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Schistosoma mansoni
cluster # 8838 cluster # 8838       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8838#0 length = 1150 sequences # 7  

consensusID : consensus_8838#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1150
fasta sequence
                              [ACCTAACAGCAGAATGATGAATCAACAAGAAATTTCTCAATTAACAACGTCGTCTTCTGTTCACAAAACAGTAGGTATTGGAAAGAGAATCACTGAGAAGAAGGAAGAGAAGCAACACTGGCCACAGCAACATGAG---GATGATGATGATGAGCAGGAGCAGACTGTCGATGAAAAGAGAAAACTTATCAATTTATCTAAAGCACTTTCTAATTTAAAACCAGATATGTCTACAAATGACTATTTAAGTGGAAATAAACAAGCTGAACACAATTACTTATCTTCTGAATCCAAACAGTTAAATTATTCATCAGGTAATATTTCCGATGTGTAAAAATGAGAGACAGAGAGTATGGAAAACTGAGAATTTTTATCTTAACATGTTTGTTTGATTACAATAATGGTTGTTTTATTTTGTAAATACTCGTTTAAAAC-CGAACGAACAGATCAAAGAGGAGCGAATGCAATGGATCTATCAATCTTTCTATTTAAGTATATATGTATGTGTAAACGAATAATACCTGCCAAAAGAATCATTTGCCTAACTACTTGAAAGTTGTTTGTATCTTTCAAGTTCCTGTCTTTCAATACTTCATTTCTATTTAAATTCCCCTTCTTTGTTGCTGAGTAAACACAACAGAATGACTGAAATCATGTATGCTCATGTTTTTATATACATATGTGTAACTTACTATTATTACTACTACTATTACTAGTAAGTCGTGATAGCGTAGCGGTACCAATATGCAATATTAATCCTTTCTTTAAATATAAATTGAGACAAATGCATTCATTATTATTTGTTTTAAATGTATTTAAGATTCATATTTTCAAGAAGAAAGAATAAATGTTTATGTCATTATTTAGATGCTTGTAATATTTTTGTTATAACCAACATCGGTAGTGGTTAATAATCATTAATTAATTATTATTTTTTTCTTTCTCTCTCTGCTTAAATGATAATCTTTAATTGAGTAGAGAGCGAAACGGAAATAATTGATAATATATACTCTCTGAATTACTCATAAAAATATGTATTGGGTAACTAGAATAGAATCAAAATGAACATTCTTTCATTTTCCTAAAGTATAATTTATGTAAATTGTTCTTATTTATCAATTTTATAATTAATGATAACCAATAAAAATGAGTT]

[+] EMBL CD149015             [ACCTAACAGCAGAATGATGAATCAACAAGAAATTTCTCAATTAACAACGTCGTCTTCTGTTCACAAAACAGTAGGTATTGGAAAGAGAATCACTGAGAAGAAGGAAGAGAAGCAACACTGGCCACAGCAACATGAG   GATGATGATGATGAGCAGGAGCAGACTGTCGATGAAAAGAGAAAACTTATCAATTTATCTAAAGCACTTTCTAATTTAAAACCAGATATGTCTTCAAATGACTATTTAAGTGGAAATAAACAAGCTGAACACAGTTACTTATCTTCTGAATCCAAACAGTTAAATTATTCAACAGGTAATATTTCCGATGTGTAAAAATGAGAGACAGAGAGTATGGAAAACTGAGAATTTTTATCTTAACATGTTTGTTTGATTACAATAATGGTTGTTTTATTTTGTAAATACTCGTTTAAAAC CGAACGAACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL BG931621             [                  GAATCAACAAGAAATTTCTCAATTAACAACGTCGTCTTCTGTTCACAAAACAGTAGGTATTGGAAAGAGAATCACTGAGAAGAAGGAAGAGAAGCAACACTGGCCACAGCAACATGAGGATGATGATGATGATGAGCAGGAGCAGACTGTCGATGAAAAGAGAAAACTTATCAATTTATCTAAAGCACTTTCTAATTTAAAACCAGATATGTCTACAAATGACTATTTAAGTGGAAATAAACAAGCTGAACACAATTACTTATCTTCTGAATCCAAACAGTTAAATTATTCATCAGGTAATATTTCCGATGTGTAAAAATGAGAGAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD082939             [                                                         TGTT ACAAAACAGTAGGTATTGGAAAGAGAATCACTGAGAAGAAGGAAGAGAAGCAACACTGGCCACAGCAACATGAG   GATGATGATGATGAGGAGGAGCAGACTGTCGATGAAAAGAGAAAACTTATCAATTTATCTAAAGCACTTTCTAATTTAAAACCAGATATGTCTACAAATGACTATTTAAGTGGAAATAAACAAGCTGAACACAATTACTTATCTTCTGAATCCAAACAGTTAAATTATTCATCAGGTAATATTTCCGATGTGTAAAAATGAGAGACAGAGAGTATGGAAAACTGAGAATTTTTATCTTAACATGTTTGTTTGATTACAATAATGGTTGTTTTATTTTGTAAATACTCGTTTAAAAC CGAACGAACAGATCAAAGAGGAGCGAATGCGATGGATCTATCAATCTTTCTATTTAAGTATATATGTATGTGTAAACGAATAATACCTGCCAAAAGAATCATTTGCCTAACTACTTGAAAGTTGTTTGTATCTTTCAAGTTCCTGTCTTTCAGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD079217             [                                                                                              GAGAAGAAGGAAGAGAAGCAACACTGGCCACAGCAACATGAG   GATGATGATGATGAGGAGGAGCAGACTGTCGATGAAAAGAGAAAACTTATCAATTTATCTAAAGCACTTTCTAATTTAAAACCAGATATGTCTACAAATGACTATTTAAGTGGAAATAAACAAGCTGAACACAATTACTTATCTTCTGAATCCAAACAGTTAAATTATTCATCAGGTAATATTTCCGATGTGTAAAAATGAGAGACAGAGAGTATGGAAAACTGAGAATTTTTATCTTAACATGTTTGTTTGATTACAATAATGGTTGTTTTATTTTGTAAATACTCGTTTAAAAC CGAACGAACAGATCAAAGAGGAGCGAATGCAATGGATCTATCAATCTTTCTATTTAAGTATATATGTATGTGTAAACGAATAATACCTGCCAAAAGAATCATTTGCCTAACTACTTGAAAGTTGTTTGTATCTTTCAAGTTCCTGTCTTTCAATACTTCATTTCTATTTAAATTCCCCTTCTTTGTTGCTGAGTAAACACAACAGAATGACTGAAATCATGTATGCTCATGTTTTTATATACATATGTGTAACTTACTATTATTACTACTACTATTACTAGNTAGTCGTGATAGCGTAGCGGTACC ATATGC ATATTAATCCTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD076524             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AGAGTCAGAGAGTATGGACAACTGAGAATTTTTATCTTAACATGTTTGTTTGATTACAATAATGGTTGTTTTATTTTGTAAATACTCGTTTAAAAC CGAACGAACAGATCAAAGAGGAGCGAATGCAATGGATCTATCAATCTTTCTATTTAAGTATATATGTATGTGTAAACGAATAATACCTGCCAAAAGAATCATTTGCCTAACTACTTGAAAGTTGTTTGTATCTTTCAAGTTCCTGTCTTTCAATACTTCATTTCTATTTAAATTCCCCTTCTTTGTTGCTGAGTAAACACAACAGAATGACTGAAATCATGTATGCTCATGTTTTTATATACATATGTGTAACTTACTATTATTACTACTACTATTACTAGTAAGTCGTGATAGCGTAGCGGTACCAATATGCAATATTAATCCTTTCTTTAAATATAAATTGAGACAAATGCATTCATTATTATTTGTTTTAAATGTATTTAAGATTCATATTTTCAAGAAGAAAGAATAAATGTTTATGTCATTATTTAGATGCTTGTAATATTTTTGTTATAACCAACATCGGTAGTGGTTAATAATCATTAA                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL AA952306             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTATCTTAACATGTTTGTTTGATTACAATAATGGTTGTTTTATTTTGTAAATACTCGTTTAAAACGCGAACGAACAGATC AAGAGGAGCGAATCGAAT GATCTATCAATCTTTCTATTTAAGTATATATGTA G GTAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD077166             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TACTAGTAAGTCGTGATAGCGTAGCGGTACCAATATGCAATATTAATCCTTTCTTTAAATATAAATTGAGACAAATGCATTCATTATTATTTGTTTTAAATGTATTTAAGATTCATATTTTCAAGAAGAAAGAATAAATGTTTATGTCATTATTTAGATGCTTGTAATATTTTTGTTATAACCAACATCGGTAGTGGTTAATAATCATTAATTAATTATTATTTTTTTCTTTCTCTCTCTGCTTAAATGATAATCTTTAATTGAGTAGAGAGCGAAACGGAAATAATTGATAATATATACTCTCTGAATTACTCATAAAAATATGTATTGGGTAACTAGAATAGAATCAAAATGAACATTCTTTCATTTTCCTAAAGTATAATTTATGTAAATTGTTCTTATTTATCAATTTTATAATTAATGATAACCAATAAAAATGAGTT]


>consensus_8838#0 ACCTAACAGCAGAATGATGAATCAACAAGAAATTTCTCAATTAACAACGTCGTCTTCTGT TCACAAAACAGTAGGTATTGGAAAGAGAATCACTGAGAAGAAGGAAGAGAAGCAACACTG GCCACAGCAACATGAGGATGATGATGATGAGCAGGAGCAGACTGTCGATGAAAAGAGAAA ACTTATCAATTTATCTAAAGCACTTTCTAATTTAAAACCAGATATGTCTACAAATGACTA TTTAAGTGGAAATAAACAAGCTGAACACAATTACTTATCTTCTGAATCCAAACAGTTAAA TTATTCATCAGGTAATATTTCCGATGTGTAAAAATGAGAGACAGAGAGTATGGAAAACTG AGAATTTTTATCTTAACATGTTTGTTTGATTACAATAATGGTTGTTTTATTTTGTAAATA CTCGTTTAAAACCGAACGAACAGATCAAAGAGGAGCGAATGCAATGGATCTATCAATCTT TCTATTTAAGTATATATGTATGTGTAAACGAATAATACCTGCCAAAAGAATCATTTGCCT AACTACTTGAAAGTTGTTTGTATCTTTCAAGTTCCTGTCTTTCAATACTTCATTTCTATT TAAATTCCCCTTCTTTGTTGCTGAGTAAACACAACAGAATGACTGAAATCATGTATGCTC ATGTTTTTATATACATATGTGTAACTTACTATTATTACTACTACTATTACTAGTAAGTCG TGATAGCGTAGCGGTACCAATATGCAATATTAATCCTTTCTTTAAATATAAATTGAGACA AATGCATTCATTATTATTTGTTTTAAATGTATTTAAGATTCATATTTTCAAGAAGAAAGA ATAAATGTTTATGTCATTATTTAGATGCTTGTAATATTTTTGTTATAACCAACATCGGTA GTGGTTAATAATCATTAATTAATTATTATTTTTTTCTTTCTCTCTCTGCTTAAATGATAA TCTTTAATTGAGTAGAGAGCGAAACGGAAATAATTGATAATATATACTCTCTGAATTACT CATAAAAATATGTATTGGGTAACTAGAATAGAATCAAAATGAACATTCTTTCATTTTCCT AAAGTATAATTTATGTAAATTGTTCTTATTTATCAATTTTATAATTAATGATAACCAATA AAAATGAGTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)