These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8826#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 794 fasta sequence [AATAATACGCCATGGAACAGAACTCCCGGTAAACCTGGTATTGGCACTGGTGGTACTGTTAGTTCTTATCCAACATTTTCAACGCCCTCAAATATTCCATGGTCTACAACTAGGAATGATGCCGTAGATTTAATACAAGGACGTGGTCAAATTGAAGGTGGTGGTGGTCAGATGTGGCCTCTTCCTTCAATTTTCGACACAAACCGAACTTCTGATCGTAATGCTGTTGTTGTCGGTGGTGAGGGAGGTGGAGAATTTTTACCTCAGGAATCAACAACTGATAGCCAGTGGGCAACCACACCTTTTTCAGGTCAAACAACTTCAAATGTCAGCTCTCTATTAGGTTCACCTAATACATTTCCTATCAGTAATAATCATATACAAGCTCTTAATCCATGGTCTTTCGATAATCCAAATAATAATTGTTCTATTACTGCGACCCGAGCAATTACTGGTCAACAATTAAATAATGTTGTAACCTTAGCAAACACACCGTCGGATACATTGAATCCAGATCGTTCTCGTCGTTATATGCAGCATTGGACAACATTGAATAATGAACAAGATTTGTTAAATGACGATCGATCTGGATTGGCTTTTCCTTTATCAAGTATTAACATTAATAATAATAGTAATAATTCCGTCAGTGGATTCGGCAATCCTTCTGATTTTATTGAAAATCAATCACTCTCTTCTAACATAAACAATAATACACGAGGTAGTAACAAGTTATCAGAATTTGATATTGGACAAACTAGTTTAAAAAAATCTAGTTCTGATATTGACTCTTCAAC] [+] EMBL CD147181 [AATAATACGCCATGGAACAGAACTCCCGGTAAACCTGGTATTGGCACTGGTGGTACTGTTAGTTCTTATCCAACATTTTCAACGCCCTCAAATATTCCATGGTCTACAACTAGGAATGATGCCGTAGATTTAATACAAGGACGTGGTCAAATTGAAGGTGGTGGTGGTCAGATGTGGCCTCTTCCTTCAATTTTCGACACAAACCGAACTTCTGATCGTAATGCTGTTGTTGTCGGTGGTGAGGGAGGTGGAGAATTTTTACCTCAGGAATCAACAACTGATAGCCAGTGGGCAACCACACCTTTTTCAGGTCAAACAACTTCAAATGTCAGCTCTCTATTAGGTTCACCTAATACATTTCCTATCAGTAATAATCATATACAAGCTCTTAATCCATGGTCTTTCGATAATCCAAATAATAATTGTTCTATTACTGCGACCC ] [+] EMBL CD093790 [ CGAACTTCTGATCGTAATGCTGTTGTTGTCGGTGGTGAGGGAGGTGGAGAATTTTTACCTCAGGAATCAACAACTGATAGCCAGTGGGCAACCACACCTTTTTCAGGTCAAACAACTTCAAATGTCAGCTCTCTATTAGGTTCACCTAATACATTTCCTATCAGTAATAATCATATACAAGCTCTTAATCCATGGTCTTTCGATAATCCAAATAATAGTTGTTCTATTACTGCGCCTCGAGCAATTACTGGTCAGCAATTAAATAATGTTGTAACCTTAGCAAACACACCGTCGGATACATTGAATCCAGATCGTTCTC ] [+] EMBL CD071287 [ TGGTCAACAATTAAATAATGTTGTAACCTTAGCAAACACACCGTCGGATACATTGAATCCAGATCGTTCTCGTCGTTATATGCAGCATTGGACAACATTGAATAATGAACAAGATTTGTTAAATGACGATCTATCTGGATTGGCTTTTCCTTTATCAAGTATTAACATTAATAATAATAGTAATAATTCCGTCAGTGGATTCGGCAATCCTTCTGATTTTATTGAAAATCAATCACTCTCTTCTAACATAAACAATAATACACGAGGTAGTAACAAGTTATCAGAATTTGATATTGGACCAACTAGTTT AAAAAATCTAGTTCTGATATTGACTCTTCAAC] [-] EMBL CD071249 [ GGTCAACAATTAAATAATGTTGTAACCTTAGCAAACACACCGTCGGATACATTGAATCCAGATCGTTCTCGTCGTTATATGCAGCATTGGACAACATTGAATAATGAACAAGATTTGTTAAATGACGATCGATCTGGATTGGCTTTTCCTTTATCAAGTATTAACATTAATAATAATAGTAATAATTCCGTCAGTGGATTCGGCAATCCTTCTGATTTTATTGAAAATCAATCACTCTCTTCTAACATAAACAATAATACACGAGGTAGTAACAAGTTATCAGAATTTGATATTGGACAAACTAGTTTAAAAAAATCTAGTTCTGATATTGACTCTTCAAC] [-] EMBL CD071245 [ GGTCAACAATTAAATAATGTTGTAACCTTAGCANACACACCGTCGGATACATTGAATCCAGATCGTTCTCGTCGTTATATGCAGCATTGGACAACATTGAATAATGAACAAGATTTGTTAAATGACGATCGATCTGGATTGGCTTTTCCTTTATCAAGTATTAACATTAATAATAATAGTAATAATTCCGTCAGTGGATTCGGCAATCCTTCTGATTTTATTGAAAATCAATCACTCTCTTCTAACATAAACAATAATACACGAGGTAGTAACAAGTTATCAGAATTTGATATTGGACAAACTAGTTTAAAAAAATCTAGTTCTGATATTGACTCTTCAAC] [-] EMBL CD071241 [ ACATTGAATAATGAACAAGATTTGTTAAATGACGATCGATCTGGATTGGCTTTTCCTTTATCAAGTATTAACATAAATAATAATAGTAATAATTCCGTCAGTGGATTCGGCAATCCTTCTGATTTTATTGAAAATCAATCACTCTCTTCTAACATAAACAATAATACACGAGGTAGTAACAAGTTATCAGAATTTGATATTGGACAAACTAGTTTAAAAAAATCTAGTTCTGATATTGACTCTTCAAC] [-] EMBL CD071258 [ CATTGAATAATGAACAAGATTTGTTAAATGACGATCGATCTGGATTGGCTTTTCCTTTATCAAGTATTAACATTAATAATAATAGTAATAATTCCGTCAGTGGATTCGGCAATCCTTCTGATTTTATTGAAAATCAATCACTCTCTTCTAACATAAACAATAATACACGAGGTAGTAACAAGTTATCAGAATTTGATATTGGACAAACTAGTTTAAAAAAATCTAGTTCTGATATTGACTCTTCAAC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||