cluster # 8843

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Schistosoma mansoni
cluster # 8843 cluster # 8843 Sequences # 7 consensus # 1
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consensus_8843#0 length = 827 sequences # 7
consensusID : consensus_8843#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 827
fasta sequence
                              [AAATTATTATGATTGCTATTATCCCTTTATTATGTAACTGTTTTATCAAATACAAATTCCCATACACTAAACTTTGAGGTACAACTTAAATCTGAAACTAGTAGTGAATGACCTACCTGATTGCTAAACACAAGTTAGGTAGTGTGAAGTGAGTTTGAAACTGAGATCACATGGATGGATGTTAGCTAGCTATGGAATCCACAACGTATA-TTTTCAATGCCAGCCGCAATCCATGTATTATTTATGATGTAAAAAAGTGCTTTTATTGAGGCAATCCGACAAGGATTCATCTATCTTAACAACGACTGAACAAAATTCAGTTCTGAATTTTAAAAACGGGATAATTTAAACCCTTGTTAACTGAGACTCAACGGTTCGAATTAGAGTGTTGCTTATAACTGCTAAACTACTTTACATTCGATGAAAATTAAACAGAACTGTTTTATCCCTTCATACTGTTTTACATCATGAAGAAATAAATTCCATCGTAATTCAAATATTTTACCAGTCATCTAAACACAGAGAGTAGGTATATCAAAATGTTTGGGGTGTGTAAACTAGTACTATAAGGTATAAAATAGAAAAAAAACTTAATGGAAATCATTAGTGATTAGGTCGATCAGTAATTTTCATACAAATTCCTTAACTACCGCTTACAGTTTAGTATGTAAATCAAACTACTCTTACATATATT-TTTAGATTTGTTTCGTAGATTGGACTGATTTTTCTAAGAGTTCTAACACCTTTCTCCTCATACTCTTTGCTTAGTTTCTACACTAAACGCTTGCCAATTTCATCGCATTTGAGGATCACTTGAAAGACATCGG]

[+] EMBL CD091412             [AAATTATTATGATTGCTATTATCCCTTTATTATGTAACTGTTTTATCAAATACAAATTCCCATACACTAAACTTTGAGGTACAACTTAAATCTGAAACTAGTAGTGAATGACCTACCTGATTGCTAAACACAAGTTAGGTAGTGTGAAGTGAGTTTGAAACTGAGATCACATGGATGGATGTTAGCTAGCTATGGAATCCACAACGTATA TTTTCAATGCCAGCCGCAATCCATGTATTATTTATGATGTAAAAAAGTGCTTTTATTGAGGCAATCCGACAAGGATTCATCTATCTTAACAACGACTGAACAAAATTCAGTTCTGAATTTTAAAAACGGGATAATTTAAACCCTTGTTAACTGAGACTCAACGGTTCGAATTAGAGTGTTGCTTATAACTGCCAAACTACTTTACATTCGATGAAAATTAAACAGAACTGTTTTATCCCTTCATACTGTTTTACATCATGAAGAAATAAATTCCATCGTAATTCAAATATTTTACCAGTCATCTAAACACAGAGAGTANGTATATCAAAATGTTTGGGGTGTGTAAACTAGTACTATAAGGTATAAAATAGAAAAAAAACTTAATGGAAATCATTAGTGATTANGTCGATCAGTAA                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD091388             [                                                                                    aTTAGACCTGAATCTACCAGTGAATGACCTACCTGATTGCTAAACACAAGTTAGGTAGTGTGAAGTGAGTTTGAAACTGAGATCACATGGATGGATGTTAGCTAGCTATGGAATCCACAACGTATA TTTTCAATGCCAGCCGCAATCCATGTATTATTTATGATGTAAAAAAGTGCTTTTATTGAGGCAATCCGACAAGGATTCATCTATCTTAACAACGACTGAACAAAATTCAGTTCTGAATTTTAAAAACGGGATAATTTAAGCCCTTGTTAACTGAGACTCAACGGTTCGAATTAGAGTGTTGCTTATAACTGCTAAACTACTTTACATTCGATGAAAATTAAACAGAACTGTTTTATCCCTTCATACTGTTTTACATCATGAAGAAATAAATTCCATCGTAATTCAAATATTTTACCAGTCATCTAAACACAGAGAGTAGGTATATCAAAATGTTTGGGGTGTGTAAACTAGTACTATAAGGTATANAATAGAAAAAAAACTTAATGGAAATCATTAGTGATTANGTCGAACAGT ATTTTCATACAAATTCCTTAACTACCGCTTACAGTTTAGTATGGAAATCAAACTACTGTGACATATATTNTTTAGATTTGTTCCGTAAATTGGACTGATTTTTCTAA                                                                                                ]
[-] EMBL CD091433             [                                                                                                                                  CAAGTTAGGTAGTGTGAAGTGAGTTTGAAACTGAGATCACATGGATGGATGTTAGCTAGCTATGGAATCCACAACGTATA TTTTCAATGCCAGCCGCAATCCATGTATTATTTATGATGTAAAAAAGTGCTTTTATTGAGGCAATCCGACAAGGATTCATCTATCTTAACAACGACTGAACAAAATTCAGTTCTGAATTTTAAAAACGGGATAATTTAAACCCTTGTTAACTGAGACTCAACGGTTCGAATTAGGGTGTTGCTTATAACTGCTAAACTACTTTACATTCGATGAAAATTAAACAGAACTGTTTTATCCCTTCATACTGTTTTACATCATGAAGAAATAAATTCCATCGTAATTCAAATATTTTACCAGTCATCTAAACACAGAGAGTAGGTATATCAAAATGTTTGGGGTGTGTAAACTAGTACTATAAGGTATAAAATAGAAAAAAAACTTAATGGAAATCATTAGTGATTAGGTCGATCAGTAATTTTCATACAAATTCCTTAACTACCGCTTACAGTTTAGTATGTAAATCAAACTACTCTTACATATATT TTTAGATTTGTTTCGTAGATTGGACTGATTTTTCTAAGA                                                                                              ]
[-] EMBL CD091378             [                                                                                                                                                                        ACATGGATGGATGTTAGTTAGCTATGGAATCCACAACGTATANTTTTCAATGCCAGCCGCAATCCATGTATTATTTATGATGTAAAAAAGTGCTTTTATTGAGGCAATCCGACAAGGATTCATCTATCTTAACAACGACTGAACAAAATTCAGTTCTGAATTTTAAAAACGGGATAATTTAAACCCTTGTTAACTGAGACTCAACGGTTCGAATTAGAGTGTTGCTTATAACTGCTAAACTACTTTACATTCGATGAAAATTAAACAGAACTGTTTTATCCCTTCATACTGTTTTACATCATGAAGAAATAAATTCCATCGTAATTCAAATATTTTACCAGTCATCTAAACACAGAGAGTAGGTATATCAAAATGTTTGGGGTGTGTAAACTAGTACTATAAGGTATAAAATAGAAAAAAAACTTAATGGAAATCATTAGTGATTAGGTCGATCAATAATTTTCATACAAATTCCTTAACTACCGCTTACAGTTCAGTATGTAAATCAAACTACTCTTACATATATT TTTAGATTTGTTTCGTAGATTGGACTGATTTTTCTAAGA                                                                                              ]
[-] EMBL CD091364             [                                                                                                                                                                                                                               GCCGCAATCCATGTATTATTTATGATGTAAAAAAGTGCTTTTATTGAGGCAATCCGACAAGGATTCATCTATCTTAACAACGACTGAACAAAATTCAGTTCTGAATTTTAAAAACGGGATAATTTAAACCCTTGTTAACTGAGACTCAACGGTTCGAATTAGAGTGTTGCTTATAACTGCTAAACTACTTTACATTCGATGAAAATTAAACAGAACTGTTTTATCCCTTCATACTGTTTTACATCATGAAGAAATAAATTCCATCGTAATTCAAATATTTTACCAGTCATCTAAACACAGAGAGTAGGTATATCAAAATGTTTGGGGTGTGTAAACTAGTACTATAAGGTATAAAATAGAAAAAAAACTTAATGGAAATCATTAGTGATTAGGTCGATCAGTAATTTTCATACAAATTCCTTAACTACCGCTTACAGTTTAGTATGTAAATCAAACTACTCTTACATATATT TTTAGATTTGTTTCGTAGATTGGACTGATTTTTCTAAGA                                                                                              ]
[+] EMBL CD128412             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TGAAGAAATAA  T CATCGTAATTCAAATATTTTACCAGTCATCTAAACACAGAGAGTAGGTATATCAAAATGTTTGGGGTGTGTAAACTAGTACTATAAGGTATAAAATAGAAAAAAAACTTAATGGAAATCATTAGTGATTAGGTCGATCAGTAATTTTCATACAAATTCCTTAACTACCGCTTACAGTTTAGTATGTAAACCAAACTACTCTTACATATATT TTTAGATTTGTTTCGTAGATTGGACTGATTTTTCTAAGAGTTCTAACACCTTTCTCCTCATACTCTTTGCTTAGTTTCTACACTAAACGCTTGCCAATTTCATCGCATTTGAGGATCACTTGAAAGACATCGG]
[+] EMBL CD128458             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTACAGTTTAGTATGTAAATCAAACTACTCTTACATATATT TTTAGATTTGTTTCGTAGATCGGACTGATTTTTCTAAGAGTTCTAACACCCTTCTCCTCATACTCTTTGCTTAGTTTCTACACTAAACGCTTGCCAATTTCATCGCATTTGAGGATCACTTGTAAGACATCGG]




>consensus_8843#0
AAATTATTATGATTGCTATTATCCCTTTATTATGTAACTGTTTTATCAAATACAAATTCC
CATACACTAAACTTTGAGGTACAACTTAAATCTGAAACTAGTAGTGAATGACCTACCTGA
TTGCTAAACACAAGTTAGGTAGTGTGAAGTGAGTTTGAAACTGAGATCACATGGATGGAT
GTTAGCTAGCTATGGAATCCACAACGTATATTTTCAATGCCAGCCGCAATCCATGTATTA
TTTATGATGTAAAAAAGTGCTTTTATTGAGGCAATCCGACAAGGATTCATCTATCTTAAC
AACGACTGAACAAAATTCAGTTCTGAATTTTAAAAACGGGATAATTTAAACCCTTGTTAA
CTGAGACTCAACGGTTCGAATTAGAGTGTTGCTTATAACTGCTAAACTACTTTACATTCG
ATGAAAATTAAACAGAACTGTTTTATCCCTTCATACTGTTTTACATCATGAAGAAATAAA
TTCCATCGTAATTCAAATATTTTACCAGTCATCTAAACACAGAGAGTAGGTATATCAAAA
TGTTTGGGGTGTGTAAACTAGTACTATAAGGTATAAAATAGAAAAAAAACTTAATGGAAA
TCATTAGTGATTAGGTCGATCAGTAATTTTCATACAAATTCCTTAACTACCGCTTACAGT
TTAGTATGTAAATCAAACTACTCTTACATATATTTTTAGATTTGTTTCGTAGATTGGACT
GATTTTTCTAAGAGTTCTAACACCTTTCTCCTCATACTCTTTGCTTAGTTTCTACACTAA
ACGCTTGCCAATTTCATCGCATTTGAGGATCACTTGAAAGACATCGG
clustalw multiple alignements is not computed in this case