These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8686#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 554 fasta sequence [GTACGAAACCACATTCACC-ATATATTTGGAATTTTTATTTT-GAAAGAAATATGAATAACTCAATACTAATTACACTAATTATAATACTAATTTATTCTCAAATAATTAATGCAGGCGTTGACTTTAAAAAACGTCGACAAATGGATGGTGTTGGTTTGCGTACCAAAATGAATCATTTTAAGAGTTATGATGAGATTCTCCAACATCCTTTTGATTTTCATTTACACGGAATAGACTCGAAAATCTTTGATGAGTTCCTAAAATATATTATTGACGGGTTTCTGGATTTCGACAAATGGTTTGAAGTTATCATATAACAGTTCCAGTGTGATTCGGTGGTCGGAAGTAACCTCCTTTTTATTCAGTACATCATATTAACTAATTCGATATTACCAAAAACAGAAAAAATAAAGCAAAATAATAAGTACGCCGGATTCAAATGGTTATTTTTCCTTGTAAACCGTGTTTACTAGTATTTATATTCTGTAACATTGATAACTTATCAAGAATGTACTAAATTGACAAACGAATTAATTCAATACCATACTTTAGAC] [+] EMBL CD082188 [GTACGAAACCACATTCACC ATATATTTGGAATTTTTATTTT GTAAGAAATATGAATAACTCAATACTAATTACACTAATTATAATACTAATTTATTCTCAAATAATTAATGCAGGCGTTGACTTTAAAAAACGTCGACAAATGGATGGTGTTGGTTTGCGTACCAAAATGAATCATTTTAAGAGTTATGATGAGATTCTCCAACATCCTTTTGATTTTCATTTACACGGAATAGACTCGAAAATCTTTGATGAGTTCCTAAAATATATTATTGACGGGTTTCTGGATTTCGACAAATGGTTTGAAGTTATCATATAACAGTTCCAGTGTGATTCGGTGGTCGGAAGTAACCTCCTTTTTATTCAGTACATCATATTAACTAATTCGATATTACCAAAAACAGAAAAAATAAAGCAAAATAATAAGTACGCCGGATTCAAATGGTTATTTTTCCTTGTAAACCGTGTTTACTAGTATTTATATTCTGTAACATTGATAACTTATCAAGAATGTACTAAATTGACAAACGAATTAATTCAATACCATACTTTAGA ] [-] EMBL CD075802 [ ACATTCACCNATATATTTGGAATTTTTATTTT GAAAGAAATATGAATAACTCAATACTAATTACACTAATTATAATACTAATTTATTCTCAAATAATTAATGCAGGCGTTGACTTTAAAAAACGTCGACAAATGGATGGTGTTGGTTTGCGTACCAAAATGAATCATTTTAAGAGTTATGATGAGATTCTCCAACATCCTTTTGATTTTCATTTACACGGAATAGACTCGAAAATCTTTGATGAGTTCCTAAAATATATTATTGACGGGTTTTTGGATTTCGACAAATGGTTTGAAGTTATCATATAACAGTTCCAGTGTGATTCGGTGGTCGGAAGTAACCTCCTTTTTATTCAGTACATCATATTAACTAATTCGATATTACCAAAAACAGAAAAAATAAAGCAAAATAATAAGTACGCCGGATTCAAATGGTTATTTTTCCTTGTAAACCGTGTTTACTAGTATTTATATTCTGTAACATTGATAACTTATCAAGAATGTACTAAATTGACAAACGAATTAATTCAATACCATACTTTAGAC] [+] EMBL SMAA69217 [ ACC ATATATTTGGAATTTTTATTTT GAAAGAAATATGAATAACTCAATACTAATTACACTAATTATAATACTAATTTATTCTCAAATAATTAATGCAGGCGTTGACTTTAAAAAACGTCGACAAATGGATGGTGTTGGTTTGCGTACCAAAATGAATCATTTTAAGAGTTATGATGAGAT ] [+] EMBL AI438709 [ nATATTTGGAATTTTTATTTT GAAAGAAATATGAGTAACTCAATACTAATTACGCTAATTATAATACTAATTTTTTCTCAAATAATTTATGCGGGCGTTGGCTTTAAAAACCGTC ] [+] EMBL AI618786 [ TTTTATTTTCGGAAGAAATATGAATAACTCAATACTAATTACACTAATTATAATACTAATTTATTCTCAAATAATTAATGCAGGCGTTGACTTTAAAAAACGTCGACAAATGGATGGTGTTGGTTTGCGTACCAAAATGAATCATTTTAAGAGTTATGATGAGATTCTCCAACATCCTTTTGATTTTCATTTACACGGAATAGACTCGAAAATCTTTGATGAGTTCCTAAAATATATTATTGACGGGTTTCTGGATTT ] [+] EMBL CD061989 [ TAATTACACTAATTATAATACTAATTTATTCTCAAATAATTAATGCAGGCGTTGACTTTAAAAAACGTCGACAAATGGATGGTGTTGGTTTGCGTACCAAAATGAATCATTTTAAGAGTTATGATGAGATTCTCCAACATCCTTTTGATTTTCATTTACACGGAATAGACTCGAAAATCTTTGATGAGTTCCTAAAATATATTATTGACGGGTTTCTGGATTTCGACAAATGGTTTGAAGTTATCATATAACAGTTCCAGTGTGATTCGGTGGTCGGAAGTAACCTCCTTTTTATTCAGTACATCATATTAACTAATTCGATATTACCAAAAACAGAAAAAATAA ] [+] EMBL CD061566 [ GACAAATGG TTG AGTTATCATATAACAG TCCAGTGTGATTCGGTGGTCGGAAGTAACCTCCTTTTTATTCAGTACATCATATTAACTAATTCGATATTACCAAAAACAGAAAAAATAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||