|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8838#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1150 fasta sequence
[ACCTAACAGCAGAATGATGAATCAACAAGAAATTTCTCAATTAACAACGTCGTCTTCTGTTCACAAAACAGTAGGTATTGGAAAGAGAATCACTGAGAAGAAGGAAGAGAAGCAACACTGGCCACAGCAACATGAG---GATGATGATGATGAGCAGGAGCAGACTGTCGATGAAAAGAGAAAACTTATCAATTTATCTAAAGCACTTTCTAATTTAAAACCAGATATGTCTACAAATGACTATTTAAGTGGAAATAAACAAGCTGAACACAATTACTTATCTTCTGAATCCAAACAGTTAAATTATTCATCAGGTAATATTTCCGATGTGTAAAAATGAGAGACAGAGAGTATGGAAAACTGAGAATTTTTATCTTAACATGTTTGTTTGATTACAATAATGGTTGTTTTATTTTGTAAATACTCGTTTAAAAC-CGAACGAACAGATCAAAGAGGAGCGAATGCAATGGATCTATCAATCTTTCTATTTAAGTATATATGTATGTGTAAACGAATAATACCTGCCAAAAGAATCATTTGCCTAACTACTTGAAAGTTGTTTGTATCTTTCAAGTTCCTGTCTTTCAATACTTCATTTCTATTTAAATTCCCCTTCTTTGTTGCTGAGTAAACACAACAGAATGACTGAAATCATGTATGCTCATGTTTTTATATACATATGTGTAACTTACTATTATTACTACTACTATTACTAGTAAGTCGTGATAGCGTAGCGGTACCAATATGCAATATTAATCCTTTCTTTAAATATAAATTGAGACAAATGCATTCATTATTATTTGTTTTAAATGTATTTAAGATTCATATTTTCAAGAAGAAAGAATAAATGTTTATGTCATTATTTAGATGCTTGTAATATTTTTGTTATAACCAACATCGGTAGTGGTTAATAATCATTAATTAATTATTATTTTTTTCTTTCTCTCTCTGCTTAAATGATAATCTTTAATTGAGTAGAGAGCGAAACGGAAATAATTGATAATATATACTCTCTGAATTACTCATAAAAATATGTATTGGGTAACTAGAATAGAATCAAAATGAACATTCTTTCATTTTCCTAAAGTATAATTTATGTAAATTGTTCTTATTTATCAATTTTATAATTAATGATAACCAATAAAAATGAGTT]
[+] EMBL CD149015 [ACCTAACAGCAGAATGATGAATCAACAAGAAATTTCTCAATTAACAACGTCGTCTTCTGTTCACAAAACAGTAGGTATTGGAAAGAGAATCACTGAGAAGAAGGAAGAGAAGCAACACTGGCCACAGCAACATGAG GATGATGATGATGAGCAGGAGCAGACTGTCGATGAAAAGAGAAAACTTATCAATTTATCTAAAGCACTTTCTAATTTAAAACCAGATATGTCTTCAAATGACTATTTAAGTGGAAATAAACAAGCTGAACACAGTTACTTATCTTCTGAATCCAAACAGTTAAATTATTCAACAGGTAATATTTCCGATGTGTAAAAATGAGAGACAGAGAGTATGGAAAACTGAGAATTTTTATCTTAACATGTTTGTTTGATTACAATAATGGTTGTTTTATTTTGTAAATACTCGTTTAAAAC CGAACGAACA ]
[-] EMBL BG931621 [ GAATCAACAAGAAATTTCTCAATTAACAACGTCGTCTTCTGTTCACAAAACAGTAGGTATTGGAAAGAGAATCACTGAGAAGAAGGAAGAGAAGCAACACTGGCCACAGCAACATGAGGATGATGATGATGATGAGCAGGAGCAGACTGTCGATGAAAAGAGAAAACTTATCAATTTATCTAAAGCACTTTCTAATTTAAAACCAGATATGTCTACAAATGACTATTTAAGTGGAAATAAACAAGCTGAACACAATTACTTATCTTCTGAATCCAAACAGTTAAATTATTCATCAGGTAATATTTCCGATGTGTAAAAATGAGAGAC ]
[+] EMBL CD082939 [ TGTT ACAAAACAGTAGGTATTGGAAAGAGAATCACTGAGAAGAAGGAAGAGAAGCAACACTGGCCACAGCAACATGAG GATGATGATGATGAGGAGGAGCAGACTGTCGATGAAAAGAGAAAACTTATCAATTTATCTAAAGCACTTTCTAATTTAAAACCAGATATGTCTACAAATGACTATTTAAGTGGAAATAAACAAGCTGAACACAATTACTTATCTTCTGAATCCAAACAGTTAAATTATTCATCAGGTAATATTTCCGATGTGTAAAAATGAGAGACAGAGAGTATGGAAAACTGAGAATTTTTATCTTAACATGTTTGTTTGATTACAATAATGGTTGTTTTATTTTGTAAATACTCGTTTAAAAC CGAACGAACAGATCAAAGAGGAGCGAATGCGATGGATCTATCAATCTTTCTATTTAAGTATATATGTATGTGTAAACGAATAATACCTGCCAAAAGAATCATTTGCCTAACTACTTGAAAGTTGTTTGTATCTTTCAAGTTCCTGTCTTTCAGTA ]
[+] EMBL CD079217 [ GAGAAGAAGGAAGAGAAGCAACACTGGCCACAGCAACATGAG GATGATGATGATGAGGAGGAGCAGACTGTCGATGAAAAGAGAAAACTTATCAATTTATCTAAAGCACTTTCTAATTTAAAACCAGATATGTCTACAAATGACTATTTAAGTGGAAATAAACAAGCTGAACACAATTACTTATCTTCTGAATCCAAACAGTTAAATTATTCATCAGGTAATATTTCCGATGTGTAAAAATGAGAGACAGAGAGTATGGAAAACTGAGAATTTTTATCTTAACATGTTTGTTTGATTACAATAATGGTTGTTTTATTTTGTAAATACTCGTTTAAAAC CGAACGAACAGATCAAAGAGGAGCGAATGCAATGGATCTATCAATCTTTCTATTTAAGTATATATGTATGTGTAAACGAATAATACCTGCCAAAAGAATCATTTGCCTAACTACTTGAAAGTTGTTTGTATCTTTCAAGTTCCTGTCTTTCAATACTTCATTTCTATTTAAATTCCCCTTCTTTGTTGCTGAGTAAACACAACAGAATGACTGAAATCATGTATGCTCATGTTTTTATATACATATGTGTAACTTACTATTATTACTACTACTATTACTAGNTAGTCGTGATAGCGTAGCGGTACC ATATGC ATATTAATCCTT ]
[-] EMBL CD076524 [ AGAGTCAGAGAGTATGGACAACTGAGAATTTTTATCTTAACATGTTTGTTTGATTACAATAATGGTTGTTTTATTTTGTAAATACTCGTTTAAAAC CGAACGAACAGATCAAAGAGGAGCGAATGCAATGGATCTATCAATCTTTCTATTTAAGTATATATGTATGTGTAAACGAATAATACCTGCCAAAAGAATCATTTGCCTAACTACTTGAAAGTTGTTTGTATCTTTCAAGTTCCTGTCTTTCAATACTTCATTTCTATTTAAATTCCCCTTCTTTGTTGCTGAGTAAACACAACAGAATGACTGAAATCATGTATGCTCATGTTTTTATATACATATGTGTAACTTACTATTATTACTACTACTATTACTAGTAAGTCGTGATAGCGTAGCGGTACCAATATGCAATATTAATCCTTTCTTTAAATATAAATTGAGACAAATGCATTCATTATTATTTGTTTTAAATGTATTTAAGATTCATATTTTCAAGAAGAAAGAATAAATGTTTATGTCATTATTTAGATGCTTGTAATATTTTTGTTATAACCAACATCGGTAGTGGTTAATAATCATTAA ]
[+] EMBL AA952306 [ TTTATCTTAACATGTTTGTTTGATTACAATAATGGTTGTTTTATTTTGTAAATACTCGTTTAAAACGCGAACGAACAGATC AAGAGGAGCGAATCGAAT GATCTATCAATCTTTCTATTTAAGTATATATGTA G GTAAA ]
[-] EMBL CD077166 [ TACTAGTAAGTCGTGATAGCGTAGCGGTACCAATATGCAATATTAATCCTTTCTTTAAATATAAATTGAGACAAATGCATTCATTATTATTTGTTTTAAATGTATTTAAGATTCATATTTTCAAGAAGAAAGAATAAATGTTTATGTCATTATTTAGATGCTTGTAATATTTTTGTTATAACCAACATCGGTAGTGGTTAATAATCATTAATTAATTATTATTTTTTTCTTTCTCTCTCTGCTTAAATGATAATCTTTAATTGAGTAGAGAGCGAAACGGAAATAATTGATAATATATACTCTCTGAATTACTCATAAAAATATGTATTGGGTAACTAGAATAGAATCAAAATGAACATTCTTTCATTTTCCTAAAGTATAATTTATGTAAATTGTTCTTATTTATCAATTTTATAATTAATGATAACCAATAAAAATGAGTT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||