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Schistosoma mansoni
cluster # 8655 cluster # 8655       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8655#0 length = 1287 sequences # 7  

consensusID : consensus_8655#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1287
fasta sequence
                              [AATCATGTAATATTTCGCATGTTAATAACCATCTAGATCAACCATTAGATATAACACATTCAAATTTTTAAGATTTGTAGCATTTGTACTCCTTATCGTACAGATGACCAAGAACACCAACGATATCGTCGCATTTTGTCAGGCAATGCATTGTAACGTCCAGGAATGGGTTTTGGTCTTGGTATATTTCTTGAATGTAAAGCTTCATACATTTCTTGTTCCTTACGTATGGTGAAATCTGATCGACCAGGATAAGAACATTTTAATCTAAAATAGTCTGGTGAACTTTTACTTGATACAAGATCAACAGGTGGACCGATCGGTCGTATTTTCCGACCAAATCTTCCTGTTTTACGCTGCCACAATCCACTGCGTTGTTTAATTCCTCTCCATTTCTTTTCACCGAATTTACGAAATTTAAATTGATCATGATTTTGATTAGAAACTTGTCCAACTACAGACATACATGTTGGTAAAAGTCGATAAATTTTACGTTTTCCATTTGTTCTAACAAATACAACATATTCATCTCCTAGTTCATTAGTNTGAAGATGTTAAATTTAAATCATCATTTAATTTTGTACCAACATATTTTCCTCGTCGAAATATTGTTGCACTAGATCCTGCTGTAC-GACAAAATAAAG-CACCTTGACCAGGTTTTATTTCAAATTGACTAATGATTGTACCA-ACTGGTAATGCACCAACTGGATGAGCATCACCTTCTTTTGGATCAACTGGTATAGTAGGGATATCAACGTGTGAACGTATAACATCTCCAGGTTTCATATTAACAGTTGCAATAATCCATCTTTTCACTTCACCTGAAGCTACTAAAGCAATAAACGGATGTCTCCACCATGTTTTTTTGACCTGTAATACTAATTCTTCATGGATAGTTTTAGTTAAAACTTG-T-CTGGAACGATTATTATCCACCATAAAC-CATGGACGATTTAATCCAGTTGTAACATGTTTTAGTTGAATTTTACCGTCAGGTCCTCGTCCTCCTGTTCGTACCAATGGCATTGCGTCAACTGTATATTGATGAGGATCCATCACTTTACTAATTGCCCAATAGCGACTAACTGGCCGCGGATATGTTATACCAGGACGGCGATTTAAACTGCAGCTTGTTGACAATCCATATTTATAAATTTGTAGAGGATTTAAGCTAGTAAGGTATGATGGTGAGAATTTGGATGACTGAAGCAATTTGTTTCCCAAACTGAAATTTGTATATAACCGTAGAGAATTAGTCAAATGACTACAAAGATTCATTTAATGCCATCA]

[+] EMBL CD074060             [AATCATGTAATATTTCGCATGTTAATAACCATCTAGATCAACCATTAGATATAACACATTCAAATTTTTAAGATTTGTAGCATTTGTACTCCTTATCGTACAGATGACCAAGAACACCAACGATATCGTCGCATTTTGTCAGGCAATGCATTGTAACGTCCAGGAATGGGTTTTGGTCTTGGTATATTTCTTGAATGTAAAGCTTCATACATTTCTTGTTCCTTACGTATGGTGAAATCTGATCGACCAGGATAAGAACATTTTAATCTAAAATAGTCTGGTGAACTTTTACTTGATACAAGATCAACAGGTGGACCGATCGGTCGTATTTTCCGACCAAATCTTCCTGTTTTACGCTGCCACAATCCACTGCGTTGTTTAATTCCTCTCCATTTCTTTTCACCGAATTTACGAAATTTAAATTGATCATGATTTTGATTAGAAACTTGTCCAACTACAGACATACATGTTGGTAAAAGTCGATAAATTTTACGTTTTCCATTTGTTCTAACAAATACAACATATTCATCTCCTAGTTCATTAGTNTGAAGATGTTAAATTTAAATCATCATTTAATTTTGTACCAACATATTTTCCTCGTCGAAATATTGTTGCACTAGATCCTGCTGTAC GACAAAATAAAG CACCTTGACCAGGTTTTATTTCAAATTGACTAATGATTGTACCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD060890             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TAGATCCTGCTGTACGGACAAAATAAAGACACCTTGACCAGGTTTTATTTCAAATTGACTAATGATTGTACCG ACTGGTAATGCACCAACTGGATGAGCATCACCTTCTTTTGGATCAACTGGTATAGTAGGGATATCAACGTGTGAACGTATAACATCTCCAGGTTTCATATTAACAGTTGCAATAATCCATCTTTTCACTTCACCTGAAGCTACTAAAGCAATAAACGGATGTCTCCACCATGTTTTTTTGACCTGTAATACTAATTCTTCATGGATAGTTTCAGATAAAACTTG T CTGGAACGATTATTATCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD096705             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CAAAATAAAG CACCTTGACCAGGTTTTATTTCAAATTGACTAATGATTGTACCA ACTGGTAATGCACCAACTGGATGAGCATCACCTTCTTTTGGATCAACTGGTATAGTAGGGATATCAACGTGTGAACGTATAACATCTCCAGGTTTCATATTAACAGTTGCAATAATCCATCTTTTCACTTCACCTGAAGCTACTAAAGCAATAAACGGATGTCTCCACCATGTTTTTTTGACCTGTAATACTAATTCTTCATGGATAGTTTTAGTTAAAGCTTG T CTGGAACGATTATTATCCACCATAAAC CATGGACGATTTAATCCAGTTGTAACATGTTTTAGTTGAATTTTACCGTCAGGTCCTCGTCCTCCTGTTCGTACCAATGGCATTGCGTCAACTG                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD096787             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CAAAATAAAG CACCTTGACCAGGTTTTATTTCAAATTGACTAATGATTGTACCA ACTGGTAATGCACCAACTGGATGAGCATCACCTTCTTTTGGATCAACTGGTATAGTAGGGATATCAACGTGTGAACGTATAACATCTCCAGGTTTCATATTAACAGTTGCAATAATCCATCTTTTCACTTCACCTGAAGCTACTAAAGCAATAAACGGATGTCTCCACCATGTTTTTTTGACCTGTAATACTAATTCTTCATGGATAGTTTTAGTTAAAACTTG T CTGGAACGATTATTATCCACCATAAAC CATGGACGATTTAATCCAGTTGTAACATGTTTTAGTTGAATTTTACCGTCAGGTCCTCGTCCTCCTGTTCGTACCAATGGCATTGCGTCAACTG                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD096814             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CAAAATAAAG CACCTTGACCAGGTTTTATTTCAAATTGACTAATGATTGTACCA ACTGGTAATGCACCAACTGGATGAGCATCACCTTCTTTTGGATCAACTGGTATAGTAGGGATATCAACGTGTGAACGTATAACATCTCCAGGTTTCATATTAACAGTTGCAATAATCCATCTTTTCACTTCACCTGAAGCTACTAAAGCAATAAACGGATGTCTCCACCATGTTTTTTTGACCTGTAATACTAATTCTTCATGGATAGTTTTAGTTAAAACTTG T CTGGAACGATTATTATCCACCATANAC CATGGGCGATTTAATCCAGTTGTAACATGTTTTAGTTGAATTTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD183225             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAATAAAG CACCTTGACCAGGTTTTATTTCAAATTGAGTAATGATTGTGCCAGACTGGTAATGCACCAGCTGGATGAGCATCACCTTCTTTTGGATCAGGTGGTATAGTAGGGATATCAACGTGTGAGCGTATAACATCTCCAGGTTTCATATTAACAGTTGCAATAATCCATCTTTTCACTTCACCTGAAGCTACTAAAGCAATAAACGGATGTCTCCACCATGTTCTTTTGACCTGTAATACTAATTGTTCATGGATAGTGTTAGTTAAAACTTG TCCTGGAGCGATTATTATCCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD079802             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATTCTTCATGGATAGTTTTAGTTAAAACTTGTT CTGGAACGATTATTATCCATCATAAACTCATGGACGATTTAATCCAGTTGTAACATGTTTTAGTTGAATTTTACCGTCAGGTCCTCGTCCTCCTGTTCGTACCAATGGCATTGCGTCAACTGTATATTGATGAGGATCCATCACTTTACTAATTGCCCAATAGCGACTAACTGGCCGCGGATATGTTATACCAGGACGGCGATTTAAACTGCAGCTTGTTGACAATCCATATTTATAAATTTGTAGAGGATTTAAGCTAGTAAGGTATGATGGTGAGAATTTGGATGACTGAAGCAATTTGTTTCCCAAACTGAAATTTGTATATAACCGTAGAGAATTAGTCAAATGACTACAAAGATTCATTTAATGCCATCA]


>consensus_8655#0 AATCATGTAATATTTCGCATGTTAATAACCATCTAGATCAACCATTAGATATAACACATT CAAATTTTTAAGATTTGTAGCATTTGTACTCCTTATCGTACAGATGACCAAGAACACCAA CGATATCGTCGCATTTTGTCAGGCAATGCATTGTAACGTCCAGGAATGGGTTTTGGTCTT GGTATATTTCTTGAATGTAAAGCTTCATACATTTCTTGTTCCTTACGTATGGTGAAATCT GATCGACCAGGATAAGAACATTTTAATCTAAAATAGTCTGGTGAACTTTTACTTGATACA AGATCAACAGGTGGACCGATCGGTCGTATTTTCCGACCAAATCTTCCTGTTTTACGCTGC CACAATCCACTGCGTTGTTTAATTCCTCTCCATTTCTTTTCACCGAATTTACGAAATTTA AATTGATCATGATTTTGATTAGAAACTTGTCCAACTACAGACATACATGTTGGTAAAAGT CGATAAATTTTACGTTTTCCATTTGTTCTAACAAATACAACATATTCATCTCCTAGTTCA TTAGTNTGAAGATGTTAAATTTAAATCATCATTTAATTTTGTACCAACATATTTTCCTCG TCGAAATATTGTTGCACTAGATCCTGCTGTACGACAAAATAAAGCACCTTGACCAGGTTT TATTTCAAATTGACTAATGATTGTACCAACTGGTAATGCACCAACTGGATGAGCATCACC TTCTTTTGGATCAACTGGTATAGTAGGGATATCAACGTGTGAACGTATAACATCTCCAGG TTTCATATTAACAGTTGCAATAATCCATCTTTTCACTTCACCTGAAGCTACTAAAGCAAT AAACGGATGTCTCCACCATGTTTTTTTGACCTGTAATACTAATTCTTCATGGATAGTTTT AGTTAAAACTTGTCTGGAACGATTATTATCCACCATAAACCATGGACGATTTAATCCAGT TGTAACATGTTTTAGTTGAATTTTACCGTCAGGTCCTCGTCCTCCTGTTCGTACCAATGG CATTGCGTCAACTGTATATTGATGAGGATCCATCACTTTACTAATTGCCCAATAGCGACT AACTGGCCGCGGATATGTTATACCAGGACGGCGATTTAAACTGCAGCTTGTTGACAATCC ATATTTATAAATTTGTAGAGGATTTAAGCTAGTAAGGTATGATGGTGAGAATTTGGATGA CTGAAGCAATTTGTTTCCCAAACTGAAATTTGTATATAACCGTAGAGAATTAGTCAAATG ACTACAAAGATTCATTTAATGCCATCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)