These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8841#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 899 fasta sequence [TAATTTGAAAGAAATTGTTTTAACCAATTCATGTTATAATCAATATTCGATTTTCGATGAACTGATAATAATTGAATAATATTTGGTTTTATGAAATTATTCATCCATTGGCTCGCCTGATATCATTAATTTGGAATTTTCTGTACAGCCAAGATCAAATGTAACATGAAAAGATTGGTGACTTTGTTGTTCGTTAGTAAGTATTGATTTATTCATTTTTAGTGTCATATCTATATCTTCAGTTTTCGCAGGCTGAAGATCGAAGCCTAATTTAAGAAACTTAAGACCTTGTTCGGTGATATGATCCGGATGACTAGAAAGCCAGCTAGTATAGTTGGATAAATTAGATGTTGATGTTTGTTTATCTAAGAATAA-TTGTCGACAATCTGTAAAAGATGTTCGGAGTAAAGCTAATTCATCATCTTCAAGTTTATTATAATCATTGTCCTGATCTTTATTATGTATGATGTGAACATCATGATTATCTCTTTGAAACGATGTATGGTCGTAAGACACTTCATCTTCGTAATCCTTGGACGACGGCATTCCTGACAAACGACGATAAAGTCTATAACTGATTGCTTCAGCTGAATCTAAGGAAGTTGATGTAAAAGTAGACGGTAACCAGGCAGGAATGCGAGTTAAATATTCAGTCTCTAACCAACTGGGTTTAGTATTTTCAGAATCGGAAATACATAAATTTTCATCAGATATACGATGGATAAAACGTGATGATGAGAGATCCAATCGACCTTTAGATATGTTTTCACTATACAGTGTAAGATCTTTGGTATCTGATAAGCTAAAACGCCGAGTAGATTTGAAACCCCCCATTTTACCTGAAATTGCTCTCATTGCTGAACTATTACCTTGAACCATACTCGCCACACGTCCGGTAT] [+] EMBL CD195244 [TAATTTGAAAGAAATTGTTTTAACCAATTCATGTTATAATCAATATTCGATTTTCGATGAACTGATAATAATTGAATAATATTTGGTTTTATGAAATTATTCATCCATTGGCTCGCCTGATATCATTAATTTGGAATTTTCTGTACAGCCAAGATCAAATGTAACATGAAAAGATTGGTGACTTTGTTGTTCGTTAGTAAGTATTGATTTATTCATTTTTAGTGTCATATCTATATCTTCAGTTTTCGCAGGCTGAAGATCGAAGCCTAATTTAAGAAACTTAAGACCTTGTTCGGTGATATGATCCGGATGACTAGAAAGCCAGCTAGTATAGTTGGATAAATTAGATGTTGATGTTTGTTTATCTAAGAATAA TTGTCGACAATCTGTAAAAGATGTTCGGAGTAAAGCTAATTCATCATCTTCAAGTTTATTATAATCATTGTCCTGACCTTTATTATGTATGATGTGAAC ] [+] EMBL CD159235 [ ATTTGGAATTTTCTGTACAGCCAAGATCAAATGTAACATGAAAAGATTGGTGACTTTGTTGTTCGTTAGTAAGTATTGATTTATTCATTTTTAGTGTCATATCTATATCTTCAGTTTTCGCAGGCTGAAGATCGAAGCCTAATTTAAGAAACTTAAGACCTTGTTCGGTGATATGATCCGGATGACTAGAAAGCCAGCTAGTATAGTTGGATAAATTAGATGTTGATGTTTGTTTATCTAAGAATAA TTGTCGACAATCTGTAAAAGATGTTCGGAGTAAAGCTAATTCATCATCTTCAAGTTTATTATAATCATTGCCCTGACCTTTATTATGTATGATGT ] [+] EMBL CD169163 [ GTTTATCTAAGAATAATTTGTCGACAATCTGTAAAAGATGTTCGGAGTAAAGCTAATTCATCATCTTCAAGTTTATTATAATCATTGTCCTGATCTTTATTATGTATGATGTGAACATCATGATTATCTCTTTGAAACGATGTATGGTCGTAAGACACTTCATCTTCGTAATCCTTGGACGACGGCATTCCTGACAAACGACGATAAGGTCTATAACTGATTGCTTCAGCTGAATCTAAGGAAGTTGATGTAAAAGTAGACGGTAACCAGGCAGGAATGCGAGTTAAATATTCAGTCTCTAACCAACTGGGTTTAGTATTTTCAGAATCGGAAATACATAAATTTTCATCAGATATACGATGGATAAAACGTGATGATGAGAGATCCAATCGACCTTTAGATATGTTTTCACTATACAGTGTAAGATCTTTGGTATCTGATAAGCTAAAACGCCGAGTAGATTTGAAACCCCCCATTTT ] [+] EMBL CD168927 [ CTAAGAATAA TTGTCGACAATCTGTAAAAGATGTTCGGAGTAAAGCTAATTCATCATCTTCAAGTTTATTATAATCATTGTCCTGATCTTTATTATGTATGATGTGAACATCATGATTATCTCTTTGAAACGATGTATGGTCGTAAGACACTTCATCTTCGTAATCCTTGGACGACGGCATTCCTGACAAACGACGATAAAGTCTATAACTGATTGCTTCAGCTGAATCTAAGGAAGTTGATGTAAAAGTAGACGGTAACCAGCCAGGAATGCGAGTTAAATATTCAGTCTCTAACCAACTGGGTTTAGTATTTTCAGAATCGGAAATACATAAATTTTCATCAGATATACGATGGATAAAACGTGATGATGAGAGATCCAATCGACCTTTAGATATGTTTTCACTATACAGTGTAAGATCTTTGGTATCTGATAAGCTAAAACGCCGAGTAGATTTGAAACCCCCCATTTT ] [+] EMBL CD169054 [ CTAAGAATAA TTGTCGACAATCTGTAAAAGATGTTCGGAGTAAAGCTAATTCATCATCTTCAAGTTTATTATAATCATTGTCCTGATCTTTATTATGTATGATGTGAACATCATGATTATCTCTTTGAAACGATGTATGGTCGTAAGACACTTCATCTTCGTAATCCTTGGACGACGGCTTTCCTGACAAACGACGATAAAGTCTATAACTGATTGCTTCAGCTGAATCTAAGGAAGTTGATGTAAAAGTAGACGGTAACCAGGCAGGAATGCGAGTTAAATATTCAGTCTCTAACCAACTGGGTTTAGTA ] [+] EMBL CD168399 [ AACATCATGATTATCTCTTTGAAACGATGTATGGTCGTAAGACACTTCATCTTCGTAATCCTTGGACGACGGCATTCCTGACAAACGACGATAAAGTCTATAACTGATTGCTTCAGCTGAATCTAAGGAAGTTGATGTAAAAGTAGACGGTAACCAGGCAGGAATGCGAGTTAAATATTCAGTCTCTAACCAACTGGGTTTAGTATTTTCAGAATCGGAAATACACAAATTTTCATCAGATATACGATGGATAAAACGTGATGATGAGAGATCCAATCGACCTTTACATATGTTTTCACTATACAGTGTAAGATCTTTGGTATCTGAT AGCTAAAACGCCGAGTAGATTTGAAACCCCCCATTTTACCTGAAATTGCTCTCATTGCTGAACTATTACCTTGAACCATACTCGCCACACGTCCGGTAT] [+] EMBL CD168398 [ AACATCATGATTATCTCTTTGAAACGATGTATGGTCGTAAGACACTTCATCTTCGTAATCCTTGGACGACGGCATTCCTGACAAACGACGATAAAGTCTATAACTGATTGCTTCAGCTGAATCTAAGGAAGTTGATGTAAAAGTAGACCGTAACCAGGCAGGAATGCGAGTTAAATATTCAGTCTCTAACCAACTGGGTTTAGTATTTTCAGAATC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||