cluster # 875

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Schistosoma mansoni
cluster # 875 cluster # 875 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_875#0 length = 892 sequences # 2

consensusID : consensus_875#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 892
fasta sequence

                              [NCGAGGCCTTTAATTCGGCACGCAGGTAAATTCTCATGTTGATATTTATTTACCAGAAGAGATACGTGATCGTCGATATTGGTTCCTCACAGATGCTACTAGAGAAAAGGTGGAAGAGTTACTGAGGGATAGACCTGCTGGGACTTTTGTTGTCAGACCGTCTGCTACTGGTGATAAATTAGCGTTGGGCATACGGTTAGCAACATCTGTTCAACATTGTTTAATTCATTGTGTAAACGGAAAGTATGGATTTGTTGAAAATTCTTGTACATATGAATCATTGGAAGATTTGATCTGTTACTATCATGTGGAGAATTTAAAGCGATACAATAATCTACTCAACATAACTTTGAAGTATCCAATTAAGTTACAGTTGGATGAATGAAAAAATAATAGGGAAGGAGATTATGTGGTTTATTTGTTTTACTTCATTATCCTTTTTTGTTAACTCCGGTTTGTATTGTGTGTGTATGTGTTTGTTCATAGTTGTGTATTCATACATAAAAATACAGATAATTTTTGTCTTTTATTGTTTACATTTTTCCAAGAACGTATTTTTCTTTCATCAGTAATCAACAGTCACCACGTGGAACTATCAAGTCCAACCTTAGCATTGATAATTTATTATGTGCCTTAATATCTATTGTTTGTTAATTTTTTTGGCTTCAGAAGTTTTTATTTTATTATTATTACAGTGTTTTTATGTTGGCG-AAAAATACCACTCAGAAATCGTACTATCTTGTTTTCCCCTCCCCTTTCTTTTCCCTGTTACTCCCTTTCATTATATTTCCAGAATTATTTCTTGATAGTAAGTTACGTCTTCGTGTAGGTAAAAACAGTTCCTGATCGTATTTATTGAATACCTCACTACATAANCTG-ATAGAANACANGT]

[+] EMBL CD081748             [NCGAGGCCTTTAATTCGGCACGCAGGTAAATTCTCATGTTGATATTTATTTACCAGAAGAGATACGTGATCGTCGATATTGGTTCCTCACAGATGCTACTAGAGAAAAGGTGGAAGAGTTACTGAGGGATAGACCTGCTGGGACTTTTGTTGTCAGACCGTCTGCTACTGGTGATAAATTAGCGTTGGGCATACGGTTAGCAACATCTGTTCAACATTGTTTAATTCATTGTGTAAACGGAAAGTATGGATTTGTTGAAAATTCTTGTACATATGAATCATTGGAAGATTTGATCTGTTACTATCATGTGGAGAATTTAAAGCGATACAATAATCTACTCAACATAACTTTGAAGTATCCAATTAAGTTACAGTTGGATGAATGAAAAAATAATAGGGAAGGAGATTATGTGGTTTATTTGTTTTACTTCATTATCCTTTTTTGTTAACTCCGGTTTGTATTGTGTGTGTATGTGTTTGTTCATAGTTGTGTATTCATACATAAAAATACAGATAATTTTTGTCTTTTATTGTTTACATTTTTCCAAGAACGTATTTTTCTTTCATCAGTAATCAACAGTCACCACGTGGAACTATCAAGTCCAACCTTAGCATTGATAATTTATTATGTGCCTTAATATCTATTGTTTGTTAATTTTTTTGGCTTCAGAAGTTTTTATTTTATTATTATTACAGTGTTTTTATGTTGGCG AAAAATACCACTCAGAAATCGTACTATCTTGTTTTCCCCTCCCCTTTCTTTTCCCTGTTACTCCCTTTCATTATATTTCCAGAATTATTTCTTGATAGTAAGTTACGTCTTCGTGTAGGTAAAAACAGTTCCTGATCGTATTTATTGAATACCTCACTACATAANCTG ATAGAANACANG ]
[-] EMBL CD075482             [                                                                                                         AAAGGTGGAAGAGTTACTGAGGGATAGACCTGCTGGGACTTTTGTTGTCAGACCGTCTGCTACTGGTGATAAATTAGCGTTGGGCATACGGTTAGCAACATCTGTTCAACATTGTTTAATTCATTGTGTAAACGGAAAGTATGGATTTGTTGAAAATTCTTGTACATATGAATCATTGGAAGATTTGATCTGTTACTATCATGTGGAGAATTTAAAGCGATACAATAATCTACTCAACATAACTTTGAAGTATCCAATTAAGTTACAGTTGGATGAATGAAAAAATAATAGGGAAGGAGATTATGTGGTTTATTTGTTTTACTTCATTATCCTTTTTTGTTAACTCCGGTTTGTATTGTGTGTGTATGTGTTTGTTCATAGTTGTGTATTCATACATAAAAATACAGATAATTTTTGTCTTTTATTGTTTACATTTTTCCAAGAACGTATTTTTCTTTCATCAGTAATCAACAGTCACCACGTGGAACTATCAAGTCCAACCTTAGCATTGATAATTTATTATGTGCCTTAATATCTATTGTTTGTTAATTTTTTTGGCTTCAGAAGTTTTTATTTTATTATTATTACAGTGTTTTTATGTTGGCGAAAAAATACCACTCAGAAATCGTACTATCTTGTTTTCCCCTCCCCTTTCTTTTCCCTGTTACTCCCTTTCATTATATTTCCAGAATTATTTCTTGATAGTAAGTTACGTCTTCGTGTAGGTAAAAACAGTTCCTGATCGTATTTATTGAATACCTCACTACATAA CTGAATAGAAAACAGGT]




>consensus_875#0
NCGAGGCCTTTAATTCGGCACGCAGGTAAATTCTCATGTTGATATTTATTTACCAGAAGA
GATACGTGATCGTCGATATTGGTTCCTCACAGATGCTACTAGAGAAAAGGTGGAAGAGTT
ACTGAGGGATAGACCTGCTGGGACTTTTGTTGTCAGACCGTCTGCTACTGGTGATAAATT
AGCGTTGGGCATACGGTTAGCAACATCTGTTCAACATTGTTTAATTCATTGTGTAAACGG
AAAGTATGGATTTGTTGAAAATTCTTGTACATATGAATCATTGGAAGATTTGATCTGTTA
CTATCATGTGGAGAATTTAAAGCGATACAATAATCTACTCAACATAACTTTGAAGTATCC
AATTAAGTTACAGTTGGATGAATGAAAAAATAATAGGGAAGGAGATTATGTGGTTTATTT
GTTTTACTTCATTATCCTTTTTTGTTAACTCCGGTTTGTATTGTGTGTGTATGTGTTTGT
TCATAGTTGTGTATTCATACATAAAAATACAGATAATTTTTGTCTTTTATTGTTTACATT
TTTCCAAGAACGTATTTTTCTTTCATCAGTAATCAACAGTCACCACGTGGAACTATCAAG
TCCAACCTTAGCATTGATAATTTATTATGTGCCTTAATATCTATTGTTTGTTAATTTTTT
TGGCTTCAGAAGTTTTTATTTTATTATTATTACAGTGTTTTTATGTTGGCGAAAAATACC
ACTCAGAAATCGTACTATCTTGTTTTCCCCTCCCCTTTCTTTTCCCTGTTACTCCCTTTC
ATTATATTTCCAGAATTATTTCTTGATAGTAAGTTACGTCTTCGTGTAGGTAAAAACAGT
TCCTGATCGTATTTATTGAATACCTCACTACATAANCTGATAGAANACANGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case