cluster # 8676

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8676 cluster # 8676 Sequences # 7 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8676#0 length = 1175 sequences # 7
consensusID : consensus_8676#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1175
fasta sequence
                              [AGGAAGTGCTGCTCGTTTTGAAACATGTGCACGTGGTCAACCAGCACCAACTGTACGTTGGCTTAAAGATGGTAAACCATTATTAACTGATGGAATACGTTTATGTGTATCACAAACATCAACTGAAAGATCTGGTACTAATACATCTAGTCATACACTTTTAGTTAAAGATGCTATACCACGTGATAGTGGAACATATACATGTATTGCAACAAGTTCATCAGGTACTGCTATCACTGAAGCAGCATTACATGTTCGTGGTTTATTTGGTCGTGGAGGTCATACTGGCTCAGATGCAATTAATAGTGGTGGTATTCGACATCGTCATCCTGAATTTACTCGTCGTTTACGTAATCAACAAGTTGATTTTGGTAGTACTATACGATTAGCTGCATCAGTATTAGCTCAACCATCAGCTACAGTGGTATGGCAAAAAGATGGTATAGAAATTTTAACTGAACCATCGGATGATCCAAGAATTACTGCTAAAAATCATAGCGGTCATTTAGAATTACGTATTGAAAATGTATGTAAAGATGATTTAGGTCAATATACAGTAATTGCATATAATTCTGCTGGTGAAGCTCGTTGTTCATGCATTTTACAAGGTACAACAAAAATGGAAATACAAGTACCTAAATTCACTAAAGAACTTCGTGATTATACAATACTAGAAGGTACTAATTTATGTTTAGAAACCATAGCAATTGGTGAACCAATACCTGAATTTAAATGGGAAAAAGATGGTTTTGAAATTCTTCCTGATGAATATGGTCCACCACGTATTACACCTGGTAC-AATGGCAGTAGTTTAGCTTATTTACGCATTCACAATGTCCGTAGTTCAGATGCAGGTTTGTATCGTTGCATATCATATAATAGATTTGGTCGTGAAAGAACAACTTGTATTGTTCATGTGGAATCAATCAAACAAAAAGGTGTACATCGATCAGATATGATGAATGGATCATTTACTTCGAAAAAAGACACAGATTCTTCTTTAGCAATGTTATCTGAGAATGGTATTAAAGCATCACCGAGGAATCATTCAGATTCACCTAAATTAACTGGATATATTAATGTATTACGTCCATTGCCTAAGACTGTTGAAGTTGAAGAAGGCAGTCCTATTGAACTAACATGTCGTGTTGATACANNATTACATTACATTCCTAC]

[+] EMBL BF936404             [AGGAAGTGCTGCTCGTTTTGAAACATGTGCACGTGGTCAACCAGCACCAACTGTACGTTGGCTTAAAGATGGTAAACCATTATTAACTGATGGAATACGTTTATGTGTATCACAAACATCAACTGAAAGATCTGGTACTAATACATCTAGTCATACACTTTTAGTTAAAGATGCTATACCACGTGATAGTGGAACATATACATGTATTGCAACAAGTTCATCAGGTACTGCTATCACTGAAGCAGCATTACATGTTCGTGGTTTATTTGGTCGTGGAGGTCATACTGGCTCAGATGCAATTAATAGTGGTGGTATTCGACATCGTCATCCTGAATTTACTCGTCGTTTACGTAATCAACAAGTTGATTTTGGTAGTACTATACGATTAGCTGCATCAGTATTAGCTCAACCATCAGCTACAGTGGTATGGCAAAAAGATGGTATAGAAATTTTAACTGAACCATCGGATGATCCAAGAATTACTGCTAAAAATCATAGCGGTCATTTAGAATTACGTATTGAAAATGTATGTAAAGATGATTTAGGTCAATATACAGTAATTGCATATAATTCTGCTGGTGAAACTCGTTGTTCATGCATTTTACAAGGTACAACAAAAATGGAAATACAAGTACCTAAATTCACTAAAAAACTTCGTGATTATACAATACTAAAAGGTACTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL AW016978             [AGGAAGTGCTGCTCGTTTTGAAACATGTGCACGTGGTCAACCAGCACCAACTGTACGTTGGCTTAAAGATGGTAAACCATTATTAACTGATGGAATACGTTTATGTGTATCACAAACATCAACTGAAAGATCTGGTACTAATACATCTAGTCATACACTTTTAGTTAAAGATGCTATACCACGTGATAGTGGAACATATACATGTATTGCAACAAGTTCATCAGGTACTGCTATCACTGAAGCAGCATTACATGTTCGTGGTTTATTTGGTCGTGGAGGTCATACTGGCTCAGATGCAATTAATAGTGGTGGTATTCGACATCGTCATCCTGAATTTACTCGTCGTTTACGTAATCAACAAGTTGATTTTGGTAGTACTATACGATTAGCTGCATCAGTATTAGCTCAACCATCAGCTACAGTGGTATGGCAAAAAGATGGTATAGAAATTTTAACTGAACCATCGGATGATCCAAG ATTACTGCT AAAATCATA CGG C TTTAGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD135288             [                                GTGGTCAACCAGCACCAACTGTACGTTGGCTTAAAGATGGTAGACCATTATTAACTGATGGAATACGTTTATGTGTATCACAAACATCAACTGAAAGATCTGGTACTAATACATCTAGTCATACACTTTTAGTTAAAGATGCTATACCACGTGATAGTGGAACATATACATGTATTGCAACAAGTTCATCAGGTACTGCTATCACTGAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD197623             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GATGCAATTAATAGTGGTGGTATTCGACATCGTCATCCTGAATTTACTCGTCGTTTACGTAATCAACAAGTTGATTTTGGTAGTACTATACGATTAGCTGCATCAGTATTAGCTCAACCATCAGCTACAGTGGTATGGCAAAAAGATGGTATAGAAATTTTAACTGAACCATCGGATGATCCAAGAATTACTGCTAAAAATCATAGCGGTCATTTAGAATTACGTATTGAAAATGTATGTAAAGATGATTTAGGTCAATATACAGTAATTGCATATAATTCTGCTGGTGAAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD068176             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TAGTGGTGGTATTCGACATCGTCATCCTGAATTTACTCGTCGTTTACGTAATCAACAAGTTGATTTTGGTAGTACTATACGATTAGCTGCATCAGTATTAGCTCAACCATCAGCTACAGTAGTATGGCAAAAAGATGGTATAGAAATTTTGACTGAACCATCGGATGATCCAAGAATTACTGCTAAAAATCATAGCGGTCATTTAGAATTACGTATTGAAAATGTATGTAAAGATGATTTAGGTCAATATACAGTAATTGCATATAATTCTGCTGGTGAAGCTCGTTGTTCATGCATTTTACAAGGTACAACAAAAATGGAAATACAAGTACCTAAATTCACTAAAGAACTTCGTGATTATACAATACTAGAAGGTACTAATTTATGTTTAGAAACCATAGCAATTGGTGAACCAATACCTGAATTTAAATGGGAAAAAGATGGTTTTGAAATTCTTCCTGATGAATATGGTCCACCACGTATTACACCTGGTAC AATGGCAGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL AI975596             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GGTGGTATTCGACATCGTCATCCTGAATTTACTCGTCGTTTACGTAATCAACAAGTTGATTTTGGTAGTACTATACGATTAGCTGCATCAGTATTAGCTCAACCATCAGCTACAGTGGTATGGCAAAAAGATGGTATAGAAATTTTAACTGAACCATCGGATGATCCAAGAATTACTGCTAAAAATCATAGCGGTCATTTAGAATTACGTATTGAAAATGTATGTAAAGATGATTTAGGTCAATATACAGTAATTGCATATAATTCTGCTGGTGAAGCTCGTTGTTCATGCATTTTACAAGGTACAACAAAAATGGAAATACAAGTACCTAAATTCACTAAAGAACTTCGTGATTATACAATACTAGAAGGTACTAATTTATGTTTAGAAACCATAGCAATTGGTGAACCAATACCTGAATTTAAATGGGAAAAAGATGGTTTTGAAATTCTTCCTGATGAATATGGTCCACCACGTATTACACCTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL AW016972             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATTATACAATACTAGAAGGTACTAATTTATGTTTAGAAACCATAGCAATTGGTGAACCAATACCTGAATTTAAATGGGAAAAAGATGGTTTTGAAATTCTTCCTGATGAATATGGTCCACCACGTATTACACCTGGTACAAATGGCAGTGGTTTAGCTTATTTACGCATTCACAATGTCCGTAGTTCAGATGCAGGTTTGTATCGTTGCATATCATATAATAGATTTGGTCGTGAAAGAACAACTTGTATTGTTCATGTGGAATCAATCAAACAAAAAGGTGTACATCGATCAGATATGATGAATGGATCATTTACTTCGAAAAAAGACACAGATTCTTCTTTAGCAATGTTATCTGAGAATGGTATTAAAGCATCACCGAGGAATCATTCAGATTCACCTAAATTAACTGGATATATTAATGTATTACGTCCATTGCCTAAGACTGTTGAAGTTGAAGAAGGCAGTCCTATTGAACTAACATGTCGTGTTGATACANNATTACATTACATTCCTAC]




>consensus_8676#0
AGGAAGTGCTGCTCGTTTTGAAACATGTGCACGTGGTCAACCAGCACCAACTGTACGTTG
GCTTAAAGATGGTAAACCATTATTAACTGATGGAATACGTTTATGTGTATCACAAACATC
AACTGAAAGATCTGGTACTAATACATCTAGTCATACACTTTTAGTTAAAGATGCTATACC
ACGTGATAGTGGAACATATACATGTATTGCAACAAGTTCATCAGGTACTGCTATCACTGA
AGCAGCATTACATGTTCGTGGTTTATTTGGTCGTGGAGGTCATACTGGCTCAGATGCAAT
TAATAGTGGTGGTATTCGACATCGTCATCCTGAATTTACTCGTCGTTTACGTAATCAACA
AGTTGATTTTGGTAGTACTATACGATTAGCTGCATCAGTATTAGCTCAACCATCAGCTAC
AGTGGTATGGCAAAAAGATGGTATAGAAATTTTAACTGAACCATCGGATGATCCAAGAAT
TACTGCTAAAAATCATAGCGGTCATTTAGAATTACGTATTGAAAATGTATGTAAAGATGA
TTTAGGTCAATATACAGTAATTGCATATAATTCTGCTGGTGAAGCTCGTTGTTCATGCAT
TTTACAAGGTACAACAAAAATGGAAATACAAGTACCTAAATTCACTAAAGAACTTCGTGA
TTATACAATACTAGAAGGTACTAATTTATGTTTAGAAACCATAGCAATTGGTGAACCAAT
ACCTGAATTTAAATGGGAAAAAGATGGTTTTGAAATTCTTCCTGATGAATATGGTCCACC
ACGTATTACACCTGGTACAATGGCAGTAGTTTAGCTTATTTACGCATTCACAATGTCCGT
AGTTCAGATGCAGGTTTGTATCGTTGCATATCATATAATAGATTTGGTCGTGAAAGAACA
ACTTGTATTGTTCATGTGGAATCAATCAAACAAAAAGGTGTACATCGATCAGATATGATG
AATGGATCATTTACTTCGAAAAAAGACACAGATTCTTCTTTAGCAATGTTATCTGAGAAT
GGTATTAAAGCATCACCGAGGAATCATTCAGATTCACCTAAATTAACTGGATATATTAAT
GTATTACGTCCATTGCCTAAGACTGTTGAAGTTGAAGAAGGCAGTCCTATTGAACTAACA
TGTCGTGTTGATACANNATTACATTACATTCCTAC
clustalw multiple alignements is not computed in this case