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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8732#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1378 fasta sequence
[TGTGATTTGTTGCATGAGCCAGTCGTTTTTATTTGATTTACTGAGTGCCTACGTTATACGTAATGGTGAAGTTCGATGTTCTTCTTACTTTCGGTGAATGGATGCGTCTGGGGAAACTTTCAGAGAGCATCAATCATCTGCAGATTAACCTACAAACTCCTGGATGTCTATTGTACACAAGATATGGCAGTGTTCCTTTCCTTCCTCCAGACGTTTATGAAAAAATAGAGCTATTACCAGAGTTTTCTTTCGCTTGCATGGGTTACGTGGCTGAACGCAGGTTTGCTCTGACGAAGTTCGGTGGTGGTATTGTCAAATTTGCTGGTTTAGGGAAACGTGGTGCGGTCCTATTTCAGTCAGATCCAACTCACTTAGCGATTGTAGCAGCTGTTGATAAATCTTCTGTCCCAGTTTGGACAACCGGTGGACGATTGCAGTTGTCAATCGGGGAATATTATAAATGCAGTAAGGTTGCGTCACCGATAGTATACCAATCGCCAACCGACAACGAAACTTTCCTGTTAGATGTGAATCCAACATTAAAGCGAATTANGAGTTCCGTCGTCCGAACTTCAGGGTACTTGAAGAAGTTAGCTTCAGAATGTATATCTCATGAGGAGTTGGCAAAACGGTCGGTACTTGCATCCATCGCGGGTGGTTATGATCTACAGCTTCGTCTTCAGTCAGTTGCTGAAACAGATTTCTCACTTTGTTCAGGTGTAGTAATTGATGGTGTACTT-CGAGATTTACCTGTATCTTCAG-TTGAAGTCAAAAACTATATCGATGAAAACAAAGGTTTACAAGAATTCCTAACCACTACTTTGCCCAAAGTATTTGCTCACATTCCACCTCATCTCCCACGTTTTATTACTCAAATATGGCAACCATATGACATTGCC-TTGGCAGCTCGTTCAGGATGTGACATATTTGATGGTAGTTTGCCATACCGACTCAGTCGCAGTGGGATTGGTTGGATTTACGAAGACTGGAACGAAACTAACCCCTCTAGTATGGTTTCAGATCCAAAATTCTTAGAGTTTCCATTTGAAGAATCCTATAAATTGGATACAGAGGAGTGCTACTTACCGATTCAACATGGATGTAATTGTT-T-CACGTGTTTGCATCACACACGGATGTATATATCTCATTTGCATATTGCTCAAGAAATGTTGGCTCCTATGTTACTAATGATCCACAATTCTCATCAATATTATCGCTTTTTCTCTGATCTTCGTCGGTCTATAGCAGTAAACAAAATTGATTCATTTATTACTCATGTCTCTAACTGGCGTTTTCCTCTTAACATTCTAACTGTTGATAAAACAAATGAGTTCTCAAAAGCACAGTAAATACAGACTATGATGACGTGTAAATCTAT]
[+] EMBL CD081918 [TGTGATTTGTTGCATGAGCCAGTCGTTTTTATTTGATTTACTGAGTGCCTACGTTATACGTAATGGTGAAGTTCGATGTTCTTCTTACTTTCGGTGAATGGATGCGTCTGGGGAAACTTTCAGAGAGCATCAATCATCTGCAGATTAACCTACAAACTCCTGGATGTCTATTGTACACAAGATATGGCAGTGTTCCTTTCCTTCCTCCAGACGTTTATGAAAAAATAGAGCTATTACCAGAGTTTTCTTTCGCTTGCATGGGTTACGTGGCTGAACGCAGGTTTGCTCTGACGAAGTTCGGTGGTGGTATTGTCAAATTTGCTGGTTTAGGGAAACGTGGTGCGGTCCTATTTCAGTCAGATCCAACTCACTTAGCGATTGTAGCAGCTGTTGATAAATCTTCTGTCCCAGTTTGGACAACCGGTGGACGATTGCAGTTGTCAATCGGGGAATATTATAAATGCAGTAAGGTTGCGTCACCGATAGTATACCAATCGCCAACCGACAACGAAACTTTCCTGTTAGATGTGAATCCAACATTAAAGCGAATTANGAGTTCCGTCGTCCGAACTTCAGGGTACTTGAAGAAGTTAGCTTCAGAATGTATATCTCATG ]
[+] EMBL CD117708 [ GGGAATATTATAAATGCAGTAAGGTTGCGTCACCGATAGTATACCAATCGCCAACCGACAACGAAACTTTCCTGTTAGATGTGAATCCAACATTAAAGCGAATTAGGAGTTCCGTCGTCCGAACTTCAGGGTACTTGAAGAAGTTAGCTTCAGAATGTATATCTCATGAGGAGTTGGCAAAACGGTCGGTACTTGCATCCATCGCGGGTGGTTATGATCTACAGCTTCGTCTTCACTCAGTTGCTGAAACAGATTTCTCACTTTGTTCACGTGTAATAATTGATGGTGTACTTGCGAGATTTACCTGTATCTTCAGNTTGAAa ]
[+] EMBL CD094595 [ TCGTCCGAACTTCAGGGTACTTGAAGAAGTTAGCTTCAGAATGTATATCTCATGAGGAGTTGGCAAAACGGTCGGTACTTGCATCCATCGCGGGTGGTTATGATCTACAGCTTCGTCTTCAGTCAGTTGCTGAAACAGATTTCTCACTTTGTTCAGGTGTAGTAATTGATGGTGTACTT CGAGATTTGCCTGTATCTTCAG TTGAAGTCAAAAACTATATCGATGAAAACAAAGGTTTACAAGAATTCCTAACCACTACTTTGCCCAAAGTATTTGCTCACATTCCACCTCATCTCCCACGTTTTATTACTCAAATATGGCAACCATATGACATTGCC TTGGCAGCTCGTTCAGGATGTGACATATTTGATGGTAGTTTGCCATACCGACTCAGTCGCAGTGGGATTGGTTGGATTTACGAAGACTGGAACGAAACTAACCCCTCTAGTATGGTTTCAGATCCAAAATTCTTAGAGTTTCCATTTGAAGAATCCTATAAATTGGATACAGAGGAGTGCTACTTACCGATTCAACATGGATGTAATTGTT T CACGTGTTTGCATCACGCACGGATGTATATATCTCATTTGC ]
[+] EMBL CD094479 [ TCGTCCGAACTTCAGGGTACTTGAAGAAGTTAGCTTCAGAATGTATATCTCATGAGGAGTTGGCAAAACGGTCGGTACTTGCATCCATCGCGGGTGGTTATGATCTACAGCTTCGTCTTCAGTCAGTTGCTGAAACAGATTTCTCACTTTGTTCAGGTGTAGTAATTGATGGTGTACTT CGAGATTTACCTGTATCTTCAG TTGAAGTCAAAAACTATATCGATGAAAACAAAGGTTTACAAGAATTCCTAACCACTACTTTGCCCAAAGTATTTGCTCACATTCCACCTCATCTCCCACGTTTTATTACTCAAATATGGCAACCATATGACATTGCC TTGGCAGCTCGTTCAGGATGTGACATATTTGATGGTAGTTTGCCATACCGACTCAGTCGCGGTGGGATTGGTTGGATTTACGAAGACTGGAACGAAACTAACCCCTCTAGTATGGTTTCAGATCCAAAATTCTTAGAGTTTCCATTTGAAGAATCCTATAAATTGGATACAGAGGA ]
[-] EMBL CD095379 [ TACAGCTTCGTCTTCAGTCAGTTGCTGAAACAGATTTCTCACTTTGTTCAGGTGTAGTAATTGATGGTGTACTT CGAGATTTACCTGTATCTTCAG TTGAAGTCAAAAACTATATCGATGAAAACAAAGGTTTACAAGAATTCCTAACCACTACTTTGCCCAAAGTATTTGCTCACATTCCACCTCATCTCCCACGTTTTATTACTCAAATATGGCAACCATATGACATTGCC TTGGCAGCTCGTTCAGGATGTGACATATTTGATGGTAGTTTGCCATACCGACTCAGTCGCAGTGGGATTGGTTGGATTTACGAAGACTGGAACGAAACTAACCCCTCTAGTATGGTTTCAGATCCAAAATTCTTAGAGTTTCCATTTGAAGAATCCTATAAATTGGATACAGAGGAGTGCTACTTACCGATTCAACATGGATGTAATTGTT T CACGTGTTTGCATCACACACGGATGTATATATCTCATCTGCATATTGCTCAAGAAATGTTGGCTCCTATGTTACTAATGATCCACAATTCTCATCAATATTATCGCTTTTTC ]
[-] EMBL CD157028 [ CCACGTTNTATTACTCAAATATGGCAACCATATGACA TGCCTTTGGCAGCTCGTTCAGGATGTGACATATTTGATGGTAGTTTGCCATACCGACTCAGTCGCAGTGGGATTGGTTGGATTTACGAAGACTGGAACGAAACTAACCCCTCTAGTATGGTTTCAGATCCAAAATTCTTAGAGTTTCCATTTGAAGAATCCTATAAATTGGATACAGAGGAGTGCTACTTACCGATTCAACATGGATGTAAATGTTATGCACGTG TTGCATCACACACGGATGTATATATCTCATTTGCATATTGCTCAAGAAATGTTGGCTCCTATGTTTATAAT ATCCACAATTCTCATCAATATTATCGCTTTTTCT ]
[-] EMBL CD064623 [ AAATTGGATACAGAGGAGTGCTACTTACCGATTCAACATGGATGTAATTGTT T CACGTGTTTGCATCACACACGGATGTATATATCTCATTTGCATATTGCTCAAGAAATGTTGGCTCCTATGTTACTAATGATCCACAATTCTCATCAATATTATCGCTTTTTCTCTGATCTTCGTCGGTCTATAGCAGTAAACAAAATTGATTCATTTATTACTCATGTCTCTAACTGGCGTTTTCCTCTTAACATTCTAACTGTTGATAAAACAAATGAGTTCTCAAAAGCACAGTAAATACAGACTATGATGACGTGTAAATCTAT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||