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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8791#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 623 fasta sequence
[TATATTAAAATAGCGTTGCTGAAAGATGTCCAGCACTTTGTACGATGTATTAGAGTCCTACGAATCCGGGAAAGTCAAAAAGGGATCTGTTCGGACGAGTGAGTGGATGGGTTACAAAAATGAGAGTATGACATTTGATGAAATTATGGAACAAGCTGAAGTTATTTTCGCCGAAAAATTTGGCTCAAAAGACTGCAATAAATATCCAACTGTTGTTGAAATCAGACCAAGTGGAGGACCTGCTTGCGAATCATTATTCACGGTACTTCGGCATATAACAGATGATCAGATTAGCAAGAAAGTGTGTAATGAATCACCTCATATTTTCCAAAGCGAATGGTCTAATTTCTCTGTTTATATAAAACGTTTTCATTTAAAATCTATTAAACAAGATGAATTTATGGATGAAACAAAAGATTTTATTGAACAATTATCAGAAGGAAATTTTAACTATTTGCCAGAACCATATTATTGGATTATATATGATCCATCCTTAACAACTAATGAAGATGGTAATGCAGAGATTTGGTTAAAAGTTGAATAACACTATGATTGTCTTCAATGTTTACTATTGGAAACTTTGTCTGGATTCAGCTTAACTATCTTATCATACCTTTTTCATT]
[+] EMBL CD120811 [TATATTAAAATAGCGTTGCTGAAAGATGTCCAGCACTTTGTACGATGTATTAGAGTCCTACGAGTCCGGGAAAGTCAAAAAGGGTTCTGTTCGGACGAGTGAGTGGATGGGTTACAAAAATGAGAGT ]
[+] EMBL AW330553 [ AAATAGCGTTGCTGAAAGATGTCCAGCACTTTGTACGATGTATTAGAGTCCTACGAATCCGGGAAAGTCAAAAAGGGATCTGTTCGGACGAGTGAGTGGATGGGTTACAAAAATGAGAGTATGACATTTGATGAAATTATGGAACAAGCTGAAGTTATTTTCGCCGAAAAATTTGGCTCAAAAGACTGCAATAAATATCCAACTGTTGTTGAAATCAGACCAAGTGGAGGACCTGCTTGCGAATCATTATTCACGGTACTTCGGCATATAACAGATGATCAGATTAGCAAGAAAGTGTGTAATGAATCACCTCATATTTTCCCAAGCGAATGGTCT ATTTCTCTGTTTATATAAAACGTTTTCATTTAAAATCTATTAAAC ACATG ATTTTTGGATG AACAAAA ATTTTTTTG AC ATTATC G AGGAATTTT ]
[+] EMBL AI977656 [ ATAGCGTTGCTGAAAGATGTCCAGCACTTTGTACGATGTATTAGAGTCCTACGAATCCGGGAAAGTCAAAAAGGGATCTGTTCGGACGAGTGAGTGGATGGGTTACAAAAATGAGAGTATGACATTTGATGAAATTATGGAACAAGCTGAAGTTATTTTCGCCGAAAAATTTGGCTCAAAAGACTGCAATAAATATCCAACTGTTGTTGAAATCAGACCAAGTGGAGGACCTGCTTGCGAATCATTATTCACGGTACTTCGGCATATAACAGATGATCAGATTAGCAAGAAAGTGTGTAATGAATCACCTCATATTTTCCAAAGCGAATGGTCTAATTTCTCTGTTTATATAAAACGTTTTCATTTAAAATCTATTAAACAAGATGAATTTATGGATGAAACAAAAGATTTTATTGAACAATTATCAGAAGGAAATTNTAACTATTTGCCAGAACCATATTATTGGATTATATATGATCCATCCTTAACAACTAATGAAGATGGTAATGCAGAGATTTGGTTAAAAG TGAATAACACTATGATTGTCTTCAATGTTT ]
[+] EMBL CD140560 [ GACATTTGATGAAATTATGGAACAAGCTGAAGTTATTTTCGCCGAAAAATTTGGCTCAAAAGACTGCAATAAATATCCAACTGTTGTTGAAATCAGACCAAGTGGAGGACCTGCTTGCGAATCATTATTCACGGTACTTCGGCATATAACAGATGATCAGATTAGCAAGAAAGTGTGTAATGAATCACCTCATATTTTCCAAAGCGAATGGTCTAATTTCTCTGTTTATATAAAACGTTTTCATTTAAAATCTATTAAACAAGATGAATTTATGGATGAAACAAAAGATTTTATTGAACAATTATCAGAAGGAAATTTTAACTATTTGCCAGAACCATATTATTGGATTATATATGATCCATCCTTAACAACTAATGAAGATGGTAATGCAGAGA ]
[+] EMBL CD140594 [ TGATGAAATTATGGAACAAGCTGAAGTTATTTTCGCCGAAAAATTTGGCTCAAAAGACTGCAATAAATATCCAACTGTTGTTGAAATCAGACCAAGTGGAGGACCTGCTTGCGAATCATTATTCACGGTACTTCGGCATATAACAGATGATCAGATTAGCAAGAAAGTGTGTAATGAATCACCTCATATTTTCCAAAGCGAATGGTCTAATTTCTCTGTTTATATAAAACGTTTTCATTTAAAATCTATTAAACAAGATGAATTTATGGATGAAACAAAAGATTTTATTGAACAATTATCAGAAGGAAATTTTAACTATTTGCCAGAACCATATTATTGGATTATATATGATCCATCCTTAACAACTAATGAAGATGGTAATGCAGAGATTTGGTTAAAAGTTGAAT ]
[-] EMBL CD140623 [ TGGCTCAAAAGACTGCAATAAATATCCAACTGTTGTTGAAATCAGACCAAGTGGAGGACCTGCTTGCGAATCATTATTCACGGTACTTCGGCATATAACAGATGATCAGATTAGCAAGAAAGTGTGTAATGAATCACCTCATATTTTCCAAAGCGAATGGTCTAATTTCTCTGTTTATATAAAACGTTTTCATTTAAAATCTATTAAACAAGATGAATTTATGGATGAAACAAAAGATTTTATTGAACAATTATCAGAAGGAAATTTTAACTATTTGCCAGAACCATATTATTGGATTATATATGATCCATCCTTAACAACTAATGAAGATGGTAATGCAGAGATTTGGTTAAAAGTTGAATAACACTATGATTGTCTTCAATGTTTACTATTGGAAACTTTGTCTGGATTCAGCTTAACTATCTTATCATACCTTTTTCATT]
[-] EMBL CD140674 [ AAGACTGCAATAAATATCCAACTGTTGTTGAAATCAGACCAAGTGGAGGACCTGCTTGCGAATCATTATTCACGGTACTTCGGCATATAACAGATGATCAGATTAGCAAGAAAGTGTGTAATGAATCACCTCATATTTTCCAAAGCGAATGGTCTAATTTCTCTGTTTATATAAAACGTTTTCATTTAAAATCTATTAAACAAGATGAATTTATGGATGAAACAAAAGATTTTATTGAACAATTATCAGAAGGAAATTTTAACTATTTGCCAGAACCATATTATTGGATTATATATGATCCATCCTTAACAACTAATGAAGATGGTAATGCAGAGATTTGGTTAAAAGTTGAATAACACTATGATTGTCTTCAATGTTTACTATTGGAAACTTTGTCTGGATTCAGCTTAATTATCTTATCATACCTTTTTCATT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||