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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8757#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1341 fasta sequence
[CTTCGTACACGTGATGAATTCTATTAATGCAGTGGTTTGTGGTTGGAATCAAATTACGGCATCTGTAATAAAGATGCTCAGGAGACATAAAGATGTAAATATAATTGGATACTGGTGTGAATCTCCGAATAACCAAATTCATGCGGATGTTGCTGGTATAAAAGTTATTAGTGGGGATTTTAAAGATCTAATATTAAATAAAGATATACAGTTTTTATTTCTTTGTGATACTCCGGTCAATCAACGCAATCTTTTCTCAATTGTTGATTGCTTGAGCATAGGACAGTCTACTTCGGATAAGGTATTGAAAGACATCCCTCATGTGATTATTCTTCCTCCCGTATCACCTAATTATGATATGGATATGTTGGAGAGAACCAGGATTCGTGTCGGTTTCGCCATGCCCTTAAGACACCTGCCTTTATCTACACTTTTGTCCACTCACCTTAACTACAAATATAAAGAAATAAAAGCACTCAGTAATTACGAAATTACTCGACTCCCTACACATTGGTTATTAGGAAATATAGAAAGCATCCATATAAAATTGCGCACGGTCAATTTCGTTGATGGTAGTGAATACTCATGGCTATGTGAGTCAGAAGAAATGGGTGGAGGGCTGCTGAATATGTTCTGTCCAGGTCTTATTGACCTCGTTTACTTCCTTTCTGGAGGGCTTCAGATAACATCGGTTACGAGTATTGGTCGAACATCCGATAGAGGAACAGACGGTCTAAGTCATCCTATTCGTCATATCTCTGCAGATGACTATGTCACTATAATGGGCGAACTTGGCAAACCACCATTATCAGGATTTCGTAAACCAGTAGTTGTCGTAATCCTTTCAGCAGATATCCCTTTCCCAAGAAATAGGATAAGCAGTCTCCCTGAAGCTCATTTTTATGACAATCATTGTTTCAGACTGGAAATAGAAGTTAATGGATCAACTGGTAGCTTCCTGATTGATGAAGGCAAAAGACGAATTTCATGGACCCCTCGAAAAGCCGTCTCATCAAAGTCTGGTAAACTTAACAACAAATCAGCTCATTCGGACTACGAAAATCACTTCCATGACAAACGACTTGGAAATATGGAGGAATATGAATTAGAAAAAGAGTATATTGAGGACGTATTGGCCAGCCCTAATGGTAGTAACGTGCCTCGAACTCAGGTTCCTACGATGCTAAACATCGATCTCGATGAGGATGGAATAACANNGAATAG-TCATCTACCATTAAAAGACTCATTANATGACTCGAAATCAGTGGAGAGTGCTCANACATCGTATCTATCAGCAACTGGAGAAGCGTGGACAAACTGGATCAGTGGNTTAACCAAAAA]
[+] EMBL CD183647 [CTTCGTACACGTGATGAATTCTATTAATGCAGTGGTTTGTGGTTGGAATCAAATTACGGCATCTGTAATAAAGATGCTCAGGAGACATAAAGATGTAAATATAATTGGATACTGGTGTGAATCTCCGAATAACCAAATTCATGCGGATGTTGCTGGTATAAAAGTTATTAGTGGGGATTTTAAAGATCTAATATTAAATAAAGATATACAGTTTTTATTTCTTTGTGATACTCCGGTCAATCAACGCAATCTTTTCTCAATTGTTGATTGCTTGAGCATAGGACAGTCTACTTCGGATAAGGTATTGAAAGACATCCCTCATGTGATTATTCTTCCTCCCGTATCACCTAATTATGATATGGATATG ]
[-] EMBL CD095043 [ GTGATGAATTCTATTAATGCAGTGGTTTGTGGTTGGAATCAAATTACGGCATCTGTAATAAAGATGCTCAGGAGACATAAAGATGTAAATATAATTGGATACTGGTGTGAATCTCCGAATAACCAAATTCATGCGGATGTTGCTGGTATAAAAGTTATTAGTGGGGATTTTAAAGATCTAATATTAAATAAAGATATGCAGTTTTTATTTCTTTGTGATACTCCGGTCAATCAACGCAATCTTTTCTCAATTGTTGATTGCTTGAGCATAGGACAGTCTACTTCGGATAAGGTATTGAAAGACATCCCTCATGTGATTATTCTTCCTCCCGTATCACCTAATTATGATATGGATATGTTGGAGAGAACCAGGATTCGTGTCGGTTTCGCCATGCCCTTAAGACACCTGCCTTTATCTACACTTTTGTCCACTCACCTTAACTACAAATATAAAGAAATAAAAGCACTCAGTAATTACGAAATTACTCGACTCCCTACACATTGGTTATTAGGAAATATAGAAAGCATCCAT ]
[+] EMBL CD095303 [ GAATTCTATTAATGCAGTGGTTTGTGGTTGGAATCAAATTACGGCATCTGTAATAAAGATGCTCAGGAGACATAAAGATGTAAATATAATTGGATACTGGTGTGAATCTCCGAATAACCAAATTCATGCGGATGTTGCTGGTATAAAAGTTATTAGTGGGGATTTTAAAGATCTAATATTAAATAAAGATATACAGTTTTTATTTCTTTGTGATACTCCGGTCAATCAACGCAATCTTTTCTCAATTGTTGATTGCTTGAGCATAGGACAGTCTACTTCGGATAAGGTATTGAAAGACATCCCTCATGTGATTATTCTTCCTCCCGTATCACCTAATTATGATATGGATATGTTGGAGAGAACCAGGATTCGTGTCGGTTTCGCCATGCCCTTAAGACACCTGCCTTTATCTACACTTTTGTCCACTCACCTTAACTACAAATATAAAGAAATAAAAGCACTCAGTAATTACGAAATTACTCGACTCCCTACACATTGGTTATTAGGAAATATAGAAAGCATCCA ]
[+] EMBL CD118253 [ AATATTAAATAAAGATATACAGTTTTTATTTCTTTGAGATACTCCGGTCAATCAACGCAATCTTTTCTCAATTGTTGATTGCTTGAGCATAAGACAGTCTACTTCGGATAAGGTATTGAAAGACATCCCTCATGTGATTATTCTTCCTCCCGTATCACCTAATTATGATATGGATATGTTGGAGAGAACCAGGATTCGTGTCGGTTTCGCCATGCCCTTAAGACACCTGCCTTTATCTACACTTTTGTGCACTCACCTTAACTACAAATATAAAGAAATAA ]
[-] EMBL CD110753 [ ATGCCCTTAAGCCACCTGCCTTTATCTACACTTTTGTCCACTCACCTTAACTACAAATATAAAGAAATAAAAGCACTCAGTAATTACGAAATTACTCGACTCCCTACACATTGGTTATTAGGAAATATAGAAAGCATCCATATAAAATTGCGCACGGTCAATTTCGTTGATGGTAGTGAATACTCATGGCTATGTGAGTCAGAAGAAATGGGTGGAGGGCTGCTGAATATGTTCTGTCCAGGTCTTATTGACCTCGTTTACTTCCTTTCTGGAGGGCTTCAGATAACATCGGTTACGAGTATTGGTCGAA ]
[+] EMBL CD118413 [ AATATAGAAAGCATCCATATAAAATTGCGCACGGTCAATTTCGTTGATGGTAGTGAATACTCATGGCTATGTGAGTCAGAAGAAATGGGTGGAGGGCTGCTGAATATGTTCTGTCCAGGTCTTATTGACCTCGTTTACTTCCTTTCTGGAGGGCTTCAGATAACATCGGTTACGAGTATTGGTCGAACATCCGATAGAGGAACAGACGGTCTAAGTCATCCTATTCGTCATATCTCTGCAGATGACTATGTCACTATAATGGGCGAACTTGGCAAACCACCATTATCAGGATTTCGTAAACCAGTAGTTGTCGTAATCCTTTCAGCAGATATCCCTTTCCCAAGAAATAGGATAAGCAGTCTCCCTGAAGCTCATTTTTATGACAATCATTGTTTCAGACTGGAAATAGAAGTTAATGGATCAACTGGTAGCTTCCTGATTGATGAAGGCAAAAGACGAATTTCATGGACCCCTCGAAAAGCCGTCTCATCAAAGTCTGGTAAACTTAACAACAAATCAGCTCATTCGGACTACGAAAATCACTTCCATGACAAACGACTTGGAAATATGGAGGAATATGAATTAGAAAAAGAGTATATTGAGGACGTATTGGCCAGCCCTAATGGTAGTAACGTGCCTCGAACTCAGGTTCCTACGATGCTAAACATCGATCTCGATGAGGATGGAATAACANNGAATAG TCATCTACCATTAAAAGACTCATTANATGACTCGAAATCAGTGGAGAGTGCTCANACATCGTATCTATCAGCAACTGGAGAAGCGTGGACAAACTGGATCAGTGGNTTAACCAAAAA]
[-] EMBL CD116600 [ AAATCACTTCCATGACAATCGTCTTGGAAATATGGAGGAATATGAATTAGAAAAAGAGTATATTGAGGACGTATTGGCCAGCCCTAATGGTAGTAACGTGCCTCGAACTCAGGTTCCTACGATGCTAAACATCGATCTCGATGAGGATGGAATAACA GAAATAGTTCATCTACCATTAAAAGACTCATTAAATGA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||