Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8772 cluster # 8772       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8772#0 length = 1337 sequences # 7  

consensusID : consensus_8772#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1337
fasta sequence
                              [AGCACTGCATTCTGCTGATAACATGGGTCTTCCTTTTTACCAACCTTATAATTCGCAGATCGAGGATGGTTTAAGTCAGCATACTGGTTTTAATAACAGTCTGGTTGGAAGTGTAGGAGGCCGCCGCTGTACAGTAACTGACGTACTGACAGCAGACATGTCAGTAAGTGCTCTTTATATTCATGAGCTTTTCCATAGAAGACGACAACAACGACAGAACCACGATTCAAGTCGGGGCTATAGTTCACAACGTGGTATGACAGGTAGTACTCCTGGTGCTAATCCTGGAAACAATGAAACTTTTCCCTCTACACAGTCATCAAACCCACTAGGTGTAGGTGTTTATTCTACATCTGGATATTTACCTAGTTATCAGTTGCCACATGTTTCATTTGCTCCGACTACATTTACTAATAACTCAGCCACTATACCAGAATCAAGAAATACTATTGAACGTGGTTCTCTTTATCCCACCTCACCGTCTTGTGAGCCTGGTATCATTAGAACGCCTTCAGATGGACGCAGAATACCTTCAGCACATTTTACAGATGTCACAGAAGAAGATGATGAAAATGTTGGGACACCTAGATCATGTAGAGATACAAACGTTTCTGCCTATATAACAGGAAGTGAGTCACATATAATTCGTTATCCAAGTGGCCAAATAACTACAGGGGGCGGTATCATTACTCTGTCAGGTAGTCCATCAGTACGACCTCAGCATGGTCTGTCATATCAAAATATACAACAAACAAGTGACCCAAGTTTGGGTTCAGTTCCTAATATTGACAGTGATCCAATATGGCCTGATTTGCCTCCAACTAATTGTTAATCTTATTAATATACACACAAATCGGTGTTTGTGTGTTCAACTGTGTAAAGCGGTAACTAGATATGGTTTCAACGTCATCTAACCTACCCAATCATTAATAAGAATGACAATGAAGTGAATTACTAGTTTATTTTAAACAAGTTTTTAAACACTCAATAACACATGCATCCATTCATATTTCTTTACTTTATATTCGCTTAATTACCCTAGCTAAGGCGTATTTCAACGTATACAAACTACCCAATTAAAATTACATCCACATTAGATTGAACATATTTTTGCTAAATTATTCAAACTTGCTTTACTAATTATGTTAGCATCATTTCACTTCCGTTNTATGNCACTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGAGGNGGGCTTTCTGTAACGCAATAAATAGTTAAACTGTGNTAATNNGTTTTTTGTTGTATCCCTATGCAGTTTTTTTAAACTTGTAAATAGGTTTATATTTTACCAAACAAAACTTC]

[+] EMBL CD188640             [AGCACTGCATTCTGCTGATAACATGGGTCTTCCTTTTTACCAACCTTATAATTCGCAGATCGAGGATGGTTTAAGTCAGCATACTGGTTTTAATAACAGTCTGGTTGGAAGTGTAGGAGGCCGCCGCTGTACAGTAACTGACGTACTGACAGCAGACATGTCAGTAAGTGCTCTTTATATTCATGAGCTTTTCCATAGAAGACGACAACAACGACAGAACCACGATTCAAGTCGGGGCTATAGTTCACAACGTGGTATGACAGGTAGTACTCCTGGTGCTAATCCTGGAAACAATGAAACTTTTCCCTCTACACAGTCATCAAACCCACTAGGTGTAGGTGTTTATTCTACATCTGGATATTTACCTAGTTATCAGTTGCCACATGTTTCATTTGCTCCGACTACATTTACTAATAACTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD112585             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GAAACTTTTCCCTCTACACAGTCATCAAACCCACTAGGTGTAGGTGTTTATTCTACATCTGGATATTTACCTAGTTATCAGTTGCCACATGTTTCATTTGCTCCGACTACATTTACTAATAACTCAGCCACTATACCAGAATCAAGAAATACTATTGAACGTGGTTCTCTTTATCCCACCTCACCGTCTTGTGAGCCTGGTATCATTAGAACGCCTTCAGATGGACGCAGAATACCTTCAGCACATTTTACAGATGTCACAGAAGAAGATGATGTAAATGTTGGGACACCTAGATCATGTAGAGATACAAACGTTTCTCCCTATATAACAGGAAGTGAGTCACATATAATTCGTTATCCAAGTGGCCAAATAACTACAGGGGGCGGTATCATTACTCCGTCAGGTAGTTCAc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD112400             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TACACAGTCATCAAACCCACTAGGTGTAGGTGTTTATTCTACATCTGGATATTTACCTAGTTATCAGTTGCCACATGTTTCATTTGCTCCGACTACATTTACTAATAACTCAGCCACTATACCAGAATCAAGAAATACTATTGAACGTGGTTCTCTTTATCCCACCTCACCGTCTTGTGAGCCTGGTATCATTAGAACGCCTTCAGATGGACGCAGAATACCTTCAGCACATTTTACAGATGTCACAGAAGAAGATGATGAAAATGTTGGGACACCTAGATCATGTAGAGATACAAACGTTTCTGCCTATATAACAGGAAGTGAGTCACATATAATTCGTTATCCAAGTGGCCAAATAACTACAGGGGGCGGTATCATTACTCTGTTAGGTAGTCCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD111134             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACATCTGGATATTTACCTAGTTATCAGTTGCCACATGTTTCATTTGCTCCGACTACATTTACTAATAACTCAGCCACTATACCAGAATCAAGAAATACTATTGAACGTGGTTCTCTTTATCCCACCTCACCGTCTTGTGAGCCTGGTATCATTAGAACGCCTTCAGATGGACGCAGAATACCTTCAGCACATTTTACAGATGTCACAGAAGAAGATGATGAAAATGTTGGGACACCTAGATCATGTAGAGATACAAACGTTTCTGCCTATATAACAGGAAGTGAGTCACATATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL AI067570             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGCTCCGACTACATTTACTAATAACTCAGCCACTATACCAGAATCAAGAAATACTATTGAACGTGGTTCTCTTTATCCCACCTCACCGTCTTGTGAGCCTGGTATCATTAGAACGCCTTCAGATGGACGCAGAATACCTTCAGCACATTTTACAGATGTCACAGAAGAAGATGATGAAAATGTTGGGACACCTAGATCATGTATAGATACAAACGTTTCTGCCTATATAACAGGAAGTGAGTCACATATAATTCGTTATCCAAGTGGCCAAATAACTACAGGGGGCGGTATCATTACTCTGTCAGGTAGTCCATCAGTACGACCTCAGCATGGTCTGTCATATCAAAATATACAACAAACAAGTGACCCAAGTTTGGGTTCAGTTCCTAATATTGACAGTGATCCAATATGGCCTGATTTGCCTCCAACTAATTGTGAATCTTATTAATATACACACAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD090007             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CCCACCTCACCGTCTTGTGAGCCTGGTATCATTAGAACGCCTTCAGATGGACGCAGAATACCTTCAGCACATTTTACAGATGTCACAGAAGAAGATGATGAAAATGTTGGGACACCTAGATCATGTAGAGATACAAACGTTTCTGCCTATATAACAGGAAGTGAGTCACATATAATTCGTTATCCAAGTGGCCAAATAACTACAGGGGGCGGTATCATTACTCTGTCAGGTAGTCCATCAGTACGACCTCAGCATGGTCTGTCATATCAAAATATACAACAAACAAGTGACCCAAGTTTGGGTTCAGTTCCTAATATTGACAGTGATCCAATATGGCCTGATTTGCCTCCAACTAATTGTTAATCTTATTAATATACACACAAATCGGTGTTTGTGTGTTCAACTGTGTAAAGCGGTAACTAGATATGGTTTCAACGTCATCTAACCTACCCAATCATTAATAAGAATGACAATGAAGTGAATTACTAGTTTATTTTAAACAAGTTTTTAAACACTCAATAACACATGCATCCATTCATATTTCTTTACTTTATATTCGCTTAATTACCCTAGCTAAGGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD080541             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGTTGGGACACCTAGATCATGTAGAGATACAAACGTTTCTGCCTATATAACAGGAAGTGAGTCACATATAATTCGTTATCCAAGTGGCCAAATAACTACAGGGGGCGGTATCATTACTCTGTCAGGTAGTCCATCAGTACGACCTCAGCATGGTCTGTCATATCAAAATATACAACAAACAAGTGACCCAAGTTTGGGTTCAGTTCCTAATATTGACAGTGATCCAATATGGCCTGATTTGCCTCCAACTAATTGTTAATCTTATTAATATACACACAAATCGGTGTTTGTGTGTTCAACTGTGTAAAGCGGTAACTAGATATGGTTTCAACGTCATCTAACCTACCCAATCATTAATAAGAATGACAATGAAGTGAATTACTAGTTTATTTTAAACAAGTTTTTAAACACTCAATAACACATGCATCCATTCATATTTCTTTACTTTATATTCGCTTAATTACCCTAGCTAAGGCGTATTTCAACGTATACAAACTACCCAATTAAAATTACATCCACATTAGATTGAACATATTTTTGCTAAATTATTCAAACTTGCTTTACTAATTATGTTAGCATCATTTCACTTCCGTTNTATGNCACTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGAGGNGGGCTTTCTGTAACGCAATAAATAGTTAAACTGTGNTAATNNGTTTTTTGTTGTATCCCTATGCAGTTTTTTTAAACTTGTAAATAGGTTTATATTTTACCAAACAAAACTTC]


>consensus_8772#0 AGCACTGCATTCTGCTGATAACATGGGTCTTCCTTTTTACCAACCTTATAATTCGCAGAT CGAGGATGGTTTAAGTCAGCATACTGGTTTTAATAACAGTCTGGTTGGAAGTGTAGGAGG CCGCCGCTGTACAGTAACTGACGTACTGACAGCAGACATGTCAGTAAGTGCTCTTTATAT TCATGAGCTTTTCCATAGAAGACGACAACAACGACAGAACCACGATTCAAGTCGGGGCTA TAGTTCACAACGTGGTATGACAGGTAGTACTCCTGGTGCTAATCCTGGAAACAATGAAAC TTTTCCCTCTACACAGTCATCAAACCCACTAGGTGTAGGTGTTTATTCTACATCTGGATA TTTACCTAGTTATCAGTTGCCACATGTTTCATTTGCTCCGACTACATTTACTAATAACTC AGCCACTATACCAGAATCAAGAAATACTATTGAACGTGGTTCTCTTTATCCCACCTCACC GTCTTGTGAGCCTGGTATCATTAGAACGCCTTCAGATGGACGCAGAATACCTTCAGCACA TTTTACAGATGTCACAGAAGAAGATGATGAAAATGTTGGGACACCTAGATCATGTAGAGA TACAAACGTTTCTGCCTATATAACAGGAAGTGAGTCACATATAATTCGTTATCCAAGTGG CCAAATAACTACAGGGGGCGGTATCATTACTCTGTCAGGTAGTCCATCAGTACGACCTCA GCATGGTCTGTCATATCAAAATATACAACAAACAAGTGACCCAAGTTTGGGTTCAGTTCC TAATATTGACAGTGATCCAATATGGCCTGATTTGCCTCCAACTAATTGTTAATCTTATTA ATATACACACAAATCGGTGTTTGTGTGTTCAACTGTGTAAAGCGGTAACTAGATATGGTT TCAACGTCATCTAACCTACCCAATCATTAATAAGAATGACAATGAAGTGAATTACTAGTT TATTTTAAACAAGTTTTTAAACACTCAATAACACATGCATCCATTCATATTTCTTTACTT TATATTCGCTTAATTACCCTAGCTAAGGCGTATTTCAACGTATACAAACTACCCAATTAA AATTACATCCACATTAGATTGAACATATTTTTGCTAAATTATTCAAACTTGCTTTACTAA TTATGTTAGCATCATTTCACTTCCGTTNTATGNCACTATATATATATATATATATATATA TATATATATATATATATATGAGGNGGGCTTTCTGTAACGCAATAAATAGTTAAACTGTGN TAATNNGTTTTTTGTTGTATCCCTATGCAGTTTTTTTAAACTTGTAAATAGGTTTATATT TTACCAAACAAAACTTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)