These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8829#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 584 fasta sequence [CCGGTATGTTATTAAGTACATCAACCTCATGAAGTCATGTAATGTTAAACCAATCCTTGTCTTTGACGGCTCAGATTTGCCATCCAAGGCTGAAACGGATTTAAAACGTCGAGAGACCAAGGAGTTAAATCGAAAGAAAGCTGCAGAATATCTAATGAAGGGAGATAAAGCAGCTGCACAGGAGTGTTTCGAAAGGTCCGTGTTTGTCACTTCTGAAATGGCGTACGAGGTTCTTCGAGCTGCTCGTAACATGGGTGTTGATTGCGTTGTCGCACCATATGAAGCAGATGCTCAACTAGCGTATCTTAATCGAACGGGTTATGCCGACTTTGTCATCACTGAAGATTCTGATCTATTATTATTTGGATGTAGACAGGTTGTATTCAAACTTGATTTATCGGGATCTGGGGTTCTTGTAGCAGCCGCATCGGGTATATGTGAATGTTGTGGAATTCCTGCTAGTCAATTTACTGAATCGAAATTTAGGTATATGGGTATTATGGCTGGCTGTGACTATTTTAGTGGAATTCCAGGCATAGGATTAAACACTGCTGCTAAAATATTACGTCAGACCCGCATAACAN] [-] EMBL CD181836 [CCGGTATGTTATTAAGTACATCAGCCTCATGAAGTCATGTAATGTTAAACCAATCCTTGTCTCTGACGGCTCAGATTTGCCATCCAAGGCTGAAACGGATTTAAAACGTCGAGAGACCAAGGAGTTAAATCGAAAGAAAGCTGCAGAATATCTAATGAAGGGAGATAAAGCAGCTGCACAGGAGTGTTTCGAAAGGTCCGTGTTTGTCACTTCTGAAATGGCGTACGAGGTTCTTCGAGCTGCTCGTAACATGGGTGTTGATTGCGTTGTCGCACCATATGAAGCAGATGCTCAACTAGCGTATCTTAATCGAACGGGTTAT ] [+] EMBL CD124744 [ CGGTATGTTATTAAGTACATCAACCTCATGAAGTCATGTAATGTTAAACCAATCCTTGTCTTTGACGGCTCAGATTTGCCATCCAAGGCTGAAACGGATTTAAAACGTCGAGAGACCAAGGAGTTAAATCGAAAGAAAGCTGCAGAATATCTAATGAAGGGAGATAAAGCAGCTGCACAGGAGTGTTTCGAAAGGTCCGTGTTTGTCACTTCTGAAATGGCGTACGAGGTTCTTCGAGCTGCTCGTAACATGGGTGTTGATTGCGTTGTCGCACCATATGAAGGAGATGCTCAACTAGCGTATCTTAATCGAACGGGTTATGCCGACTTTGTCATCACTGAAGATTCTGATCTATTATTATTTGGATGTAGACAGGTTGTATTCAAACTTGATTTATCGGGATCTGGGGTTCTTGTAGCAGCCGCATCGGGTATATGTGAATGTTGTGGAATTCCTGCTAGTCAATTTACTGAATCGAAATTTAGGTATATGGGTATTATGGCTGGCTGTGACTATTTTAGTGGAATTCCAGGCATAGGATTAAACACTGCTGCTAAAATATTACGTCAGACCCGCATAACAN] [+] EMBL CD163876 [ CGGTATGTTATTAAGTACATCAACCTCATGAAGTCATGTAATGTTAAACCAATCCTTGTCTTTGACGGCTCAGATTTGCCATCCAAGGCTGAAACGGATTTAAAACGTCGAGAGACCAAGGAGTTAAATCGAAAGAAAGCTGCAGAATATCTAATGAAGGGAGATAAAGCAGCTGCACAGGAGTGTTTCGAAAGGTCCGCGTTTGTCACTTCTGAAATGGCGTACGAGGTTCTTCGAGCTGCTCGTAACATGGGTGTTGATTGCGTTGTCGCACCATATGAAGCAGATGCTCAACTAGCGTATCTTAATCGAACGGGTTA ] [-] EMBL CD163866 [ GGTATGTTATTAAGTACATCAACCTCATGAAGTCATGTAATGTTAAACCAATCCTTGTCTTTGACGGCTCAGATTTGCCATCCAAGGCTGAAACGGATTTAAAACGTCGAGAGACCAAGGAGTTAAATCGAAAGAAAGCTGCAGAATATCTAATGAAGGGAGATAAAGCAGCTGCACAGGAGTGTTTCGAAAGGTCCGTGTTTGTCACTTCTGAAATGGCGTACGAGGTTCTTCGAGCTGCTCGTAACATGGGCGTTGATTGCGTTGTCGCACCATATGAAGCAGATGCTCAACTAGCGTATCTTAATCGAACGGGTTAT ] [-] EMBL CD163824 [ GGTATGTTATTAAGTACATCAACCTCATGAAGTCATGTAATGTTAAACCAATCCTTGTCTTTGACGGCTCAGATTTGCCATCCAAGGCTGAAACGGATTTAAAACGTCGAGAGACCAAGGAGTTAAATCGAAAGAAAGCTGCAGAATATCTAATGAAGGGAGATAAAGCAGCTGCACAGGAGTGTTTCGAAAGGTCCGTGTTTGTCACTTCTGAAATGGCGTACGAGGTTCTTCGAGCTGCTCGTAACATGGGTGTTGATTGCGTTGTCGCACCATATGAAGCAGATGCTCAACTAGCGTATCTTAATCGAACGGGTTAT ] [-] EMBL CD181831 [ TAAGTACATCAACCTCATGAAGTCATGTAATGTTAAACCAATCCTTGTCTTTGACGGCTCAGATTTGCCATCCAAGGCTGAAACGGATCTAAAACGTCGAGAGACCAAGGAGTTAAATCGAAAGAAAGCTGCAGAATATCTAATGAAGGGAGATAAAGCAGCTGCACAGGAGTGTTTCGAAAGGTCCGTGTTTGTCACTTCTGAAATGGCGTACGAGGTTCTTCGAGCTGCTCGTAACATGGGTGTTGATTGCGTTGTCGCACCATATGAAGCAGATGCTCAACTAGCGTATCTTAATCGAACGGGTTAT ] [-] EMBL CD138401 [ GAGCTGCTCGTAACATGGGTGTTGAATGCGTTGTCGCACCATATGAAGCAGATGCTCAGCTAGCGTATCTTAATCGAACGGGTTATGCCGACTTTGTCATCACTGAAGATTCTGATCTATTATTATTTGGATGTAGACAGGTTGTATTCAAACTTGATTTATCGGGATCTGGGGTTCTTGTAGCAGCCGCATCGGGTATATGTGAATGTTGTGGAATTCCTGCTGGTCAATTTACTGAATCGAAATTTAGGTATATGGGTATTATGGCTGGCTGTGACTATTTTAGTGGAATTCCTGGCATAGGATTAAACACTGCTGCTA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||