These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8700#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 432 fasta sequence [TAACATCA-GAATTCATTCTAAGATATTAAAAAATTATTTATTTCCTTTCTTCTTTTATCATCAGTTAATCTCTTTTTAAGTGAAAGTATGTAGATTAATGCAGTGATAGAGAATATGGTTTCAAATTACAAATTATTGACAGTTTGGATATTGTTCATAACTTTATGTAGAAGCGGAGGGGGGAGGGCAGCGGCAGGTTATCTATTTCCTCTGATTCAACAGTTTGTATATATGATTGGATTGATAAGATTTATAATTGACAGAAATGCATAGTTGTTAAACTCATGAAACAATTAAAGTTAGACCATCATCTTCAGTAGTGTACATTCACGATCCCGCCCCGCAAGATTCGAACCGAGGACCTTCAGTCTGGCACGCGAATGCTTAATCTCTAAGAGTCCCATACCAGGACAAGACATCCATATGCTGCTT] [+] EMBL CD064955 [TAACATCA GAATTCATTCTAAGATATTAAAAAATTATTTATTTCCTTTCTTCTTTTATCATCAGTTAATCTCTTTTTAAGTGAAAGTATGTAGATTAATGCAGTGATAGAGAATATGGTTTCAAATTACAAATTATTGACAGTTTGGATATTGTTCATAACTTTATGTAGAAGCGGAGGGGGGAGGGCAGCGGCAGGTTATCTATTTCCTCTGATTCAACAGTTTGTATATATGATTGGATTGATAAGATTTATAATTGACAGAAATGCATAGTTGTTAAACTCATGAAACAATTAAAGTTAGACCATCATCTTCAGTAGTGTACATTCACGATCCCGCCCCGCACGATTCGAACCGAGGACCTTCAGTCTGGCACGCGAATGCTTAACCTCTAAGAGTCCCATACCAGGACAAGACATCCATATGCTGCT ] [+] EMBL CD064925 [TAACATCA GAATTCATTCTAAGATATTAAAAAATTATTTATTTCCTTTCTTCTTTTATCATCAGTTAATCTCTTTTTAAGTGAAAGTATGTAGATTAATGCAGTGATAGAGAATATGGTTTCAAATTACAAATTATTGACAGTTTGGATATTGTTCATAACTTTATGTAGAAGCGGAGGGGGGAGGGCAGCGGCAGGTTATCTATTTCCTCTGATTCAACAGTTTGTATATATGATTGGATTGATAAGATTTATAATTGACAGAAATGCATAGTTGTTAAACTCATGAAACAATTAAAGTTAGACCATCATCTTCAGTAGTGTACATTCACGATCCCGCCCCGCACGATTCGAACCGAGGACCTTCAGTCTGGCACGCGAATGCTTAACCTCTAAGAGTCCCATACCAGGACAAGACATCCATATGCTGCT ] [+] EMBL CD064931 [TAACATCA GAATTCATTCTAAGATATTAAAAAATTATTTATTTCCTTTCTTCTTTTATCATCAGTTAATCTCTTTTTAAGTGAAAGTATGTAGATTAATGCAGTGATAGAGAATATGGTTTCAAATTACAAATTATTGACAGTTTGGATATTGTTCATAACTTTATGTAGAAGCGGAGGGGGGAGGGCAGCGGCAGGTTATCTATTTCCTCTGATTCAACAGTTTGTATATATGATTGGATTGATAAGATTTATAATTGACAGAAATGCATAGTTGTTAAACTCATGAAACAATTAAAGTTAGACCATCATCTTCAGTAGTGTACATTCACGATCCCGCCCCGCAAGATTCGAACCGAGGACCTTCAGTCTGGCACGCGAATGCTTAATCTCTAAGAGTCCCATACCAGGACAAGACATCCATATGCTGCT ] [+] EMBL CD065115 [TAACATCACGAATTCATTCTAAGATATTAAAAAATTATTTATTTCCTTTCTTCTTCTATCATCAGTTAATCTCTTTTTAAGAGGAAGTATGTACATTAATGCAGCGATA ] [-] EMBL CD064986 [ AACATCA GAATTCATTCTAAGATATTAAAAAATTATTTATTTCCTTTCTTCTTTTATCATCAGTTAATCTCTTTTTAAGTGAAAGTATGTAGATTAATGCAGTGATAGAGAATATGGTTTCAAATTACAAATTATTGACAGTTTGGATATTGTTCATAACTTTATGTAGAAGCGGAGGGGGGAGGGCAGCGGCAGGTTATCTATTTCCTCTGATTCAACAGTTTGTATATATGATTGGATTGATAAGATTTATAATTGACAGAAATGCATAGTTGTTAAACTCATGAAACAATTAAAGTTAGACCATCATCTTCAGTAGTGTACATTCACGATCCCGCCCCGCAAGATTCGAACCGAGGACCTTCAGTCTGGCACGCGAATGCTTAATCTCTAAGAGTCCCATACCAGGACAAGACATCCATATGCTGCTT] [-] EMBL CD064974 [ AACATCA GAATTCATTCTAAGATATTAAAAAATTATTTATTTCCTTTCTTCTTTTATCATCAGTTAATCTCTTTTTAAGTGAAAGTATGTAGATTAATGCAGTGATAGAGAATATGGTTTCAAATTACAAATTATTGACAGTTTGGATATTGTTCATAACTTTATGTAGAAGCGGAGGGGGGAGGGCAGCGGCAGGTTATCTATTTCCTCTGATTCAACAGTTTGTATATATGATTGGATTGATAAGATTTATAATTGACAGAAATGCATAGTTGTTAAACTCATGAAACAATTAAAGTTAGACCATCATCTTCAGTAGTGTACATTCACGATCCCGCCCCGCAAGATTCGAACCGAGGACCTTCAGTCTGGCACGCGAATGCTTAATCTCTAAGAGTCCCATACCAGGACAAGACATCCATATGCTGCTT] [-] EMBL CD064939 [ TTCCTCTGATTCAACAGTTTGTATATATGATTGGATTGATAAGATTTATAATTGACAGAAATGCATAGTTGTTAAACTCATGAAACAATTAAAGTTAGACCATCATCTTCAGTAGTGTACATTCACGATCCCGCCCCGCAAGATTCGAACCGAGGACCTTCAGTCTGGCACGCGAATGCTTAATCTCTAAGAGTCCCATACCAGGACAAGACATCCATATGCTGCTT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||