cluster # 8755

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Schistosoma mansoni
cluster # 8755 cluster # 8755 Sequences # 7 consensus # 2

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consensus_8755#0 length = 871 sequences # 6

consensus_8755#1 length = 379 sequences # 1

consensusID : consensus_8755#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 871
fasta sequence

                              [TTTCTAGGGACCTACCCAATAAAGTTGGTCACGTCTTCAGGATCTGCACAAAAAATGTTTGTGTCAAGCAGTATTCATGCTAATCATGCTGATTTAATTCATGATGTAGCCTATGATTTCTATGGTCGACGTATGGCAACTTGTAGTAGTGATCAAATGATTAAAATTTGGGATTTAAAAGACAATGAAGAATGGGTATGCACTGCTTCATGGCGATGTCATTTAGGATCAGCATGGCGTGTTACTTGGGCACATCCTGAATTCGGTCAGGTTATCGCTACCTGTTCATTCGATCGTACAATAGCTGTATGGGAGGAAATAGCAGGCACTCAAACTATAACTAGTGGTGGTGAAAATGATGGTGGTAATAATCAAACTCCTTCAACTGTAACAAACGTTGCATATGGAAGTCAGTCAGCAAACACTAATTGGATAAGACGTGCCTACCTTGTTGATCCACGTACTTCTGTGACTGGTCTACAGTTTGCTCCAAGACATCTAGGTCTTCAGTTGGCTGCTATTTCTACAGATGGCATGTTGCGAATTTATGAAGCATTGGATGTTATGAATTTAAGTCAATGGCGTTTACAGTTTGATTTCGGTACAAAAATGGCTGGATCATGTTTAGCATGGTCTCAGTCACGTCTTGATCCACCTTTAATTGCTGTTGGCAGCGTTAGTCCTAATGATCCAGATACTGCGGATAATTCAGACGGTTTACCAGCACATCATTCTATGTCTCATTCAACAACGCATCCAACAAATACTCTAGTGAACGGCAAACTTATCCTTTATGAATATTCTGAAGTTAGAAGGCATTGGTATCTTGTGGAAGATGTACATGCACTGAATGATCCTATTTACGATGTTT]

[+] EMBL AI067952             [TTTCTAGGGACCTACCCAATAAAGTTGGTCACGTCTTCAGGATCTGCACAAAAAATGTTTGTGTCAAGCAGTATTCATGCTAATCATGCTGATTTAATTCATGATGTAGCCTATGATTTCTATGGTCGACGTATGGCAACTTGTAGTAGTGATCAAATGATTAAAATTTGGGATTTAAAAGACAATGAAGAATGGGTATGCACTGCTTCATGGCGATGTCATTTAGGATCAGCATGGCGTGTTACTTGGGCACATCCTGAATTCGGTCAGGTTATCGCTACCTGTTCATTCGATCGTACAATAGCTGTATGGGAGGAAATAGCAGGCACTCAAACTATAACTAGTGGTGGTGAAAATGATGGTGGTAATAATCAAACTCCTTCAACTGTAACAAACGTTGCATATGGAAGTCAGTCAGCAAACACTAATTGGATAAGACGTGCCTACCTTGTTGATCCACGTACTTCTGTGACTGGTCTACAGTTTGCTCCAAGACATCTAGGTCTTCAGTTGGCTGCTATTTCTACAGATGGCATGTTGCGAATTTATGAAGCATTGGATGTTATGAATTTAAGTCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL AI067919             [      GGGACCTACCCAATAAAGTTGGTCACGTCTTCAGGATCTGCACAAAAAATGTTTGTGTCAAGCAGTATTCATGCTAATCATGCTGATTTAATTCATGATGTAGCCTATGATTTCTATGGTCGACGTATGGCAACTTGTAGTAGTGATCAAATGATTAAAATTTGGGATTTAAAAGACAATGAAGAATGGGTATGCACTGCTTCATGGCGATGTCATTTAGGATCAGCATGGCGTGTTACTTGGGCACATCCTGAATTCGGTCAGGTTATCGCTACCTGTTCATTCGATCGTACAATAGCTGTATGGGAGGAAATAGCAGGCACTCAAACTATAACTAGTGGTGGTGAAAATGATGGTGGTAATAATCAAACTCCTTCAACTGTAACAAACGTTGCATATGGAAGTCAGTCAGCAAACACTAATTGGATAAGACGTGCCTACCTTGTTGATCCACGTACTTCTGTGACTGGTCTACAGTTTGCTCCAAGACATCTAGGTCTTCAGTTGGCTGCTATTTCTACAGATGGCATGTTGCGAATTTATGAAGCATTGGCTGTTATGAATTTAAGTCAATGGCGTTTACAGTTTGATTTCGGTACAAAAATGGCTG                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL AI067181             [      GGGACCTACCCAATAAAGTTGGTCACGTCTTCAGGATCTGCACAAAAGGTGTGTGTGTCAAGCAGTATTCATGCTAATCATGCTGATTTAATTCATGATGTAGCCTATGATTTCTATGGTCGACGTATGGCAACTTGTAGTAGTGATCAAATGATTAAAATTTGGGATTTAAAAGACAATGAAGAATGGGTATGCACTGCTTCATGGCGATGTCATTTAGGATCAGCATGGCGTGTTACTTGGGCACATCCTGAATTCGGTCAGGTTATCGCTACCTGTTCATTCGATCGTACAATAGCTGTATGGGAGGAAATAGCAGGCACTCAAACTATAACTAGTGGTGGTGAAAATGATGGTGGTAATAATCAAACTCCTTCAACTGTAACAAACGTTGCATATGGAAGTCAGTCAGCACACACTAATTGGATAAGACGTGCCTACCTTGTTGATCCACGTACTTCTGTGACTGGTCTACAGTTTGCTCCAAGACATCTAGGTCTTCAGTTGGCTGCTATTTCTACAGATGGCATGTTGCGAATTTATGAAGCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL AI067848             [      GGGACCTACCCAATAAAGTTGGTCACGTCTTCAGGATCTGCACAAAAAATGTTTGTGTCAAGCAGTATTCATGCTAATCATGCTGATTTAATTCATGATGTAGCCTATGATTTCTATGGTCGACGTATGGCAACTTGTAGTAGTGATCAAATGATTAAAATTTGGGATTTAAAAGACAATGAAGAATGGGTATGCACTGCTTCATGGCGATGTCATTTAGGATCAGCATGGCGTGTTACTTGGGCACATCCTGAATTCGGTCAGGTTATCGCTACCTGTTCATTCGATCGTACAATAGCTGTATGGGAGGAAATAGCAGGCACTCAAACTATAACTAGTGGTGGTGAAAATGATGGTGGTAATAATCAAACTCCTTCAACTGTAACAAACGTTGCATATGGAAGTCAGTCAGCANACACTAATTGGATAAGACGTGCCTACCTTGTTGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL AI067126             [      GGGACCTACCCAATAAAGTTGGTCACGTCTTCAGGATCTGCACAAAAAATGTTTGTGTCAAGCAGTATTCATGCTAATCATGCTGATTTAATTCATGATGTAGCCTATGATTTCTATGGTCGACGTATGGCAACTTGTAGTAGTGATCAAATGATTAAAATTTGGGATTTAAAAGACAATGAAGAATGGGTATGCACTGCTTCATGGCGATGTCATTTAGGATCAGCATGGCGTGTTACTTGGGCACATCCTGAATTCGGTCAGGTTATCGCTACCTGTTCATTCGATCGTACAATAGCTGTATGGGAGGAAATAGCAGGCACTCAAACTATAACTAGTGGTGGTGAAAATGATGGTGGTAATAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD112119             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AGTTTGCTCCAAGACATCTAGGTCTTCAGTTGGCTGCTATTTCTACAGATGGCATGTTGCGAATTTATGAAGCATTGGATGTTATGAATTTAAGTCAATGGCGTTTACAGTTTGATTTCGGTACAAAAATGGCTGGATCATGTTTAGCATGGTCTCAGTCACGTCTTGATCCACCTTTAATTGCTGTTGGCAGCGTTAGTCCTAATGATCCAGATACTGCGGATAATTCAGACGGTTTACCAGCACATCATTCTATGTCTCATTCAACAACGCATCCAACAAATACTCTAGTGAACGGCAAACTTATCCTTTATGAATATTCTGAAGTTAGAAGGCATTGGTATCTTGTGGAAGATGTACATGCACTGAATGATCCTATTTACGATGTTT]




>consensus_8755#0
TTTCTAGGGACCTACCCAATAAAGTTGGTCACGTCTTCAGGATCTGCACAAAAAATGTTT
GTGTCAAGCAGTATTCATGCTAATCATGCTGATTTAATTCATGATGTAGCCTATGATTTC
TATGGTCGACGTATGGCAACTTGTAGTAGTGATCAAATGATTAAAATTTGGGATTTAAAA
GACAATGAAGAATGGGTATGCACTGCTTCATGGCGATGTCATTTAGGATCAGCATGGCGT
GTTACTTGGGCACATCCTGAATTCGGTCAGGTTATCGCTACCTGTTCATTCGATCGTACA
ATAGCTGTATGGGAGGAAATAGCAGGCACTCAAACTATAACTAGTGGTGGTGAAAATGAT
GGTGGTAATAATCAAACTCCTTCAACTGTAACAAACGTTGCATATGGAAGTCAGTCAGCA
AACACTAATTGGATAAGACGTGCCTACCTTGTTGATCCACGTACTTCTGTGACTGGTCTA
CAGTTTGCTCCAAGACATCTAGGTCTTCAGTTGGCTGCTATTTCTACAGATGGCATGTTG
CGAATTTATGAAGCATTGGATGTTATGAATTTAAGTCAATGGCGTTTACAGTTTGATTTC
GGTACAAAAATGGCTGGATCATGTTTAGCATGGTCTCAGTCACGTCTTGATCCACCTTTA
ATTGCTGTTGGCAGCGTTAGTCCTAATGATCCAGATACTGCGGATAATTCAGACGGTTTA
CCAGCACATCATTCTATGTCTCATTCAACAACGCATCCAACAAATACTCTAGTGAACGGC
AAACTTATCCTTTATGAATATTCTGAAGTTAGAAGGCATTGGTATCTTGTGGAAGATGTA
CATGCACTGAATGATCCTATTTACGATGTTT

consensusID : consensus_8755#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 379
fasta sequence

                              [TGAACCATTTGAACTATTTGACAGTGCTCTTTTTAAACATTCGCGCTTCGTTGATACTCATGGCTTTCTAGGGACCTACCCAATAAAGTTGGTCACGTCTTCAGGATCTGCACGTAAGTTAATTAACAGCAAATTTTAAAACGGCAACTGCCTAAGACTTAATGGTCTTGATTAAATTGTCACGTCTGAGTAAAACAGTTATCTATCACCTAGGTACCCAAATAAATCAAAAAGGGAAGATAATGGTGAAGTTTCAAAAAGTATCAATATGTCTCCTTTGTTCCTCATCCTAAGGGAATTAGTAAAAGTTTTTCTATCATCTTCCTGTTGAGGGGAAATATCTTGAAATTTAAACCTTAGTCTTCAGTTAAATTCCCCT]

[+] EMBL CD111309             [TGAACCATTTGAACTATTTGACAGTGCTCTTTTTAAACATTCGCGCTTCGTTGATACTCATGGCTTTCTAGGGACCTACCCAATAAAGTTGGTCACGTCTTCAGGATCTGCACGTAAGTTAATTAACAGCAAATTTTAAAACGGCAACTGCCTAAGACTTAATGGTCTTGATTAAATTGTCACGTCTGAGTAAAACAGTTATCTATCACCTAGGTACCCAAATAAATCAAAAAGGGAAGATAATGGTGAAGTTTCAAAAAGTATCAATATGTCTCCTTTGTTCCTCATCCTAAGGGAATTAGTAAAAGTTTTTCTATCATCTTCCTGTTGAGGGGAAATATCTTGAAATTTAAACCTTAGTCTTCAGTTAAATTCCCCT]




>consensus_8755#1
TGAACCATTTGAACTATTTGACAGTGCTCTTTTTAAACATTCGCGCTTCGTTGATACTCA
TGGCTTTCTAGGGACCTACCCAATAAAGTTGGTCACGTCTTCAGGATCTGCACGTAAGTT
AATTAACAGCAAATTTTAAAACGGCAACTGCCTAAGACTTAATGGTCTTGATTAAATTGT
CACGTCTGAGTAAAACAGTTATCTATCACCTAGGTACCCAAATAAATCAAAAAGGGAAGA
TAATGGTGAAGTTTCAAAAAGTATCAATATGTCTCCTTTGTTCCTCATCCTAAGGGAATT
AGTAAAAGTTTTTCTATCATCTTCCTGTTGAGGGGAAATATCTTGAAATTTAAACCTTAG
TCTTCAGTTAAATTCCCCT

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_8755#0      TTTCTAGGGACCTACCCAATAAAGTTGGTCACGTCTTCAGGATCTGCACAAAAAATGTTT 60
consensus_8755#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8755#0      GTGTCAAGCAGTATTCATGCTAATCATGCTGATTTAATTCATGATGTAGCCTATGATTTC 120
consensus_8755#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8755#0      TATGGTCGACGTATGGCAACTTGTAGTAGTGATCAAATGATTAAAATTTGGGATTTAAAA 180
consensus_8755#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8755#0      GACAATGAAGAATGGGTATGCACTGCTTCATGGCGATGTCATTTAGGATCAGCATGGCGT 240
consensus_8755#1      --------TGAACCA-TTTGAACTATTTGACAGTGCTCTTTTTAAACATTCGCGCTTCGT 51
                               ***    * ** ***  ** *  * * * *  ** *  **  **    ***

consensus_8755#0      -GTTACTTGGGCACATCCTGAATTCGGTCAGGTTATCGCTACCTGTTCATTCGATCGTAC 299
consensus_8755#1      TGATACTCATGGCTTTCTAGGGACCTACCCAATAA-----AGTTGGTCACGTCTTCAGGA 106
                       * ****   *    **  *    *   *   * *     *  ** ***     **    

consensus_8755#0      AATAGCTGTATGGGAGGAAATAGCAGGCACTCAAACTATAACTAGTGGTGGTGAAAATGA 359
consensus_8755#1      TCTGCACGTAAGTTAATTAACAGCAAATTTTAAAACGGCAACTGCC-----TAAGACT-- 159
                        *    *** *  *   ** ****     * ****   ****        * * * *  

consensus_8755#0      TGGTGGTAATAATCAAACTCCTTCAACTGTAACAAACGTTGCATATGGAAGTCAGTCAGC 419
consensus_8755#1      TAATGGTCTTGATTAAATTGTCACGTCTGAGTAAAACAGT-TATCTATCACCTAGGTACC 218
                      *  ****  * ** *** *    *  ***    ****  *  ** *   *   **  * *

consensus_8755#0      AAACACTAATTGGATAAGACGTGCCTACCTTGTTGATCCACGTACTTCTGTGACTGGTCT 479
consensus_8755#1      CAA--ATAAATCAAAAAGGGAAGATAATGGTGAAGTTTCAAAAAGTATCA--ATATGTCT 274
                       **   *** *  * ***    *   *   **  * * **   * *      *   ****

consensus_8755#0      ACAGTTTGCTCCAAGACATCTAGGTCTTCAGTTGGCTGCTATTTCTACAGATGGCATGTT 539
consensus_8755#1      CC--TTTGTTCCTC-ATCCTAAGGGAATTAGTAAA--AGTTTTTCTATCATCTTCCTGTT 329
                       *  **** ***   *     ***   * ***       * ******       * ****

consensus_8755#0      GCGAATTTATGAAGCATTGGATGTTATGAATTTAAGTCAATGGCGTTTACAGTTTGATTT 599
consensus_8755#1      GAGGG-----GAAATATCTTGAAATTTAAACCTTAGTC---------TTCAGTTAAATTC 375
                      * *       ***  **       * * **  * ****         * *****  *** 

consensus_8755#0      CGGTACAAAAATGGCTGGATCATGTTTAGCATGGTCTCAGTCACGTCTTGATCCACCTTT 659
consensus_8755#1      CCCT-------------------------------------------------------- 379
                      *  *                                                        

consensus_8755#0      AATTGCTGTTGGCAGCGTTAGTCCTAATGATCCAGATACTGCGGATAATTCAGACGGTTT 719
consensus_8755#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8755#0      ACCAGCACATCATTCTATGTCTCATTCAACAACGCATCCAACAAATACTCTAGTGAACGG 779
consensus_8755#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8755#0      CAAACTTATCCTTTATGAATATTCTGAAGTTAGAAGGCATTGGTATCTTGTGGAAGATGT 839
consensus_8755#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8755#0      ACATGCACTGAATGATCCTATTTACGATGTTT 871
consensus_8755#1      --------------------------------