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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8828#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 647 fasta sequence
[CCAGTCTCCGGGATGTTGTTGGCGTTGGTCTTTGTTTCTGTGTGCCTTTGTTTTAGTGAAGCTAGGTCGCGTCGCGTATTACTTCGAGATGTAGACGTCATAACTTTATATCATGATAAATTTGCCCAGTCGAGAAAAGAATATAGATTACCTCAGCTTAAATGTGTTGGTGGAAGTGGTTTCAAGCACCCTCAGTACTATCCCAAGGTTGTCCAGTGTTATAATCGCGGATTCGATGGTCGTGATGTTCAGTGGGAATGCAAAGCTGAACTAGATAAGAGTGTATCCTTCGGGGCCGTGAACGTTAATTGCGAAGGCTATGACTATCCAGAGGACGAGTATATTGTTTATGGCTCATGCGCTCTGGAATACGAATTAAATGTACGAAGCTCTACTCGGGAGAAAAGATATCACAGAACATTTGAAAAGATCTATACACATGCACAAAATAATTCTGGTTACTTTATAATTATTGGATTGATTGTATTAGCTGCTATATTATGGTATTTTTGTATTAGACCTACATTTCCATGCGACTATATCCCACCAACTGGATTTGATTTTTCACAGTCACAACAACGACCACCACCTCCCACTTATGATGAGACAATTTTTCATGATCATGAAGACAATTTCTACAGACGACG]
[+] EMBL CD078932 [CCAGTCTCCGGGATGTTGTTGGCGTTGGTCTTTGTTTCTGTGTGCCTTTGTTTTAGTGAAGCTAGGTCGCGTCGCGTATTACTTCGAGATGTAGACGTCATAACTTTATATCATGATAAATTTGCCCAGTCGAGAAAAGAATATAGATTACCTCAGCTTAAATGTGTTGGTGGAAGTGGTTTCAAGCACCCTCAGTACTATCCCAAGGTTGTCCAGTGTTATAATCGCGGATTCGATGGTCGTGATGTTCAGTGGGAATGCAAAGCTGAACTAGATAAGAGTGTATCCTTCGGGGCCGTGAACGTTAATTGCGAAGGCTATGACTATCCAGAGGACGAGTATATTGTTTATGGCTCATGCGCTCTGGAATACGAATTAAATGTACGAAGCTCTACTCGGGATAAAAGATATCACAGAACATTTGAAAAGATCTATACACATGCACAAAATAATTCTGGTTACTTTATAATTATTGGATTGATTGTATTAGCTGCTATATTATGGTATTTTTGTATTAGACCTACATTTCCATGCGACTATATCCCACCAACTGGATTTGATTTTTCACAGTCACAACANCGACCACCACCTCCCACTT ]
[+] EMBL CD127691 [ atAGGTAGGTTACGTCGCTTTTTACTTCGAGATGTAGACGTCATACCTTTATATCATGATAAATTTGCCCAGTCGAGAAAAGAATATAGATTACCTCAGCTTAAATGTGTTGGTGGAAGTGGTTTCAAGCACCCTCAGTACTATCCCAAGGTTGTCCAGTGTTATAATCGCGGATTCGATGGTCGTGATGTTCAGTGGGAATGCAAAGCTGAACTAGATAAGAGTGTATCCTTCGGGGCCGTGAACGTTAATTGCGAAGGCTATGACTATCCAGAGGACGAGTATATTGTTTATGGCTCATGCGCTCTGGAATACGAATTAAATGTACGAAGCTCTACTCGGGAGAAAAGATATGACAGAACATTTGAGAAGATCTATACACATGCACAAAATAATTCTGGTTACTTTATAATGATTGGATTGATTGCATCACCTGCTACATTATGGTATTTGTGCATTAGACCTACGTGTGCATGCGACTATATCCGACCAACTGGATTTGATTTTTCACAGGCACAACAACCACCAg ]
[-] EMBL CD127700 [ ATTACTTCGAAATGTAGACGTCATACCTTTATATCATGATAAATTTGCCCAGTCGAGAAAAGAATATAGATTACCTCAGCTTAAATGTGTTGGTGGAAGTGGTTTCAAGCACCCTCAGTACTATCTTAAGGTTGTCCAGTGTTATAATCGCGGATTCGATGGTCGTGATGTTCAGTGGGAATGCAAAGCTGAACTAGATAAGAGTGTATCCTTCGGGGCCGTGAACGTTAATTGCGAAGGCTATGACTATCCAGAGGACGAGTATATTGTTTATGGCTCATGCGCTCTGGAATACGAATTAAATATACGAAGCTCTACTCGGGAGAAAAGATATCACAGAACATTTGAAAAGATCTATACACATGCACAAAATAATTCTGGTTACTTTATAATTATTGGATTGATTGTATGAGCTGCTATATTATGGTATTTTTGTAATA ]
[+] EMBL CD098309 [ ACGTCATAACTTTATATCATGATAAATTTGCCCAGTCGAGAAAAGAATATAGATTACCTCAGCTTAAATGTGTTGGTGGAAGTGGTTTCAAGCACCCTCAGTACTATCCCAAGGTTGTCCAGTGTTATAA ]
[+] EMBL CD160804 [ CAAGGTTGTCCAGTGTTATAATCGCGGATTCGATGGTCGTGATGTTCAGTGGGAATGCAAAGCTGAACTAGATAAGAGTGTATCCTTCGGGGCCGTGAACGTTAATTGCGAAGGC ]
[-] EMBL CD202736 [ TGTCCAGTGTTATAATCGCGGATTCGATGGTCGTGATGTTCAGTGGGAATGCAAAGCTGAACTAGATAAGAGTGTATCCTTCGGGGCCGTGAACGTTAATTGCGAAGGCTAT ]
[+] EMBL CD181474 [ GAGTGTATCCTTCGGGGCCGTGAACGTTAATTGCGAAGGCTATGACTATCCAGAGGACGAGTATATTGTTTATGGCTCATGCGCTCTGGAATACGAATTAAATGTACGAAGCTCTACTCGGGAGAAAAGATATCACAGAACATTTGAAAAGATCTATACACATGCACAAAATAATTCTGGTTACTTTATAATTATTGGATTGATTGTATTAGCTGCTATATTATGGTATTTTTGTATTAGACCTACATTTCCATGCGACTATATCCCACC ACTGGATTTGATTTTTCACAGTCACAACAACGACCACCACCT CCACTTATGATGAGACAATTTTTCATGATCATGAAGACAATTTCTACAGACGACG]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||