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Schistosoma mansoni
cluster # 8668 cluster # 8668       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8668#0 length = 521 sequences # 7  

consensusID : consensus_8668#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 521
fasta sequence
                              [CTGACCTCGCCTTGTTAGGTTGCAAGGACAGTAAATATGCACGTAAATGGATGCATGGGCAGCAATCTTTCGGATGTCTTTCCTTCACTTCCTTTCCAAGACTCAATTAATAACTCTGCCACTGGTCCAGTCCTGAATGTCAACGGACCAAACGTAAACAGCATTGATACTATGTCTCGACTCAAATTTCTTGGTTTAAATTTGACGAGTAATAATCAGAATGGAAATAGTAACACCCTTTGTAATGAGGATCGCTCACGCACCAATTTGATAATCAATTACCTGCCTCAGAGCTACGACCAGAACGACCTCCAGCGTCTCTTTGAGCGAGTGGGACCTATTAGACAGTGTAAGCTAATCAGAGACAAGAATACGGGTGCAAGTCTGTGTTATGGGTTCGTGGATTTCGTGAATCCTCAGCACGCAGCTCTAGCAATACAAACTTATCACGGTTACGAGACGGAGCAAAAACGACTGCGTGTAGCATACGCCAGTTCAGGTGGTCGCCGGTTCACACCAGG]

[+] EMBL CD188844             [CTGACCTCGCCTTGTTAGGTTGCAAGGACAGTAAATATGCACGTAAATGGATGCATGGGCAGCAATCTTTCGGATGTCTTTCCTTCACTTCCTTTCCAAGACTCAATTAATAACTCTGCCACTGGTCCAGTCCTGAATGTCAACGGACCAAACGTAAACAGCATTGATACTATGTCTCGACTCAAATTTCTTGGTTTAAATTTGACGAGTAATAATCAGAATGGAAATAGTAACACCCTTTGTAATGAGGATCGCTCACGCACCAATTTGATAATCAGTTACCTGCCTCAGAGCTACGACCAGAACGACCTCCAGCGTCTCTTTGAGCGAGTGGGACCTATTAGACAGTGTAAGCTAATCAGAGACAAGAATACGGGTGCAAGTCTGTGTTATGGGTTCGTGGATTTCGTGAATCCTCAGCACGCAGCTCTAGCAATACAAACTTATCACGGTTACGAGACGGAGCAAAAACGACTGCGTGTAGCATACGCCAGTTCAAGTGGTCG               ]
[+] EMBL CD183569             [CTGACCTCGCCTTGTTAGGTTGCAAGGACAGTAAATATGCACGTAAATGGATGCATGGGCAGCAATCTTTCGGATGTCTTTTCTTCACTTCCTTTCCAAGACTCAATTAATAACTCTGCCACTGGTCCAGTCCTGAATGTCAACGGACCAAACGTAAACAGCATTGATACTATGTCTCGACTCAAATTTCTTGGTTTAAATTTGACGAGTAATAATCAGAATGGAAATAGTAACACCCTTTGTAATGAGGATCGCTCACGCACCAATTTGATAATCAGTTACCTGCCTCAGAGCTACGACCAGAACGACCTCCAGCGTCTCTTTGAGCGAGTGGGACCTATTAGACAGTGTAAGCTAATC                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD068101             [   ACCTCGCCTTGTTAGGTTGCAAGGACAGTAAATATGCACGTAAATGGATGCATGGGCAGCAATCTTTCGGATGTCTTTCCTTCACTTCCTTTCCAAGACTCAATTAATAGCTCTGCCACTGGTCCAGTCCTGAATGTCAACGGACCAAACGTAAACAGCATTGATACTATGTCTCGACTCAAATTTCTTGGTTTAAATTTGACGAGTAATAATCAGAATGGAAATAGTAACACCCTTTGTAATGAGGATCGCTCACGCACCAATTTGATAATCAATTACCTGCCTCAGAGCTACGACCAGAACGACCTCCAGCGTCTC TTGAGCG                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD125811             [                                                         GGCAGAAATCTTTCGGATGTCTTTCCTTCACTTCCTTTCCAAGACTCAATTAATAACTCTGCCACTGGTCCAGTCCTGAATGTCAACGGACCAAACGTAAACAGCATTGATACTATGTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD155324             [                                                                     TCGGATGTCTTTCCTTCACTTCCTTTCCAAGACTCAATTAATAACTCTGCCACTGGTCCAGTCCTGAATGTCAACGGACCAAACGTAAACAGCATTGATACTATGTCTCGACTCAAATTTCTTGGTTTAAATTTGACGAGTAATAATCAGAATGGAAATAGTAACACCCTTTGTAATGAGGATCGCTCACGCACCAATTTGATAATCAATTACCTGCCTCAGAGCTACGACCAGAACGACCTCCAGCGTCTCTTTGAGCGAGTGGGACCTATTAGACAGTGTAAGCTAATCAGAGACAAGAATACGGGTGCAAGTCTGTGTTATGGGTTCGTGGATTTCGTGAATCCTCAGCACGCGGCTCTAGCAATACAAATTTATCACGGTTACGAGACGGAGCAAAAACGACTGCGTGTAGCAT                                  ]
[+] EMBL CD189455             [                                                                                                                                      GAATGTCAACGGACCAAACGTAAACAGCATTGATACTATGTCTCGACTCAAATTTCTTGGTTTAAATTTGACGAGTAATAATCAGAATGGAAATAGTAACACCCTTTGTAATGAGGATCGCTCACGCACCAATTTGATAATCAATTACCTGCCTCAGAGCTACGACCAGAACGACCTCCAGCGTCTCTTTGAGCGAGTGGGACCTATTAGACAGTGTAAGCTAATCAGAGACAAGAATACGGGTGCAAGTCTGTGTTATGGGTTCGTGGATTTCGTGAATCCTCAGCACGCAGCTCTAGCAATACAAACTTATCACGGTTACGAGACGGAGCAAAAACGACTGCGTGTAGCATACGCCAGTTCAGGTGGTCG               ]
[+] EMBL CD190019             [                                                                                                                                      GAATGTCAACGGACCAAACGTAAACAGCATTGATACTATGTCTCGACTCAAATTTCTTGGTTTAAATTTGACGAGTAATAATCAGAATGGAAATAGTAACACCCTTTGTAATGAGGATCGCTCACGCACCAATTTGATAATCAATTACCTGCCTCAGAGCTACGACCAGAACGACCTCCAGCGTCTCTTTGAGCGAGTGGGACCTATTAGACAGTGTAAGCTAATCAGAGACAAGAATACGGGTGCAAGTCTGTGTTATGGGTTCGTGGATTTCGTGAATCCTCAGCACGCAGCTCTAGCAATACAAACTTATCACGGTTACGAGCCGGAGCAAAAACGACTGCGTGTAGCATACGCCAGTTCAGGTGGTCGCCGGTTCACACCAGG]


>consensus_8668#0 CTGACCTCGCCTTGTTAGGTTGCAAGGACAGTAAATATGCACGTAAATGGATGCATGGGC AGCAATCTTTCGGATGTCTTTCCTTCACTTCCTTTCCAAGACTCAATTAATAACTCTGCC ACTGGTCCAGTCCTGAATGTCAACGGACCAAACGTAAACAGCATTGATACTATGTCTCGA CTCAAATTTCTTGGTTTAAATTTGACGAGTAATAATCAGAATGGAAATAGTAACACCCTT TGTAATGAGGATCGCTCACGCACCAATTTGATAATCAATTACCTGCCTCAGAGCTACGAC CAGAACGACCTCCAGCGTCTCTTTGAGCGAGTGGGACCTATTAGACAGTGTAAGCTAATC AGAGACAAGAATACGGGTGCAAGTCTGTGTTATGGGTTCGTGGATTTCGTGAATCCTCAG CACGCAGCTCTAGCAATACAAACTTATCACGGTTACGAGACGGAGCAAAAACGACTGCGT GTAGCATACGCCAGTTCAGGTGGTCGCCGGTTCACACCAGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)