cluster # 8833

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Schistosoma mansoni
cluster # 8833 cluster # 8833 Sequences # 7 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_8833#0 length = 462 sequences # 7

consensusID : consensus_8833#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 462
fasta sequence

                              [AGATGTCAAGGTTCAACTA-TTTG-ATTCGTATTTGTTTAGATCGAATTTAGGAATCATAATGATTCATTTATGAAGATTTGAATTGTGTATTTATCATATTGAATAAATAGTAGTATGATTTGC-TTTTTTGCAGCAACATTTATTATGATTAAATTTAATCTAAACCAGTTTACTATTTTAAATGTTAATCATGATAAGTTTAATAGGCATAATCTGGTCGTTGAGTTAGTAGTTTATTATCTTGTTCAAATGTTGATGCTGATTGATAATTATATTGATTGATAGGATCCTTAGGATGATGATATTGTTGTCGAGGATGATGATTTGGTTCACCTTTTATTGTTGAATTTTGTTCATAACCTGGATAGTTTTTAATAGGAGCATAATCATCTTGATCAAATGAATGATCAATTGAATCAGTTTTTAAAGATGGTATTTCTCTATATTGTGGTCTTTCAACAT]

[+] EMBL CD197049             [AGATGTCAAGGTTCAACTG TTTG ATTCGTATTTGTTTAGATCGAATTTAGGAATCATAATGATTCATTTATGAAGATTTGAATTGTGTATTTATCATATTGAATAAATAGTAGTATGATTTGC TTTTTTGCAGCAACATTTATTATGATTAAATTTAATCTAAACCAGTTTACTATTTTAAATGTTAATCATGATAAGTTTAATAGGCATAATCTGGTCGTTGAGTTAGTAGTTTATTATCTTGTTCAAATGTTGATGCTGATTGATAATTATATTGATTGATAGGATCCTTAGGATGAAGATATTGTTGTCGAGGATGATGGTTTGGTTCACCTTTTATTGTTGAATTTTGTTCATAACCTGGATAGTTTTTAATAGGAGCATAATCATCTTGATCAAATGAATGATCAATTGAATCAGTTTTTACAGATGGTATTTCTCTATATTGTGGTCTTTCAACAT]
[+] EMBL CD196892             [AGATGTCAAGGTTCAACTA TTTG ATTCGTATTTGTTTAGATCGAATTTAGGAATCATAATGATTCATTTATGAAGATTTGAATTGTGTATTTATCATATTGAATAAATAGTAGTATGATTTGC TTTTTTGCAGCAACATTTATTATGATTAAATTTAATCTAAACCAGTTTACTATTTTAAATGTTAATCATGATAAGTTTAATAGGCATAATCTGGTCGTTGAGTTAGTAGTTTATTATCTTGTTCAAATGTTGATGCTGATTGATAATTATATTGATTGATAGGATCCTTAGGATGATGATATTGTTGTCGAGGATGATGATTTGGTTCACCTTTTATTGTTGAATTTTGTTCATAACCTGGATAGTTTTTAATAGGAGCATAATCATCTTGATCAAATGAATGATCAATTGAATCAGTTTTTAAAGATGGTATTTCTCTATTTTGTGGTCTTTCAAC  ]
[+] EMBL CD197180             [AGATGTCAAGGTTCAACTA TTTG ATTCGTATTTGCTTAGATCGAATTTAGGAATCATAATGATTCATTTATGAAGATTTGAATTGTGTATTTATCATATTGAATAAATAGTAGTATGATTTGCTTTTTTTGCAGCAACATTTATTATGATTAAATTTAATCTAAACCAGTTTACTATTTTAAATGTTAATCATGATAAGTTTAATAGGCATAATCTGGTCGTTGAGTTAGTAGTTTATTATCTTGTTCAAATGTTGATGCTGATTGATAATTATATTGATTGATAGGATCCTTAGGATGACGATATTGTTGTCGAGGATGATGATTTGGTTCACCTTTTATTGTTGAATTTTGTTCATAACCTGGATAGTTTTTAATAGGAGCATAATCATCTTGATCAAATGAATGATCAATTGAATCAGTTTTTAAAGATGGTATTTCTCTAT                  ]
[+] EMBL CD196897             [AGATGTCAAGGTTCAACTA TTTG ATTCGTATTTGTTTAGATCGAATTTAGGAATCATAATGATTCATTTATGAAGATTTGAATTGTGTATTTATCATATTGAATAAATAGTAGTATGATTTGC TTTTTTGCAGCAACATTTATTATGATTAAATTTAATCTAAACCAGTTTACTATTTTAAATGTTAATCATGATAAGTTTAATAGGCATAATCTGGTCGTTGAGTTAGTAGTTTATTATCTTGTTCAAATGTTGATGCTGATTGATAATTATATTGATTGATAGGATCCTTAGGATGATGATATTGTTGTCGAGGATGATGATTTGGTTCACCTTTTATTGTTGAATTTTGTTCATAACCTGGATAGTTTTTAATAGGAGCATAATCATCTTGATCAAATGAATGATCAA                                                   ]
[+] EMBL CD197151             [AGATGTCAAGGTTCAACTA TTTG ATTCGTATTTGTTTAGATCGAATTTAGGAATCATAATGATTCATTTATGAAGATTTGAATTGTGTATTTATCATATTGAATAAATAGTAGTATGATTTGC TTTTTTGCAGCAACATTTATTATGATTAAATTTAATCTAAACCAGTTTACTATTTTAAATGTTAATCATGATAAGTTTAATAGGCATAATCTGGTCGTTGAGTTAGTAGTTTATTATCTTGTTCAAATGTTGATGCTGATTGATAATTATATTGATTGATAGGATCCTTAGGATGATGATACTGTTGTCGAGGATGATGGTTTGGTTCACCTTTTATTGTTGAATTTTGTTCATAACCTGGATAGTTTTTAATAGGAGCATAATCATCTTGATCAAATGAc                                                          ]
[+] EMBL CD196401             [AGATGTCAAGGTTCAACTA TTTG ATTCGTATTTGTTTAGATCGAATTTAGGAATCATAATGATTCATTTATGAAGATTTGAATTGTGTATTTATCATATTGAATAAATAGTAGTATGATTTGC TTTTTTGCAGCAACATTTATTATGATTAAATTTAATCTAAACCAGTTTACTATTTTAAATGTTAATCATGATAAGTTTAATAGGCATAATCTGGTCGTTGAGTTAGTAGTTTATTATCTTGTTCAAATGTTGATGCTGATTGATAATTATATTGATTGATAGGATCCTTAGGATGATGATATTGTTGTCGAGGATGATGATCTGGTTCACCTTTTATTGTTGA                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD140617             [AGATGTCAAGGTTCAACTAGTTTGCATTCGTATTTGTTTAGATCGAATTTAGGAATCATAATGATTCATTTATGAAGATTTGAATTGTGTATTTTTCATATTGAATAAATAGTAGTATGATTTGCTTTTTTTGCAGCAACATTTATTATGATTAAATTTAATCTAAACCAGTTTACTATTTTAAATGTTAATCATGATAAGTTTAATAGGCATAATCTGGTCGTTGAGTTAGTAG                                                                                                                                                                                                                                      ]




>consensus_8833#0
AGATGTCAAGGTTCAACTATTTGATTCGTATTTGTTTAGATCGAATTTAGGAATCATAAT
GATTCATTTATGAAGATTTGAATTGTGTATTTATCATATTGAATAAATAGTAGTATGATT
TGCTTTTTTGCAGCAACATTTATTATGATTAAATTTAATCTAAACCAGTTTACTATTTTA
AATGTTAATCATGATAAGTTTAATAGGCATAATCTGGTCGTTGAGTTAGTAGTTTATTAT
CTTGTTCAAATGTTGATGCTGATTGATAATTATATTGATTGATAGGATCCTTAGGATGAT
GATATTGTTGTCGAGGATGATGATTTGGTTCACCTTTTATTGTTGAATTTTGTTCATAAC
CTGGATAGTTTTTAATAGGAGCATAATCATCTTGATCAAATGAATGATCAATTGAATCAG
TTTTTAAAGATGGTATTTCTCTATATTGTGGTCTTTCAACAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case