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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8771#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 883 fasta sequence
[ATTATCAGCTAAATAGTTTAATGATATAGGATTTCCATTAGAATCCATGATATCCCAATTGTATGAAAGTATGACAGAGTTTATACCATCTTTAGCTTCAGCATTACAATCCAGTGTTTTATCATCATTAGCCGCTCCAATCAAATTACCGTCATCGTTTAGACCGTCCACAGTAACAAGAATACGATCATCTGTATCTTCCGTTTCTTTGATACCTTTCTGTTTGATTGCTTCCTCATATTCCTTCAATTTTTCTACATCATCCAATGTTGGCGGTTTAGTTTCAGGTTCTGCAGTATCTTTCTCCAAATTAATTAAGAAATCTGGTGAACTATCCCATTTATTTGATCCTCTATAAGAAACTTTACATCGTCCTTTAACATTATCAGATAATGAATCCAAATTAGTAATTGTCAACTGATTTTGTACAAATTGAAAATCTCCTTTTGGATGATATGCTTCAGGCTCTTTGAAATCCCATACATAAATGACATCTTCAGCTGGTTTTCTTGTTATAATATCAATAGCAGAACATTCCAGTGATACATTATCTCCTTGTTTAATTTGAAGTTGACCATCTTTATCTAAACCATGTACGGTGATAAGATATCTAGGAGTGATCACTGGAATAACTTCTGATCCTTCTTCATCAGATTCAGTAAGTAATCGATAATATGGTGACGAATAGATTGATGTACCATTTGATAAACGACATCTTACATAAGCTTCATCCTTTGGAGTTAAATCATCATTTAATAAAATAGATAAATAACCACCAGGTGATTCTTCTAATTTAGAAACTAATGGACCAAGTGAACCCCGTATAGGCGGTGATGATGATGTATCAGATTGTGTATAATAATAATCCCATCCATAATTTAAA]
[-] EMBL CD191282 [ATTATCAGCTAAATAGTTTAATGATATAGGATTTCCATTAGAATCCATGATATCCCAATTGTATGAAAGTATGACAGAGTTTATACCATCTTTAGCTTCAGCATTACAATCCAGTGTTTTATCATCATTAGCCGCTCCAATCAAATTACCGTCATCGTTTAGACCGTCCACAGTAACAAGAATACGATCATCTGTATCTTCCGTTTCTTTGATACCTTTCTGTTTGATTGCTTCCTCATATTCCTTCAATTTTTCTACATCATCCAATGTTGGCGGTTTAGTTTCAGGTTCTGCAGTATCTTTCTCCAAATTAATTAAGAAATCTGGTGAACTATCCCATTTATTTGATCCTCTATAAGAAAC TTACATC TCCTag ]
[+] EMBL CD126336 [ AGACCGTCCACAGTAACAAGAATACGATCATCTGTATCTTCCGTTTCTTTGATACCTTTCTGTTTGATTGCTTCCTCATATTCCTTCAATTTTTCTACATCATCCAATGTTGGCGGTTTAGTTTCAGGTTCTGCAGTATCTTTCTCCAAATTAATTAAGAAATCTGGTGAACTATCCCATTTATTTGATCCTCTATAAGAAACTTTACATCGTCCTTTAACATTATCAGATAATGAATCCAAATTAGTAATTGTCAACTGATTTTGTACAAATTGAAAATCTCCTTTTGGATGATATGCTTCAGGCTCTTTGAAATCCCATACATAAATGACATCTTCAGCTGGTTTTCTTGTTATAATATCAATAGCAGAACATTCCAGTGATACATTATCTCCTTGTTTAATTTGAAGTTGACCATCTTTATCTAAACCATGTACGGTGATAAGATATCTAGGAGTGATCACTGGAATAACTTCTGATCCTTCTTCATCAGATTCAGTAAGTAATCGATAATATGGTGACGAATAGATTGATGTACCATTTGATAAACGACATCTTACATAAGCTTCATCCTTTGGA ]
[+] EMBL CD063814 [ GTAACAAGAA A GATCATCTGTATCTTCCGTTTC TTGATACCTTTCTGTTTGATTGCTTCCTCATATTCCTTCAATTTTTCTACATCATCCAATGTTGGCGGTTTAGTTTCAGGTTCTGCAGTATCTTTCTCCAAATTAATTAAGAAATCTGGTGAACTATCCCATTTATTTGATCCTCTATAAGAAACTTTACATCGTCCTTTAACATTATCAGATAATGAATCCAAATTAGTAATTGTCAACTGATTTTGTACAAATTGAAAATCTCCTTTTGGATGATATGCTTCAGGCTCTTTGAAATCCCATACATAAATGACATCTTCAGCTGGTTTTCTTGTTATAATATCAATAGCAGAACATTCCAGTGATACATTATCTCCTTGTTTAATTTGAAGTTGACCATCTTTATCTAAACCATGTACGGTGATAAGATATCTAGGAGTGATCACTGGAATAACTTCTGATCCTTCTTCATCAGATTCAGTAAGTAATCGATAATATGGTGACGAATA ]
[+] EMBL CD190020 [ TACGATCATCTGTATCTTCCGTTTCTTTGATACCTTTCTGTTTGATTGCTTCCTCATATTCCTTCAATTTTTCTACATCATCCAATGTTGGCGGTTTAGTTTCAGGTTCTGCAGTATCTTTCTCCAAATTAATTAAGAAATCTGGTGAACTATCCCATTTATTTGATCCTCTATAAGAAACTTTACATCGTCCTTTAACATTATCAGATAATGAATCCAAATTAGTAATTGTCAACTGATTTTGTACAAATTGAAAATCTCCTTTTGGATGATATGCTTCAGGCTCTTTGAAATCCCATACATAAATGACATCTTCAGCTGGTTTTCTTGTTATAATATCAATAGCAGAACATTCCAGTGATACAT ]
[+] EMBL CD064416 [ TCAATGTGTCTACATCATCCAATGCTGGCGGTTTAGTTTCAGGTTCTGCAGTATCTTTCTCCAAATTAATTAAGAAATCTGGTGAACTATCCCATTTATCTGATCCTCTATAAGAAACTTTACATCGTCCTTTAACATTATCAGATAATGAATCCAAATTAGTAATTGTCAACTGATTTTGTACAAATTGAAAATCTCCTTTTGGATGATATGCTTCAGGCTCTTTGAAATCCCATACATAAATGACATCTTCAGCTGGTTTTCTTGTTATAATATCAATAGCAGAACATTCCAGTGATACATTATCTCCTTGGTTAATTTGAAGTTGACCATCTTTATCTAAACCATGT ]
[-] EMBL CD063744 [ CTTCAGGCTCTTTGAAATCCCATACATAAATGACATCTTCAGCTGGTTTTCTTGTTATAATATCAATAGCAGAACATTCCAGTGATACATTATCTCCTTGTTTAATTTGAAGTTGACCATCTTTATCTAAACCATGTGCGGTGATAAGATATCTAGGAGTGATCACTGGAATAACTTCTGATCCTTCTTCATCAGATTCAGTAAGTAATCGATAATATGGTGACGAATAGATTGATGTACCATTTGATAAACGACATCTTACATAAGCTTCATCCTTTGGAGTTAAATCATCATTTAATAAAATAGATAAATAACCACCAGGTGATTCTTCTAATTTAGAAACTAATGGACCAAGTGAACCCCGTATAGGCGGTGATGATGATGTATCAGATTGTGTATAATAATAATCCCATCCATAATTTAAA]
[+] EMBL CD063745 [ GCTGGTTTTCTAGTTATAATATCAATAGCAGAACATTCCAGTGATACATTATCTCCTTGTTTAATTTGAAGTTGACCATCTTTATCTAAACCATGTACGGTGATAA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||