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Schistosoma mansoni
cluster # 8686 cluster # 8686       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8686#0 length = 554 sequences # 7  

consensusID : consensus_8686#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 554
fasta sequence
                              [GTACGAAACCACATTCACC-ATATATTTGGAATTTTTATTTT-GAAAGAAATATGAATAACTCAATACTAATTACACTAATTATAATACTAATTTATTCTCAAATAATTAATGCAGGCGTTGACTTTAAAAAACGTCGACAAATGGATGGTGTTGGTTTGCGTACCAAAATGAATCATTTTAAGAGTTATGATGAGATTCTCCAACATCCTTTTGATTTTCATTTACACGGAATAGACTCGAAAATCTTTGATGAGTTCCTAAAATATATTATTGACGGGTTTCTGGATTTCGACAAATGGTTTGAAGTTATCATATAACAGTTCCAGTGTGATTCGGTGGTCGGAAGTAACCTCCTTTTTATTCAGTACATCATATTAACTAATTCGATATTACCAAAAACAGAAAAAATAAAGCAAAATAATAAGTACGCCGGATTCAAATGGTTATTTTTCCTTGTAAACCGTGTTTACTAGTATTTATATTCTGTAACATTGATAACTTATCAAGAATGTACTAAATTGACAAACGAATTAATTCAATACCATACTTTAGAC]

[+] EMBL CD082188             [GTACGAAACCACATTCACC ATATATTTGGAATTTTTATTTT GTAAGAAATATGAATAACTCAATACTAATTACACTAATTATAATACTAATTTATTCTCAAATAATTAATGCAGGCGTTGACTTTAAAAAACGTCGACAAATGGATGGTGTTGGTTTGCGTACCAAAATGAATCATTTTAAGAGTTATGATGAGATTCTCCAACATCCTTTTGATTTTCATTTACACGGAATAGACTCGAAAATCTTTGATGAGTTCCTAAAATATATTATTGACGGGTTTCTGGATTTCGACAAATGGTTTGAAGTTATCATATAACAGTTCCAGTGTGATTCGGTGGTCGGAAGTAACCTCCTTTTTATTCAGTACATCATATTAACTAATTCGATATTACCAAAAACAGAAAAAATAAAGCAAAATAATAAGTACGCCGGATTCAAATGGTTATTTTTCCTTGTAAACCGTGTTTACTAGTATTTATATTCTGTAACATTGATAACTTATCAAGAATGTACTAAATTGACAAACGAATTAATTCAATACCATACTTTAGA ]
[-] EMBL CD075802             [          ACATTCACCNATATATTTGGAATTTTTATTTT GAAAGAAATATGAATAACTCAATACTAATTACACTAATTATAATACTAATTTATTCTCAAATAATTAATGCAGGCGTTGACTTTAAAAAACGTCGACAAATGGATGGTGTTGGTTTGCGTACCAAAATGAATCATTTTAAGAGTTATGATGAGATTCTCCAACATCCTTTTGATTTTCATTTACACGGAATAGACTCGAAAATCTTTGATGAGTTCCTAAAATATATTATTGACGGGTTTTTGGATTTCGACAAATGGTTTGAAGTTATCATATAACAGTTCCAGTGTGATTCGGTGGTCGGAAGTAACCTCCTTTTTATTCAGTACATCATATTAACTAATTCGATATTACCAAAAACAGAAAAAATAAAGCAAAATAATAAGTACGCCGGATTCAAATGGTTATTTTTCCTTGTAAACCGTGTTTACTAGTATTTATATTCTGTAACATTGATAACTTATCAAGAATGTACTAAATTGACAAACGAATTAATTCAATACCATACTTTAGAC]
[+] EMBL SMAA69217            [                ACC ATATATTTGGAATTTTTATTTT GAAAGAAATATGAATAACTCAATACTAATTACACTAATTATAATACTAATTTATTCTCAAATAATTAATGCAGGCGTTGACTTTAAAAAACGTCGACAAATGGATGGTGTTGGTTTGCGTACCAAAATGAATCATTTTAAGAGTTATGATGAGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL AI438709             [                     nATATTTGGAATTTTTATTTT GAAAGAAATATGAGTAACTCAATACTAATTACGCTAATTATAATACTAATTTTTTCTCAAATAATTTATGCGGGCGTTGGCTTTAAAAACCGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AI618786             [                                 TTTTATTTTCGGAAGAAATATGAATAACTCAATACTAATTACACTAATTATAATACTAATTTATTCTCAAATAATTAATGCAGGCGTTGACTTTAAAAAACGTCGACAAATGGATGGTGTTGGTTTGCGTACCAAAATGAATCATTTTAAGAGTTATGATGAGATTCTCCAACATCCTTTTGATTTTCATTTACACGGAATAGACTCGAAAATCTTTGATGAGTTCCTAAAATATATTATTGACGGGTTTCTGGATTT                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD061989             [                                                                    TAATTACACTAATTATAATACTAATTTATTCTCAAATAATTAATGCAGGCGTTGACTTTAAAAAACGTCGACAAATGGATGGTGTTGGTTTGCGTACCAAAATGAATCATTTTAAGAGTTATGATGAGATTCTCCAACATCCTTTTGATTTTCATTTACACGGAATAGACTCGAAAATCTTTGATGAGTTCCTAAAATATATTATTGACGGGTTTCTGGATTTCGACAAATGGTTTGAAGTTATCATATAACAGTTCCAGTGTGATTCGGTGGTCGGAAGTAACCTCCTTTTTATTCAGTACATCATATTAACTAATTCGATATTACCAAAAACAGAAAAAATAA                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD061566             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GACAAATGG TTG AGTTATCATATAACAG TCCAGTGTGATTCGGTGGTCGGAAGTAACCTCCTTTTTATTCAGTACATCATATTAACTAATTCGATATTACCAAAAACAGAAAAAATAA                                                                                                                                               ]


>consensus_8686#0 GTACGAAACCACATTCACCATATATTTGGAATTTTTATTTTGAAAGAAATATGAATAACT CAATACTAATTACACTAATTATAATACTAATTTATTCTCAAATAATTAATGCAGGCGTTG ACTTTAAAAAACGTCGACAAATGGATGGTGTTGGTTTGCGTACCAAAATGAATCATTTTA AGAGTTATGATGAGATTCTCCAACATCCTTTTGATTTTCATTTACACGGAATAGACTCGA AAATCTTTGATGAGTTCCTAAAATATATTATTGACGGGTTTCTGGATTTCGACAAATGGT TTGAAGTTATCATATAACAGTTCCAGTGTGATTCGGTGGTCGGAAGTAACCTCCTTTTTA TTCAGTACATCATATTAACTAATTCGATATTACCAAAAACAGAAAAAATAAAGCAAAATA ATAAGTACGCCGGATTCAAATGGTTATTTTTCCTTGTAAACCGTGTTTACTAGTATTTAT ATTCTGTAACATTGATAACTTATCAAGAATGTACTAAATTGACAAACGAATTAATTCAAT ACCATACTTTAGAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)