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Schistosoma mansoni
cluster # 8699 cluster # 8699       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8699#0 length = 609 sequences # 7  

consensusID : consensus_8699#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 609
fasta sequence
                              [TCAAACTCAGTTCGCATAACAATTGGATTGATTACCACTTTATTAGTGGGTTATTTGTCTGATCGATATGGTCGTCGAGCAGCGTTTGGAATTTTATTAATCGGTGAAATTTTGCATGTTGGTATAACTGGTCTTATTGTGTTGTTGAAGCTGAATTTGTGGCTGATTTTAATCCCCGGACTTTTGGAAGCGATTTTTGGTGGTGGTCTTTTGTCACTCTTTGCTCAGGTTGCCACTATCCAAGTAGACGTTTGTCATCTATCCAAGATGCATTCAAAGGAAAAAACAGATGG-AAAAAATGTAAAGTCCTCTGATAAACAAATGTGGATATTATTTACAATTTTTGACGGAATAGCTGCATTATGTGTATCAGCAGGATCACCGATTGGAGGAGCTTTAATCTACCACTATGGATTTCAAGTAGCCATGTTCACATCATTAGGTTTACTCGTTCCAAGCTTAATTTTAATATTCTGTTTACCCGAGACGCATAAAAACAGAAGGAAAATAATGGCTGTACCGGACAAACAGCCTATTGATGAAGAAAAGAATGATGATCCAAATGATGATACTCGTAGCATTCAAA-GGAATTTGAAAGACGCGTGAGCC]

[+] EMBL CD191690             [TCAAACTCAGTTCGCATAACAATTGGATTGATTACCACTTTATTAGTGGGTTATTTGTCTGATCGATATGGTCGTCGAGCAGCGTTTGGAATTTTATTAATCGGTGAAATTTTGCATGTTGGTATAACTGGTCTTATTGTGTTGTTGAAGCTGAATTTGTGGCTGATTTTAATCCCCGGACTTTTGGAAGCGATTTTTGGTGGTGGTCTTTTGTCACTCTTTGCTCAGGTTGCCACTATCCAAGTAGACGTTTGTCATCTATCCAAGATGCATTCAAAGGAAAAAACAGATGG AAAAAATGTAAAGTCCTCTGATAAACAAATGTGGATATTATTTACAATTTTTGACGGAATAGCTGCATTATGTGTATCAGCAGGATCACCGATTGGAGGAGCTTTAATCTACCACTATGGATTTCAAGTAGCCATGTTCACATCATTAGGTTTACTCGTTCCAAGCTTAATTNTAATATTCTGTTTACCCGAGACGCATAAAAACAGAAGGAAAAATATGGCTGTACCGGAC AACAGC                                                                              ]
[+] EMBL CD065518             [                                                                                                                                                                                                 TTTTCGGTGGTGGTC TTTGTCACTCTTTGCTCAGGTTGCCACTATCCAAGTAGACGTTTGTCATCTATCCAAGATGCATTCAAAGGAAAAAACAGATGGAAAAAAATGTAAAGTCCTCTGATAAACAAATGTGGATATTATTTACAATTTTTGACGGAATAGCTGCATTATGTGTATCAGCAGGATCACCGATTGGAGGAGCTTTAATCTACCACTATGGATTTCAAGTAGCCATGTTCACATCATTAGGTTTACTCGTTCCAAGCTTAATTTTAATATTCTGTTTACCCGAGACGCATAAAAACAGAAGGAAAATAATGGCTGTACCGGACAAACAGCCTATTGATGAAGAAAAGACTGATGATCCAAATGATGATACTCGTAGCATTCAAA                        ]
[-] EMBL CD065756             [                                                                                                                                                                                                  TTTTGGTGGTGGTCTTTTGTCACTCTTTGCTCAGGTTGCCACTATCCAAGTAGACGTTTGTCATCTATCCAAGATGCATTCAAAGGAAAAAACAGATGG AAAAAATGTAAAGTCCTCTGATAAACAAATGTGGATATTATTTACAATTTTTGACGGAATAGCTGCATTATGTGTATCAGCAGGATCACCGATTGGAGGAGCTTTAATCTACCACTATGGATTTCAAGTAGCCATATTCACATCATTAGGTTTACTCGTTCCAAGCTTAATTTTAATATTCTGTTTACCCGAGACGCATAAAAACAGAAGGAAAATAATGGCTGTACCGGACAAACAGCCTATTGATGAAGAAAAGAATGATGATCCAAATGATGATACTCGTAGCATTCAAATGGAATTTGAAAGACG        ]
[-] EMBL CD065489             [                                                                                                                                                                                                   TTTGGTGGTGGTCTTTTGTCACTCTTTGCTCAGGTTGCCACTATCCAAGTAGACGTTTGTCATCTATCCAAGATGCATTCAAAGGAAAAAACAGATGG AAAAAATGTAAAGTCCTCTGATAAACAAATGTGGATATTATTTACAATTTTTGACGGAATAGCTGCATTATGTGTATCAGCAGGATCACCGATTGGAGGAGCTTTAATCTACCACTATGGATTTCAAGTAGCCATGTTCACATCATTAGGTTTACTCGTTCCAAGCTTAATTTTAATATTCTGTTTACCCGAGACGCATAAAAACAGAAGGAAAATAATGGCTGTACCGGACAAACAGCCTATTGATGAAGAAAAGAATGATGATCCAAATGATGATACTCGTAGCATTCAAT GGAATTTGAAAGTTCCGTGAGCC]
[-] EMBL CD128277             [                                                                                                                                                                                                   TTTGGTGGTGGTCTTTTGTCACTCTTTGCTCAGGTTGCCACTATCCAAGTAGACGTTTGTCATCTATCCAAGATGCATTCAAAGGAAAAAACAGATGG AAAAAATGTAAAGTCCTCTGATAAACAAATGTGGATATTATTTACAATTTTTGACGGAATAGCTGCATTATGTGTATCAGCAGGATCACCGATTGGAGGAGCTTTAATCTACCACTATGGATTTCAAGTAGCCATGTTCACATCATTAGGTTTACTCGTTCCAAGCTTAATTTTAATATTCTGTTTACCCGAGACGCATAAAAACAGAAGGAAAATAATGGCTGTACCGGAC AACAGCCTATTGATGAAGAAAAGAATGATGATCCAAATGATGATACTCGTAGCATTCAA                         ]
[+] EMBL CD128482             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CGAGACGCATAAAAAC GAAGGAAAATAATGGCTGTACCGGACAAACAGCCTATTGATGAAGAAAAGAATGATGATCCAAATGATGATACTCGTAGCATTCAAA                        ]
[-] EMBL CD128459             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AATACAGAAGGAAAATAATGGCTGTACCGGACAAACAGCCTATTGATGAAGAAAAGAATGATGATCCAAATGATGATACTCGTAGCATTCAAAt                       ]


>consensus_8699#0 TCAAACTCAGTTCGCATAACAATTGGATTGATTACCACTTTATTAGTGGGTTATTTGTCT GATCGATATGGTCGTCGAGCAGCGTTTGGAATTTTATTAATCGGTGAAATTTTGCATGTT GGTATAACTGGTCTTATTGTGTTGTTGAAGCTGAATTTGTGGCTGATTTTAATCCCCGGA CTTTTGGAAGCGATTTTTGGTGGTGGTCTTTTGTCACTCTTTGCTCAGGTTGCCACTATC CAAGTAGACGTTTGTCATCTATCCAAGATGCATTCAAAGGAAAAAACAGATGGAAAAAAT GTAAAGTCCTCTGATAAACAAATGTGGATATTATTTACAATTTTTGACGGAATAGCTGCA TTATGTGTATCAGCAGGATCACCGATTGGAGGAGCTTTAATCTACCACTATGGATTTCAA GTAGCCATGTTCACATCATTAGGTTTACTCGTTCCAAGCTTAATTTTAATATTCTGTTTA CCCGAGACGCATAAAAACAGAAGGAAAATAATGGCTGTACCGGACAAACAGCCTATTGAT GAAGAAAAGAATGATGATCCAAATGATGATACTCGTAGCATTCAAAGGAATTTGAAAGAC GCGTGAGCC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)