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Schistosoma mansoni
cluster # 8791 cluster # 8791       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8791#0 length = 623 sequences # 7  

consensusID : consensus_8791#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 623
fasta sequence
                              [TATATTAAAATAGCGTTGCTGAAAGATGTCCAGCACTTTGTACGATGTATTAGAGTCCTACGAATCCGGGAAAGTCAAAAAGGGATCTGTTCGGACGAGTGAGTGGATGGGTTACAAAAATGAGAGTATGACATTTGATGAAATTATGGAACAAGCTGAAGTTATTTTCGCCGAAAAATTTGGCTCAAAAGACTGCAATAAATATCCAACTGTTGTTGAAATCAGACCAAGTGGAGGACCTGCTTGCGAATCATTATTCACGGTACTTCGGCATATAACAGATGATCAGATTAGCAAGAAAGTGTGTAATGAATCACCTCATATTTTCCAAAGCGAATGGTCTAATTTCTCTGTTTATATAAAACGTTTTCATTTAAAATCTATTAAACAAGATGAATTTATGGATGAAACAAAAGATTTTATTGAACAATTATCAGAAGGAAATTTTAACTATTTGCCAGAACCATATTATTGGATTATATATGATCCATCCTTAACAACTAATGAAGATGGTAATGCAGAGATTTGGTTAAAAGTTGAATAACACTATGATTGTCTTCAATGTTTACTATTGGAAACTTTGTCTGGATTCAGCTTAACTATCTTATCATACCTTTTTCATT]

[+] EMBL CD120811             [TATATTAAAATAGCGTTGCTGAAAGATGTCCAGCACTTTGTACGATGTATTAGAGTCCTACGAGTCCGGGAAAGTCAAAAAGGGTTCTGTTCGGACGAGTGAGTGGATGGGTTACAAAAATGAGAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL AW330553             [       AAATAGCGTTGCTGAAAGATGTCCAGCACTTTGTACGATGTATTAGAGTCCTACGAATCCGGGAAAGTCAAAAAGGGATCTGTTCGGACGAGTGAGTGGATGGGTTACAAAAATGAGAGTATGACATTTGATGAAATTATGGAACAAGCTGAAGTTATTTTCGCCGAAAAATTTGGCTCAAAAGACTGCAATAAATATCCAACTGTTGTTGAAATCAGACCAAGTGGAGGACCTGCTTGCGAATCATTATTCACGGTACTTCGGCATATAACAGATGATCAGATTAGCAAGAAAGTGTGTAATGAATCACCTCATATTTTCCCAAGCGAATGGTCT ATTTCTCTGTTTATATAAAACGTTTTCATTTAAAATCTATTAAAC ACATG ATTTTTGGATG AACAAAA ATTTTTTTG AC ATTATC G AGGAATTTT                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL AI977656             [         ATAGCGTTGCTGAAAGATGTCCAGCACTTTGTACGATGTATTAGAGTCCTACGAATCCGGGAAAGTCAAAAAGGGATCTGTTCGGACGAGTGAGTGGATGGGTTACAAAAATGAGAGTATGACATTTGATGAAATTATGGAACAAGCTGAAGTTATTTTCGCCGAAAAATTTGGCTCAAAAGACTGCAATAAATATCCAACTGTTGTTGAAATCAGACCAAGTGGAGGACCTGCTTGCGAATCATTATTCACGGTACTTCGGCATATAACAGATGATCAGATTAGCAAGAAAGTGTGTAATGAATCACCTCATATTTTCCAAAGCGAATGGTCTAATTTCTCTGTTTATATAAAACGTTTTCATTTAAAATCTATTAAACAAGATGAATTTATGGATGAAACAAAAGATTTTATTGAACAATTATCAGAAGGAAATTNTAACTATTTGCCAGAACCATATTATTGGATTATATATGATCCATCCTTAACAACTAATGAAGATGGTAATGCAGAGATTTGGTTAAAAG TGAATAACACTATGATTGTCTTCAATGTTT                                                        ]
[+] EMBL CD140560             [                                                                                                                                 GACATTTGATGAAATTATGGAACAAGCTGAAGTTATTTTCGCCGAAAAATTTGGCTCAAAAGACTGCAATAAATATCCAACTGTTGTTGAAATCAGACCAAGTGGAGGACCTGCTTGCGAATCATTATTCACGGTACTTCGGCATATAACAGATGATCAGATTAGCAAGAAAGTGTGTAATGAATCACCTCATATTTTCCAAAGCGAATGGTCTAATTTCTCTGTTTATATAAAACGTTTTCATTTAAAATCTATTAAACAAGATGAATTTATGGATGAAACAAAAGATTTTATTGAACAATTATCAGAAGGAAATTTTAACTATTTGCCAGAACCATATTATTGGATTATATATGATCCATCCTTAACAACTAATGAAGATGGTAATGCAGAGA                                                                                                   ]
[+] EMBL CD140594             [                                                                                                                                       TGATGAAATTATGGAACAAGCTGAAGTTATTTTCGCCGAAAAATTTGGCTCAAAAGACTGCAATAAATATCCAACTGTTGTTGAAATCAGACCAAGTGGAGGACCTGCTTGCGAATCATTATTCACGGTACTTCGGCATATAACAGATGATCAGATTAGCAAGAAAGTGTGTAATGAATCACCTCATATTTTCCAAAGCGAATGGTCTAATTTCTCTGTTTATATAAAACGTTTTCATTTAAAATCTATTAAACAAGATGAATTTATGGATGAAACAAAAGATTTTATTGAACAATTATCAGAAGGAAATTTTAACTATTTGCCAGAACCATATTATTGGATTATATATGATCCATCCTTAACAACTAATGAAGATGGTAATGCAGAGATTTGGTTAAAAGTTGAAT                                                                                 ]
[-] EMBL CD140623             [                                                                                                                                                                                    TGGCTCAAAAGACTGCAATAAATATCCAACTGTTGTTGAAATCAGACCAAGTGGAGGACCTGCTTGCGAATCATTATTCACGGTACTTCGGCATATAACAGATGATCAGATTAGCAAGAAAGTGTGTAATGAATCACCTCATATTTTCCAAAGCGAATGGTCTAATTTCTCTGTTTATATAAAACGTTTTCATTTAAAATCTATTAAACAAGATGAATTTATGGATGAAACAAAAGATTTTATTGAACAATTATCAGAAGGAAATTTTAACTATTTGCCAGAACCATATTATTGGATTATATATGATCCATCCTTAACAACTAATGAAGATGGTAATGCAGAGATTTGGTTAAAAGTTGAATAACACTATGATTGTCTTCAATGTTTACTATTGGAAACTTTGTCTGGATTCAGCTTAACTATCTTATCATACCTTTTTCATT]
[-] EMBL CD140674             [                                                                                                                                                                                            AAGACTGCAATAAATATCCAACTGTTGTTGAAATCAGACCAAGTGGAGGACCTGCTTGCGAATCATTATTCACGGTACTTCGGCATATAACAGATGATCAGATTAGCAAGAAAGTGTGTAATGAATCACCTCATATTTTCCAAAGCGAATGGTCTAATTTCTCTGTTTATATAAAACGTTTTCATTTAAAATCTATTAAACAAGATGAATTTATGGATGAAACAAAAGATTTTATTGAACAATTATCAGAAGGAAATTTTAACTATTTGCCAGAACCATATTATTGGATTATATATGATCCATCCTTAACAACTAATGAAGATGGTAATGCAGAGATTTGGTTAAAAGTTGAATAACACTATGATTGTCTTCAATGTTTACTATTGGAAACTTTGTCTGGATTCAGCTTAATTATCTTATCATACCTTTTTCATT]


>consensus_8791#0 TATATTAAAATAGCGTTGCTGAAAGATGTCCAGCACTTTGTACGATGTATTAGAGTCCTA CGAATCCGGGAAAGTCAAAAAGGGATCTGTTCGGACGAGTGAGTGGATGGGTTACAAAAA TGAGAGTATGACATTTGATGAAATTATGGAACAAGCTGAAGTTATTTTCGCCGAAAAATT TGGCTCAAAAGACTGCAATAAATATCCAACTGTTGTTGAAATCAGACCAAGTGGAGGACC TGCTTGCGAATCATTATTCACGGTACTTCGGCATATAACAGATGATCAGATTAGCAAGAA AGTGTGTAATGAATCACCTCATATTTTCCAAAGCGAATGGTCTAATTTCTCTGTTTATAT AAAACGTTTTCATTTAAAATCTATTAAACAAGATGAATTTATGGATGAAACAAAAGATTT TATTGAACAATTATCAGAAGGAAATTTTAACTATTTGCCAGAACCATATTATTGGATTAT ATATGATCCATCCTTAACAACTAATGAAGATGGTAATGCAGAGATTTGGTTAAAAGTTGA ATAACACTATGATTGTCTTCAATGTTTACTATTGGAAACTTTGTCTGGATTCAGCTTAAC TATCTTATCATACCTTTTTCATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)