These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8838#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1150 fasta sequence [ACCTAACAGCAGAATGATGAATCAACAAGAAATTTCTCAATTAACAACGTCGTCTTCTGTTCACAAAACAGTAGGTATTGGAAAGAGAATCACTGAGAAGAAGGAAGAGAAGCAACACTGGCCACAGCAACATGAG---GATGATGATGATGAGCAGGAGCAGACTGTCGATGAAAAGAGAAAACTTATCAATTTATCTAAAGCACTTTCTAATTTAAAACCAGATATGTCTACAAATGACTATTTAAGTGGAAATAAACAAGCTGAACACAATTACTTATCTTCTGAATCCAAACAGTTAAATTATTCATCAGGTAATATTTCCGATGTGTAAAAATGAGAGACAGAGAGTATGGAAAACTGAGAATTTTTATCTTAACATGTTTGTTTGATTACAATAATGGTTGTTTTATTTTGTAAATACTCGTTTAAAAC-CGAACGAACAGATCAAAGAGGAGCGAATGCAATGGATCTATCAATCTTTCTATTTAAGTATATATGTATGTGTAAACGAATAATACCTGCCAAAAGAATCATTTGCCTAACTACTTGAAAGTTGTTTGTATCTTTCAAGTTCCTGTCTTTCAATACTTCATTTCTATTTAAATTCCCCTTCTTTGTTGCTGAGTAAACACAACAGAATGACTGAAATCATGTATGCTCATGTTTTTATATACATATGTGTAACTTACTATTATTACTACTACTATTACTAGTAAGTCGTGATAGCGTAGCGGTACCAATATGCAATATTAATCCTTTCTTTAAATATAAATTGAGACAAATGCATTCATTATTATTTGTTTTAAATGTATTTAAGATTCATATTTTCAAGAAGAAAGAATAAATGTTTATGTCATTATTTAGATGCTTGTAATATTTTTGTTATAACCAACATCGGTAGTGGTTAATAATCATTAATTAATTATTATTTTTTTCTTTCTCTCTCTGCTTAAATGATAATCTTTAATTGAGTAGAGAGCGAAACGGAAATAATTGATAATATATACTCTCTGAATTACTCATAAAAATATGTATTGGGTAACTAGAATAGAATCAAAATGAACATTCTTTCATTTTCCTAAAGTATAATTTATGTAAATTGTTCTTATTTATCAATTTTATAATTAATGATAACCAATAAAAATGAGTT] [+] EMBL CD149015 [ACCTAACAGCAGAATGATGAATCAACAAGAAATTTCTCAATTAACAACGTCGTCTTCTGTTCACAAAACAGTAGGTATTGGAAAGAGAATCACTGAGAAGAAGGAAGAGAAGCAACACTGGCCACAGCAACATGAG GATGATGATGATGAGCAGGAGCAGACTGTCGATGAAAAGAGAAAACTTATCAATTTATCTAAAGCACTTTCTAATTTAAAACCAGATATGTCTTCAAATGACTATTTAAGTGGAAATAAACAAGCTGAACACAGTTACTTATCTTCTGAATCCAAACAGTTAAATTATTCAACAGGTAATATTTCCGATGTGTAAAAATGAGAGACAGAGAGTATGGAAAACTGAGAATTTTTATCTTAACATGTTTGTTTGATTACAATAATGGTTGTTTTATTTTGTAAATACTCGTTTAAAAC CGAACGAACA ] [-] EMBL BG931621 [ GAATCAACAAGAAATTTCTCAATTAACAACGTCGTCTTCTGTTCACAAAACAGTAGGTATTGGAAAGAGAATCACTGAGAAGAAGGAAGAGAAGCAACACTGGCCACAGCAACATGAGGATGATGATGATGATGAGCAGGAGCAGACTGTCGATGAAAAGAGAAAACTTATCAATTTATCTAAAGCACTTTCTAATTTAAAACCAGATATGTCTACAAATGACTATTTAAGTGGAAATAAACAAGCTGAACACAATTACTTATCTTCTGAATCCAAACAGTTAAATTATTCATCAGGTAATATTTCCGATGTGTAAAAATGAGAGAC ] [+] EMBL CD082939 [ TGTT ACAAAACAGTAGGTATTGGAAAGAGAATCACTGAGAAGAAGGAAGAGAAGCAACACTGGCCACAGCAACATGAG GATGATGATGATGAGGAGGAGCAGACTGTCGATGAAAAGAGAAAACTTATCAATTTATCTAAAGCACTTTCTAATTTAAAACCAGATATGTCTACAAATGACTATTTAAGTGGAAATAAACAAGCTGAACACAATTACTTATCTTCTGAATCCAAACAGTTAAATTATTCATCAGGTAATATTTCCGATGTGTAAAAATGAGAGACAGAGAGTATGGAAAACTGAGAATTTTTATCTTAACATGTTTGTTTGATTACAATAATGGTTGTTTTATTTTGTAAATACTCGTTTAAAAC CGAACGAACAGATCAAAGAGGAGCGAATGCGATGGATCTATCAATCTTTCTATTTAAGTATATATGTATGTGTAAACGAATAATACCTGCCAAAAGAATCATTTGCCTAACTACTTGAAAGTTGTTTGTATCTTTCAAGTTCCTGTCTTTCAGTA ] [+] EMBL CD079217 [ GAGAAGAAGGAAGAGAAGCAACACTGGCCACAGCAACATGAG GATGATGATGATGAGGAGGAGCAGACTGTCGATGAAAAGAGAAAACTTATCAATTTATCTAAAGCACTTTCTAATTTAAAACCAGATATGTCTACAAATGACTATTTAAGTGGAAATAAACAAGCTGAACACAATTACTTATCTTCTGAATCCAAACAGTTAAATTATTCATCAGGTAATATTTCCGATGTGTAAAAATGAGAGACAGAGAGTATGGAAAACTGAGAATTTTTATCTTAACATGTTTGTTTGATTACAATAATGGTTGTTTTATTTTGTAAATACTCGTTTAAAAC CGAACGAACAGATCAAAGAGGAGCGAATGCAATGGATCTATCAATCTTTCTATTTAAGTATATATGTATGTGTAAACGAATAATACCTGCCAAAAGAATCATTTGCCTAACTACTTGAAAGTTGTTTGTATCTTTCAAGTTCCTGTCTTTCAATACTTCATTTCTATTTAAATTCCCCTTCTTTGTTGCTGAGTAAACACAACAGAATGACTGAAATCATGTATGCTCATGTTTTTATATACATATGTGTAACTTACTATTATTACTACTACTATTACTAGNTAGTCGTGATAGCGTAGCGGTACC ATATGC ATATTAATCCTT ] [-] EMBL CD076524 [ AGAGTCAGAGAGTATGGACAACTGAGAATTTTTATCTTAACATGTTTGTTTGATTACAATAATGGTTGTTTTATTTTGTAAATACTCGTTTAAAAC CGAACGAACAGATCAAAGAGGAGCGAATGCAATGGATCTATCAATCTTTCTATTTAAGTATATATGTATGTGTAAACGAATAATACCTGCCAAAAGAATCATTTGCCTAACTACTTGAAAGTTGTTTGTATCTTTCAAGTTCCTGTCTTTCAATACTTCATTTCTATTTAAATTCCCCTTCTTTGTTGCTGAGTAAACACAACAGAATGACTGAAATCATGTATGCTCATGTTTTTATATACATATGTGTAACTTACTATTATTACTACTACTATTACTAGTAAGTCGTGATAGCGTAGCGGTACCAATATGCAATATTAATCCTTTCTTTAAATATAAATTGAGACAAATGCATTCATTATTATTTGTTTTAAATGTATTTAAGATTCATATTTTCAAGAAGAAAGAATAAATGTTTATGTCATTATTTAGATGCTTGTAATATTTTTGTTATAACCAACATCGGTAGTGGTTAATAATCATTAA ] [+] EMBL AA952306 [ TTTATCTTAACATGTTTGTTTGATTACAATAATGGTTGTTTTATTTTGTAAATACTCGTTTAAAACGCGAACGAACAGATC AAGAGGAGCGAATCGAAT GATCTATCAATCTTTCTATTTAAGTATATATGTA G GTAAA ] [-] EMBL CD077166 [ TACTAGTAAGTCGTGATAGCGTAGCGGTACCAATATGCAATATTAATCCTTTCTTTAAATATAAATTGAGACAAATGCATTCATTATTATTTGTTTTAAATGTATTTAAGATTCATATTTTCAAGAAGAAAGAATAAATGTTTATGTCATTATTTAGATGCTTGTAATATTTTTGTTATAACCAACATCGGTAGTGGTTAATAATCATTAATTAATTATTATTTTTTTCTTTCTCTCTCTGCTTAAATGATAATCTTTAATTGAGTAGAGAGCGAAACGGAAATAATTGATAATATATACTCTCTGAATTACTCATAAAAATATGTATTGGGTAACTAGAATAGAATCAAAATGAACATTCTTTCATTTTCCTAAAGTATAATTTATGTAAATTGTTCTTATTTATCAATTTTATAATTAATGATAACCAATAAAAATGAGTT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||