These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8655#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1287 fasta sequence [AATCATGTAATATTTCGCATGTTAATAACCATCTAGATCAACCATTAGATATAACACATTCAAATTTTTAAGATTTGTAGCATTTGTACTCCTTATCGTACAGATGACCAAGAACACCAACGATATCGTCGCATTTTGTCAGGCAATGCATTGTAACGTCCAGGAATGGGTTTTGGTCTTGGTATATTTCTTGAATGTAAAGCTTCATACATTTCTTGTTCCTTACGTATGGTGAAATCTGATCGACCAGGATAAGAACATTTTAATCTAAAATAGTCTGGTGAACTTTTACTTGATACAAGATCAACAGGTGGACCGATCGGTCGTATTTTCCGACCAAATCTTCCTGTTTTACGCTGCCACAATCCACTGCGTTGTTTAATTCCTCTCCATTTCTTTTCACCGAATTTACGAAATTTAAATTGATCATGATTTTGATTAGAAACTTGTCCAACTACAGACATACATGTTGGTAAAAGTCGATAAATTTTACGTTTTCCATTTGTTCTAACAAATACAACATATTCATCTCCTAGTTCATTAGTNTGAAGATGTTAAATTTAAATCATCATTTAATTTTGTACCAACATATTTTCCTCGTCGAAATATTGTTGCACTAGATCCTGCTGTAC-GACAAAATAAAG-CACCTTGACCAGGTTTTATTTCAAATTGACTAATGATTGTACCA-ACTGGTAATGCACCAACTGGATGAGCATCACCTTCTTTTGGATCAACTGGTATAGTAGGGATATCAACGTGTGAACGTATAACATCTCCAGGTTTCATATTAACAGTTGCAATAATCCATCTTTTCACTTCACCTGAAGCTACTAAAGCAATAAACGGATGTCTCCACCATGTTTTTTTGACCTGTAATACTAATTCTTCATGGATAGTTTTAGTTAAAACTTG-T-CTGGAACGATTATTATCCACCATAAAC-CATGGACGATTTAATCCAGTTGTAACATGTTTTAGTTGAATTTTACCGTCAGGTCCTCGTCCTCCTGTTCGTACCAATGGCATTGCGTCAACTGTATATTGATGAGGATCCATCACTTTACTAATTGCCCAATAGCGACTAACTGGCCGCGGATATGTTATACCAGGACGGCGATTTAAACTGCAGCTTGTTGACAATCCATATTTATAAATTTGTAGAGGATTTAAGCTAGTAAGGTATGATGGTGAGAATTTGGATGACTGAAGCAATTTGTTTCCCAAACTGAAATTTGTATATAACCGTAGAGAATTAGTCAAATGACTACAAAGATTCATTTAATGCCATCA] [+] EMBL CD074060 [AATCATGTAATATTTCGCATGTTAATAACCATCTAGATCAACCATTAGATATAACACATTCAAATTTTTAAGATTTGTAGCATTTGTACTCCTTATCGTACAGATGACCAAGAACACCAACGATATCGTCGCATTTTGTCAGGCAATGCATTGTAACGTCCAGGAATGGGTTTTGGTCTTGGTATATTTCTTGAATGTAAAGCTTCATACATTTCTTGTTCCTTACGTATGGTGAAATCTGATCGACCAGGATAAGAACATTTTAATCTAAAATAGTCTGGTGAACTTTTACTTGATACAAGATCAACAGGTGGACCGATCGGTCGTATTTTCCGACCAAATCTTCCTGTTTTACGCTGCCACAATCCACTGCGTTGTTTAATTCCTCTCCATTTCTTTTCACCGAATTTACGAAATTTAAATTGATCATGATTTTGATTAGAAACTTGTCCAACTACAGACATACATGTTGGTAAAAGTCGATAAATTTTACGTTTTCCATTTGTTCTAACAAATACAACATATTCATCTCCTAGTTCATTAGTNTGAAGATGTTAAATTTAAATCATCATTTAATTTTGTACCAACATATTTTCCTCGTCGAAATATTGTTGCACTAGATCCTGCTGTAC GACAAAATAAAG CACCTTGACCAGGTTTTATTTCAAATTGACTAATGATTGTACCA ] [+] EMBL CD060890 [ TAGATCCTGCTGTACGGACAAAATAAAGACACCTTGACCAGGTTTTATTTCAAATTGACTAATGATTGTACCG ACTGGTAATGCACCAACTGGATGAGCATCACCTTCTTTTGGATCAACTGGTATAGTAGGGATATCAACGTGTGAACGTATAACATCTCCAGGTTTCATATTAACAGTTGCAATAATCCATCTTTTCACTTCACCTGAAGCTACTAAAGCAATAAACGGATGTCTCCACCATGTTTTTTTGACCTGTAATACTAATTCTTCATGGATAGTTTCAGATAAAACTTG T CTGGAACGATTATTATCC ] [+] EMBL CD096705 [ CAAAATAAAG CACCTTGACCAGGTTTTATTTCAAATTGACTAATGATTGTACCA ACTGGTAATGCACCAACTGGATGAGCATCACCTTCTTTTGGATCAACTGGTATAGTAGGGATATCAACGTGTGAACGTATAACATCTCCAGGTTTCATATTAACAGTTGCAATAATCCATCTTTTCACTTCACCTGAAGCTACTAAAGCAATAAACGGATGTCTCCACCATGTTTTTTTGACCTGTAATACTAATTCTTCATGGATAGTTTTAGTTAAAGCTTG T CTGGAACGATTATTATCCACCATAAAC CATGGACGATTTAATCCAGTTGTAACATGTTTTAGTTGAATTTTACCGTCAGGTCCTCGTCCTCCTGTTCGTACCAATGGCATTGCGTCAACTG ] [+] EMBL CD096787 [ CAAAATAAAG CACCTTGACCAGGTTTTATTTCAAATTGACTAATGATTGTACCA ACTGGTAATGCACCAACTGGATGAGCATCACCTTCTTTTGGATCAACTGGTATAGTAGGGATATCAACGTGTGAACGTATAACATCTCCAGGTTTCATATTAACAGTTGCAATAATCCATCTTTTCACTTCACCTGAAGCTACTAAAGCAATAAACGGATGTCTCCACCATGTTTTTTTGACCTGTAATACTAATTCTTCATGGATAGTTTTAGTTAAAACTTG T CTGGAACGATTATTATCCACCATAAAC CATGGACGATTTAATCCAGTTGTAACATGTTTTAGTTGAATTTTACCGTCAGGTCCTCGTCCTCCTGTTCGTACCAATGGCATTGCGTCAACTG ] [+] EMBL CD096814 [ CAAAATAAAG CACCTTGACCAGGTTTTATTTCAAATTGACTAATGATTGTACCA ACTGGTAATGCACCAACTGGATGAGCATCACCTTCTTTTGGATCAACTGGTATAGTAGGGATATCAACGTGTGAACGTATAACATCTCCAGGTTTCATATTAACAGTTGCAATAATCCATCTTTTCACTTCACCTGAAGCTACTAAAGCAATAAACGGATGTCTCCACCATGTTTTTTTGACCTGTAATACTAATTCTTCATGGATAGTTTTAGTTAAAACTTG T CTGGAACGATTATTATCCACCATANAC CATGGGCGATTTAATCCAGTTGTAACATGTTTTAGTTGAATTTTA ] [-] EMBL CD183225 [ AAATAAAG CACCTTGACCAGGTTTTATTTCAAATTGAGTAATGATTGTGCCAGACTGGTAATGCACCAGCTGGATGAGCATCACCTTCTTTTGGATCAGGTGGTATAGTAGGGATATCAACGTGTGAGCGTATAACATCTCCAGGTTTCATATTAACAGTTGCAATAATCCATCTTTTCACTTCACCTGAAGCTACTAAAGCAATAAACGGATGTCTCCACCATGTTCTTTTGACCTGTAATACTAATTGTTCATGGATAGTGTTAGTTAAAACTTG TCCTGGAGCGATTATTATCCA ] [-] EMBL CD079802 [ ATTCTTCATGGATAGTTTTAGTTAAAACTTGTT CTGGAACGATTATTATCCATCATAAACTCATGGACGATTTAATCCAGTTGTAACATGTTTTAGTTGAATTTTACCGTCAGGTCCTCGTCCTCCTGTTCGTACCAATGGCATTGCGTCAACTGTATATTGATGAGGATCCATCACTTTACTAATTGCCCAATAGCGACTAACTGGCCGCGGATATGTTATACCAGGACGGCGATTTAAACTGCAGCTTGTTGACAATCCATATTTATAAATTTGTAGAGGATTTAAGCTAGTAAGGTATGATGGTGAGAATTTGGATGACTGAAGCAATTTGTTTCCCAAACTGAAATTTGTATATAACCGTAGAGAATTAGTCAAATGACTACAAAGATTCATTTAATGCCATCA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||