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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8647#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 651 fasta sequence
[CTAATG-ACCCCTCAT-GGCTCG-AGGGTGTGATTTAATTGCAGGTTTAATGTTTCTGGCTAATCTAACGAAAGTTCGTGAAAAAAACGAATTTATCTAGTCTTCTTGTCGGTCTACCTCAAACTGTTTGGCCCAGACTTGCCCAGTTGTTATGCTTACCGGATTTGGCAGTTGTGTGTGCTACTTTAGAGGCTCTTCGTTGCTTAACAAATCTGGATGCAACGATGTGCTTAACTTGCTGGGAGTCCTGTTGCTTAAATGTAAATTCATTCGATCAAGAAAACATTCCTTTTATTTTACTTCAACCTTTGTTAGCATTACTTACATTAGAAGGCCAGGCGATGGGTTCTCAATCGCTTCATCGCATTAGACTTTTACCCCGCACTCCACAAGCTCAAAATGTTCAACCACAACCTCCTCATGGGGCCGGTCTACGAATTCCTGCTCTTAGTCGTGTGTCTCCTAATGTAAATGAGCTCAATCGATCCAGGGATGCACCTGCATACACTAATGGGCAGATGTTAAAGTCATCTTTACGCCCAAAACTTCCTGTAGTACACCCAGTTCCTTCTGATTCTTTTGATAATAATGATATTCATAACTCTACTACTTCATCCTTCCGTAATTTGAAGTTTGAATCTAGTACTTATTCAA]
[+] EMBL CD060766 [CTAATG ACCCCTCAT GGCTCG AGGGTGTGATTTAATTGCAGGTTTAATGTTTCTGGCTAATCTAACGAAAGTTCGTGAAAAAAACGAATTTATCTAGTCTTCTTGTCGGTCTACCTCAAACTGTTTGGCCCAAACTTGCCCAGTTGTTATGCTTACCGGATTTGGCAGTTGTGTGTGCTACTTTAGAGGCTCTTCGTTGCTTAACAAATCTGGATGCAACGATGTGCTTAACTTGCTGGGAGTCCTGTTGCTTAAATGTAAATTCATTCGATCAAGAAAACATTCCTTTTATTTTACTTCAACCTTTGTTAGCATTACTTACATTAGAAGGCCAGGCGATGGGTTCTCAATCGCTTCATCGCATTAGACTTTTACCCCGCACTCCACAAGCTCAAAATGTTCAACCACAACCTCCTCATGGGGCCGGTCTACGAATTCCTGCTCT ]
[+] EMBL CD061061 [ tATGAACCACTCATAGGTACGCAGGGTGTGATTTAATTGCAGGTTTAATGTTTCTGGCTAATCTAACGAAAGTTCGTGAAAAAAACGAATTTATCTAGGGTTCTTGTCGGTCTACCTCAAACTGTTTGGCCCAGACTTGCCCAGTTGTTATGCTTACCGGATTTGGCAGTTGTGTGTGCTACTTTAGAGGCTCTTCGTTGCTTAACAAATCTGGATGCAACGATGTGCTTAACTTGCTGGGAGTCCTGTTGCTTAAATGTAAATTCATTCGATCAAGAAAACATTCCTTTTATTTTACTTCAACCTTTGTTAGCATTACTTACAT ]
[+] EMBL CD061078 [ AATTGCAGGTTTAATGTTTCTGGCTAATCTAACGAAAGTTCGTGAAAAAAACGAATTTATCTAGTCTTCTTGTCGGTCTACCTCAAACTGTTTGGCCCAGACTTGCCCAGTTGTTATGCTTACCGGATTTGGCAGTTGTGTGTGCTACTTTAGAGGCTCTTCGTTGCTTAACAAATCTGGATGCAACGATGTGCTTAACTTGCTGGGAGTCCTGTTGCTTAAATGTAAATTCATTCGATCAAGAAAACATTCCTTTTATTTTACTTCAACCTTTGTTAGCATTACTTACATTAGAAGGCCAGGCGATGGGTTCTCAATCGCTTCATCGCATTAGACTTTTACCCCGCACTCCACAAGCTCAAAATGTTCAACCACAACCTCCTCATGGGGCCGGTCTACGAATTCCTGCTCTTAGTCGTGTGTCTCCTAATGTAAATGAGCTCAATCGATCCAGGGATGCACCTGCATACACTAATGGGCAGATGTTAAAGTCATCTTTACGCC ]
[+] EMBL CD120923 [ TATGCTTACCGGATTTGGCAGTTGTGTGTGCTACTTTAGAGGCTCTTCGTTGCTTAACAAATCTGGATGCAACGATGTGCTTAACTTGCTGGGAGTCCTGTTGCTTAAATGTAAATTCATTCGATCAAGAAAACATTCCTTTTATTTTACTTCAACCTTTGTTAGCATTACTTACATTAGAAGGCCAGGCGATGGGTTCTCAATCGCTTCATCGCATTAGACTTTTACC ]
[+] EMBL CD121121 [ TATGCTTACCGGACTTGGCAGTTGTGTGTGCTACTTTAGAGGCTCTTCGTTGCTTAACAAATCTGGATGCAACGATGTGCTTAACTTGCTGGGAGTCCTGTTGCTTAAATGTAAATTCATTCGATCAAGAAAACATTCCTTTTATTTTACTTCAACCTTTGTTAGCATTACTTACATTAGAAGGCCAGGCGATGGGTTCTCAATCGCTTCATCGCATTAGACTTTTACC ]
[+] EMBL CD112249 [ GCTTCATCGCATTAGACTTTTACCCCGCACTCCACAAGCTCAAAATGTTCAACCACAACCTCCTCATGGGGCCGGTCTACGAATTCCTGCTCTTAGTCGTGTGTCTCCTAATGTAAATGAGCTCAATCGATCCAGAGATGCACCTGCATACACTAATGGGCAGATGTTAAAGTCATCTTTACGCCCAAAACTTCCTGTAGTACACCC ]
[+] EMBL CD182167 [ GGCAGATGTTAAAGTCATCTTTACGCCCAAAACTTCCTGTAGTACACCCAGTTCCTTCTGATTCTTTTGATAATAATGATATTCATAACTCTACTACTTCATCCTTCCGTAATTTGAAGTTTGAATCTAGTACTTATTCAA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||