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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8674#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1481 fasta sequence
[AACTCTGCTAGTTGCTTCAGCTTTGAATGCAGTCGGTGGTTGTATTAAATGTATAGCGGGTGCGGTTACATATGAAACAACGTTTGGACAATCTGATATATCTATTCCATTCAGCCATAAACTTGGTTTTCCAATACTTATGTTTGGACAAACTATTTGTGGAATAGCTCAATCCGGTATATTGGGTATACCAGCCCATTTAGCAGCAGTTTGGTTTGGAGTGAATGAAGTCTCAACCGCCACTGCACTTGGTGTATTCGGGAATCAACTTGGTGTTGCATTTGGCTTTCTAGTACCACCGCTTATTTTACCATCGATACCGTATAGTTCAAATGGAACTAACCAACTTG-ATCCATCAACAGATGTAAATCAATTATTCAATAATGTTAAACACTATATGATGATTATGCTGTATTTTAGTGCGGCTTTAAATATACTTCCATTTATATTTGCATTATTTGGTTTACGTGCAAAACCTAAAACGGAACCAAGTTTAGCACAATATAAACGTAATGGTTCATCAATTAATCATAAATTACAAATCAATGATCAATTATCAATTGATAAACCTTTAAATGGTATCCATTCAATAATCAATAATAATGGTCTACATGATAAGAAAAACAATATTGATAAAGAATTCTATACTAAATCATTAGAAAGTGATAAACAATATCCAGCTCTTAGTCCAAATGAATATTCCATATCATCAACAAAACAGAATACAACTGATAAGAATGATTCAATAATAAATAATTTTGTTATCAATATTGATGAGAATAATGATATAAATAGTATAGATGATTATTCGCAACAATCATTACAAAATCATCCTAGAAATGAGAAGATATCAGCTGCATTA-AAACGTTTATTTAAAAATATTCCATTTGTTTTATTGTTTATCAGTTATGGTATACTTACTGGTGTCTACTATGCTGTTGGTACATTGTTAAACTATTTTACTAGGATATTTCACAAATTCTACTTTATCTGGTTGGGCTGGTTTCACTATGATTATTGCCGGTATATTTGGATCAGTAATAACTGGTGTAATTTTAGATAAAACAAAAAAATTTAAGATAATCACATGTATTATATATATTCTAAGTTTAATATTCATGGGAATCTTTACTGGAATATTATATCTCCGTTCAATGCCAATAGTCTTTATTGTTATGTTCTTTTTAGGTTTCTTTATGACCGGTTATTTAAGTATTGGTTTTGAATTAGCCGCTGAATTAACTTATCCAGAAAGTGAAGGTTTATCTTCTGGTTTGTTGAATACATCAGCACAGATATTTGGCCTTATATTGATTCATGTTGCAACACCATTAAGAACACATTATGGAGTTTTGCCTGGAAATTTATTCCTTACAGGATTAACATTAATTGGAACAATAATGACAGTATTAATTAAAGAGAATCTTTATCGTCAACAGGCACATGAACGTAAGAAGTTTGAAACACAAACTGTTCCCGAT]
[-] EMBL CD068152 [AACTCTGCTAGTTGCTTCAGCTTTGAATGCAGTCGGTGGTTGTATTAAATGTATAGCGGGTGCGGTTACATATGAAACAACGTTTGGACAATCTGATATATCTATTCCATTCAGCCATAAACTTGGTTTTCCAATACTTATGTTTGGACAAACTATTTGTGGAATAGCTCAATCCGGTATATTGGGTATACCAGCCCATTTAGCAGCAGTTTGGTTTGGAGTGAATGAAGTCTCAACCGCCACTGCACTTGGTGTATTCGGGAATCAACTTGGTG ]
[-] EMBL CD124234 [ nAGCAGCAGTTT GTTGNNAGTG ATGAAGTCTCAACCG CACTGCAC TGGTGTA TCGGGAATCAACTTGGTG TGCATTTGGCTTTCTAGTACCACCGCTTATTTTACCATCGATACCGTATAGTTCAAATGGAACTAACCAACTTG ATCCATCAACAGATGTAAATCAATTATTCAATAATGTTAAACACTATATGATGATTATGCTGTATTTTAGTGCGGCTTTAAATATACTTCCATTTATATTTGCATTATTTGGTTTACGTGCAAAACCTAAAACGGAACCAAGTTTAGCACAATATAAACGTAATGGTTCATCAATTAATCATAAATTACAAATCAATGATCAATTATCAATTGATAAACCTTTAAATGGTATCCATTCAATAATCAATAATAATGGTCTACATGATAAGAAAAACAATATTGATAAAGAATTCTATACTAAATCATTAGAAAGTGATAAACAATATCCAGCTCTTAGTCCAAATGAATATTCCATATCATCAACAAAACAGAATACAACTGATAAGAATGATTCAATAATAAATAATTTTGTTATCAATATTGATGAGAATAATGATATAAATAGTATAGATGATTATTCGCAACAATCATTACAAAATCATCCTAGAAATGAGAAGATATCAGCTGCATTA AAACGTTTATTTAAAAATATTCCATTTGTTTTATTGTTTATCAGTTATG ]
[+] EMBL CD124288 [ CAGCAGTTTGGTTTGGAGTGAATGAAGTCTCAACCGCCACTGCACTTGGTGTATTCGGGAATCAACTTGGTGTTGCATTTGGCTTTCTAGTACCACCGCTTATTTTACCATCGATACCGTATAGTTCAAATGGAACTAACCAACTTG ATCCATCAACAGATGTAAATCAATTATTCAATAATGTTAAACACTATATGATGATTATGCTGTATTTTAGTGCGGCTTTAAATATACTTCCATTTATATTTGCATTATTTGGTTTACGTGCAAAACCTAAAACGGAACCAAGTTTAGCACAATATAAACGTAATGGTTCATCAATTAATCATAAATTACAAATCAATGATCAATTATCAATTGATAAACCTTTAAATGGTATCCATTCAATAATCAATAATAATGGTCTACATGATAAGAAAAACAATATTGATAAAGAATTCTATACTAAATCATTAGAAAGTGATAAACAATATCCAGCTCTTAGTCCAAATGAATATTCCATATCATCAACAAAACAGAATACAACTGATAAGAATGATTCAATAATAAATAATTNTGTTATCAATATTGATGAGAATAATGATATAAATAGTATAGATGATTATTCGCAACAATCATTACAAAATCATCCTAGAAATGAGAAGATATCAGCTGCATTANAAACG TTATTT AAAATATTCCATTTGTTTTATTGGTTATCAGTTAT ]
[-] EMBL CD200998 [ AAGTCTCAACCGCCACTGCACTTGGTGTATTCGGGAATCAACTTGGTGTTGCATTTGGCTTTCTAGTACCACCGCTTATTTTACCATCGATACCGTATAGTTCAAATGGAACTAACCAACTTG ATCCATCAACAGATGTAAATCAATTATTCAATAATGTTAAACACTATATGATGATTATGCTGTATTTTAGTGCGGCTTTAAATATACTTCCGTTTATATTTGCATTATTTGGTTTACGTGCAAAACCTAAAACGGAACCAAGTTTAGCACAATATAAACGTAATGGTTCATCAATTAATCATAAATTACAAATCAATGATCAATTATCAATTGATAAACCTTTAAATGGTATCCATTCAGTAATCAATAATAATGGTCTACATGATAAGAAAAACAATATTGATAAAGAATTCTATACTAAATCATTAGAAAGTGA ]
[-] EMBL CD124298 [ TTTTACCATCGATACCGTATAGTTCAAATGGAACTAACC ACTTGNATCCATCAACAGATGTAAATCAATTATTCAATAATGTTAAACACTATATGATGATTATGCTGTATTTTAGTGCGGCTTTAAATATACTTCCATTTATATTTGCATTATTTGGTTTACGTGCAAAACCTAAAACGGAACCAAGTTTAGCACAATATAAACGTAATGGTTCATCAATTAATCATAAATTACAAATCAATGATCAATTATCAATTGATAAACCTTTAAATGGTATCCATTCAATAATCAATAATAATGGTCTACATGATAAGAAAAACAATATTGATAAAGAATTCTATACTAAATCATTAGAAAGTGATAAACAATATCCAGCTCTTAGTCCAAATGAATATTCCATATCATCAACAAAACAGAATACAACTGATAAGAATGATTCAATAATAAATAATTTTGTTATCAATATTGATGAGAATAATGATATAAATAGTATAGATGATTATTCGCAACAATCGTTACAAAATCATCCTAGAAATGAGAAGATATCAGCTGCATTA AAACGTTTATTTAAAAATATTCCATTTGTTTTATTGTTTATCAGTTATG ]
[-] EMBL CD201172 [ GATGAGAATAATGATATAAATAGTATAGATGATTATTCGCAACAATCATTACAAAATCATCCTAGAAATGAGAAGATATCAGCTGCATTA AAACGTTTATTTAAAAATATTCCATTTGTTTTATTGTTTATCAGTTATGGTATACTTACTGGTGTCTACTATGCTGTTGGTACATTGTTAAACTATTTTACTAGGATATTTCACAAATTCTACTTTATCTGGTTGGGCTGGTTTCACTATGATTATTGCCGGTATATTTGGATCAGTAATAACTGGTGTAATTTTAGATAAAACAAAAAAATTTAAGATAATCACATGTATTATATATATTCTAAGTTTAATATTCATGGGAATCTTTACTGGA ]
[+] EMBL AI976922 [ CATGTATTATATATATTCTAAGTTTAATATTCATGGGAATCTTTACTGGAATATTATATCTCCGTTCAATGCCAATAGTCTTTATTGTTATGTTCTTTTTAGGTTTCTTTATGACCGGTTATTTAAGTATTGGTTTTGAATTAGCCGCTGAATTAACTTATCCAGAAAGTGAAGGTTTATCTTCTGGTTTGTTGAATACATCAGCACAGATATTTGGCCTTATATTGATTCATGTTGCAACACCATTAAGAACACATTATGGAGTTTTGCCTGGAAATTTATTCCTTACAGGATTAACATTAATTGGAACAATAATGACAGTATTAATTAAAGAGAATCTTTATCGTCAACAGGCACATGAACGTAAGAAGTTTGAAACACAAACTGTTCCCGAT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||