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Schistosoma mansoni
cluster # 8826 cluster # 8826       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8826#0 length = 794 sequences # 7  

consensusID : consensus_8826#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 794
fasta sequence
                              [AATAATACGCCATGGAACAGAACTCCCGGTAAACCTGGTATTGGCACTGGTGGTACTGTTAGTTCTTATCCAACATTTTCAACGCCCTCAAATATTCCATGGTCTACAACTAGGAATGATGCCGTAGATTTAATACAAGGACGTGGTCAAATTGAAGGTGGTGGTGGTCAGATGTGGCCTCTTCCTTCAATTTTCGACACAAACCGAACTTCTGATCGTAATGCTGTTGTTGTCGGTGGTGAGGGAGGTGGAGAATTTTTACCTCAGGAATCAACAACTGATAGCCAGTGGGCAACCACACCTTTTTCAGGTCAAACAACTTCAAATGTCAGCTCTCTATTAGGTTCACCTAATACATTTCCTATCAGTAATAATCATATACAAGCTCTTAATCCATGGTCTTTCGATAATCCAAATAATAATTGTTCTATTACTGCGACCCGAGCAATTACTGGTCAACAATTAAATAATGTTGTAACCTTAGCAAACACACCGTCGGATACATTGAATCCAGATCGTTCTCGTCGTTATATGCAGCATTGGACAACATTGAATAATGAACAAGATTTGTTAAATGACGATCGATCTGGATTGGCTTTTCCTTTATCAAGTATTAACATTAATAATAATAGTAATAATTCCGTCAGTGGATTCGGCAATCCTTCTGATTTTATTGAAAATCAATCACTCTCTTCTAACATAAACAATAATACACGAGGTAGTAACAAGTTATCAGAATTTGATATTGGACAAACTAGTTTAAAAAAATCTAGTTCTGATATTGACTCTTCAAC]

[+] EMBL CD147181             [AATAATACGCCATGGAACAGAACTCCCGGTAAACCTGGTATTGGCACTGGTGGTACTGTTAGTTCTTATCCAACATTTTCAACGCCCTCAAATATTCCATGGTCTACAACTAGGAATGATGCCGTAGATTTAATACAAGGACGTGGTCAAATTGAAGGTGGTGGTGGTCAGATGTGGCCTCTTCCTTCAATTTTCGACACAAACCGAACTTCTGATCGTAATGCTGTTGTTGTCGGTGGTGAGGGAGGTGGAGAATTTTTACCTCAGGAATCAACAACTGATAGCCAGTGGGCAACCACACCTTTTTCAGGTCAAACAACTTCAAATGTCAGCTCTCTATTAGGTTCACCTAATACATTTCCTATCAGTAATAATCATATACAAGCTCTTAATCCATGGTCTTTCGATAATCCAAATAATAATTGTTCTATTACTGCGACCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD093790             [                                                                                                                                                                                                            CGAACTTCTGATCGTAATGCTGTTGTTGTCGGTGGTGAGGGAGGTGGAGAATTTTTACCTCAGGAATCAACAACTGATAGCCAGTGGGCAACCACACCTTTTTCAGGTCAAACAACTTCAAATGTCAGCTCTCTATTAGGTTCACCTAATACATTTCCTATCAGTAATAATCATATACAAGCTCTTAATCCATGGTCTTTCGATAATCCAAATAATAGTTGTTCTATTACTGCGCCTCGAGCAATTACTGGTCAGCAATTAAATAATGTTGTAACCTTAGCAAACACACCGTCGGATACATTGAATCCAGATCGTTCTC                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD071287             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGGTCAACAATTAAATAATGTTGTAACCTTAGCAAACACACCGTCGGATACATTGAATCCAGATCGTTCTCGTCGTTATATGCAGCATTGGACAACATTGAATAATGAACAAGATTTGTTAAATGACGATCTATCTGGATTGGCTTTTCCTTTATCAAGTATTAACATTAATAATAATAGTAATAATTCCGTCAGTGGATTCGGCAATCCTTCTGATTTTATTGAAAATCAATCACTCTCTTCTAACATAAACAATAATACACGAGGTAGTAACAAGTTATCAGAATTTGATATTGGACCAACTAGTTT AAAAAATCTAGTTCTGATATTGACTCTTCAAC]
[-] EMBL CD071249             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GGTCAACAATTAAATAATGTTGTAACCTTAGCAAACACACCGTCGGATACATTGAATCCAGATCGTTCTCGTCGTTATATGCAGCATTGGACAACATTGAATAATGAACAAGATTTGTTAAATGACGATCGATCTGGATTGGCTTTTCCTTTATCAAGTATTAACATTAATAATAATAGTAATAATTCCGTCAGTGGATTCGGCAATCCTTCTGATTTTATTGAAAATCAATCACTCTCTTCTAACATAAACAATAATACACGAGGTAGTAACAAGTTATCAGAATTTGATATTGGACAAACTAGTTTAAAAAAATCTAGTTCTGATATTGACTCTTCAAC]
[-] EMBL CD071245             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GGTCAACAATTAAATAATGTTGTAACCTTAGCANACACACCGTCGGATACATTGAATCCAGATCGTTCTCGTCGTTATATGCAGCATTGGACAACATTGAATAATGAACAAGATTTGTTAAATGACGATCGATCTGGATTGGCTTTTCCTTTATCAAGTATTAACATTAATAATAATAGTAATAATTCCGTCAGTGGATTCGGCAATCCTTCTGATTTTATTGAAAATCAATCACTCTCTTCTAACATAAACAATAATACACGAGGTAGTAACAAGTTATCAGAATTTGATATTGGACAAACTAGTTTAAAAAAATCTAGTTCTGATATTGACTCTTCAAC]
[-] EMBL CD071241             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ACATTGAATAATGAACAAGATTTGTTAAATGACGATCGATCTGGATTGGCTTTTCCTTTATCAAGTATTAACATAAATAATAATAGTAATAATTCCGTCAGTGGATTCGGCAATCCTTCTGATTTTATTGAAAATCAATCACTCTCTTCTAACATAAACAATAATACACGAGGTAGTAACAAGTTATCAGAATTTGATATTGGACAAACTAGTTTAAAAAAATCTAGTTCTGATATTGACTCTTCAAC]
[-] EMBL CD071258             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CATTGAATAATGAACAAGATTTGTTAAATGACGATCGATCTGGATTGGCTTTTCCTTTATCAAGTATTAACATTAATAATAATAGTAATAATTCCGTCAGTGGATTCGGCAATCCTTCTGATTTTATTGAAAATCAATCACTCTCTTCTAACATAAACAATAATACACGAGGTAGTAACAAGTTATCAGAATTTGATATTGGACAAACTAGTTTAAAAAAATCTAGTTCTGATATTGACTCTTCAAC]


>consensus_8826#0 AATAATACGCCATGGAACAGAACTCCCGGTAAACCTGGTATTGGCACTGGTGGTACTGTT AGTTCTTATCCAACATTTTCAACGCCCTCAAATATTCCATGGTCTACAACTAGGAATGAT GCCGTAGATTTAATACAAGGACGTGGTCAAATTGAAGGTGGTGGTGGTCAGATGTGGCCT CTTCCTTCAATTTTCGACACAAACCGAACTTCTGATCGTAATGCTGTTGTTGTCGGTGGT GAGGGAGGTGGAGAATTTTTACCTCAGGAATCAACAACTGATAGCCAGTGGGCAACCACA CCTTTTTCAGGTCAAACAACTTCAAATGTCAGCTCTCTATTAGGTTCACCTAATACATTT CCTATCAGTAATAATCATATACAAGCTCTTAATCCATGGTCTTTCGATAATCCAAATAAT AATTGTTCTATTACTGCGACCCGAGCAATTACTGGTCAACAATTAAATAATGTTGTAACC TTAGCAAACACACCGTCGGATACATTGAATCCAGATCGTTCTCGTCGTTATATGCAGCAT TGGACAACATTGAATAATGAACAAGATTTGTTAAATGACGATCGATCTGGATTGGCTTTT CCTTTATCAAGTATTAACATTAATAATAATAGTAATAATTCCGTCAGTGGATTCGGCAAT CCTTCTGATTTTATTGAAAATCAATCACTCTCTTCTAACATAAACAATAATACACGAGGT AGTAACAAGTTATCAGAATTTGATATTGGACAAACTAGTTTAAAAAAATCTAGTTCTGAT ATTGACTCTTCAAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)