These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8820#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 787 fasta sequence [AGAGAAAGAGAGGAATAGATCTATTGATTGAATTGAATAGGAACTGATAGATACATCACACACATATGTATAGATAATGATCCACTGAATATAAACACTCATTCATGGATACATTGATCATTCAATGGAACATAGATAATTGATTGATTGAACACAAGCGCGGATACGAATTAACGAAAGGGGGAGGGAGAGAGGAATATATCTATTGATTGAATTGAATAGGAACTGATCTATTGAATATAAACACTAAACCACAGATAAATTGATCATTCAATGGAAAATATATAATTGACTGATTAAACACAAGCGCGGATCCGAA-CCGACGAAAG-GGG-TAGAGAG--AGAGA--AATATATCTATTGATTGAGTTGAATAGGAACTGATAGATACATCACACATATATATATTTATAAATAAGGATCCATTGAATATAAATACTCATTCATGGATATATTGATCATTCAATGAAACATAGATAATTGATTGATTGAACACAAGCGCGGATACGAACCAACGACAGAAACAGAGAGGAAGAGGGGAGGGGAGAGAAATTGAGCATAATTTGTTCCAAAGGGATAATCATTATTATGCTTCAGAGTTTAACATGTATATAATCAAATCATATATATGACAACAAAGAGTAACTATTGAATAGAATATACATACATTGTGTGTCTGTGTGTGTGTGTATAAGTACTTTTAATAAGGTATTTGATTTTGCATATATTGTAATACATCATATGATTTATCACGCCAATGTGCTAAACATGAACGTATAATACGTAAATATGA] [+] EMBL CD118784 [AGAGAAAGAGAGGAATAGATCTATTGATTGAATTGAATAGGAACTGATAGATACATCACACACATATGTATAGATAATGATCCACTGAATATAAACACTCATTCATGGATACATTGATCATTCAATGGAACATAGATAATTGATTGATTGAACACAAGCGCGGATACGAATTAACGAAAGGGGGAGGGAGAGAGGAATATATCTATTGATTGAATTGAATAGGAACTGATCTATTGAATATAAACACTAAACCACAGATAAATTGATCATTCAATGGAAAATATATAATTGACTGATTAAACACAAGCGCGGATCCGAA CCGACGAAAG GGG TAGAGAG AGAGA AATATATCTATTGATTGAGTTGAATAGGAACTGATAGATACATCACACATATATATATTTATAAATAAGGATCCATTGAATATAAATACTCATTCATGGATATATTGATCATTCAATGAAACATAGATAATTGATTGATTGAACACAAGCGCGGATACGAACCAACGACAGCAACAGAGAGGAAGAGGGGAGGGGAGAGAAATTGAGCATAATTTGNTCCAAAGGGATAATCATTATTATGCTTCAGA ] [+] EMBL CD118815 [AGAGAAAGAGAGGAATAGATCTATTGATTGAATTGAATAGGAACTGATAGATACATCACACACATATGTATAGATAATGATCCACTGAATATAAACACTCATTCATGGATACATTGATCATTCAATGGAACATAGATAATTGATTGATTGAACACAAGCGCGGATACGAATTAACGAAAGGGGGAGGGAGAGAGGAATATATCTATTGATTGAATTGAATAGGAACTGATCTATTGAATATAAACACTAAACCACAGATAAATTGATCATTCAATGGAAAATATATAATTGACTGATTAAACACAAGCGCGGATCCGAA CCGACGAAAG GGG TAGAGAG AGAGA AATATATCTATTGATTGAGTTGAATAGGAACTGATAGATACATCACACATATATATATTTATAAATAAGGATCCATTGAATATAAATACTCATTCATGGATATATTGATCATTCAATGAAACATAGATAATTGATTGATTGAACACAAGCGCGGATACGAACCAACGACAGAAACAGAGAGGAAGAGGNGA ] [+] EMBL CD141167 [ GAATAGATCTATTGATTGAATTGAATAGGAACTGATAGATACATCACACACATATGTATAGATAATGATCCACTGAATATAAACACTCATTCATGGATACATTGATCATTCAATGGAACATAGATAATTGATTGATTGAACACAAGCGCGGATACGAATTAACGAAAGGGGGAGGGAGAGAGGAATATATCTATTGATTGAATTGAATAGGAACTGATCTATTGAATATAAACACTAAACCACAGATAAATTGATCATTCAATGGAAAATATATAATTGACTGATTAAACACAAGCGCGGATCCGAA CCGACGAAAG GGG T AGAG AGAGA AATATATCTATT ] [+] EMBL CD141571 [ GAATAGATCTATTGATTGAATTGAATAGGAACTGATAGATACATCACACACATATGTATAGATAATGATCCACTGAATATAAACACTCATTCATGGATACATTGATCATTCAATGGAACATAGATAATTGATTGATTGAACACAAGCGCGGATACGAATTAACGAAAGGGGGAGGGAGAGAGGAATATATCTATTGATTGAATTGAATAGGAACTGATCTATTGAATATAAACACTAAACCACAGATAAATTGATCATTCAATGGAAAATATATAATTGACTGATTAAACACAAGCGCGGATCCGAACCCGACG AAG GNG TAGAGAG AG AATATATCTATT ] [+] EMBL CD149383 [ ATAGATCTATTGATTGAATTGAATAGGAACTGATAGATACATCACACACATATGTATAGATAATGATCCACTGAATATAAACACTCATTCATGGATACATTGATCATTCAATGGAACATAGATAATTGATTGATTGAACACAAGCGCGGATACGAATTAACGAAAGGGGGAGGGAGAGAGGAATATATCTATTGATTGAATTGAATAGGAACTGATCTATTGAATATAAACACTAAACCACAGATAAATTGATCATTCAATGGAAAATATATAATTGACTGATTAAACACAAGCGCGGATACGAA CCGACGAAAGTGGGAGAGAGAGAAAGAGAGGAATAGATCTATTGATTGAATTGAATAGGAACCGATAGATACATCACACACATA ] [+] EMBL CD188127 [ AGAGAG AGAGA AATATATCTATTGATTGAGTTGAATAGGAACTGATAGATACATCACACATATATATATTTATAAATAAGGATCCATTGAATATAAATACTCATTCATGGATATATTGATCATTCAATGAAACATAGATAATTGATTGATTGAACACAAGCGCGGATACGAACCAACGACAGAAACAGAGAGGAAGAGGGGAGGGGAGAGAAATTGAGCATAATTTGTTCCAAAGGGATAATCATTATTATGCTTCAGAGTTTAACATGTATATAATCAAATCATATATATGACAACAAAGAGTAACTATTGAATAGAATATACATACATTGTGTGTCTGTGT ] [-] EMBL CD126008 [ ATTGTGCATAATTTGTTCCAAAGGGATAATCATTATTATGCTTCAGAGTTTAACATGTATATAATCAAATCATATATATGACAACAAAGAGTAACTATTGAATAGAATATACATACATTGTGTGTCTGTGTGTGTGTGTATAAGTACTTTTAATAAGGTATTTGATTTTGCATATATTGTAATACATCATATGATTTATCACGCCAATGTGCTAAACATGAACGTATAATACGTAAATATGA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||