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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8807#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 718 fasta sequence
[TGGCACGTTGGATATACGTCTTATAAAAGCTTGAATTTTTCGAGGAGATGGCTGATTTAGAAGCTGTGCTAGCGGATGTCAGCTATTTGATGGCTATGGAGATGAGTAAATCCACTCCAGCGGCTCGTGCGAGCAAAAGAATTACATTACCGGACCCCAGCATCCGTGGTATCATGACCAAGTATTTGGAAAAGAACAACCAAATGACCTTCGATAAAATTTTCAACGAGAAGTTAGGTTACTTGTTGTTTCGGGATTTCGTTCTCAATGTAAGTGAAGAACCTGTTCCTCAGCTTACGTTTTACGAAAATATTAAAAAGTTTGAAAAGTTAGACACAGATGAAGAGCGTATTAAATTTGGCCGAGAAATATATGATCAACACATTATGAAAGAACTTTTATCTCATAACCACAAATTCTCTAAATCAACTGTGGATCATGTCCATGAACTACTCACTGTATCTCAAAAGACTAAAAAGCTACCAGCAGATACATTTTCTTTGTATGAAGATGAAATCCTACAGTCCCTTCGTGGTGATGTATTTGACAATTTTCTTAGAAGTAATAAATTCACTCGATTTTGTCAATGGAAGGATTTGGAGTTAAATATTAACTTAACCACAAACGATTTTAGCGTACATCGTATTATTGGCCGTGGTGGTTTTGGGGAGGTTTATGGATGCCGAAAAGCAGACACTGGTAAAATGTATGCTATGAA]
[+] EMBL CD115551 [TGGCACGTTGGATATACGTCTTATAAAAGCTTGAATTTTTCGAGGAGATGGCTGATTTAGAAGCTGTGCTAGCGGATGTCAGCTATTTGATGGCTATGGAGATGAGTAAATCCACTCCAGCGGCTCGTGCGAGCAAAAGAATTACATTACCGGACCCCAGCATCCGTGGTATCATGACCAAGTATTTGGAAAAGAACAACCAAATGACCTTCGATAAAATTTTCAACGAGAAGTTAGGTTACTTGTTGTTTCGGGATTTCGTTCTCAATGTAAGTGAAGAACCTGTTCCTCAGCTTACGTTTTACGAAAATATTAAAAAGTTTGAAAAGTTAGACACAGATGAAGAGCGTATTAAATTTGGCCGAGAAATATATGATCAACACATTATGAAAGAACTTTTATCTCATAACCACAAATTCTCTAAATCAACTGTGGATCATGTCCATGAACTACTCACTGTATCTCAAAAGACTAAAAAGCTACCAGCAGATACATTTTCTTTGTATGAAGATGAAATCCTACAGTCCCTTCGTGGTGATGTATTTGACAATTTTCTTAGAAGTAATAAATTCACTCGATTCTGTCA ]
[+] EMBL CD185121 [ TTAAAAAGTTTGAAAAGTTAGACACAGATGAAGAGCGTATTAAATTTGGCCGAGAAATATATGATCAACACATTATGAAAGAACTTTTATCTCATAACCACAAATTCTCTAAATCAACTGTGGATCATGTCCATGAACTACTCACTGTATCTCAAAAGACTAAAAAGCTACCAGCAGATACATTTTCTTTGTATGAAGATGAAATCCTACAGTCCCTTCGTGGTGATGTATTTGACAATTTTCTTAGAAGTAATAAATTCACTCGATTTTGTCAATGGAAGGATTTGGAGTTAAATATTAACTTAACCACAAACGATTTTAGCGTACATCGTATTATTGGCCGTGGTGGTTTTGGGGAGGTTTATGGATGCCGAAAAGCAGACACTGGTAAAATGTATGCTATGAA]
[+] EMBL CD133916 [ TTAAAAAGTTTGAAAAGTTAGACACAGATGAAGAGCGTATTAAATTTGGCCGAGAAATATATGATCAACACATTATGAAAGAACTTTTATCTCATAACCACAAATTCTCTAAATCAACTGTGGATCATGTCCATGAACTACTCACTGTATCCCAAAAGACTAAAAAGCTACCAGCAGATACATTTTCTTTGTATGAAGATGAAATCCTACAGTCCCTTCGTGGTGATGTATTTGACAATTTTCTTAGAAGTAATAAATTCACTCGATTTTGTCAATGGAAGGATTTGGAGTTAAATATTAACTTAACCACAAACGATTTTAGCGTACATCGTATTATTGGCCGTGGTGGTTTTGGGGAGGTTTATGGATGCCGAAAAGCAGACACTGGTAAAATGTATGCTATGAA]
[+] EMBL CD185525 [ ATATATGATCAACACATTATGAAAGAACTTTTATCTCATAACCACAAATTCTCTAAATCAACTGTGGATCATGTCCATGAACTACTCACTGTATCTCAAAAGACTAAAAAGCTACCAGCAGATACATTTTCTTTGTATGAAGATGAAATCCTACAGTCCCTTCGTGGTGATGTATTTGACAATTTTCTTAGAAGTAATAAATTCACTCGATTTTGTCAATGGAAGGATTTGGAGTTAAATATTAACTTAACCACAAACGATTTTAGCGTACATCGTATTATTGGCCGTGGTGGTTTTGGGGAGGTTTATGGATGCCGAAAAGCAGACACTGGTAAAATGTATGCTATGAA]
[+] EMBL CD133872 [ ATATATGATCAACACATTATGAAAGAACTTTTATCTCATAACCACAAATTCTCTAAATCAACTGTGGATCATGTCCATGAACTACTCACTGTATCTCAAAAGACTAAAAAGCTACCAGCAGATACATTTTCTTTGTATGAAGATGAAATCCTACAGTCCCTTCGTGGTGATGTATTTGACAATTTTCTTAGAAGTAATAAATTCACTCGATTTTGTCAATGGAAGGATTTGGAGTTAAATATTAACTTAACCACAAACGATTTTAGCGTACATCGTATTATTGGCCGTGGTGGTTTTGGGGAGGTTTATGGATGCCGAAAAGCAGACACTGGTAAAATGTATGCTATGAA]
[+] EMBL CD131515 [ ATATATGATCAACACATTATGAAAGAACTTTTATCTCATAACCACAAACTCTCTAAATCAACTGTGGATCATGTCCATGAACTACTCACTGTATCTCAAAAGACTAAAAAGCTACCAGCAGATACATTTTCTTTGTATGAAGATGAAATCCTACAGTCCCTTCGTGGTGATGTATTTGACAATTTTCTTAGAAGTAATAAATTCACTCGATTTTGTCAATGGAAGGATTTGGAGTTAAATATTAACTTAACCACAAACGATTTTAGCGTACATCGTATTATTGGCCGTGGTGGTTTTGGGGAGGTTTATGGATGCCGAAAAGCAGACACTGGTAAAATGTATGCTATGAA]
[+] EMBL CD131458 [ TCTCTAAATCAACTGTGGATCATGTCCATGAACTACTCACTGTATCTCAAAAGACTAAAAAGCTACCAGCAGATACATTTTCTTTGTATGAAGATGAAATCCTACAGTCCCTTCGTGGTGATGTATCTGACAATTTTCTTAGAAGTAATAAATTCACTCGATTTTGTCAATGGAAGGATTTGGAGTTAAATATTAACTTAACCACAAACGATTTTAGCGTACATCGTATTATTGGCCGTGGTGGTTTTGGGGAGGTTTATGGATGCCGAAAAGCAGACACTGGTAAAATGTATGCTATGAA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||