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Schistosoma mansoni
cluster # 8665 cluster # 8665       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8665#0 length = 713 sequences # 7  

consensusID : consensus_8665#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 713
fasta sequence
                              [ATTGTAATTGTCGTTACGATTTGGTCGTTATGTCCGGACAAATAAGTTGTTTCGAGATTTGAGGACCCGTGGCTAATTTCCAGTTCTTTAAACTTTCAATCTAATACCAACTATACATAAATCAAAATTATGGGTAACTCTTCCAGTGGTCACAAGCGCAGACCGTCACTGGACGACGATGTCCTCTCGGGCGTTCTTGCTGGTAAAAGATATGTATATCAAATGTCACATGACACTCCTGCCGAGGATTCCGTGATTAGCTTTGTTACTGGTAATTCTGCCGTTCATGCTATTGCGGACCAACTCCGTGATTCCCGACTTTATGACTCAGGTGGCAAGCCAAATTTATTCGTTGGAGGACCGGGTCCAGGTCTTGATATTTCAGAAGAAAATCAACCTGTTCAGAGTGTACCAACTGTTTTTAAGTGGGATGGAGGAGGAAAAGACGTTTACATAAGTGGTACATTCAATGGTTGGAGATCGAAAATCCCGATGGTTAAAAGCTCGAGTAAACATAACTTTTATACGATCATTGATCTTCCTCTTGGTGAACATCAGTACAAATTTATTGTTGATGAGCATTGGAAGCTAGACCAAAACCAGCCTGTTTCTACTAGTCCGACCGGTGTTCAAAATAACGTGATTCAAGTCAAAGAGTCGGACTTTGATGTGCTTACTGCTCTATCTCATGATATGGCGAATTCTCGTGGTAG]

[-] EMBL CD092890             [ATTGTAATTGTCGTTACGATTTGGTCGTTATGTCCGGACAAATAAGTTGTTTCGAGATTTGAGGACCCGTGGCTAATTTCCAGTTCTTTAAACTTTCAATCTAATACCAACTATACATAAATCAAAATTATGGGTAACTCTTCCAGTGGTCACAAGCGCAGACCGTCACTGGACGACGATGTCCTCTCGGGCGTTCTTGCTGGTAAAAGATATGTATATCAAATGTCACATGACACTCCTGCCGAGGATTCCGTGATTAGCTTTGTTACTGGTAATTCTGCCGTTCATGCTATTGCGGACCAACTCCGTGATTCCCGAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD133028             [            GTTACGATTTGGTCGTTATGTCCGGACAAATAAGTTGTTTCGAGATTTGAGGACCCGTGGCTAATTTCCAGTTCTTTAAACTTTCAATCTAATACCAACTATACATAAATCAAAATTATGGGTAACTCTTCCAGTGGTCACAAGCGCAGACCGTCACTGGACGACGATGTCCTCTCGGGCGTTCTTGCTGGTAAAAGATATGTATATCAAATGTCACATGACACTCCTGCCGAGGATTCCGTGATTAGCTTTGTTACTGGTAATTCTGCCGTTCATGCTATTGCGGACCAACTCCGTGATTCCCGACTTTATGACTCAGGTGGCAAGCCAAATTTATTCGTTGGAGGACCGGGTCTAGGTCTTGATATTTCAGAAGAAAATCAACCTGTTCAGAGTGTACCAACTGTTTTTAAGTGGGATGGANGAGGAAAAGACGTTTACATAAGTGGTACATTCAATGGTTGGAGATCGAANATCCCGATGGTTAAAAGCTCGAGTAAACATAACTTTTATACGATCATTGATCTTCCTCTTGG                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL AI976332             [              TACGATTTGGTCGTTATGTCCGGACAAATAAGTTGTTTCGAGATTTGAGGACCCGTGGCTAATTTCCAGTTCTTTAAACTTTCAATCTAATACCAACTATACATAAATCAAAATTATGGGTAACTCTTCCAGTGGTCACAAGCGCAGACCGTCACTGGACGACGATGTCCTCTCGGGCGTTCTTGCTGGTAAAAGATATGTATATCAAATGTCACATGACACTCCTGCCGAGGATTCCGTGATTAGCTTTGTTACTGGTAATTCTGCCGTTCATGCTATTGCGGACCAACTCCGTGATTCCCGACTTTATGACTCACGTGGCAAGCCAAATTTATTCGTTGGAGGACCGGGTCCAGGTCTTGATATTTCAGAAGAAAATCAACCTGTTCAGAGTGTACCAACTGTTTTTAAGTGGGATGGAGGAGGAAAAGACGTTTACATAAGTGGTACATTCAATGGTTGGAGATCGAA                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL AI976330             [              TACGATTTGGTCGTTATGTCCGGACAAATAAGTTGTTTCGAGATTTGAGGACCCGTGGCTAATTTCCAGTTCTTTAAACTTTCAATCTAATACCAACTATACATAAATCAAAATTATGGGTAACTCTTCCAGTGGTCACAAGCGCAGACCGTCACTGGACGACGATGTCCTCTCGGGCGTTCTTGCTGGTAAAAGATATGTATATCAAATGTCACATGACACTCCTGCCGAGGATTCCGTGATTAGCTTTGTTACTGGTAATTCTGCCGTTCATGCTATTGCGGACCAACTCCGTGATTCCCGACTTTATGACTCAGGTGGCAAGCCAAATTTATTCGTTGGAGGACCGGGTCCAGGTCTTGATATTTCATAAGAAAATCAACCTGTTCAGAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD181103             [                                                GTTTCGAGATTCGAGGACCCGTGGCTAATTTCCAGTTCTTTAAACTTTCAATCTAATACCAACTATACATAAATCAAAATTATGGGTAACTCTTCCAGTGGTCACAAGCGCAGACCGTCACTGGACGACGATGTCCTCTCGGGCGTTCTTGCTGGTAAAAGATATGTATATCAAATGTCACATGACACTCCTGCCGAGGATTCCGTGATTAGCTTTGTTACTGGTAATTCTGCCGTTCATGCTATTGCGGACCAACTCCGTGATTCCCGACTTTATGACTCAGGTGGCAAGCCAAATTTATTCGTTGGAGGACCGGGTCCAGGTCTTGATATTTCAGAAGAAAATCAACCTGTTCAGAGTGTACCAACTGTTTTTAAGTGGGATGGAGGAGGAAAAGACGTTTACATAAGTGGTACATTCAATGGTTGGAGATCGAAAATCCCGATGGTTAAAAGCTCGAGTAAACATAACTTTTATACGATCATTG                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD110789             [                                                                                                                            AAATTATGGGTAACTCTTCCAGTGGTCACAAGCGCAGACCGTCACTGGACGACGATGTCCTCTCGGGCGTTCTTGCTGGTAAAAGATATGTATATCAAATGTCACATGACACTCCTGCCGAGGATTCCGTGATTAGCTTTGTTACTGGTAATTCTGCCGTTCATGCTATTGCGGACCAACTCCGTGATTCCCGACTTTATGACTCAGGTGGCAAGCCAAATTTATTCGTTGGAGGACCGGGTCTAGGTCTTGATATTTCAGAAGAAAATCAACCTGTTCAGAGTGTACCAACTGTTTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD095983             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTTTACATAAGTGGTACATTCAATGGTTGGAGATCGAAAATCCCGATGGTTAAAAGCTCGAGTAAACATAACTTTTATACGATCATTGATCTTCCTCTTGGTGAACATCAGTACAAATTTATTGTTGATGAGCATTGGAAGCTAGACCAAAACCAGCCTGTTTCTACTAGTCCGACCGGTGTTCAAAATAACGTGATTCAAGTCAAAGAGTCGGACTTTGATGTGCTTACTGCTCTATCTCATGATATGGCGAATTCTCGTGGTAG]


>consensus_8665#0 ATTGTAATTGTCGTTACGATTTGGTCGTTATGTCCGGACAAATAAGTTGTTTCGAGATTT GAGGACCCGTGGCTAATTTCCAGTTCTTTAAACTTTCAATCTAATACCAACTATACATAA ATCAAAATTATGGGTAACTCTTCCAGTGGTCACAAGCGCAGACCGTCACTGGACGACGAT GTCCTCTCGGGCGTTCTTGCTGGTAAAAGATATGTATATCAAATGTCACATGACACTCCT GCCGAGGATTCCGTGATTAGCTTTGTTACTGGTAATTCTGCCGTTCATGCTATTGCGGAC CAACTCCGTGATTCCCGACTTTATGACTCAGGTGGCAAGCCAAATTTATTCGTTGGAGGA CCGGGTCCAGGTCTTGATATTTCAGAAGAAAATCAACCTGTTCAGAGTGTACCAACTGTT TTTAAGTGGGATGGAGGAGGAAAAGACGTTTACATAAGTGGTACATTCAATGGTTGGAGA TCGAAAATCCCGATGGTTAAAAGCTCGAGTAAACATAACTTTTATACGATCATTGATCTT CCTCTTGGTGAACATCAGTACAAATTTATTGTTGATGAGCATTGGAAGCTAGACCAAAAC CAGCCTGTTTCTACTAGTCCGACCGGTGTTCAAAATAACGTGATTCAAGTCAAAGAGTCG GACTTTGATGTGCTTACTGCTCTATCTCATGATATGGCGAATTCTCGTGGTAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)