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Schistosoma mansoni
cluster # 8671 cluster # 8671       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8671#0 length = 824 sequences # 7  

consensusID : consensus_8671#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 824
fasta sequence
                              [ACCATGAATGGTTATGTTGACTAACAATAGTAAACAGTAATAATATTATTAAATATATTAGTTATTATCACTTTCATTTATGATTTCAGTGGGGACCTTCTATGTTCCTTTATTTATTTAATCTTTCGTTTCTTTTTATAGTATTTTATTAATTTTGATTCTTATGAAATGTGGAATGTAGGCTGTAATTATGCTGCATATTGCTTCTTTTTTTGTTCTGTTAAAATATATACATTCGCATATCTGATTTATGATAC-TTTATTACAAAGACCTCCTCCCCCCCCC-AAAAAAAACAACCACATAAAACTGAAACCAATTTATCTGTAACTACACTCCAGTCGCCTTTTATTTCGTATTTCTGTGTATATGTGCTTTGTTCAGACATATCCATTAACTAAAGATAGACAATGTATTGTCAATCTATGCAAACCTATCTTGTATTATTCAAAATTGTGTTTATACCGTCATCTAGTGTCTA-CTGAGAATTATAATAATGTACTGTTTATCCTCAGGGGTTTGAGTTGTTTTTTCGGTTTAAGAACAGTATAATTCTCTCATTTTTACGTTGAAATAATTTCCACTGTTAGCTTATTTATGCATAATTTATTTTTATTACTGATGACTTATGAAAGCGTAGTCTTTAACAGATGACGACAACAAACTTTTCTTACAACTTTATTCTAATACACAAGAACGTTTAACTTTATTAAACAATATACTATTGATACTACTGTGGTATGGGCTACTGATGTCGACAGA-TATAAGTAC-TATGTA-GCACCAATCGAAAGTGAAACACAGAAGGTTAAGGAGATTAA-TGAGAACAG]

[+] EMBL CD159789             [ACCATGAATGGTTATGTTGACTAACAATAGTAAACAGTAATAATATTATTAAATATGTTAGTTATTATCACTTTCATTTATGATTTCAGTGGGGACCTTCTATGTTCCTTTATTTATTTAATCTTTCGTTTCTTTTTATAGTATTTTATTAATTTTGATTCTTATGAAATGTGGAATGTAGGCTGTAATTATGCTGCATATTGCTTCTTTTTTTGTTCTGTTAGAATATATACATTCGCATATCTGATTTATGATACGTTTATTACAAAGACCTCCTCCCCCCCCC AAAAAAAACAACCACATAAAACTGAAACCAATTTATCTGTAACTACACTCCAGTCGCCTTTTATTTCGTATTTCTGTGTATATGTGCTTNGTTCAGACATATTCATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD159780             [ACCATGAATGGTTATGTTGACTAACAATAGTAAACAGTAATAATATTATTAAATATATTAGTTATTATCACTTTCATTTATGATTTCAGTGGGGACCTTCTATGTTCCTTTATTTATTTAATCTTTCGTTTCTTTTTATAGTATTTTATTAATTTTGATTCTTATGAAATGTGGAATGTAGGCTGTCATTATGCTGCATATTGCTTCTTTTGTTGTTCTGTTAAAATATATACATTCGCATATCTGATTTATGATAC TTTATTACAAAGACCTCCTCCGCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD159801             [ACCATGAATGGTTATGTTGACTAACAATAGTAAACAGTAATAATATTATTAAATATATTAGTTATTATCACTTTCATTTATGATTTCAGTGGGGACCTTCTATGTTCCTTTATTTATTTAATCTTTCGTTTCTTTTTATAGTATTTTATTAATTTTGATTCTTATGAAATGTGGAATGTAGGCTGTAATTATGCTGCATATTGCTTCTTTTTTTGTTCTGTTAAAATATATACATTCGCATATCTGATTTATGATAC TTTATTACAAAGACCTCCTCCCCCCCCCAAAAAAAAACAACCACATAAAACTGAAACCAATTTATCTGTAACTACACTCCAGTCGCCTTTCGTTTGGTATTTCTGTGTATATGTGCTTTGTTCAGACATATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD134093             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AAAAACAACCACATAAAACTGAAACCAATTTATCTGTAACTACACTCCAGTCGCCTTTTATTTTGTATTTCTGTTTATATGTGCTTTGTTCAGACATATCCATTAACTAAAGATAGACAATGTATTGTCAATCTATGCAAACCTATCTTGTATTATTCAAAATTGTGTTTATACCGTCATCTAGTGTCTA CTGAAAATTATAATAATGTACTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD159768             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATCTTGTATTATTCAAAATTGTGTTTATACCGTCATCTAGTGTCTA CTGAGAATTATAATAATGTACTGTTTATCCTCAGGGGTTTGAGTTGTTTTTTCGGTTTAAGAACAGTATAATTCTCTCATTTTTACGTTGAAATAATTTCCACTGTTAGCTTATTTATGCATAATTTATTTTTATTACTGATGACTTATGAAAGCGTAGTCTTTAACAGATGACGACAACAAACTTTTCTTACAACTTTATTCTAATACACAAGAACGTTTAACTTTATTAAACAATATACTATTGATACTACTGTGGTATGGGCTACTGATGTCGACAGA TATAAGTAC TATGTA GCACCAATCGAAAGTGAAACACAGAAGGTTAAGGAGATTAACTGAGAACA ]
[-] EMBL CD159767             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TAGTGTCTACCTGAGAATTATAATAATGTACTGTTTATCCTCAGGGGTTTGAGTTGTTTTTTCGCTTTAAGAACAGTATAATTCTCTCATTTTTACGTTGAAATAATTTCCACTGTTAGCTTATTTATGCATAATTTATTTTTATTACTGATGACTTATGAAAGCGTAGTCTTTAACAGATGACGACAACAAACTTTTCTTACAACTTTATTCTAATACACAAGAACGTTTAACTTTATTAAACAATATACTATTGATACTACTGTGGTATGGGCTACTGATGTCGACAGA TATAAGTAC TATGTA GCACCAATCGAAAGTGAAACACAGAAGGTTAAGGAGATTAA TGAGCACA ]
[-] EMBL CD159756             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATACTATTGATACTACTGTGGTATGGGCTACTGATGTCGACAGACTATAAGTACATATGTACGCACCAATCGAAAGTGAAACACAGAAGGTTAAGGAGATTAA TGAGAACAG]


>consensus_8671#0 ACCATGAATGGTTATGTTGACTAACAATAGTAAACAGTAATAATATTATTAAATATATTA GTTATTATCACTTTCATTTATGATTTCAGTGGGGACCTTCTATGTTCCTTTATTTATTTA ATCTTTCGTTTCTTTTTATAGTATTTTATTAATTTTGATTCTTATGAAATGTGGAATGTA GGCTGTAATTATGCTGCATATTGCTTCTTTTTTTGTTCTGTTAAAATATATACATTCGCA TATCTGATTTATGATACTTTATTACAAAGACCTCCTCCCCCCCCCAAAAAAAACAACCAC ATAAAACTGAAACCAATTTATCTGTAACTACACTCCAGTCGCCTTTTATTTCGTATTTCT GTGTATATGTGCTTTGTTCAGACATATCCATTAACTAAAGATAGACAATGTATTGTCAAT CTATGCAAACCTATCTTGTATTATTCAAAATTGTGTTTATACCGTCATCTAGTGTCTACT GAGAATTATAATAATGTACTGTTTATCCTCAGGGGTTTGAGTTGTTTTTTCGGTTTAAGA ACAGTATAATTCTCTCATTTTTACGTTGAAATAATTTCCACTGTTAGCTTATTTATGCAT AATTTATTTTTATTACTGATGACTTATGAAAGCGTAGTCTTTAACAGATGACGACAACAA ACTTTTCTTACAACTTTATTCTAATACACAAGAACGTTTAACTTTATTAAACAATATACT ATTGATACTACTGTGGTATGGGCTACTGATGTCGACAGATATAAGTACTATGTAGCACCA ATCGAAAGTGAAACACAGAAGGTTAAGGAGATTAATGAGAACAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)