These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8828#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 647 fasta sequence [CCAGTCTCCGGGATGTTGTTGGCGTTGGTCTTTGTTTCTGTGTGCCTTTGTTTTAGTGAAGCTAGGTCGCGTCGCGTATTACTTCGAGATGTAGACGTCATAACTTTATATCATGATAAATTTGCCCAGTCGAGAAAAGAATATAGATTACCTCAGCTTAAATGTGTTGGTGGAAGTGGTTTCAAGCACCCTCAGTACTATCCCAAGGTTGTCCAGTGTTATAATCGCGGATTCGATGGTCGTGATGTTCAGTGGGAATGCAAAGCTGAACTAGATAAGAGTGTATCCTTCGGGGCCGTGAACGTTAATTGCGAAGGCTATGACTATCCAGAGGACGAGTATATTGTTTATGGCTCATGCGCTCTGGAATACGAATTAAATGTACGAAGCTCTACTCGGGAGAAAAGATATCACAGAACATTTGAAAAGATCTATACACATGCACAAAATAATTCTGGTTACTTTATAATTATTGGATTGATTGTATTAGCTGCTATATTATGGTATTTTTGTATTAGACCTACATTTCCATGCGACTATATCCCACCAACTGGATTTGATTTTTCACAGTCACAACAACGACCACCACCTCCCACTTATGATGAGACAATTTTTCATGATCATGAAGACAATTTCTACAGACGACG] [+] EMBL CD078932 [CCAGTCTCCGGGATGTTGTTGGCGTTGGTCTTTGTTTCTGTGTGCCTTTGTTTTAGTGAAGCTAGGTCGCGTCGCGTATTACTTCGAGATGTAGACGTCATAACTTTATATCATGATAAATTTGCCCAGTCGAGAAAAGAATATAGATTACCTCAGCTTAAATGTGTTGGTGGAAGTGGTTTCAAGCACCCTCAGTACTATCCCAAGGTTGTCCAGTGTTATAATCGCGGATTCGATGGTCGTGATGTTCAGTGGGAATGCAAAGCTGAACTAGATAAGAGTGTATCCTTCGGGGCCGTGAACGTTAATTGCGAAGGCTATGACTATCCAGAGGACGAGTATATTGTTTATGGCTCATGCGCTCTGGAATACGAATTAAATGTACGAAGCTCTACTCGGGATAAAAGATATCACAGAACATTTGAAAAGATCTATACACATGCACAAAATAATTCTGGTTACTTTATAATTATTGGATTGATTGTATTAGCTGCTATATTATGGTATTTTTGTATTAGACCTACATTTCCATGCGACTATATCCCACCAACTGGATTTGATTTTTCACAGTCACAACANCGACCACCACCTCCCACTT ] [+] EMBL CD127691 [ atAGGTAGGTTACGTCGCTTTTTACTTCGAGATGTAGACGTCATACCTTTATATCATGATAAATTTGCCCAGTCGAGAAAAGAATATAGATTACCTCAGCTTAAATGTGTTGGTGGAAGTGGTTTCAAGCACCCTCAGTACTATCCCAAGGTTGTCCAGTGTTATAATCGCGGATTCGATGGTCGTGATGTTCAGTGGGAATGCAAAGCTGAACTAGATAAGAGTGTATCCTTCGGGGCCGTGAACGTTAATTGCGAAGGCTATGACTATCCAGAGGACGAGTATATTGTTTATGGCTCATGCGCTCTGGAATACGAATTAAATGTACGAAGCTCTACTCGGGAGAAAAGATATGACAGAACATTTGAGAAGATCTATACACATGCACAAAATAATTCTGGTTACTTTATAATGATTGGATTGATTGCATCACCTGCTACATTATGGTATTTGTGCATTAGACCTACGTGTGCATGCGACTATATCCGACCAACTGGATTTGATTTTTCACAGGCACAACAACCACCAg ] [-] EMBL CD127700 [ ATTACTTCGAAATGTAGACGTCATACCTTTATATCATGATAAATTTGCCCAGTCGAGAAAAGAATATAGATTACCTCAGCTTAAATGTGTTGGTGGAAGTGGTTTCAAGCACCCTCAGTACTATCTTAAGGTTGTCCAGTGTTATAATCGCGGATTCGATGGTCGTGATGTTCAGTGGGAATGCAAAGCTGAACTAGATAAGAGTGTATCCTTCGGGGCCGTGAACGTTAATTGCGAAGGCTATGACTATCCAGAGGACGAGTATATTGTTTATGGCTCATGCGCTCTGGAATACGAATTAAATATACGAAGCTCTACTCGGGAGAAAAGATATCACAGAACATTTGAAAAGATCTATACACATGCACAAAATAATTCTGGTTACTTTATAATTATTGGATTGATTGTATGAGCTGCTATATTATGGTATTTTTGTAATA ] [+] EMBL CD098309 [ ACGTCATAACTTTATATCATGATAAATTTGCCCAGTCGAGAAAAGAATATAGATTACCTCAGCTTAAATGTGTTGGTGGAAGTGGTTTCAAGCACCCTCAGTACTATCCCAAGGTTGTCCAGTGTTATAA ] [+] EMBL CD160804 [ CAAGGTTGTCCAGTGTTATAATCGCGGATTCGATGGTCGTGATGTTCAGTGGGAATGCAAAGCTGAACTAGATAAGAGTGTATCCTTCGGGGCCGTGAACGTTAATTGCGAAGGC ] [-] EMBL CD202736 [ TGTCCAGTGTTATAATCGCGGATTCGATGGTCGTGATGTTCAGTGGGAATGCAAAGCTGAACTAGATAAGAGTGTATCCTTCGGGGCCGTGAACGTTAATTGCGAAGGCTAT ] [+] EMBL CD181474 [ GAGTGTATCCTTCGGGGCCGTGAACGTTAATTGCGAAGGCTATGACTATCCAGAGGACGAGTATATTGTTTATGGCTCATGCGCTCTGGAATACGAATTAAATGTACGAAGCTCTACTCGGGAGAAAAGATATCACAGAACATTTGAAAAGATCTATACACATGCACAAAATAATTCTGGTTACTTTATAATTATTGGATTGATTGTATTAGCTGCTATATTATGGTATTTTTGTATTAGACCTACATTTCCATGCGACTATATCCCACC ACTGGATTTGATTTTTCACAGTCACAACAACGACCACCACCT CCACTTATGATGAGACAATTTTTCATGATCATGAAGACAATTTCTACAGACGACG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||