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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8772#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1337 fasta sequence
[AGCACTGCATTCTGCTGATAACATGGGTCTTCCTTTTTACCAACCTTATAATTCGCAGATCGAGGATGGTTTAAGTCAGCATACTGGTTTTAATAACAGTCTGGTTGGAAGTGTAGGAGGCCGCCGCTGTACAGTAACTGACGTACTGACAGCAGACATGTCAGTAAGTGCTCTTTATATTCATGAGCTTTTCCATAGAAGACGACAACAACGACAGAACCACGATTCAAGTCGGGGCTATAGTTCACAACGTGGTATGACAGGTAGTACTCCTGGTGCTAATCCTGGAAACAATGAAACTTTTCCCTCTACACAGTCATCAAACCCACTAGGTGTAGGTGTTTATTCTACATCTGGATATTTACCTAGTTATCAGTTGCCACATGTTTCATTTGCTCCGACTACATTTACTAATAACTCAGCCACTATACCAGAATCAAGAAATACTATTGAACGTGGTTCTCTTTATCCCACCTCACCGTCTTGTGAGCCTGGTATCATTAGAACGCCTTCAGATGGACGCAGAATACCTTCAGCACATTTTACAGATGTCACAGAAGAAGATGATGAAAATGTTGGGACACCTAGATCATGTAGAGATACAAACGTTTCTGCCTATATAACAGGAAGTGAGTCACATATAATTCGTTATCCAAGTGGCCAAATAACTACAGGGGGCGGTATCATTACTCTGTCAGGTAGTCCATCAGTACGACCTCAGCATGGTCTGTCATATCAAAATATACAACAAACAAGTGACCCAAGTTTGGGTTCAGTTCCTAATATTGACAGTGATCCAATATGGCCTGATTTGCCTCCAACTAATTGTTAATCTTATTAATATACACACAAATCGGTGTTTGTGTGTTCAACTGTGTAAAGCGGTAACTAGATATGGTTTCAACGTCATCTAACCTACCCAATCATTAATAAGAATGACAATGAAGTGAATTACTAGTTTATTTTAAACAAGTTTTTAAACACTCAATAACACATGCATCCATTCATATTTCTTTACTTTATATTCGCTTAATTACCCTAGCTAAGGCGTATTTCAACGTATACAAACTACCCAATTAAAATTACATCCACATTAGATTGAACATATTTTTGCTAAATTATTCAAACTTGCTTTACTAATTATGTTAGCATCATTTCACTTCCGTTNTATGNCACTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGAGGNGGGCTTTCTGTAACGCAATAAATAGTTAAACTGTGNTAATNNGTTTTTTGTTGTATCCCTATGCAGTTTTTTTAAACTTGTAAATAGGTTTATATTTTACCAAACAAAACTTC]
[+] EMBL CD188640 [AGCACTGCATTCTGCTGATAACATGGGTCTTCCTTTTTACCAACCTTATAATTCGCAGATCGAGGATGGTTTAAGTCAGCATACTGGTTTTAATAACAGTCTGGTTGGAAGTGTAGGAGGCCGCCGCTGTACAGTAACTGACGTACTGACAGCAGACATGTCAGTAAGTGCTCTTTATATTCATGAGCTTTTCCATAGAAGACGACAACAACGACAGAACCACGATTCAAGTCGGGGCTATAGTTCACAACGTGGTATGACAGGTAGTACTCCTGGTGCTAATCCTGGAAACAATGAAACTTTTCCCTCTACACAGTCATCAAACCCACTAGGTGTAGGTGTTTATTCTACATCTGGATATTTACCTAGTTATCAGTTGCCACATGTTTCATTTGCTCCGACTACATTTACTAATAACTC ]
[-] EMBL CD112585 [ GAAACTTTTCCCTCTACACAGTCATCAAACCCACTAGGTGTAGGTGTTTATTCTACATCTGGATATTTACCTAGTTATCAGTTGCCACATGTTTCATTTGCTCCGACTACATTTACTAATAACTCAGCCACTATACCAGAATCAAGAAATACTATTGAACGTGGTTCTCTTTATCCCACCTCACCGTCTTGTGAGCCTGGTATCATTAGAACGCCTTCAGATGGACGCAGAATACCTTCAGCACATTTTACAGATGTCACAGAAGAAGATGATGTAAATGTTGGGACACCTAGATCATGTAGAGATACAAACGTTTCTCCCTATATAACAGGAAGTGAGTCACATATAATTCGTTATCCAAGTGGCCAAATAACTACAGGGGGCGGTATCATTACTCCGTCAGGTAGTTCAc ]
[-] EMBL CD112400 [ TACACAGTCATCAAACCCACTAGGTGTAGGTGTTTATTCTACATCTGGATATTTACCTAGTTATCAGTTGCCACATGTTTCATTTGCTCCGACTACATTTACTAATAACTCAGCCACTATACCAGAATCAAGAAATACTATTGAACGTGGTTCTCTTTATCCCACCTCACCGTCTTGTGAGCCTGGTATCATTAGAACGCCTTCAGATGGACGCAGAATACCTTCAGCACATTTTACAGATGTCACAGAAGAAGATGATGAAAATGTTGGGACACCTAGATCATGTAGAGATACAAACGTTTCTGCCTATATAACAGGAAGTGAGTCACATATAATTCGTTATCCAAGTGGCCAAATAACTACAGGGGGCGGTATCATTACTCTGTTAGGTAGTCCAT ]
[-] EMBL CD111134 [ ACATCTGGATATTTACCTAGTTATCAGTTGCCACATGTTTCATTTGCTCCGACTACATTTACTAATAACTCAGCCACTATACCAGAATCAAGAAATACTATTGAACGTGGTTCTCTTTATCCCACCTCACCGTCTTGTGAGCCTGGTATCATTAGAACGCCTTCAGATGGACGCAGAATACCTTCAGCACATTTTACAGATGTCACAGAAGAAGATGATGAAAATGTTGGGACACCTAGATCATGTAGAGATACAAACGTTTCTGCCTATATAACAGGAAGTGAGTCACATATA ]
[+] EMBL AI067570 [ TGCTCCGACTACATTTACTAATAACTCAGCCACTATACCAGAATCAAGAAATACTATTGAACGTGGTTCTCTTTATCCCACCTCACCGTCTTGTGAGCCTGGTATCATTAGAACGCCTTCAGATGGACGCAGAATACCTTCAGCACATTTTACAGATGTCACAGAAGAAGATGATGAAAATGTTGGGACACCTAGATCATGTATAGATACAAACGTTTCTGCCTATATAACAGGAAGTGAGTCACATATAATTCGTTATCCAAGTGGCCAAATAACTACAGGGGGCGGTATCATTACTCTGTCAGGTAGTCCATCAGTACGACCTCAGCATGGTCTGTCATATCAAAATATACAACAAACAAGTGACCCAAGTTTGGGTTCAGTTCCTAATATTGACAGTGATCCAATATGGCCTGATTTGCCTCCAACTAATTGTGAATCTTATTAATATACACACAAAT ]
[-] EMBL CD090007 [ CCCACCTCACCGTCTTGTGAGCCTGGTATCATTAGAACGCCTTCAGATGGACGCAGAATACCTTCAGCACATTTTACAGATGTCACAGAAGAAGATGATGAAAATGTTGGGACACCTAGATCATGTAGAGATACAAACGTTTCTGCCTATATAACAGGAAGTGAGTCACATATAATTCGTTATCCAAGTGGCCAAATAACTACAGGGGGCGGTATCATTACTCTGTCAGGTAGTCCATCAGTACGACCTCAGCATGGTCTGTCATATCAAAATATACAACAAACAAGTGACCCAAGTTTGGGTTCAGTTCCTAATATTGACAGTGATCCAATATGGCCTGATTTGCCTCCAACTAATTGTTAATCTTATTAATATACACACAAATCGGTGTTTGTGTGTTCAACTGTGTAAAGCGGTAACTAGATATGGTTTCAACGTCATCTAACCTACCCAATCATTAATAAGAATGACAATGAAGTGAATTACTAGTTTATTTTAAACAAGTTTTTAAACACTCAATAACACATGCATCCATTCATATTTCTTTACTTTATATTCGCTTAATTACCCTAGCTAAGGC ]
[+] EMBL CD080541 [ TGTTGGGACACCTAGATCATGTAGAGATACAAACGTTTCTGCCTATATAACAGGAAGTGAGTCACATATAATTCGTTATCCAAGTGGCCAAATAACTACAGGGGGCGGTATCATTACTCTGTCAGGTAGTCCATCAGTACGACCTCAGCATGGTCTGTCATATCAAAATATACAACAAACAAGTGACCCAAGTTTGGGTTCAGTTCCTAATATTGACAGTGATCCAATATGGCCTGATTTGCCTCCAACTAATTGTTAATCTTATTAATATACACACAAATCGGTGTTTGTGTGTTCAACTGTGTAAAGCGGTAACTAGATATGGTTTCAACGTCATCTAACCTACCCAATCATTAATAAGAATGACAATGAAGTGAATTACTAGTTTATTTTAAACAAGTTTTTAAACACTCAATAACACATGCATCCATTCATATTTCTTTACTTTATATTCGCTTAATTACCCTAGCTAAGGCGTATTTCAACGTATACAAACTACCCAATTAAAATTACATCCACATTAGATTGAACATATTTTTGCTAAATTATTCAAACTTGCTTTACTAATTATGTTAGCATCATTTCACTTCCGTTNTATGNCACTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGAGGNGGGCTTTCTGTAACGCAATAAATAGTTAAACTGTGNTAATNNGTTTTTTGTTGTATCCCTATGCAGTTTTTTTAAACTTGTAAATAGGTTTATATTTTACCAAACAAAACTTC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||