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Schistosoma mansoni
cluster # 8774 cluster # 8774       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8774#0 length = 957 sequences # 7  

consensusID : consensus_8774#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 957
fasta sequence
                              [TGGTATTGAATTAGAACAAGCTGTTGGCAAGAATAATGGTTCTATCAATGGGATACGTTATTTTGATTGTGCTGTTGGTCATGGAATATTTGCACCCATTAGCCGTATACAGAAATTGCCTGCACGACCGAACACACCAAACTTAACTAAACTATCGGATAATTCAACAACGATGACTACATCATTTCATTCGGAGCAAGTTGATGGAGTAGCAGGTAGATCATGGTGTTGTCGTCGTACACCATGGTCTAGTACCACATCACCAATGATTGGACGTGCTGTAATTGGTCGACCACCTCTACCGACAGAATTAGTCAATGCATTGAAAGCTGTTGGACGTGTACCAGCTGAGTCATTCGAAGAACCAGTGTTTTATTTAACTGAAGGAATGCAAGTTTTATGTGCTGGAGAAATTGGTATTGTTCGGTATATTGGTCCAATTACATTTGCTGAAGGTATTTGGCTTGGTATTGAATTACGTAAACCACGTGGACGTCATGATGGATGTGTTGCTGGGCGACGTTATTTCACATGTCGTCCTGGTCATGGTTTATTAGTTCGACCAGCTCGTGTATTTTGTCATGGTATAAATGCTGTCAATCTTCTTCCACCTGCTTTAGCTGAAATAGAACGTCAATTAGCTGTTAAACGTCAAGAGTCAGCAAACAGTTGTAACAACGGTAGCAGTAGAGTATCTTCAACGAATTCAATAACTTCTGATAATGAACAGTCTTCAAAGATTTCATCATAGAATACATTACAGTGAATGGAATATGTTTTTTTTTAATTGGCATTTTGCAACAACCTTTCTTTCTATCCTTACTGTAAACCTCATAGATATGAAATCACTCATCATTATCCCATTCCACCAAAACCCCATTTTTTCTTTTTGTTAAACGCATTTACACTGCTTATCTTCGTTGGTTTTTCAGTCTTCGGTTNTTCTATTCCAAAACA]

[-] EMBL CD171172             [TGGTATTGAATTAGAACAAGCTGTTGGCAAGAATAATGGTTCTATCAATGGGATACGTTATTTTGATTGTGCTGTTGGTCATGGAATATTTGCACCCATTAGCCGTATACAGAAATTGCCTGCACGACCGAACACACCAAACTTAACTAAACTATCGGATAATTCAACAACGATGACTACATCATTTCATTCGGAGCAAGTTGATGGAGTAGCAGGTAGATCATGGTGTTGTCGTCGTACACCATGGTCTAGTACCACATCACCAATGATTGGACGTGCTGTAATTGGTCGACCACCTCTACCGACAGAATTAGTCAATGCATTGAAAGCTGTTGGACGTGTACCAGCTGAGTCATTCGAAGAACCAGTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD159850             [TGGTATTGAAGTAGAACATGCTGTTGGCAAGAATAATGGTTCTATCAATGGGATACGTTATTTTGATTGTGCTGTTGGTCATGGAATATTTGCACCCATTAGCCGTATACAGAAATTGCCTGCACGACCGAACACACCAAACTTAACTAAACTATCGGATAATTCAACAACGATGACTACATCATTTCATTCGGAGCAAGTTGATGGAGTAGCAGGTAGATCATGGTGTTGTCGTCGTACACCATGGTCTAGTACCACATCACCAATGATTGGACGTGCTGTAATTGGTCGACCACCTCTACCGACAGAATTAGTCAATGCATTGAAAGCTGTTGGACGTGTACCAGCTGAGTCATTCGAAGAACCAGTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD171176             [TGGTATTGAATTAGAACAAGCTGTTGGCAAGAATAATGGTTCTATCAATGGGATACGTTATTTTGATTGTGCTGTTGGTCATGGAATATTTGCACCCATTAGCCGTATACAGAAATTGCCTGCACGACCGAACACACCAAACTTAACTAAACTATCGGATAATTCAACAACGATGACTACATCATTTCATTCGGAGCAAGTTGATGGAGTAGCAGGTAGATCATGGTGTTGTCGTCGTACACCATGGTCTAGTACCACATCACCAATGATTGGACGTGCTGTAATTGGTCGACCACCTCTACCGACAGAATTAGTCAATGCATTGAAAGCTGTTGGACGTGTACCAGCTGAGTCATTCGAAGAACCAGCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD065084             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTAGTCAATGCATTGAAAGCTGTTGGACGTGTACCAGCTGAGTCATTCGAAGAACCAGTGTTTTATTTAACTGAAGGAATGCAAGTTTTATGTGCTGGAGAAATTGGTATTGTTCGGTATATTGGTCCAATTACATTTGCTGAAGGTATTTGGCTTGGTATTGAATTACGCAAACCACGTGGACCTTATGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD156078             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TGTACCAGCTGAGTCATTCGAAGAACCAGTGTTTTATTTAACTGAAGGAATGCAAGTTTTATGTGCTGGAGAAATTGGTATTGTTCGGTATATTGGTCCAATTACATTTGCTGAAGGTATTTGGCTTGGTATTGAATTACGTAAACCACGTGGACGTCATGATGGATGTGTTGCTGGGCGACGTTATTTCACATGTCGTCCTGGTCATGGTTTATTAGTTCGACCAGCTCGTGTATTTTGTCATGGTATAAATGCTGTCAATCTTCTTCCACCTGCTTTAGCTGAAATAGAACGTCAATTAGCTGTTAAACGTCAAGAGTCAGCAAACAGTTGTAACA                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD082960             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agGTTTTATGTGCTGGAGAAATTGGTATTGTTCGGTATATTGGTCCAATTACATTTGCTGAAGGTATTTGGCTTGGTATTGAATTACGTAAACCACGTGGACGTCATGATGGATGTGTTGCTGGGCGACGTTATTTCACATGTCGTCCTGGTCATGGTTTATTAGTTCGACCAGCTCGTGTATTTTGTCATGGTATAAATGCTGTCAATCTTCTTCCACCTGCTTTAGCTGAAATAGAACGTCAATTAGCTGTTAAACGTCAAGAGTCAGCAAACAGTTGTAACAACGGTAGCAGTAGAGTATCTTCAACGAATTCAATAACTTCTGATAATGAACAGTCTTCAAAGATTTCATCATAGAATACATTACAGTGAATGGAATATGTTTTTTTTTAATTGGCATTTTGCAACAACCTTTCTTTCTATCCTTACTGTAAACCTCATAGATATGAAATCACTCATCATTATCCCATTCCACCAAAACCCCATTTTTTCTTTTTGTTAAACGCATTTACACTGCTTATCTTCGTTGGTTTTTCAGTCTTCGGTTNTTCTATTCCAAAACA]
[-] EMBL CD194301             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CGTCATGATGGATGTGTTGCTGGGCGACGGTATTTCACATGTCGTCCTGGTCATGGTTTATTAGTTCGACCAGCTCGTGTATTTTGTCATGGTATAAATGCTGTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]


>consensus_8774#0 TGGTATTGAATTAGAACAAGCTGTTGGCAAGAATAATGGTTCTATCAATGGGATACGTTA TTTTGATTGTGCTGTTGGTCATGGAATATTTGCACCCATTAGCCGTATACAGAAATTGCC TGCACGACCGAACACACCAAACTTAACTAAACTATCGGATAATTCAACAACGATGACTAC ATCATTTCATTCGGAGCAAGTTGATGGAGTAGCAGGTAGATCATGGTGTTGTCGTCGTAC ACCATGGTCTAGTACCACATCACCAATGATTGGACGTGCTGTAATTGGTCGACCACCTCT ACCGACAGAATTAGTCAATGCATTGAAAGCTGTTGGACGTGTACCAGCTGAGTCATTCGA AGAACCAGTGTTTTATTTAACTGAAGGAATGCAAGTTTTATGTGCTGGAGAAATTGGTAT TGTTCGGTATATTGGTCCAATTACATTTGCTGAAGGTATTTGGCTTGGTATTGAATTACG TAAACCACGTGGACGTCATGATGGATGTGTTGCTGGGCGACGTTATTTCACATGTCGTCC TGGTCATGGTTTATTAGTTCGACCAGCTCGTGTATTTTGTCATGGTATAAATGCTGTCAA TCTTCTTCCACCTGCTTTAGCTGAAATAGAACGTCAATTAGCTGTTAAACGTCAAGAGTC AGCAAACAGTTGTAACAACGGTAGCAGTAGAGTATCTTCAACGAATTCAATAACTTCTGA TAATGAACAGTCTTCAAAGATTTCATCATAGAATACATTACAGTGAATGGAATATGTTTT TTTTTAATTGGCATTTTGCAACAACCTTTCTTTCTATCCTTACTGTAAACCTCATAGATA TGAAATCACTCATCATTATCCCATTCCACCAAAACCCCATTTTTTCTTTTTGTTAAACGC ATTTACACTGCTTATCTTCGTTGGTTTTTCAGTCTTCGGTTNTTCTATTCCAAAACA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)