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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8764#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 954 fasta sequence
[CACCATTCGAAATTTTAAGGTTATGTA-CTACTGTTGACTTATCTATAGTAAGGTATCGATTATAATGGAAGCTTTCCTCACTGGATTCAAACAAAAGCCCCAAGATAGCAAGCGACGCATAAAAAGTCAGAAGCATATCCCTTGGGTTGAAAAATATCGACCAAAGACAGTAGGTGAAGTAGCTTATCAAACAGAAGTCGTTAGCGTTCTTCAAAGGTGTATTGAAGGATCTGATTTGCCAAATTTATTGTTTTATGGACCGCCGGGAACTGGAAAGACGTCTTTAATTCTGGCTTTAGCTCGTCAACTTTTTGGCCCTTTGTATTCGGAACGTGTTTTAGAATTGAATGCGAGCGATGAACGCGGGATCAGTGTTATTCGAGAAAAAGTGAAGGCTTTCGCTCACATTGCTGTTAGTAGTAGTACTAATAGCTCTGGTTCAAGTTCAACTAATATACCACCATATAAATTAATAATCTTAGATGAAGCTGATTCTATGACAGCACCTGCACAAGCTGCTCTACGTCGTACAATGGAGACTGAAATGAGAACTACACGATTTTGTTTAACTTGTAATTATGTTACACGAATTATTGAACCAATCACAAGTCGATGTGCAAAGTTTAGATTTCGTCCATTGGATAATGAAATTGCACGTTCTCGTTTGCGTCATATTGCAGATGCAGAAAATTTATCTATTACTAATGAGACATTGGATCATTTACTGTCACTTTGTCATGGTGATTTACGGCAAGGCATCACAATGTTACAATGTGTTCATCAGTTAATTCTATCCGTTGATGATTCCGATGTTGGTTGTCGTTCTTCGATTACCTCAAAAGAATTAGATGAGGCTGCAGCTGTTGTTCCTAGTGATTTAATTAAAAGTCTTATTAAAACATCAGAAAATGGTAGTTTCGATGATTTACAAATCATTATCAAAAACTTATTATT]
[+] EMBL AI976205 [CACCATTCGAAATTTTAAGGTTATGTACCTACTGTTGACTTATCTATAGTAAGGTATCGATTATAATGGAAGCTTTCCTCACTGGATTCAAACAAAAGCCCCAAGATAGCAAGCGACGCATAAAAAGTCAGAAGCATATCCCTTGGGTTGAAAAATATCGACCAAAGACAGTAGGTGAAGTATCTTATCAAACAGAAGTCGTTAGCGTTCTTCAAAGGTGTATTGAAGGATCTGATTTGCCAAATTTATTGTTTTATGGACCGCCGGGAACTGGAAAGACGTCTTTAATTCTGGCTTTAGCTCGTCAACTTTTTGGCCCTTCGTATTCGGAACGTGTTTTAGAATTGAATGCGAGCGATGAACGCGGGATCAGTGTTATTCTAGAAAAAGTGAAGGCTTTCGCTCACATTGCTGTTAGTAGTAGTACTAATAGCTCTGGTTCAAGTTCAACTAATATACCACCATATAAATTAATAATCTTAGATGAAGCTGATTCTATGACAGCACCTGCACAAGCTGCTCTACGTCGTACAATGGAGACTGAAATGAGAACTACACGATTNTGTTTAACTTGTAATTAT ]
[+] EMBL BF936697 [ ACCATTCGAAATTTTAAGGTTATGTA CTACTGTTGACTTATCTATAGTAAGGTATCGATTATAATGGAAGCTTTCCTCACTGGATTCAAACAAAAGCCCCAAGATAGCAAGCGACGCATAAAAAGTCAGAAGCATATCCCTTGGGTTGAAAAATATCGACCAAAGACAGTAGGTGAAGTAGCTTATCAAACAGAAGTCGTTAGCGTTCTTCAAAGGTGTATTGAAGGATCTGATTTGCCAAATTTATTGTTTTATGGACCGCCGGGAACTGGAAAGACGTCTTTAATTCTGGCTTTAGCTCGTCAACTTTTTGGCCCTTTGTATTCGGAACGTGTTTTAGAATTGAATGCGAGCGATGAACGCGGGATCAGTGTTATTCGAGAAAAAGTGAAGGCTTTCGCTCACATTGCTGTTAGTAGTAGTACTAATAGCTCTGGTTCAAGTTCAACTAATATACCACCATATAAATTAATAATCTTAGATGAAGCTGATTCTATGACAGCACCTGCACAAGCTGCTCTACGTCGTACAATGGAGACTGAAATGAGAACTACACGATTTTGTTTAACTTGTAATTATGTTACACGAATTATTGAACCAATCACAAGTCGATGTGCAAAGTTTAGATTTCGTCCATTG ]
[+] EMBL BF936485 [ ACCATTCGAAATTTTAAGGTTATGTA CTACTGTTGACTTATCTATAGTAAGGTATCGATTATAATGGAAGCTTTCCTCACTGGATTCAAACAAAAGCCCCAAGATAGCAAGCGACGCATAAAAAGTCAGAAGCATATCCCTTGGGTTGAAAAATATCGACCAAAGACAGTAGGTGAAGTAGCTTATCAAACAGAAGTCGTTAGCGTTCTTCAAAGGTGTATTGAAGGATCTGATTTGCCAAATTTATTGTTTTATGGACCGCCGGGAACTGGAAAGACGTCTTTAATTCTGGCTTTAGCTCGTCAACTTTTTGGCCCTTTGTATTCGGAACGTGTTTTAGAATTGAATGCGAGCGATGAACGCGGGATCAGTGTTATTCGAGAAAAAGTGAAGGCTTTCGCTCACATTGCTGTTAGTAGTAGTACTAATAGCTCTGGTTCAAGTTCAACTAATATACCACCATATAAATTAATAATCTTAGATGAAGCTGATTCTATGACAGCACCTGCACAAGCTGCTCTACGTCGTACAATGGAGACTGAAATGAGAACTACACGATTTTGTTTAACTTGTAATTATGTTACACGAATTATTGAACCAATCACAGTTCGATGTGCAAAGTTTAGATTTCGTCCATT ]
[+] EMBL AI976607 [ ACCATTCGAAATTTTAAGGTTATGTA CTACTGTTGACTTATCTATAGTAAGGTATCGATTATAATGGAAGCTTTCCTCACTGGATTCAAACAAAAGCCCCAAGATAGCAAGCGACGCATAAAAAGTCAGAAGCATATCCCTTGGGTTGAAAAATATCGACCAAAGACAGTAGGTGAAGTAGCTTATCAAACAGAAGTCGTTAGCGTTCTTCAAAGGTGTATTGAAGGATCTGATTTGCCAAATTTATTGTTTTATGGACCGCCGGGAACTGGAAAGACGTCTTTAATTCTGGCTTTAGCTCGTCAACTTTTTGGCCCTTTGTATTCGGAACGTGTTTTAGAATTGAATGCGAGCGATGAACGCGGGATCAGTGTTATTCGAGAAAAAGTGAAGGCTTTCGCTCACATTGCTGTTAGTAGTAGTACTAATAGCTCTGGTTCAAGTTCAACTAATTTACCACCATATAAATTAATAATCTTA ]
[+] EMBL CD069699 [ AGCACCTGCACAAGCTGCTCTACGTCGTACAATGGAGACTGAAATGAGAACTACACGATTTTGTTTAACTTGTAATTATGTTACACGAATTATTGAACCAATCACAAGTCGATGTGCAAAGTTTAGATTTCGTCCATTGGATAATGAAATTGCACGTTCTCGTTTGCGTCATATTGCAGATGCAGAAAATTTATCTATTACTAATGAGACATTGGATCATTTACTGTCACTTTGTCATGGTGATTTACGGCAAGGCATCACAATGTTACAATGTGTTCATCAGTTAATTCTATCCGTTGATGATTCCGATGTTGGTTGTCGTTCTTCGATTACCTCAAAAGAATTAGATGAGGCTGCGGCTGTTGCTCCTAGTGATTTAATTAAAAGTCTTATTAAAACATCAGAAAATGGTAGTTTCGATGATTTACAAATCATTATCACAAACTTATTATT]
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[+] EMBL CD069641 [ AGCACCTGCACAAGCTGCTCTACGTCGTACAATGGAGACTGAAATGAGAACTACACGATTTTGTTTAACTTGTAATTATGTTACACGAATTATTGAACCAATCACAAGTCGATGTGCAAAGTTTAGATTTCGTCCATGGGATAATGAAATTGCACGTTCTCGTTTGCGTCATATTGCAGATGCAGAAAATTTATCTATTACTAATGAGACATTGGATCATTTACTGTCACTTTGTCATGGTGATTTACGGCAAGGCATCACAATGTTACAATGTGTTCATCAGTTAATTCTATCCGTTGATGATTCCGATGTTGGTTGTCGTTCTTCGATTACCTCAAAAGAATTAGATGAGGCTGCAGCTGTTGTTCCTAGTGATTTAATTAAAAGTCTTATTAAAACATCAGAAAATGGTAGTTTCGATGATTTACAAATCATTATCAAAAACTTATTATT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||