These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8752#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 970 fasta sequence [ATAAAGTAAATAGATTGTCAAATCGATTAAGAAATCAAAAACGAAAAAAAACAACAAAACAAACTGTATATACTACTCATAACTACTACTGGCAAAATTAGTAGTAGTAGAATAATGAAAGAATCCAAAAAAATCTCATTAAATTGATCTTTCACAAATATGATTAAAACGTCTAGCATGATTATAATTATAACTTTGATAACGACAATAACGTCCATAATAACAATTTGGTTTATTAATTACATCATTTGGTAATTCATTTGAACATATAGTTAAACGATATTGATAAGCTAATTGACTAAGTAAACGTTCACCACAATGTTTACAAATTAATGAATTACCATTTAAT-GTA-CATAATGAAG-AAATTGTTGTTGTATTCATATAGTATGTTAAACAATGATTAATAAATGTTGGAATTGTAACACCTTTTGAAGTAAGATAATCATCAAGAATTCTTGTCTCTATACGATTATTCAATAATAAATTACGAGGTATTGAATTGTATCGAGTCAAATCTTGTACACGAGATAAACAATAACCATCACATGTTGAACATCCATATGGATTGACTAAAGAACAAAATGTACGCCGGCATACTTCACATTCTGTTCGATTTATACCATGTAGTTGTGGAATTGTTGTTGTTCGACTTGGCATTGGTCTATTACAACATGTACAATAACAATGCGCTGAGCATTCTTCAATTCTTGGTCCATGGTCGCTAAGAGTAATGCCACTAATACTTGTCATACTATTGCCACGACGGTCATATGATGGTGGTAACCATGAACATATAACACAACCAGCACTCATCGGTAGAGAAGTGGGCATAATTATCGGACCAGTAGAAACACTGCTTGTTGTGGTGGTAGTGATGGTCGGAACAATAGGAAAGATGCCAGAAGAACTACGCAGTAAACCATAGTCACCTCCAGTAAAAGTAATTCTCTCTCTCTAAAAATAGACCGCA] [+] EMBL CD152451 [ATAAAGTAAATAGATTGTCAAATCGATTAAGAAATCAAAAACGAAAAAAAACAACAAAACAAACTGTATATACTACTCATAACTACTACTGGCAAAATTAGTAGTAGTAGAATAATGAAAGAATCCAAAAAAATCTCATTAAATTGATCTTTCACAAATATGATTAAAACGTCTAGCATGATTATAATTATAACTTTGATAACGACAATAACGTCCATAATAACAATTTGGTTTATTAATTACATCATTTGGTAATTCATTTGAACATACAGTTAAACGATATTGATAAGCTAATTGACTAAGTAAACGTTCACCACAATGTTTACAAATTAATGAATTACCATTTAAT GTA CATAATGAAG AAATTGTTGTTGTATTCATATAGTATGTTAAACAATGATTAATAAATGTTGGAATTGTAACACCTTTTGAAGTAAGATAATCATCAAGAATTCTTGTCTCTATACGATTATTCAATAATAAATTACGAGGTATTGAATTGTATCGAGTCAAATCTTGTACACGAGATAAACAATAACCATCACATGTTGAACATCCATATGGATTGACTAAAGAACAAAAT ] [+] EMBL CD152412 [ATAAAGTAAATAGATTGTCAAATCAATTAAGAAATCAAAAACGAAAAAAAACAACAAAACAAACTGTATATACTACTCATAACTACTACTGGCAAAATTAGTAGTAGTAGAATAATGAAAGAATCCAAAAAAATCTCATTAAATTGATCTTTCACAAATATGATTAAAACGTCTAGCATGATTATAATTATAACTTTGATAACGACAATAACGTCCATAATAACAATTTGGTTTATTAATTACATCATTTGGTAATTCATTTGAACATATAGTTAAACGATATTGATAAGCTAATTGACTAAGTAAACGTTCACCTCAATGTTTACAAATTAATGAATTACCATTTAAT GTA CATAATGAAG AAATTGTTGTTGTATTCATATAGTATGTTAAACAATGATTAATAAATGTTGGAATTGTAACACCTTTTGAAGTAAGATAATCATCAAGAATTCTTGTCTCTATACGATTATTCAATAATAAATTACGAGGTATTGAATTGTATCGAGTCAAATCTTGTACACGAGATAAACAATAACCATCACATGTTGAA ] [-] EMBL CD152420 [ GTCCATAATAACAATTTGGTTTATTAATTACATCATTTGGTAATTCATTTGAACATATAGTTAAACGATATTGGTAAGCTAATTGACTAAGTAAACGTTCACCACAATGTTTACAAATTAATGAATTACCATTTAAT GTA CATAATGAAG AAATTGTTGTTGTATTCATATAGTATGTTAGACAATGATTAATAAATGTTGGAATTGTAACACCTTTTGAAGTAAGATAATCATCAAGAATTCTTGTCTCTATACGATTATTCAATAATAAATTACGAGGTATTGAATTGTATCGAGTCAAATCTTGTACACGAGATAAACAATAACCATCACATGTTGAACATCCATATGGATTGACTAAAGAACAAAATGTACGCCGGCATACTTCACATTCTGTTCGATTTATACCATGTAGTTGTGGAATTGTTGTTGTTCGACTTGGCATTGGCCTATTACAACATGTACAATAACAATGCGCTGAGCATTCTTCAATTCTTGGTCCATGGTCGCTAAGAGTAATGCCACTAATACTTGTCATACTATTGCCACGACGGTCATATGATGGCGGTA ] [-] EMBL CD152394 [ AATGGTACCATAATGAAGAAAATTGTTGTTGTATTCATATAGTATGTTAAACAATGATTAATAAATGTTGGAATTGTAACACCTTTTGAAGTAAGATAATCATCAAGAATTCTTGTCTCTATACGATTATTCAATAATAAATTACGAGGTATTGAATTGTATCGAGTCAAATCTTGTACACGAGATAAACAATAACCATCACATGTTGAACATCCATATGGATTGACTAAAGAACAAAATGTACGCCGGCATACTTCACATTCTGTTCGATTTATACCATGTAGTTGTGGAATTGTTGTTGTTCGACTTGGCATTGGTCTATTACAACATGTACAATAACAATGCGCTGAGCATTCTTCAATTCTTGGTCCATGGTCGCTAAGAGTAATGCCACTAATACTTGTCATACTATTGCCACGACGGTCATATGATGGTGGTA ] [+] EMBL CD187543 [ AAGAACAAAATGTACGCCGGCATACTTCACATTCTGTTCGATTTATACCATGTAGTTGTGGAATTGTTGTTGTTCGACTTGGCATTGGTCTATTACAACATGTACAATAACAATGCGCTGAGCATTCTTCAATTCTTGGTCCATGGTCGCTAAGAGTAATGCCACTAATACTTGTCATACTATTGCCACGACGGTCACATGATGGTGGTAACCATGAACATATAACACAACCAGCACTCATCGGTAGAGAAGTGGGCATAATTATCGGACCAGTAGAAACACTGCTT ] [-] EMBL CD194001 [ TACCATGTAGTCGTGGAATCGTAGTTGTTCGACTTGGCATTGGTCTATTACAACATGTACAATAACAATGCGCTGAGCATTCTTCAATTCTTGGTCCATGGTCGCTAAGAGTAATGCCACTAATACTTGTCATACTATTGCCACGACGGTCATATGATGGTGGTAACCATGAACATATAACACAACCAGCACTCATCGGTAGAGAAGTGGGCATAATTATCGGACCAGTAGAAACACTGCTTGTTGTGGTGGTAGTGATGGTCGGAACAATAGGAAAGATGCCAGAAGAACTACGCAGTAAACCATAGTCACCTCCAGTAAAAGTAATTCTCTCTC ] [-] EMBL CD193327 [ agTAATACTTGTCATACTATTGCCGCGACGGTCATATGATGGTGGTACCCATGTACATATAACACATCCAGCACTCATCGGTAGAGAAGTGGGCATAATGATCGGACCAGTAGAAACACTGCTTGTTGTGGTGGTAGTGATGGTCGGAACAATAGGAAAGATGCCAGAAGAGGTACGCAGTAATCCATAGTCACCACCAGTAAAAGTAATTCTCTCTCTCTAAAAATAGACCGCA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||