These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8772#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1337 fasta sequence [AGCACTGCATTCTGCTGATAACATGGGTCTTCCTTTTTACCAACCTTATAATTCGCAGATCGAGGATGGTTTAAGTCAGCATACTGGTTTTAATAACAGTCTGGTTGGAAGTGTAGGAGGCCGCCGCTGTACAGTAACTGACGTACTGACAGCAGACATGTCAGTAAGTGCTCTTTATATTCATGAGCTTTTCCATAGAAGACGACAACAACGACAGAACCACGATTCAAGTCGGGGCTATAGTTCACAACGTGGTATGACAGGTAGTACTCCTGGTGCTAATCCTGGAAACAATGAAACTTTTCCCTCTACACAGTCATCAAACCCACTAGGTGTAGGTGTTTATTCTACATCTGGATATTTACCTAGTTATCAGTTGCCACATGTTTCATTTGCTCCGACTACATTTACTAATAACTCAGCCACTATACCAGAATCAAGAAATACTATTGAACGTGGTTCTCTTTATCCCACCTCACCGTCTTGTGAGCCTGGTATCATTAGAACGCCTTCAGATGGACGCAGAATACCTTCAGCACATTTTACAGATGTCACAGAAGAAGATGATGAAAATGTTGGGACACCTAGATCATGTAGAGATACAAACGTTTCTGCCTATATAACAGGAAGTGAGTCACATATAATTCGTTATCCAAGTGGCCAAATAACTACAGGGGGCGGTATCATTACTCTGTCAGGTAGTCCATCAGTACGACCTCAGCATGGTCTGTCATATCAAAATATACAACAAACAAGTGACCCAAGTTTGGGTTCAGTTCCTAATATTGACAGTGATCCAATATGGCCTGATTTGCCTCCAACTAATTGTTAATCTTATTAATATACACACAAATCGGTGTTTGTGTGTTCAACTGTGTAAAGCGGTAACTAGATATGGTTTCAACGTCATCTAACCTACCCAATCATTAATAAGAATGACAATGAAGTGAATTACTAGTTTATTTTAAACAAGTTTTTAAACACTCAATAACACATGCATCCATTCATATTTCTTTACTTTATATTCGCTTAATTACCCTAGCTAAGGCGTATTTCAACGTATACAAACTACCCAATTAAAATTACATCCACATTAGATTGAACATATTTTTGCTAAATTATTCAAACTTGCTTTACTAATTATGTTAGCATCATTTCACTTCCGTTNTATGNCACTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGAGGNGGGCTTTCTGTAACGCAATAAATAGTTAAACTGTGNTAATNNGTTTTTTGTTGTATCCCTATGCAGTTTTTTTAAACTTGTAAATAGGTTTATATTTTACCAAACAAAACTTC] [+] EMBL CD188640 [AGCACTGCATTCTGCTGATAACATGGGTCTTCCTTTTTACCAACCTTATAATTCGCAGATCGAGGATGGTTTAAGTCAGCATACTGGTTTTAATAACAGTCTGGTTGGAAGTGTAGGAGGCCGCCGCTGTACAGTAACTGACGTACTGACAGCAGACATGTCAGTAAGTGCTCTTTATATTCATGAGCTTTTCCATAGAAGACGACAACAACGACAGAACCACGATTCAAGTCGGGGCTATAGTTCACAACGTGGTATGACAGGTAGTACTCCTGGTGCTAATCCTGGAAACAATGAAACTTTTCCCTCTACACAGTCATCAAACCCACTAGGTGTAGGTGTTTATTCTACATCTGGATATTTACCTAGTTATCAGTTGCCACATGTTTCATTTGCTCCGACTACATTTACTAATAACTC ] [-] EMBL CD112585 [ GAAACTTTTCCCTCTACACAGTCATCAAACCCACTAGGTGTAGGTGTTTATTCTACATCTGGATATTTACCTAGTTATCAGTTGCCACATGTTTCATTTGCTCCGACTACATTTACTAATAACTCAGCCACTATACCAGAATCAAGAAATACTATTGAACGTGGTTCTCTTTATCCCACCTCACCGTCTTGTGAGCCTGGTATCATTAGAACGCCTTCAGATGGACGCAGAATACCTTCAGCACATTTTACAGATGTCACAGAAGAAGATGATGTAAATGTTGGGACACCTAGATCATGTAGAGATACAAACGTTTCTCCCTATATAACAGGAAGTGAGTCACATATAATTCGTTATCCAAGTGGCCAAATAACTACAGGGGGCGGTATCATTACTCCGTCAGGTAGTTCAc ] [-] EMBL CD112400 [ TACACAGTCATCAAACCCACTAGGTGTAGGTGTTTATTCTACATCTGGATATTTACCTAGTTATCAGTTGCCACATGTTTCATTTGCTCCGACTACATTTACTAATAACTCAGCCACTATACCAGAATCAAGAAATACTATTGAACGTGGTTCTCTTTATCCCACCTCACCGTCTTGTGAGCCTGGTATCATTAGAACGCCTTCAGATGGACGCAGAATACCTTCAGCACATTTTACAGATGTCACAGAAGAAGATGATGAAAATGTTGGGACACCTAGATCATGTAGAGATACAAACGTTTCTGCCTATATAACAGGAAGTGAGTCACATATAATTCGTTATCCAAGTGGCCAAATAACTACAGGGGGCGGTATCATTACTCTGTTAGGTAGTCCAT ] [-] EMBL CD111134 [ ACATCTGGATATTTACCTAGTTATCAGTTGCCACATGTTTCATTTGCTCCGACTACATTTACTAATAACTCAGCCACTATACCAGAATCAAGAAATACTATTGAACGTGGTTCTCTTTATCCCACCTCACCGTCTTGTGAGCCTGGTATCATTAGAACGCCTTCAGATGGACGCAGAATACCTTCAGCACATTTTACAGATGTCACAGAAGAAGATGATGAAAATGTTGGGACACCTAGATCATGTAGAGATACAAACGTTTCTGCCTATATAACAGGAAGTGAGTCACATATA ] [+] EMBL AI067570 [ TGCTCCGACTACATTTACTAATAACTCAGCCACTATACCAGAATCAAGAAATACTATTGAACGTGGTTCTCTTTATCCCACCTCACCGTCTTGTGAGCCTGGTATCATTAGAACGCCTTCAGATGGACGCAGAATACCTTCAGCACATTTTACAGATGTCACAGAAGAAGATGATGAAAATGTTGGGACACCTAGATCATGTATAGATACAAACGTTTCTGCCTATATAACAGGAAGTGAGTCACATATAATTCGTTATCCAAGTGGCCAAATAACTACAGGGGGCGGTATCATTACTCTGTCAGGTAGTCCATCAGTACGACCTCAGCATGGTCTGTCATATCAAAATATACAACAAACAAGTGACCCAAGTTTGGGTTCAGTTCCTAATATTGACAGTGATCCAATATGGCCTGATTTGCCTCCAACTAATTGTGAATCTTATTAATATACACACAAAT ] [-] EMBL CD090007 [ CCCACCTCACCGTCTTGTGAGCCTGGTATCATTAGAACGCCTTCAGATGGACGCAGAATACCTTCAGCACATTTTACAGATGTCACAGAAGAAGATGATGAAAATGTTGGGACACCTAGATCATGTAGAGATACAAACGTTTCTGCCTATATAACAGGAAGTGAGTCACATATAATTCGTTATCCAAGTGGCCAAATAACTACAGGGGGCGGTATCATTACTCTGTCAGGTAGTCCATCAGTACGACCTCAGCATGGTCTGTCATATCAAAATATACAACAAACAAGTGACCCAAGTTTGGGTTCAGTTCCTAATATTGACAGTGATCCAATATGGCCTGATTTGCCTCCAACTAATTGTTAATCTTATTAATATACACACAAATCGGTGTTTGTGTGTTCAACTGTGTAAAGCGGTAACTAGATATGGTTTCAACGTCATCTAACCTACCCAATCATTAATAAGAATGACAATGAAGTGAATTACTAGTTTATTTTAAACAAGTTTTTAAACACTCAATAACACATGCATCCATTCATATTTCTTTACTTTATATTCGCTTAATTACCCTAGCTAAGGC ] [+] EMBL CD080541 [ TGTTGGGACACCTAGATCATGTAGAGATACAAACGTTTCTGCCTATATAACAGGAAGTGAGTCACATATAATTCGTTATCCAAGTGGCCAAATAACTACAGGGGGCGGTATCATTACTCTGTCAGGTAGTCCATCAGTACGACCTCAGCATGGTCTGTCATATCAAAATATACAACAAACAAGTGACCCAAGTTTGGGTTCAGTTCCTAATATTGACAGTGATCCAATATGGCCTGATTTGCCTCCAACTAATTGTTAATCTTATTAATATACACACAAATCGGTGTTTGTGTGTTCAACTGTGTAAAGCGGTAACTAGATATGGTTTCAACGTCATCTAACCTACCCAATCATTAATAAGAATGACAATGAAGTGAATTACTAGTTTATTTTAAACAAGTTTTTAAACACTCAATAACACATGCATCCATTCATATTTCTTTACTTTATATTCGCTTAATTACCCTAGCTAAGGCGTATTTCAACGTATACAAACTACCCAATTAAAATTACATCCACATTAGATTGAACATATTTTTGCTAAATTATTCAAACTTGCTTTACTAATTATGTTAGCATCATTTCACTTCCGTTNTATGNCACTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGAGGNGGGCTTTCTGTAACGCAATAAATAGTTAAACTGTGNTAATNNGTTTTTTGTTGTATCCCTATGCAGTTTTTTTAAACTTGTAAATAGGTTTATATTTTACCAAACAAAACTTC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||