These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8665#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 713 fasta sequence [ATTGTAATTGTCGTTACGATTTGGTCGTTATGTCCGGACAAATAAGTTGTTTCGAGATTTGAGGACCCGTGGCTAATTTCCAGTTCTTTAAACTTTCAATCTAATACCAACTATACATAAATCAAAATTATGGGTAACTCTTCCAGTGGTCACAAGCGCAGACCGTCACTGGACGACGATGTCCTCTCGGGCGTTCTTGCTGGTAAAAGATATGTATATCAAATGTCACATGACACTCCTGCCGAGGATTCCGTGATTAGCTTTGTTACTGGTAATTCTGCCGTTCATGCTATTGCGGACCAACTCCGTGATTCCCGACTTTATGACTCAGGTGGCAAGCCAAATTTATTCGTTGGAGGACCGGGTCCAGGTCTTGATATTTCAGAAGAAAATCAACCTGTTCAGAGTGTACCAACTGTTTTTAAGTGGGATGGAGGAGGAAAAGACGTTTACATAAGTGGTACATTCAATGGTTGGAGATCGAAAATCCCGATGGTTAAAAGCTCGAGTAAACATAACTTTTATACGATCATTGATCTTCCTCTTGGTGAACATCAGTACAAATTTATTGTTGATGAGCATTGGAAGCTAGACCAAAACCAGCCTGTTTCTACTAGTCCGACCGGTGTTCAAAATAACGTGATTCAAGTCAAAGAGTCGGACTTTGATGTGCTTACTGCTCTATCTCATGATATGGCGAATTCTCGTGGTAG] [-] EMBL CD092890 [ATTGTAATTGTCGTTACGATTTGGTCGTTATGTCCGGACAAATAAGTTGTTTCGAGATTTGAGGACCCGTGGCTAATTTCCAGTTCTTTAAACTTTCAATCTAATACCAACTATACATAAATCAAAATTATGGGTAACTCTTCCAGTGGTCACAAGCGCAGACCGTCACTGGACGACGATGTCCTCTCGGGCGTTCTTGCTGGTAAAAGATATGTATATCAAATGTCACATGACACTCCTGCCGAGGATTCCGTGATTAGCTTTGTTACTGGTAATTCTGCCGTTCATGCTATTGCGGACCAACTCCGTGATTCCCGAC ] [+] EMBL CD133028 [ GTTACGATTTGGTCGTTATGTCCGGACAAATAAGTTGTTTCGAGATTTGAGGACCCGTGGCTAATTTCCAGTTCTTTAAACTTTCAATCTAATACCAACTATACATAAATCAAAATTATGGGTAACTCTTCCAGTGGTCACAAGCGCAGACCGTCACTGGACGACGATGTCCTCTCGGGCGTTCTTGCTGGTAAAAGATATGTATATCAAATGTCACATGACACTCCTGCCGAGGATTCCGTGATTAGCTTTGTTACTGGTAATTCTGCCGTTCATGCTATTGCGGACCAACTCCGTGATTCCCGACTTTATGACTCAGGTGGCAAGCCAAATTTATTCGTTGGAGGACCGGGTCTAGGTCTTGATATTTCAGAAGAAAATCAACCTGTTCAGAGTGTACCAACTGTTTTTAAGTGGGATGGANGAGGAAAAGACGTTTACATAAGTGGTACATTCAATGGTTGGAGATCGAANATCCCGATGGTTAAAAGCTCGAGTAAACATAACTTTTATACGATCATTGATCTTCCTCTTGG ] [+] EMBL AI976332 [ TACGATTTGGTCGTTATGTCCGGACAAATAAGTTGTTTCGAGATTTGAGGACCCGTGGCTAATTTCCAGTTCTTTAAACTTTCAATCTAATACCAACTATACATAAATCAAAATTATGGGTAACTCTTCCAGTGGTCACAAGCGCAGACCGTCACTGGACGACGATGTCCTCTCGGGCGTTCTTGCTGGTAAAAGATATGTATATCAAATGTCACATGACACTCCTGCCGAGGATTCCGTGATTAGCTTTGTTACTGGTAATTCTGCCGTTCATGCTATTGCGGACCAACTCCGTGATTCCCGACTTTATGACTCACGTGGCAAGCCAAATTTATTCGTTGGAGGACCGGGTCCAGGTCTTGATATTTCAGAAGAAAATCAACCTGTTCAGAGTGTACCAACTGTTTTTAAGTGGGATGGAGGAGGAAAAGACGTTTACATAAGTGGTACATTCAATGGTTGGAGATCGAA ] [+] EMBL AI976330 [ TACGATTTGGTCGTTATGTCCGGACAAATAAGTTGTTTCGAGATTTGAGGACCCGTGGCTAATTTCCAGTTCTTTAAACTTTCAATCTAATACCAACTATACATAAATCAAAATTATGGGTAACTCTTCCAGTGGTCACAAGCGCAGACCGTCACTGGACGACGATGTCCTCTCGGGCGTTCTTGCTGGTAAAAGATATGTATATCAAATGTCACATGACACTCCTGCCGAGGATTCCGTGATTAGCTTTGTTACTGGTAATTCTGCCGTTCATGCTATTGCGGACCAACTCCGTGATTCCCGACTTTATGACTCAGGTGGCAAGCCAAATTTATTCGTTGGAGGACCGGGTCCAGGTCTTGATATTTCATAAGAAAATCAACCTGTTCAGAGT ] [-] EMBL CD181103 [ GTTTCGAGATTCGAGGACCCGTGGCTAATTTCCAGTTCTTTAAACTTTCAATCTAATACCAACTATACATAAATCAAAATTATGGGTAACTCTTCCAGTGGTCACAAGCGCAGACCGTCACTGGACGACGATGTCCTCTCGGGCGTTCTTGCTGGTAAAAGATATGTATATCAAATGTCACATGACACTCCTGCCGAGGATTCCGTGATTAGCTTTGTTACTGGTAATTCTGCCGTTCATGCTATTGCGGACCAACTCCGTGATTCCCGACTTTATGACTCAGGTGGCAAGCCAAATTTATTCGTTGGAGGACCGGGTCCAGGTCTTGATATTTCAGAAGAAAATCAACCTGTTCAGAGTGTACCAACTGTTTTTAAGTGGGATGGAGGAGGAAAAGACGTTTACATAAGTGGTACATTCAATGGTTGGAGATCGAAAATCCCGATGGTTAAAAGCTCGAGTAAACATAACTTTTATACGATCATTG ] [-] EMBL CD110789 [ AAATTATGGGTAACTCTTCCAGTGGTCACAAGCGCAGACCGTCACTGGACGACGATGTCCTCTCGGGCGTTCTTGCTGGTAAAAGATATGTATATCAAATGTCACATGACACTCCTGCCGAGGATTCCGTGATTAGCTTTGTTACTGGTAATTCTGCCGTTCATGCTATTGCGGACCAACTCCGTGATTCCCGACTTTATGACTCAGGTGGCAAGCCAAATTTATTCGTTGGAGGACCGGGTCTAGGTCTTGATATTTCAGAAGAAAATCAACCTGTTCAGAGTGTACCAACTGTTTTT ] [+] EMBL CD095983 [ GTTTACATAAGTGGTACATTCAATGGTTGGAGATCGAAAATCCCGATGGTTAAAAGCTCGAGTAAACATAACTTTTATACGATCATTGATCTTCCTCTTGGTGAACATCAGTACAAATTTATTGTTGATGAGCATTGGAAGCTAGACCAAAACCAGCCTGTTTCTACTAGTCCGACCGGTGTTCAAAATAACGTGATTCAAGTCAAAGAGTCGGACTTTGATGTGCTTACTGCTCTATCTCATGATATGGCGAATTCTCGTGGTAG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||