cluster # 8700

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Schistosoma mansoni
cluster # 8700 cluster # 8700 Sequences # 7 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_8700#0 length = 432 sequences # 7

consensusID : consensus_8700#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 432
fasta sequence

                              [TAACATCA-GAATTCATTCTAAGATATTAAAAAATTATTTATTTCCTTTCTTCTTTTATCATCAGTTAATCTCTTTTTAAGTGAAAGTATGTAGATTAATGCAGTGATAGAGAATATGGTTTCAAATTACAAATTATTGACAGTTTGGATATTGTTCATAACTTTATGTAGAAGCGGAGGGGGGAGGGCAGCGGCAGGTTATCTATTTCCTCTGATTCAACAGTTTGTATATATGATTGGATTGATAAGATTTATAATTGACAGAAATGCATAGTTGTTAAACTCATGAAACAATTAAAGTTAGACCATCATCTTCAGTAGTGTACATTCACGATCCCGCCCCGCAAGATTCGAACCGAGGACCTTCAGTCTGGCACGCGAATGCTTAATCTCTAAGAGTCCCATACCAGGACAAGACATCCATATGCTGCTT]

[+] EMBL CD064955             [TAACATCA GAATTCATTCTAAGATATTAAAAAATTATTTATTTCCTTTCTTCTTTTATCATCAGTTAATCTCTTTTTAAGTGAAAGTATGTAGATTAATGCAGTGATAGAGAATATGGTTTCAAATTACAAATTATTGACAGTTTGGATATTGTTCATAACTTTATGTAGAAGCGGAGGGGGGAGGGCAGCGGCAGGTTATCTATTTCCTCTGATTCAACAGTTTGTATATATGATTGGATTGATAAGATTTATAATTGACAGAAATGCATAGTTGTTAAACTCATGAAACAATTAAAGTTAGACCATCATCTTCAGTAGTGTACATTCACGATCCCGCCCCGCACGATTCGAACCGAGGACCTTCAGTCTGGCACGCGAATGCTTAACCTCTAAGAGTCCCATACCAGGACAAGACATCCATATGCTGCT ]
[+] EMBL CD064925             [TAACATCA GAATTCATTCTAAGATATTAAAAAATTATTTATTTCCTTTCTTCTTTTATCATCAGTTAATCTCTTTTTAAGTGAAAGTATGTAGATTAATGCAGTGATAGAGAATATGGTTTCAAATTACAAATTATTGACAGTTTGGATATTGTTCATAACTTTATGTAGAAGCGGAGGGGGGAGGGCAGCGGCAGGTTATCTATTTCCTCTGATTCAACAGTTTGTATATATGATTGGATTGATAAGATTTATAATTGACAGAAATGCATAGTTGTTAAACTCATGAAACAATTAAAGTTAGACCATCATCTTCAGTAGTGTACATTCACGATCCCGCCCCGCACGATTCGAACCGAGGACCTTCAGTCTGGCACGCGAATGCTTAACCTCTAAGAGTCCCATACCAGGACAAGACATCCATATGCTGCT ]
[+] EMBL CD064931             [TAACATCA GAATTCATTCTAAGATATTAAAAAATTATTTATTTCCTTTCTTCTTTTATCATCAGTTAATCTCTTTTTAAGTGAAAGTATGTAGATTAATGCAGTGATAGAGAATATGGTTTCAAATTACAAATTATTGACAGTTTGGATATTGTTCATAACTTTATGTAGAAGCGGAGGGGGGAGGGCAGCGGCAGGTTATCTATTTCCTCTGATTCAACAGTTTGTATATATGATTGGATTGATAAGATTTATAATTGACAGAAATGCATAGTTGTTAAACTCATGAAACAATTAAAGTTAGACCATCATCTTCAGTAGTGTACATTCACGATCCCGCCCCGCAAGATTCGAACCGAGGACCTTCAGTCTGGCACGCGAATGCTTAATCTCTAAGAGTCCCATACCAGGACAAGACATCCATATGCTGCT ]
[+] EMBL CD065115             [TAACATCACGAATTCATTCTAAGATATTAAAAAATTATTTATTTCCTTTCTTCTTCTATCATCAGTTAATCTCTTTTTAAGAGGAAGTATGTACATTAATGCAGCGATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD064986             [ AACATCA GAATTCATTCTAAGATATTAAAAAATTATTTATTTCCTTTCTTCTTTTATCATCAGTTAATCTCTTTTTAAGTGAAAGTATGTAGATTAATGCAGTGATAGAGAATATGGTTTCAAATTACAAATTATTGACAGTTTGGATATTGTTCATAACTTTATGTAGAAGCGGAGGGGGGAGGGCAGCGGCAGGTTATCTATTTCCTCTGATTCAACAGTTTGTATATATGATTGGATTGATAAGATTTATAATTGACAGAAATGCATAGTTGTTAAACTCATGAAACAATTAAAGTTAGACCATCATCTTCAGTAGTGTACATTCACGATCCCGCCCCGCAAGATTCGAACCGAGGACCTTCAGTCTGGCACGCGAATGCTTAATCTCTAAGAGTCCCATACCAGGACAAGACATCCATATGCTGCTT]
[-] EMBL CD064974             [ AACATCA GAATTCATTCTAAGATATTAAAAAATTATTTATTTCCTTTCTTCTTTTATCATCAGTTAATCTCTTTTTAAGTGAAAGTATGTAGATTAATGCAGTGATAGAGAATATGGTTTCAAATTACAAATTATTGACAGTTTGGATATTGTTCATAACTTTATGTAGAAGCGGAGGGGGGAGGGCAGCGGCAGGTTATCTATTTCCTCTGATTCAACAGTTTGTATATATGATTGGATTGATAAGATTTATAATTGACAGAAATGCATAGTTGTTAAACTCATGAAACAATTAAAGTTAGACCATCATCTTCAGTAGTGTACATTCACGATCCCGCCCCGCAAGATTCGAACCGAGGACCTTCAGTCTGGCACGCGAATGCTTAATCTCTAAGAGTCCCATACCAGGACAAGACATCCATATGCTGCTT]
[-] EMBL CD064939             [                                                                                                                                                                                                              TTCCTCTGATTCAACAGTTTGTATATATGATTGGATTGATAAGATTTATAATTGACAGAAATGCATAGTTGTTAAACTCATGAAACAATTAAAGTTAGACCATCATCTTCAGTAGTGTACATTCACGATCCCGCCCCGCAAGATTCGAACCGAGGACCTTCAGTCTGGCACGCGAATGCTTAATCTCTAAGAGTCCCATACCAGGACAAGACATCCATATGCTGCTT]




>consensus_8700#0
TAACATCAGAATTCATTCTAAGATATTAAAAAATTATTTATTTCCTTTCTTCTTTTATCA
TCAGTTAATCTCTTTTTAAGTGAAAGTATGTAGATTAATGCAGTGATAGAGAATATGGTT
TCAAATTACAAATTATTGACAGTTTGGATATTGTTCATAACTTTATGTAGAAGCGGAGGG
GGGAGGGCAGCGGCAGGTTATCTATTTCCTCTGATTCAACAGTTTGTATATATGATTGGA
TTGATAAGATTTATAATTGACAGAAATGCATAGTTGTTAAACTCATGAAACAATTAAAGT
TAGACCATCATCTTCAGTAGTGTACATTCACGATCCCGCCCCGCAAGATTCGAACCGAGG
ACCTTCAGTCTGGCACGCGAATGCTTAATCTCTAAGAGTCCCATACCAGGACAAGACATC
CATATGCTGCTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case