACATAGAAATTGTACAGTTGTTTCCAGGAACGTGCCTTTAACCTTCTTTCAGGAAGTTACAAGTNCAAATCTTCTTATTTTAACAATTAATTTTAGCCGTATCCTTTAAATTTAATGCTCTACATACATAGAAACCTTCATGATATTTTTGTACATTCATAATACTTAAAAATGATGTGGATGGTGTTGTATCAGGATTATCAATTTTAACATCATTATGTAAA]




>consensus_8644#0
TCAGTCCATTTCGAAGGAATTCATCATAACCATCTTCACAGTCTACTACTCCATCACAAA
ACTTGTCTCTTCTAAACATTGTTGTGAACCACATGGTCGAAAACCTGGAGCACAAACTTC
TTGAACGTATAGTTTTGCATAACCTTTGCTATAACCGTCTGTACACATGTAAGATATATT
ATGATCGAATCGACCAACATCTTTAACGATTAACAAAGCTCTACCACCATTCGTTCCTAT
TACCTCTTCTTTACCAGAACGTAAATCTTGACGATCTGTACGCATCCAGAATACTTTACC
ACCTTTCATACCAGTAATTGTAGATAATTCACATAGAAATTGTACAGTTGTTCCAGGACG
TGCTTTAACCTCTTCAGGAGTTACAGTCAAATCTCTTATTTTAACAATTAATTTAGCCGT
ATCCTTTAAATTTAATGCTCTACATACATAGAAACCTTCATGATATTTTTGTACATTCAT
AATACTTAAAAATGATGTGGATGGTGTTGTATCAGGATTATCAATTTTAACATCATTATG
TAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)