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Schistosoma mansoni
cluster # 8828 cluster # 8828       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8828#0 length = 647 sequences # 7  

consensusID : consensus_8828#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 647
fasta sequence
                              [CCAGTCTCCGGGATGTTGTTGGCGTTGGTCTTTGTTTCTGTGTGCCTTTGTTTTAGTGAAGCTAGGTCGCGTCGCGTATTACTTCGAGATGTAGACGTCATAACTTTATATCATGATAAATTTGCCCAGTCGAGAAAAGAATATAGATTACCTCAGCTTAAATGTGTTGGTGGAAGTGGTTTCAAGCACCCTCAGTACTATCCCAAGGTTGTCCAGTGTTATAATCGCGGATTCGATGGTCGTGATGTTCAGTGGGAATGCAAAGCTGAACTAGATAAGAGTGTATCCTTCGGGGCCGTGAACGTTAATTGCGAAGGCTATGACTATCCAGAGGACGAGTATATTGTTTATGGCTCATGCGCTCTGGAATACGAATTAAATGTACGAAGCTCTACTCGGGAGAAAAGATATCACAGAACATTTGAAAAGATCTATACACATGCACAAAATAATTCTGGTTACTTTATAATTATTGGATTGATTGTATTAGCTGCTATATTATGGTATTTTTGTATTAGACCTACATTTCCATGCGACTATATCCCACCAACTGGATTTGATTTTTCACAGTCACAACAACGACCACCACCTCCCACTTATGATGAGACAATTTTTCATGATCATGAAGACAATTTCTACAGACGACG]

[+] EMBL CD078932             [CCAGTCTCCGGGATGTTGTTGGCGTTGGTCTTTGTTTCTGTGTGCCTTTGTTTTAGTGAAGCTAGGTCGCGTCGCGTATTACTTCGAGATGTAGACGTCATAACTTTATATCATGATAAATTTGCCCAGTCGAGAAAAGAATATAGATTACCTCAGCTTAAATGTGTTGGTGGAAGTGGTTTCAAGCACCCTCAGTACTATCCCAAGGTTGTCCAGTGTTATAATCGCGGATTCGATGGTCGTGATGTTCAGTGGGAATGCAAAGCTGAACTAGATAAGAGTGTATCCTTCGGGGCCGTGAACGTTAATTGCGAAGGCTATGACTATCCAGAGGACGAGTATATTGTTTATGGCTCATGCGCTCTGGAATACGAATTAAATGTACGAAGCTCTACTCGGGATAAAAGATATCACAGAACATTTGAAAAGATCTATACACATGCACAAAATAATTCTGGTTACTTTATAATTATTGGATTGATTGTATTAGCTGCTATATTATGGTATTTTTGTATTAGACCTACATTTCCATGCGACTATATCCCACCAACTGGATTTGATTTTTCACAGTCACAACANCGACCACCACCTCCCACTT                                                 ]
[+] EMBL CD127691             [                                                         atAGGTAGGTTACGTCGCTTTTTACTTCGAGATGTAGACGTCATACCTTTATATCATGATAAATTTGCCCAGTCGAGAAAAGAATATAGATTACCTCAGCTTAAATGTGTTGGTGGAAGTGGTTTCAAGCACCCTCAGTACTATCCCAAGGTTGTCCAGTGTTATAATCGCGGATTCGATGGTCGTGATGTTCAGTGGGAATGCAAAGCTGAACTAGATAAGAGTGTATCCTTCGGGGCCGTGAACGTTAATTGCGAAGGCTATGACTATCCAGAGGACGAGTATATTGTTTATGGCTCATGCGCTCTGGAATACGAATTAAATGTACGAAGCTCTACTCGGGAGAAAAGATATGACAGAACATTTGAGAAGATCTATACACATGCACAAAATAATTCTGGTTACTTTATAATGATTGGATTGATTGCATCACCTGCTACATTATGGTATTTGTGCATTAGACCTACGTGTGCATGCGACTATATCCGACCAACTGGATTTGATTTTTCACAGGCACAACAACCACCAg                                                             ]
[-] EMBL CD127700             [                                                                             ATTACTTCGAAATGTAGACGTCATACCTTTATATCATGATAAATTTGCCCAGTCGAGAAAAGAATATAGATTACCTCAGCTTAAATGTGTTGGTGGAAGTGGTTTCAAGCACCCTCAGTACTATCTTAAGGTTGTCCAGTGTTATAATCGCGGATTCGATGGTCGTGATGTTCAGTGGGAATGCAAAGCTGAACTAGATAAGAGTGTATCCTTCGGGGCCGTGAACGTTAATTGCGAAGGCTATGACTATCCAGAGGACGAGTATATTGTTTATGGCTCATGCGCTCTGGAATACGAATTAAATATACGAAGCTCTACTCGGGAGAAAAGATATCACAGAACATTTGAAAAGATCTATACACATGCACAAAATAATTCTGGTTACTTTATAATTATTGGATTGATTGTATGAGCTGCTATATTATGGTATTTTTGTAATA                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD098309             [                                                                                              ACGTCATAACTTTATATCATGATAAATTTGCCCAGTCGAGAAAAGAATATAGATTACCTCAGCTTAAATGTGTTGGTGGAAGTGGTTTCAAGCACCCTCAGTACTATCCCAAGGTTGTCCAGTGTTATAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD160804             [                                                                                                                                                                                                           CAAGGTTGTCCAGTGTTATAATCGCGGATTCGATGGTCGTGATGTTCAGTGGGAATGCAAAGCTGAACTAGATAAGAGTGTATCCTTCGGGGCCGTGAACGTTAATTGCGAAGGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD202736             [                                                                                                                                                                                                                 TGTCCAGTGTTATAATCGCGGATTCGATGGTCGTGATGTTCAGTGGGAATGCAAAGCTGAACTAGATAAGAGTGTATCCTTCGGGGCCGTGAACGTTAATTGCGAAGGCTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD181474             [                                                                                                                                                                                                                                                                                      GAGTGTATCCTTCGGGGCCGTGAACGTTAATTGCGAAGGCTATGACTATCCAGAGGACGAGTATATTGTTTATGGCTCATGCGCTCTGGAATACGAATTAAATGTACGAAGCTCTACTCGGGAGAAAAGATATCACAGAACATTTGAAAAGATCTATACACATGCACAAAATAATTCTGGTTACTTTATAATTATTGGATTGATTGTATTAGCTGCTATATTATGGTATTTTTGTATTAGACCTACATTTCCATGCGACTATATCCCACC ACTGGATTTGATTTTTCACAGTCACAACAACGACCACCACCT CCACTTATGATGAGACAATTTTTCATGATCATGAAGACAATTTCTACAGACGACG]


>consensus_8828#0 CCAGTCTCCGGGATGTTGTTGGCGTTGGTCTTTGTTTCTGTGTGCCTTTGTTTTAGTGAA GCTAGGTCGCGTCGCGTATTACTTCGAGATGTAGACGTCATAACTTTATATCATGATAAA TTTGCCCAGTCGAGAAAAGAATATAGATTACCTCAGCTTAAATGTGTTGGTGGAAGTGGT TTCAAGCACCCTCAGTACTATCCCAAGGTTGTCCAGTGTTATAATCGCGGATTCGATGGT CGTGATGTTCAGTGGGAATGCAAAGCTGAACTAGATAAGAGTGTATCCTTCGGGGCCGTG AACGTTAATTGCGAAGGCTATGACTATCCAGAGGACGAGTATATTGTTTATGGCTCATGC GCTCTGGAATACGAATTAAATGTACGAAGCTCTACTCGGGAGAAAAGATATCACAGAACA TTTGAAAAGATCTATACACATGCACAAAATAATTCTGGTTACTTTATAATTATTGGATTG ATTGTATTAGCTGCTATATTATGGTATTTTTGTATTAGACCTACATTTCCATGCGACTAT ATCCCACCAACTGGATTTGATTTTTCACAGTCACAACAACGACCACCACCTCCCACTTAT GATGAGACAATTTTTCATGATCATGAAGACAATTTCTACAGACGACG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)