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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8752#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 970 fasta sequence
[ATAAAGTAAATAGATTGTCAAATCGATTAAGAAATCAAAAACGAAAAAAAACAACAAAACAAACTGTATATACTACTCATAACTACTACTGGCAAAATTAGTAGTAGTAGAATAATGAAAGAATCCAAAAAAATCTCATTAAATTGATCTTTCACAAATATGATTAAAACGTCTAGCATGATTATAATTATAACTTTGATAACGACAATAACGTCCATAATAACAATTTGGTTTATTAATTACATCATTTGGTAATTCATTTGAACATATAGTTAAACGATATTGATAAGCTAATTGACTAAGTAAACGTTCACCACAATGTTTACAAATTAATGAATTACCATTTAAT-GTA-CATAATGAAG-AAATTGTTGTTGTATTCATATAGTATGTTAAACAATGATTAATAAATGTTGGAATTGTAACACCTTTTGAAGTAAGATAATCATCAAGAATTCTTGTCTCTATACGATTATTCAATAATAAATTACGAGGTATTGAATTGTATCGAGTCAAATCTTGTACACGAGATAAACAATAACCATCACATGTTGAACATCCATATGGATTGACTAAAGAACAAAATGTACGCCGGCATACTTCACATTCTGTTCGATTTATACCATGTAGTTGTGGAATTGTTGTTGTTCGACTTGGCATTGGTCTATTACAACATGTACAATAACAATGCGCTGAGCATTCTTCAATTCTTGGTCCATGGTCGCTAAGAGTAATGCCACTAATACTTGTCATACTATTGCCACGACGGTCATATGATGGTGGTAACCATGAACATATAACACAACCAGCACTCATCGGTAGAGAAGTGGGCATAATTATCGGACCAGTAGAAACACTGCTTGTTGTGGTGGTAGTGATGGTCGGAACAATAGGAAAGATGCCAGAAGAACTACGCAGTAAACCATAGTCACCTCCAGTAAAAGTAATTCTCTCTCTCTAAAAATAGACCGCA]
[+] EMBL CD152451 [ATAAAGTAAATAGATTGTCAAATCGATTAAGAAATCAAAAACGAAAAAAAACAACAAAACAAACTGTATATACTACTCATAACTACTACTGGCAAAATTAGTAGTAGTAGAATAATGAAAGAATCCAAAAAAATCTCATTAAATTGATCTTTCACAAATATGATTAAAACGTCTAGCATGATTATAATTATAACTTTGATAACGACAATAACGTCCATAATAACAATTTGGTTTATTAATTACATCATTTGGTAATTCATTTGAACATACAGTTAAACGATATTGATAAGCTAATTGACTAAGTAAACGTTCACCACAATGTTTACAAATTAATGAATTACCATTTAAT GTA CATAATGAAG AAATTGTTGTTGTATTCATATAGTATGTTAAACAATGATTAATAAATGTTGGAATTGTAACACCTTTTGAAGTAAGATAATCATCAAGAATTCTTGTCTCTATACGATTATTCAATAATAAATTACGAGGTATTGAATTGTATCGAGTCAAATCTTGTACACGAGATAAACAATAACCATCACATGTTGAACATCCATATGGATTGACTAAAGAACAAAAT ]
[+] EMBL CD152412 [ATAAAGTAAATAGATTGTCAAATCAATTAAGAAATCAAAAACGAAAAAAAACAACAAAACAAACTGTATATACTACTCATAACTACTACTGGCAAAATTAGTAGTAGTAGAATAATGAAAGAATCCAAAAAAATCTCATTAAATTGATCTTTCACAAATATGATTAAAACGTCTAGCATGATTATAATTATAACTTTGATAACGACAATAACGTCCATAATAACAATTTGGTTTATTAATTACATCATTTGGTAATTCATTTGAACATATAGTTAAACGATATTGATAAGCTAATTGACTAAGTAAACGTTCACCTCAATGTTTACAAATTAATGAATTACCATTTAAT GTA CATAATGAAG AAATTGTTGTTGTATTCATATAGTATGTTAAACAATGATTAATAAATGTTGGAATTGTAACACCTTTTGAAGTAAGATAATCATCAAGAATTCTTGTCTCTATACGATTATTCAATAATAAATTACGAGGTATTGAATTGTATCGAGTCAAATCTTGTACACGAGATAAACAATAACCATCACATGTTGAA ]
[-] EMBL CD152420 [ GTCCATAATAACAATTTGGTTTATTAATTACATCATTTGGTAATTCATTTGAACATATAGTTAAACGATATTGGTAAGCTAATTGACTAAGTAAACGTTCACCACAATGTTTACAAATTAATGAATTACCATTTAAT GTA CATAATGAAG AAATTGTTGTTGTATTCATATAGTATGTTAGACAATGATTAATAAATGTTGGAATTGTAACACCTTTTGAAGTAAGATAATCATCAAGAATTCTTGTCTCTATACGATTATTCAATAATAAATTACGAGGTATTGAATTGTATCGAGTCAAATCTTGTACACGAGATAAACAATAACCATCACATGTTGAACATCCATATGGATTGACTAAAGAACAAAATGTACGCCGGCATACTTCACATTCTGTTCGATTTATACCATGTAGTTGTGGAATTGTTGTTGTTCGACTTGGCATTGGCCTATTACAACATGTACAATAACAATGCGCTGAGCATTCTTCAATTCTTGGTCCATGGTCGCTAAGAGTAATGCCACTAATACTTGTCATACTATTGCCACGACGGTCATATGATGGCGGTA ]
[-] EMBL CD152394 [ AATGGTACCATAATGAAGAAAATTGTTGTTGTATTCATATAGTATGTTAAACAATGATTAATAAATGTTGGAATTGTAACACCTTTTGAAGTAAGATAATCATCAAGAATTCTTGTCTCTATACGATTATTCAATAATAAATTACGAGGTATTGAATTGTATCGAGTCAAATCTTGTACACGAGATAAACAATAACCATCACATGTTGAACATCCATATGGATTGACTAAAGAACAAAATGTACGCCGGCATACTTCACATTCTGTTCGATTTATACCATGTAGTTGTGGAATTGTTGTTGTTCGACTTGGCATTGGTCTATTACAACATGTACAATAACAATGCGCTGAGCATTCTTCAATTCTTGGTCCATGGTCGCTAAGAGTAATGCCACTAATACTTGTCATACTATTGCCACGACGGTCATATGATGGTGGTA ]
[+] EMBL CD187543 [ AAGAACAAAATGTACGCCGGCATACTTCACATTCTGTTCGATTTATACCATGTAGTTGTGGAATTGTTGTTGTTCGACTTGGCATTGGTCTATTACAACATGTACAATAACAATGCGCTGAGCATTCTTCAATTCTTGGTCCATGGTCGCTAAGAGTAATGCCACTAATACTTGTCATACTATTGCCACGACGGTCACATGATGGTGGTAACCATGAACATATAACACAACCAGCACTCATCGGTAGAGAAGTGGGCATAATTATCGGACCAGTAGAAACACTGCTT ]
[-] EMBL CD194001 [ TACCATGTAGTCGTGGAATCGTAGTTGTTCGACTTGGCATTGGTCTATTACAACATGTACAATAACAATGCGCTGAGCATTCTTCAATTCTTGGTCCATGGTCGCTAAGAGTAATGCCACTAATACTTGTCATACTATTGCCACGACGGTCATATGATGGTGGTAACCATGAACATATAACACAACCAGCACTCATCGGTAGAGAAGTGGGCATAATTATCGGACCAGTAGAAACACTGCTTGTTGTGGTGGTAGTGATGGTCGGAACAATAGGAAAGATGCCAGAAGAACTACGCAGTAAACCATAGTCACCTCCAGTAAAAGTAATTCTCTCTC ]
[-] EMBL CD193327 [ agTAATACTTGTCATACTATTGCCGCGACGGTCATATGATGGTGGTACCCATGTACATATAACACATCCAGCACTCATCGGTAGAGAAGTGGGCATAATGATCGGACCAGTAGAAACACTGCTTGTTGTGGTGGTAGTGATGGTCGGAACAATAGGAAAGATGCCAGAAGAGGTACGCAGTAATCCATAGTCACCACCAGTAAAAGTAATTCTCTCTCTCTAAAAATAGACCGCA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||