These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8807#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 718 fasta sequence [TGGCACGTTGGATATACGTCTTATAAAAGCTTGAATTTTTCGAGGAGATGGCTGATTTAGAAGCTGTGCTAGCGGATGTCAGCTATTTGATGGCTATGGAGATGAGTAAATCCACTCCAGCGGCTCGTGCGAGCAAAAGAATTACATTACCGGACCCCAGCATCCGTGGTATCATGACCAAGTATTTGGAAAAGAACAACCAAATGACCTTCGATAAAATTTTCAACGAGAAGTTAGGTTACTTGTTGTTTCGGGATTTCGTTCTCAATGTAAGTGAAGAACCTGTTCCTCAGCTTACGTTTTACGAAAATATTAAAAAGTTTGAAAAGTTAGACACAGATGAAGAGCGTATTAAATTTGGCCGAGAAATATATGATCAACACATTATGAAAGAACTTTTATCTCATAACCACAAATTCTCTAAATCAACTGTGGATCATGTCCATGAACTACTCACTGTATCTCAAAAGACTAAAAAGCTACCAGCAGATACATTTTCTTTGTATGAAGATGAAATCCTACAGTCCCTTCGTGGTGATGTATTTGACAATTTTCTTAGAAGTAATAAATTCACTCGATTTTGTCAATGGAAGGATTTGGAGTTAAATATTAACTTAACCACAAACGATTTTAGCGTACATCGTATTATTGGCCGTGGTGGTTTTGGGGAGGTTTATGGATGCCGAAAAGCAGACACTGGTAAAATGTATGCTATGAA] [+] EMBL CD115551 [TGGCACGTTGGATATACGTCTTATAAAAGCTTGAATTTTTCGAGGAGATGGCTGATTTAGAAGCTGTGCTAGCGGATGTCAGCTATTTGATGGCTATGGAGATGAGTAAATCCACTCCAGCGGCTCGTGCGAGCAAAAGAATTACATTACCGGACCCCAGCATCCGTGGTATCATGACCAAGTATTTGGAAAAGAACAACCAAATGACCTTCGATAAAATTTTCAACGAGAAGTTAGGTTACTTGTTGTTTCGGGATTTCGTTCTCAATGTAAGTGAAGAACCTGTTCCTCAGCTTACGTTTTACGAAAATATTAAAAAGTTTGAAAAGTTAGACACAGATGAAGAGCGTATTAAATTTGGCCGAGAAATATATGATCAACACATTATGAAAGAACTTTTATCTCATAACCACAAATTCTCTAAATCAACTGTGGATCATGTCCATGAACTACTCACTGTATCTCAAAAGACTAAAAAGCTACCAGCAGATACATTTTCTTTGTATGAAGATGAAATCCTACAGTCCCTTCGTGGTGATGTATTTGACAATTTTCTTAGAAGTAATAAATTCACTCGATTCTGTCA ] [+] EMBL CD185121 [ TTAAAAAGTTTGAAAAGTTAGACACAGATGAAGAGCGTATTAAATTTGGCCGAGAAATATATGATCAACACATTATGAAAGAACTTTTATCTCATAACCACAAATTCTCTAAATCAACTGTGGATCATGTCCATGAACTACTCACTGTATCTCAAAAGACTAAAAAGCTACCAGCAGATACATTTTCTTTGTATGAAGATGAAATCCTACAGTCCCTTCGTGGTGATGTATTTGACAATTTTCTTAGAAGTAATAAATTCACTCGATTTTGTCAATGGAAGGATTTGGAGTTAAATATTAACTTAACCACAAACGATTTTAGCGTACATCGTATTATTGGCCGTGGTGGTTTTGGGGAGGTTTATGGATGCCGAAAAGCAGACACTGGTAAAATGTATGCTATGAA] [+] EMBL CD133916 [ TTAAAAAGTTTGAAAAGTTAGACACAGATGAAGAGCGTATTAAATTTGGCCGAGAAATATATGATCAACACATTATGAAAGAACTTTTATCTCATAACCACAAATTCTCTAAATCAACTGTGGATCATGTCCATGAACTACTCACTGTATCCCAAAAGACTAAAAAGCTACCAGCAGATACATTTTCTTTGTATGAAGATGAAATCCTACAGTCCCTTCGTGGTGATGTATTTGACAATTTTCTTAGAAGTAATAAATTCACTCGATTTTGTCAATGGAAGGATTTGGAGTTAAATATTAACTTAACCACAAACGATTTTAGCGTACATCGTATTATTGGCCGTGGTGGTTTTGGGGAGGTTTATGGATGCCGAAAAGCAGACACTGGTAAAATGTATGCTATGAA] [+] EMBL CD185525 [ ATATATGATCAACACATTATGAAAGAACTTTTATCTCATAACCACAAATTCTCTAAATCAACTGTGGATCATGTCCATGAACTACTCACTGTATCTCAAAAGACTAAAAAGCTACCAGCAGATACATTTTCTTTGTATGAAGATGAAATCCTACAGTCCCTTCGTGGTGATGTATTTGACAATTTTCTTAGAAGTAATAAATTCACTCGATTTTGTCAATGGAAGGATTTGGAGTTAAATATTAACTTAACCACAAACGATTTTAGCGTACATCGTATTATTGGCCGTGGTGGTTTTGGGGAGGTTTATGGATGCCGAAAAGCAGACACTGGTAAAATGTATGCTATGAA] [+] EMBL CD133872 [ ATATATGATCAACACATTATGAAAGAACTTTTATCTCATAACCACAAATTCTCTAAATCAACTGTGGATCATGTCCATGAACTACTCACTGTATCTCAAAAGACTAAAAAGCTACCAGCAGATACATTTTCTTTGTATGAAGATGAAATCCTACAGTCCCTTCGTGGTGATGTATTTGACAATTTTCTTAGAAGTAATAAATTCACTCGATTTTGTCAATGGAAGGATTTGGAGTTAAATATTAACTTAACCACAAACGATTTTAGCGTACATCGTATTATTGGCCGTGGTGGTTTTGGGGAGGTTTATGGATGCCGAAAAGCAGACACTGGTAAAATGTATGCTATGAA] [+] EMBL CD131515 [ ATATATGATCAACACATTATGAAAGAACTTTTATCTCATAACCACAAACTCTCTAAATCAACTGTGGATCATGTCCATGAACTACTCACTGTATCTCAAAAGACTAAAAAGCTACCAGCAGATACATTTTCTTTGTATGAAGATGAAATCCTACAGTCCCTTCGTGGTGATGTATTTGACAATTTTCTTAGAAGTAATAAATTCACTCGATTTTGTCAATGGAAGGATTTGGAGTTAAATATTAACTTAACCACAAACGATTTTAGCGTACATCGTATTATTGGCCGTGGTGGTTTTGGGGAGGTTTATGGATGCCGAAAAGCAGACACTGGTAAAATGTATGCTATGAA] [+] EMBL CD131458 [ TCTCTAAATCAACTGTGGATCATGTCCATGAACTACTCACTGTATCTCAAAAGACTAAAAAGCTACCAGCAGATACATTTTCTTTGTATGAAGATGAAATCCTACAGTCCCTTCGTGGTGATGTATCTGACAATTTTCTTAGAAGTAATAAATTCACTCGATTTTGTCAATGGAAGGATTTGGAGTTAAATATTAACTTAACCACAAACGATTTTAGCGTACATCGTATTATTGGCCGTGGTGGTTTTGGGGAGGTTTATGGATGCCGAAAAGCAGACACTGGTAAAATGTATGCTATGAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||