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Schistosoma mansoni
cluster # 8701 cluster # 8701       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8701#0 length = 1371 sequences # 7  

consensusID : consensus_8701#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1371
fasta sequence
                              [ATTGATTTATTGTACTTCAAAAATTCAAATGTTTTCTCATTTACAATAATAGGGAAGACTTTTTTAATTGGGATATACAGGAAATTATACAAAGCCAAAACTTTTTGTTCCAATCGCCTGTAACAGTTTGTCACGCAATATGTGCCTTGATGAATATAGTGGTAAGTAGAGACGTGAAATACAAGTGTTAGCAGATGGAAGATGATGGTCGTCGGGTGGCTTAATTGTGATTGAAGGCATAGGCTGAAATCCTTGAGCACTGGCAGGGAGAGTTGGACTTGATGTCCAGAAGTACAATAAATCTTGACGTTGCTTCATATCCATACTGCGAACGGTACACCAAAACCACTTTTTCAAGCGATTTACCAAATTCGTGTTATCACAGCTTTTGGTCACATCTATATTTGATCCTGTACCTGTTTCGTCTACGAAAGTTGTATATCCAGATAGCACATCAACATCTATATCTCCAGTTCCGTTTAAAAGTAAACGCAAATCTTCAGCAGTTAGCCCATCCAAAGCATTTCGAGGTAGAACATCAAACACACCTTGTCGGAGTTGCTCCAGTGGTTCCTGAACTGCTATTTTCATTTTGAATTCTGTGTACTTTTTGACAAATTCAAATACATTACTTTCATTAACCTCAACTTCATCTCCACCGGGGACCAAAGCATACAAATAGTCATTTGGTTGACGAACCGCATCTGTGGTTGACAGACCGCCTTCTTCCAGGGCAGGAATAAGTGAGAAGGTTAGGTTGTAA-TCTTCTATGCTTCCCTGAGACTTTGAAAAGTCTTCAGATGTATGCAAAAGTAACTGACGCAACCCCTCAAAAGTAGTGGGGTCGTAAAAAGCAAAATCGTGCCAGTGAACCACGCGACCTAAGATGTATTTAAGTATAGGTCGACTGAAGTGCAAGGGACATGTCTCATTTGTCAGCAAACACAAACCAATTACACGGCCGATACCTCTGTAAATAGAGTAGCGTGCAGCTAATTTAACTGAGTCACATGTTTGATTTGAAGGTAAGTTTATTCCGGGAACGGCTCGTGGGAAATAGTAACCCTGTAAACCAGGTTGCCAGAAAAGAGGGACACGCTCAACATCCTCTGTAATTATTAACTCTGCAATTGTATTTAGTGATGAAGAGATATGTGATTGTTGGTTGACAGACGTA-GAACCTGCAACAGTTAAAGCCACACCTTGCCAATTAACCAAGCGTTCAAGAACAGGATGATTTAAACCAACTGAAGGTGTCCGCGGACGCTCGACTCGGTTCTGCTCATTTGTATCCGACATTGTTATTAAGGCTCGTGCTTCATCAACACGATAACATAAAGCTTCTTCATTTGTTAATAAAA-CTGGGTCCTC]

[+] EMBL CD075789             [ATTGATTTATTGTACTTCAAAAATTCAAATGTTTTCTCATTTACAATAATAGGGAAGACTTTTTTAATTGGGATATACAGGAAATTATACAAAGCCAAAACTTTTTGTTCCAATCGCCTGTAACAGTTTGTCACGCAATATGTGCCTTGATGAATATAGTGGTAAGTAGAGACGTGAAATACAAGTGTTAGCAGATGGAAGATGATGGTCGTCGGGTGGCTTAATTGTGATTGAAGGCATAGGCTGAAATCCTTGAGCACTGGCAGGGAGAGTTGGACTTGATGTCCAGAAGTACAATAAATCTTGACGTTGCTTCATATCCATACTGCGAACGGTACACCAAAACCACTTTTTCAAGCGATTTACCAAATTCGTGTTATCACAGCTTTTGGTCACATCTATATTTGATCCTGTACCTGTTTCGTCTACGAAAGTTGTATATCCAGATAGCACATCAACATCTATATCTCCAGTTCCGTTTAAAAGTAAACGCAAATCTTCAGCAGTTAGCCCATCCAAAGCATTTCGAGGTAGAACATCAAACACACCTTGTCGGAGTTGCTCCAGTGGTTCCTGAACTGCTATTTTCATTTTGAATTCTGTGTACTTTTTGACAAA TCAAATACATTACTTTCATTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD076677             [ATTGATTTATTGTACTTCAAAAATTCAAATGTTTTCTCATTTACAATAATAGGGAAGACTTTTTTAATTGGGATATACAGGAAATTATACAAAGCCAAAACTTTTTGTTCCAATCGCCTGTAACAGTTTGTCACGCAATATGTGCCTTGATGAATATAGTGGTAAGTAAAGACGTGAAATACAAGTGTTAGCAAATGGAAAATGATGGTCGTCGGGTGGCTTAATTGTGATTGAAGGCATAGGCTGAAATCCTTGAGCACTGGCAGGGAAAGTTGGACTTGATGTCCAAAAGTACAATAAATCTTGACGTTGCTTCATATCCATACTGGGAACGGGACACCAAAACCACTTTTTCAAGCGATTTACCAAATTCGTGTTATCACAGCTTTTGGTCACATCTATATTTGATCCTGTACCTGTTTCGTCTACGAAAGTTGTATATCCAGATAGCACATCAACATCTATATCTCCAGTTCCGTTTAAAAGTAAACGCAAATCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD157470             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TATATCCAGATAGCACATCAACATCTATATCTCCAGTTCCGTTTAAAAGTAAACGCAAATCTTCAGCAGTTAGCCCATCCAAAGCATTTCGAGGTAGAACATCAAACACACCTTGTCGGAGTTGCTCCAGTGGTTCCTGAACTGCTATTTTCATTTTGAATTCTGTGTACTTTTTGACAAATTCAAATACATTACTTTCATTAACCTCAACTTCATCTCCACCGGGGACCAAAGCATACAAATAGTCATTTGGTTGACGAACCGCATCTGTGGTTGACAGACCGCCTTCTTCCAGGGCAGGAATTAGTGAGAAGGTTAGGTTGTAA TCTTCTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD083103             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCATTTTGAATTCTGTGTACTTTNTGACAAATTCAAATACATTACTTTCATTAACCTCAACTTCATCTCCACCGGGGACCAAAGCATACAAATAGTCATTTGGTTGACGAACCGCATCTGTGGTTGACAGACCGCCTTCTTCCAGGGCAGGAATAAGTGAGAAGGTTAGGTTGTAA TCTTCTATGCTTCCCTGAGACTTTGAAAAGTCTTCAGATGTATGCAAAAGTAACTGACGCAACCCCTCAAAAGTAGTGGGGTCGTAAAAAGCAAAATCGTGCCAGTGAACCACGCGACCTAAGATGTATTTAAGTATAGGTCGACTGAAGTGCAAGGGACATGTCTCATTTGTCAGCAAACACAAACCAATTACACGGCCGATACCTCTGTAAATAGAGTAGCGTGCAGCTAATTTAACTGAGTCACATGTTTGATTTGAAGGTAAGTTTATTCCGGGAACGGCTCGTGGGAAATAGTAACCCTGTAAACCAGGTTGCCAGAAAAGAGGGACACGCTCAACATCCTCTGTAATTATTAACTCTGCAATTGTAGTTAGTGATGAAGAGATATGTGATTGTTGGTTGACAGACGTATGAACCTGCnagctt                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD143212             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CATACAAATAGTCATTTGGTTGACGAACCGCATCTGTGGTTGACAGACCGCCTTCTTCCAGGGCAGGAATAAGTGAGAAGGTTAGGTTGTAA TCTTCTATGCTTCCCTGAGACTTTGAAAAGTCTTCAGATGTATGCAAAAGTAACTGACGCAACCCCTCAAAAGTAGTGGGGTCGTAAAAAGCAAAATCGTGCCAGTGAACCACGCGACCTAAGATGTATTTAAGTATAGGTCGACTGAAGTGCAAGGGACATGTCTCATTTGTCAGCAAACACAAACCAATTACACGGCCGATACCTCTGTAAATAGAGTAGCGTGCAGCTAATTTAACTGAGTCACATGTTTGATTTGAAGGTAAGTTTATTCCGNGAAACGCTCGTGn                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD082173             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GGAATAAGTGAGAAGGTTAGG TGTAATTCTTCTATGCTTCCCTGAGACTTTGAANAGTCTTCAGATGTATGCAAAAGTAACTGACGCAACCCCTCAAAAGTAGTGGGGTCGTAAAAAGCAAAATCGTGCCAGTGAACCACGCGACCTAAGATGTATTTAAGTATAGGTCGACTGAAGTGCAAGGGACATGTCTCATTTGTCAGCAAACACAAACCAATTACACGGCCGATACCTCTGTAAATAGAGTAGCGTGCAGCTAATTTAACTGAGTCACATGTTTGATTTGAAGGTAAGTTTATTCCGGGAACGGCTCGTGGGAAATAGTAACCCTGTAAACCAGGTTGCCAGAAAAGAGGGACACGCTCAACATCCTCTGTAATTATTAACTCTGCAATTGTATTTAGTGATGAAGAGATATGTGATTGTTGGTTGACAGACGTA GAACCTGCAACAGTTAAAGCCACACCTTGCCAATTAACCAAGCGTTCAAGAACAGGATGATTTAAACCAACTGAAGGTGTCCGCGGACGCTCGACTCGGTTCTGCTCATTTGTATCCGACATTGTTATTAAGGCTCGTGCTTCATCAACACGATAACATAAAGCTTCTTCATTTGTTAATAAAA CTGGGTCCTC]
[-] EMBL CD194764             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tctGGCTCGTGGGAAATAGTAACCCTGTAAACCAGGTTGCCAGAAAAGGGGGACACGCTCAACATCCTCTGTAATTATTAACTCTGCAATTGTATTTAGTGATGAAGAGATATGTGATTGTTGGTTGACAGACGTA GAACCTGCAACAGTTAAAGCCACACCTTGCCAATTAACCAAGCGTTCAAGAACAGGATGATTTAAACCAACTGAAGGTGTCCGCGGACGCTCGACTCGGTTCTGCTCATTTGTATCCGACATTGTTATTAAGGCTCTTGCTTCATCAACACGATTACATAAAGCTTCTTCATTTGTTAATAAAATCTGAGTg   ]


>consensus_8701#0 ATTGATTTATTGTACTTCAAAAATTCAAATGTTTTCTCATTTACAATAATAGGGAAGACT TTTTTAATTGGGATATACAGGAAATTATACAAAGCCAAAACTTTTTGTTCCAATCGCCTG TAACAGTTTGTCACGCAATATGTGCCTTGATGAATATAGTGGTAAGTAGAGACGTGAAAT ACAAGTGTTAGCAGATGGAAGATGATGGTCGTCGGGTGGCTTAATTGTGATTGAAGGCAT AGGCTGAAATCCTTGAGCACTGGCAGGGAGAGTTGGACTTGATGTCCAGAAGTACAATAA ATCTTGACGTTGCTTCATATCCATACTGCGAACGGTACACCAAAACCACTTTTTCAAGCG ATTTACCAAATTCGTGTTATCACAGCTTTTGGTCACATCTATATTTGATCCTGTACCTGT TTCGTCTACGAAAGTTGTATATCCAGATAGCACATCAACATCTATATCTCCAGTTCCGTT TAAAAGTAAACGCAAATCTTCAGCAGTTAGCCCATCCAAAGCATTTCGAGGTAGAACATC AAACACACCTTGTCGGAGTTGCTCCAGTGGTTCCTGAACTGCTATTTTCATTTTGAATTC TGTGTACTTTTTGACAAATTCAAATACATTACTTTCATTAACCTCAACTTCATCTCCACC GGGGACCAAAGCATACAAATAGTCATTTGGTTGACGAACCGCATCTGTGGTTGACAGACC GCCTTCTTCCAGGGCAGGAATAAGTGAGAAGGTTAGGTTGTAATCTTCTATGCTTCCCTG AGACTTTGAAAAGTCTTCAGATGTATGCAAAAGTAACTGACGCAACCCCTCAAAAGTAGT GGGGTCGTAAAAAGCAAAATCGTGCCAGTGAACCACGCGACCTAAGATGTATTTAAGTAT AGGTCGACTGAAGTGCAAGGGACATGTCTCATTTGTCAGCAAACACAAACCAATTACACG GCCGATACCTCTGTAAATAGAGTAGCGTGCAGCTAATTTAACTGAGTCACATGTTTGATT TGAAGGTAAGTTTATTCCGGGAACGGCTCGTGGGAAATAGTAACCCTGTAAACCAGGTTG CCAGAAAAGAGGGACACGCTCAACATCCTCTGTAATTATTAACTCTGCAATTGTATTTAG TGATGAAGAGATATGTGATTGTTGGTTGACAGACGTAGAACCTGCAACAGTTAAAGCCAC ACCTTGCCAATTAACCAAGCGTTCAAGAACAGGATGATTTAAACCAACTGAAGGTGTCCG CGGACGCTCGACTCGGTTCTGCTCATTTGTATCCGACATTGTTATTAAGGCTCGTGCTTC ATCAACACGATAACATAAAGCTTCTTCATTTGTTAATAAAACTGGGTCCTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)