These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8699#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 609 fasta sequence [TCAAACTCAGTTCGCATAACAATTGGATTGATTACCACTTTATTAGTGGGTTATTTGTCTGATCGATATGGTCGTCGAGCAGCGTTTGGAATTTTATTAATCGGTGAAATTTTGCATGTTGGTATAACTGGTCTTATTGTGTTGTTGAAGCTGAATTTGTGGCTGATTTTAATCCCCGGACTTTTGGAAGCGATTTTTGGTGGTGGTCTTTTGTCACTCTTTGCTCAGGTTGCCACTATCCAAGTAGACGTTTGTCATCTATCCAAGATGCATTCAAAGGAAAAAACAGATGG-AAAAAATGTAAAGTCCTCTGATAAACAAATGTGGATATTATTTACAATTTTTGACGGAATAGCTGCATTATGTGTATCAGCAGGATCACCGATTGGAGGAGCTTTAATCTACCACTATGGATTTCAAGTAGCCATGTTCACATCATTAGGTTTACTCGTTCCAAGCTTAATTTTAATATTCTGTTTACCCGAGACGCATAAAAACAGAAGGAAAATAATGGCTGTACCGGACAAACAGCCTATTGATGAAGAAAAGAATGATGATCCAAATGATGATACTCGTAGCATTCAAA-GGAATTTGAAAGACGCGTGAGCC] [+] EMBL CD191690 [TCAAACTCAGTTCGCATAACAATTGGATTGATTACCACTTTATTAGTGGGTTATTTGTCTGATCGATATGGTCGTCGAGCAGCGTTTGGAATTTTATTAATCGGTGAAATTTTGCATGTTGGTATAACTGGTCTTATTGTGTTGTTGAAGCTGAATTTGTGGCTGATTTTAATCCCCGGACTTTTGGAAGCGATTTTTGGTGGTGGTCTTTTGTCACTCTTTGCTCAGGTTGCCACTATCCAAGTAGACGTTTGTCATCTATCCAAGATGCATTCAAAGGAAAAAACAGATGG AAAAAATGTAAAGTCCTCTGATAAACAAATGTGGATATTATTTACAATTTTTGACGGAATAGCTGCATTATGTGTATCAGCAGGATCACCGATTGGAGGAGCTTTAATCTACCACTATGGATTTCAAGTAGCCATGTTCACATCATTAGGTTTACTCGTTCCAAGCTTAATTNTAATATTCTGTTTACCCGAGACGCATAAAAACAGAAGGAAAAATATGGCTGTACCGGAC AACAGC ] [+] EMBL CD065518 [ TTTTCGGTGGTGGTC TTTGTCACTCTTTGCTCAGGTTGCCACTATCCAAGTAGACGTTTGTCATCTATCCAAGATGCATTCAAAGGAAAAAACAGATGGAAAAAAATGTAAAGTCCTCTGATAAACAAATGTGGATATTATTTACAATTTTTGACGGAATAGCTGCATTATGTGTATCAGCAGGATCACCGATTGGAGGAGCTTTAATCTACCACTATGGATTTCAAGTAGCCATGTTCACATCATTAGGTTTACTCGTTCCAAGCTTAATTTTAATATTCTGTTTACCCGAGACGCATAAAAACAGAAGGAAAATAATGGCTGTACCGGACAAACAGCCTATTGATGAAGAAAAGACTGATGATCCAAATGATGATACTCGTAGCATTCAAA ] [-] EMBL CD065756 [ TTTTGGTGGTGGTCTTTTGTCACTCTTTGCTCAGGTTGCCACTATCCAAGTAGACGTTTGTCATCTATCCAAGATGCATTCAAAGGAAAAAACAGATGG AAAAAATGTAAAGTCCTCTGATAAACAAATGTGGATATTATTTACAATTTTTGACGGAATAGCTGCATTATGTGTATCAGCAGGATCACCGATTGGAGGAGCTTTAATCTACCACTATGGATTTCAAGTAGCCATATTCACATCATTAGGTTTACTCGTTCCAAGCTTAATTTTAATATTCTGTTTACCCGAGACGCATAAAAACAGAAGGAAAATAATGGCTGTACCGGACAAACAGCCTATTGATGAAGAAAAGAATGATGATCCAAATGATGATACTCGTAGCATTCAAATGGAATTTGAAAGACG ] [-] EMBL CD065489 [ TTTGGTGGTGGTCTTTTGTCACTCTTTGCTCAGGTTGCCACTATCCAAGTAGACGTTTGTCATCTATCCAAGATGCATTCAAAGGAAAAAACAGATGG AAAAAATGTAAAGTCCTCTGATAAACAAATGTGGATATTATTTACAATTTTTGACGGAATAGCTGCATTATGTGTATCAGCAGGATCACCGATTGGAGGAGCTTTAATCTACCACTATGGATTTCAAGTAGCCATGTTCACATCATTAGGTTTACTCGTTCCAAGCTTAATTTTAATATTCTGTTTACCCGAGACGCATAAAAACAGAAGGAAAATAATGGCTGTACCGGACAAACAGCCTATTGATGAAGAAAAGAATGATGATCCAAATGATGATACTCGTAGCATTCAAT GGAATTTGAAAGTTCCGTGAGCC] [-] EMBL CD128277 [ TTTGGTGGTGGTCTTTTGTCACTCTTTGCTCAGGTTGCCACTATCCAAGTAGACGTTTGTCATCTATCCAAGATGCATTCAAAGGAAAAAACAGATGG AAAAAATGTAAAGTCCTCTGATAAACAAATGTGGATATTATTTACAATTTTTGACGGAATAGCTGCATTATGTGTATCAGCAGGATCACCGATTGGAGGAGCTTTAATCTACCACTATGGATTTCAAGTAGCCATGTTCACATCATTAGGTTTACTCGTTCCAAGCTTAATTTTAATATTCTGTTTACCCGAGACGCATAAAAACAGAAGGAAAATAATGGCTGTACCGGAC AACAGCCTATTGATGAAGAAAAGAATGATGATCCAAATGATGATACTCGTAGCATTCAA ] [+] EMBL CD128482 [ CGAGACGCATAAAAAC GAAGGAAAATAATGGCTGTACCGGACAAACAGCCTATTGATGAAGAAAAGAATGATGATCCAAATGATGATACTCGTAGCATTCAAA ] [-] EMBL CD128459 [ AATACAGAAGGAAAATAATGGCTGTACCGGACAAACAGCCTATTGATGAAGAAAAGAATGATGATCCAAATGATGATACTCGTAGCATTCAAAt ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||