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Schistosoma mansoni
cluster # 8716 cluster # 8716       Sequences # 7       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8716#0 length = 791 sequences # 7  
consensusID : consensus_8716#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 791
fasta sequence 
                              [TGTCAGGAAAATGTAAAACGATTTGGTTGGCGAGCTAAACTAAAACCAGAATTATTCGTATTGAGGAATTTTCATTTTGATGTTTTAATCGCTGCAGATGGCAAACGCAGTTGTCTAGGTTTCCCATGTAAAGAACTACGATGTCGTTTAGCTATTGCAATTACTGTGAATTTTATCAATTATCATACACCAGCTGAAGCACAAGTAGAAGAGATTAGTGGTGTTGCTCGTATCTTCAATCAATCATTTTTCTCACGTTTAGCCACAGAGACTGGTATTGATTTGGAGAATATTGTTTATTACAAAGATGAAACTCATTATTTTGTTATGACAGCTAAAAAAACTTAGTCTTTTAGAAAAAGGTGTATTGAAACAAGATCGCGATGATTCAGTCAGTTTATTAAGTAAAGATAATGTGGATAAGAAAGCTTTACAAGCGTATGCTAAAGAAACAGCTTCGTATGTAACCAATGGGGCATTGACACGTTTAGATTTTGCATTGAATTCATACGGCGAACCAGATGTAGATATATTTGATTTTACACGAATGTTTGCAGCGGAATATTCATGTAATATATTGGAAAAGAATCGTTGTCTTTTATTACAATGTCTTATTGGTGATGGATTATATGAACCATTTTGGCCTACTGGTAGTGGCTGTGCATTAGGCTTTATGTCTGCACTTGATGCTGCCTGGTCTGTTTCATTACTCGCATCTGGTATGCATCCATTAAAAGTGATTGCACAACGTGAATCAGTTTATCAACATTTAAGTCAAACAAACGGTCAAA]

[+] EMBL CD115078             [TGTCAGGAAAATGTAAAACGATTTGGTTGGCGAGCTAAACTAAAACCAGAATTATTCGTATTGAGGAATTTTCATTTTGATGTTTTAATCGCTGCAGATGGCAAACGCAGTTGTCTAGGTTTCCCATGTAAAGAACTACGATGTCGTTTAGCTATTGCAATTACTGTGAATTTTATCAATTATCATACACCAGCTGAAGCACAAGTAGAAGAGATTAGTGGTGTTGCTCGTATCTTCAATCAATCATTTTTCTCACGTTTAGCCACAGAGACTGGTATTGATTTGGAGAATATTGTTTATTACAAAGATGAAACTCATTATTTTGTTATGACAGCTAAAAAAACTTAGTCTTTTAGAAAAAGGTGTA TGAAACAAGATCGCGATGATTCAGTCAGTTTATTAAGTAAAGATAATGTGGATAAGAAAGCTTTACAAGCGTATGCTAAAGAAACAGCTTCGTATGTAACCAATGGGGCATTGACACGTTTAGATTTTGCATTGAATTCATACGGCGAACCAGATGTAGATATATTTGATTTTACACGAATGTTTGCAGCGGAATATTCATGTAATATATTGGAAAAGAATCGNTGTCTTTTATTACTATGTCTTATTGGTGATGGATTATATGAACCATTTTGGCCTACT                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD114948             [TGTCAGGAAAATGTAAAACGATTTGGTTGGCGAGCTAAACTAAAACCAGAATTATTCGTATTGAGGAATTTTCATTTTGATGTTTTAATCGCTGCAGATGGCAAACGCAGTTGTCTAGGTTTCCCATGTAAAGAACTACGATGTCGTTTAGCTATTGCAATTACTGTGAATTTTATCAATTATCATACACCAGCTGAAGCACAAGTAGAAGAGATTAGTGGTGTTGCTCGTATCTTCAATCAATCATTTTTCTCACGTTTAGCCACAGAGACTGGTATTGATTTGGAGAATATTGCTTATTACAAAGATGAAACTCATTATTTTGTTATGACAGCTAAAAAAACTTAGTCTTTTAGAAAAAGGTGTATTGAAACAAGATCGCGATGATTCAGTCAGTTTATTAAGTAAAGATAATGTGGATAAGAAAGCTTTACAAGCGTATGCTAAAGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD115020             [TGTCAGGAAAATGTAAAACGATTTGGTTGGCGAGCTAAACTAAAACCAGAATTATTCGTATTGAGGAATTTTCACTTTGATGTTTTAATCGCTGCAGATGGCAAACGCAGTTGTCTAGGTTTCCCATGTAAAGAACTACGATGTCGTTTAGCTATTGCAATTACTGTGAATTTTATCAATTATTATACACCAGCTGAAGCACAAGTAGAAGAGATTAGTGGTGTTGCTCGTATCTTCAATCAATCATTTTTCTCACGTTTAGCCACAGAGACTGGTATTGATTTGGAGAATATTGTTTATTACAAAGATGAAACTCATTATTTTGTTATGACAGCTAAAAAAACTTAGTCTTTTAGAAAAAGGTGTATTGAAACAAGATCGCGATGATTCAGTCAGTTTATTAAGTAAAGATAATGTGGATAAGAAAGCTTTACAAGCGTATGCTAAAGAAACAGCTTCGTATGTAACCAATGGGGCATTGACACGTTTAGATTTTGCATTGAATTCATACGGCGAACCAGATGTAGATATATTTGATTNTACACGAATGT                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD115049             [TGTCAGGAAAATGTAAAACGATTTGGTTGGCGAGCTAAACTAAAACCAGAATTATTCGTATTGAGGAATTTTCATTTTGATGTTTTAATCGCTGCAGATGGCAAACGCAGTTGTCTAGGTTTCCCATGTAAAGAACTACGATGTCGTTTGGCTATTGCAATTACTGTGAATTTTATCAATTATCATACACCAGCTGAAGCACAAGTAGAAGAGATTAGTGGTGTTGCTCGTATCTTCAATCAATCATTTTTCTCACGTTTAGCCACAGAGACTGGTATTGATTTGGAGAATATTGTTTATTACAAAGATGAAACTCATTATTTTGTTATGACAGCTAAAAAAACTTAGTCTTCTAGAAAAAGGTGTATTGAAACAAGATCGCGATGATTCAGTCAGTTTATTAAGTAAAGATAATGTGGATAAGAAAGCTTTACAAGCGTATGCTAAAGAAACAGCTTCGTATGTAACCAATGGGGCATTGACACGTTTAGATTTTGCATTGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD157334             [                                  CTAAACTAAAACCAGAATTATTCGTATTGAGGAATTTTCATTTTGATGTTTTAATCGCTGCAGATGGCAAACGCAGTTGTCTAGGTTTCCCATGTAAAGAACTACGATGTCGTTTAGCTATTGCAATTACTGTGAATTTTATCAATTATCATACACCAGCTGAAGCACAAGTAGAAGAGATTAGTGGTGTTGCTCGTATCTTCAATCAATCATTTTTCTCACGTTTAGCCACAGAGACTGGTATTGATTTGGAGAATATTGTTTATTACAAAGATGAAACTCATTATTTTGTTATGACAGCT AAAAAACATAGTCTTTTAGAAAAAGGTGTATTGAAACAAGATCGAGATGATTCAGTCAGTTTATTAAGTAAAGATAATGTGGATAAGAAAGCTTTACAAGCGTATGCTAAAGAAACAGCTTCGTATGTAACCAATGGGGCATTGACACGTTTAGATTTTGCATTGAATTCATAC                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD115039             [                                                                                                                                                                                                      GCACAAGTAGAAGAGATTAGTGGTGTTGCTCGTATCTTCAATCAATCATTTTTCTCACGTTTAGCCACAGAGACTGGTATTGATTTGGAGAATATTGTTTATTACAAAGATGAAACTCATTATTTTGTTATGACAGCTAAAAAAACTTAGTCTTTTAGAAAAAGGTGTATTGAAACAAGATCGCGATGATTCAGTCAGTTTATTAAGTAAAGATAATGTGGATAAGAAAGCTTTACAAGCGTATGCTAAAGAAACAGCTTCGTATGTAACCAATGGGGCATTGACACGTTTAGATTTTGCATTGAATTCATACGGCGAACCAGATGTAGATATATTTGATTTTACACGAATGTTTGCAGCGGAATATTCATGTAATATATTGGAAAAGAATCGTTGTCTTTTATTACAATGTCTTATTGGTGATGGATTATATGAACCATTTTGGCCTACTGGTAGTGGCTGTGCATTAGGCTTTATGTCTGCACTTGATGCTGCCTGGTCTGTTTCATTACTCGCATCTGGTATGCATCCATTAAAAGTGATTGCACAACGTGAATCAGTTTATCAACATTTAAGTCA              ]
[+] EMBL CD152132             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tTTACAACCA GTATAACATTATTTTGTTATGACAGCT AAAAAACTTAGTCTTTTAGAAAAAGGTGTATTGAAACAAGATCGCGATGATTCAGTCAGTTTATTAAGTAAAGATAATGTGGATAAGAAAGCTTTACAAGCGTATGCTAAAGAAACAGCTTCGTATGTAACCAATGGGGCATTGACACGTTTAGATTTTGCATTGAATTCATACGGCGAACCAGATGTAGATCTATTTGATTTTACACGAATGTTTGCAGCGGAATATTCATGTAATATATTGGAAAAGAATCGTTGTCTTTTATTACAATGTCTTATTGGTGATGGATTATATGAACCATTTTGGCCTACTGGTAGTGGCTGTGCATTAGGCTTTATGTCTGCACTTGATGCTGCCTGGTCTGTTTCATTACTCGCATCTGGTATGCATCCATTAAAAGTGATTGCACAACGTGAATCAGTTTATCAACATTTAAGTCCAACAAACGGTCAAA]




>consensus_8716#0
TGTCAGGAAAATGTAAAACGATTTGGTTGGCGAGCTAAACTAAAACCAGAATTATTCGTA
TTGAGGAATTTTCATTTTGATGTTTTAATCGCTGCAGATGGCAAACGCAGTTGTCTAGGT
TTCCCATGTAAAGAACTACGATGTCGTTTAGCTATTGCAATTACTGTGAATTTTATCAAT
TATCATACACCAGCTGAAGCACAAGTAGAAGAGATTAGTGGTGTTGCTCGTATCTTCAAT
CAATCATTTTTCTCACGTTTAGCCACAGAGACTGGTATTGATTTGGAGAATATTGTTTAT
TACAAAGATGAAACTCATTATTTTGTTATGACAGCTAAAAAAACTTAGTCTTTTAGAAAA
AGGTGTATTGAAACAAGATCGCGATGATTCAGTCAGTTTATTAAGTAAAGATAATGTGGA
TAAGAAAGCTTTACAAGCGTATGCTAAAGAAACAGCTTCGTATGTAACCAATGGGGCATT
GACACGTTTAGATTTTGCATTGAATTCATACGGCGAACCAGATGTAGATATATTTGATTT
TACACGAATGTTTGCAGCGGAATATTCATGTAATATATTGGAAAAGAATCGTTGTCTTTT
ATTACAATGTCTTATTGGTGATGGATTATATGAACCATTTTGGCCTACTGGTAGTGGCTG
TGCATTAGGCTTTATGTCTGCACTTGATGCTGCCTGGTCTGTTTCATTACTCGCATCTGG
TATGCATCCATTAAAAGTGATTGCACAACGTGAATCAGTTTATCAACATTTAAGTCAAAC
AAACGGTCAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)