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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8756#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 903 fasta sequence
[CATAATTGTTATTATCAATTTTGGGCAATCAGTAATATATACATATATATGTATACGCATGGAGATGTGAATAAATCACTGTCCTAATTCTACTTGAGATCTGCCTATTAGTTTGTTTTTTTGTTCATTTCCTTATTATCTTCACGTTTATTCTTTATTTGTGCTCATTTATTGTCTTCTTCCATCATTACCATTGTCTTTCATTTCTTAAAATAGAATAATTTGTCTAGAATGATGTATGTATTCTTAATTTCTTTTGTTCAGCGCTTTTTTTAAAAATAAAATGTCAACATGGAAACTAAGTATTTATTGTTCAGAGCATGAATTCTAGTTTTATAATATATACTTTTTGCCATACATCATGCATTTCATTCCTGTGTATTATATCACACGAATATCCATCTATTCATATGGACTTATACATACATATATAGCCGAATGATTACATTACTTTCATAAATAATTACATCATGTTCATAATATGTATATGCATATGTAATTTCTTCGATTCATAGCTCAATTTCATAAATTCTATTTCATAGAAAAACAAATTACAATACAAAGAAACAAAATTTCAATCATATTTAAATGATTTGGTATGTTTTTTTGTTCAGGGTTTCATTGATTTCATTGTATCTATGTATGATTACGTAATGTTCAATTATTCTCTAAAAAATTTTTATTACTTTTTTTGACATGATTTATGATTGACTAGTAAATCAGTTGTCTTCCGTGATTAAATTGAATGTTGTTGAAAAGTATTTTATCATGATGATGATAATGAACACACACACACACACGTACATTTATATACATACATGCATAAATTGTGTGCATGTTTATGTATTTCAAAGAAAAGATCTGGACAAAGTCTGTGATAAGAGAGTTTCTTCCAGTCTTCCT]
[+] EMBL CD152430 [CATAATTGTTATTATCAATTTTGGGCAATCAGTAATATATACATATATATGTATACGCATGGAGATGTGAATAAATCACTGTCCTAATTCTACTTGAGATCTGCCTATTAGTTTGTTTTTTTGTTCATTTCCTTATTATCTTCACGTTTATTCTTTATTTGTGCTCATTTATTGTCTTCTTCCATCATTACCATTGTCTTTCATTTCTTAAAATAGAATAATTTGTCTAGAATGATGTATGTATTCTTAATTTCTTTTGTTCAGCGCTTTTTTTAAAAATAAAATGTCAACATGGAAACTAAGTATTTATTGTTCAGAGCATGAATTCTAGTTTTATAATATATACTTTTTGCCATACATCATGCATTTCATTCCTGTGTATTATATCACACGAATATCCATCTATTCATATGGACTTATACATACATTTATAGCCGAATGATTACATTACTTTCATAAATAATTACATCATGTTCATAATATGTATATGCATATGTAATTTCTTCGATTCATAGCTCAATTTCATAAATTCTATTTCATAGAAAAACAAATTACAATACAAAGAAACAAAATTTCAAT ]
[+] EMBL CD152423 [CATAATTGTTATTATCAATTTTGGGCAATCAGTAATATATACATATATATGTATACGCATGGAGATGTGAATAAATCACTGTCCTAATTCTACTCGAGATCTGCCTATTAGTTTGTTTTTTTGTTCATTTCCTTATTATCTTCACGTTTATTCTTTATTTGTGCTCATTTATTGTCTTCTTCCATCATTACCATTGTCTTTCATTTCTTAAAATAGAATAATTTGTCTAGAATGATGTATGTATTCTTAATTTCTTTTGTTCAGCGCTTTTTTTAAAAATAAAATGTCAACATGGAAACTAAGTATTTATTGTTCAGAGCATGAATTCTAGTTTTATAATATATACTTTTTGCCATACATCATGCATTTCATTCCTGTGTATTATATCACACGAATATCCATCTATTCATATGGACTTATACATACATATATAGCCGAATGATTACATTACTTTCATAAGTAATTACATCATGTTCATAATATGTATATGCATATGTAATTTCTTCGATTCATAGCTCAATTTCATAAATTCTATTTCATAGAANAACAAATTACCATACAAAGAAACCAA ]
[+] EMBL CD152444 [CATAATTGTTATTATCAATTTTGGGCAATCAGTAATATATACATATATATGTATACGCATGGAGATGTGAATAAATCACTGTCCTAATTCTACTTGAGATCTGCCTATTAGTTTGTTTTTTTGTTCATTTCCTTATTATCTTCACGTTTATTCTTTATTTGTGCTCATTTATTGTCTTCTTCCATCATTACCATTGTCTTTCATTTCTTAAAATAGAATAATTTGTCTAGAATGATGTATGTATTCTTAATTTCTTTTGTTCAGCGCTTTTTTTAAAAATAAAATGTCAACATGGAAACTAAGTATTTATTGTTCAGAGCATGAATTCTAGTTTTATAATATATACTTTTTGCCATACATCATGCATTTCATTCCTGTGTATTATATCACACGAATATCCATCTATTCATATGGACTTATACATACATATATAGCCGAATGATTACATTACTTTCATAAATAATTACATCATGTTCATAATATGTATATGCATATGTAATTTCTTCGATTCATAGCTCAATTTCATAAATTCTATTTCATTGAAAAACA ]
[-] EMBL CD152432 [ TAATATATACTTTTTGCCATACATCATGCATTTCATTCCTGTGTATTATATCACACGAATATCCATCTATTCATATGGACTTATACATACATATATAGCCGAATGATTACATTACTTTCATAAATAATTACATCATGTTCATAATATGTATATGCATATGTAATTTCTTCGATTCATAGCTCAATTTCATAAATTCTATTTCATAGAAAAACAAATTACAATACAAAGAAACAAAATTTCAATCATATTTAAATGATTTGGTATGTTTTTTTGTTCAGGGTTTCATTGATTTCATTGTATCTATGTATGATTACGTAATGTTCAATTATTCTCTAAAAAATTTTTATTACTTTTTTTGACATGATTTATGATTGACTAGTAAATCAGTTGTCTTCCGTGATTAAATTGAATGTTGTTGAAAAGTATTTTATCATGATGATGATAATGAACACACACACACACACGTACATTTATATACATACATGCATAAATTGTGTGCATGTTTATGTATTTCAAAGAAAAGATCTGGACAAAGTCTGTGATAAGAGAGTTTCTTCCAGTCTTCCT]
[-] EMBL CD152428 [ TATATACTTTTTGCCATACATCATGCATTTCATTCCTGTGTATTATATCACACGAATATCCATCTATTCATATGGACTTATACATACATATATAGCCGAATGATTACATTACTTTCATAAATAATTACATCATGTTCATAATATGTATATGCATATGTAATTTCTTCGATTCATAGCTCAATTTCATAAATTCTATTTCATAGAAAAACAAATTACAATACAAAGAAACAAAATTTCAATCATATTTAAATGATTTGGTATGTTTTTTTGTTCAGGGTTTCATTGATTTCATTGTATCTATGTATGATTACGTAATGTTCAATTATTCTCTAAAAAATTTTTATTACTTTTTTTGACATGATTTATGATTGACTAGTAAATCAGTTGTCTTCCGTGATTAAATTGAGTGTTGTTGAAAAGTATTTTATCATGATGATGATAATGAACACACACACACACACGTACATTTATATACATACATGCATAAATTGTGTGCATGTTTATGTATTTCAAAGAAAAGATCTGGACAAAGTCTGTGATAAGAGAGTTTCTTCCAGTCTTCCT]
[-] EMBL CD152454 [ TTCATTCCTGTGTATTATATCACACGAATATCCATCTATTCATATGGACTTATACATACATATATAGCCGAATGATTACATTACTTTCATAAATAATTACATCATGTTCATAATATGTATATGCATATGTAATTTCTTCGATTCATAGCTCAATTTCATAAATTCTATTTCATAGAAAAACAAATTACAATACAAAGAAACAAAATTTCAATCATATTTAAATGATTTGGTATGTTTTTTTGTTCAGGGTTTCATTGATTTCATTGTATCTATGTATGATTACGTAATGTTCAATTATTCTCTAAAAAATTTTTATTACTTTTTTTGACATGATTTATGATTGACTAGTAAATCAGTTGTCTTCCGTGATTAAATTGAATGTTGTTGAAAAGTATTTTATCATGATGATGATAATGAGCACACACACACACACGTACATTTATATACATACATGCATAAATTGTGTGCATGTTTATGTATTTCAAAGAAAAGATCTGGACAAAGTCTGTGATAAGAGAGTTTCTTCCAGTCTTCCT]
[-] EMBL CD152458 [ ACATATATAGCCGAATGATANCATTACTTTCATAAATAATTACATCATGTTCATAATATGTATATGCATATGTAATTTCTTCGATTCATAGCTCAATTTCATAAATTCTATTTCATAGAAAAACAAATTACAATACAAAGAAACAAAATTTCAATCATATTTAAATGATTTGGTATGTTTTTTTGTTCAGGGTTTCATTGATTTCATTGTATCTATGTATGATTACGTAATGTTCAATTATTCTCTAAAAAATTTTTATTACTTTTTTTGACATGATTTATGATTGACTAGTAAATCAGTTGTCTTCCGTGATTAAATTGAATGTTGTTGAAAAGTATTTTATCATGATGATGATAATGAACACACACACACACACGTACATTTATATACATACATGCATAAATTGTGTGCATGTTTATGTATTTCAAAGAAAAGATCTGGACAAAGTCTGTGATAAGAGAGTTTCTTCCAGTCTTCCT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||