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Schistosoma mansoni
cluster # 8848 cluster # 8848       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8848#0 length = 1118 sequences # 7  

consensusID : consensus_8848#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1118
fasta sequence
                              [CAGTTACTTCATACATCTTAAAAAGGAACGAGGTGCATTTCGTATTTTGTGCGATACTTATGTAACAGAAGATGTTGGTACTGGTGTTGTACACCAAGCTCCCTATTTTGGTGAGGATGATTTTCGTGTGTGTCTGAGAAACGGTATTGTTGGGAAAGATACACCGATGATTTGTCCTGTAAATCCAAACGGTCGATTCACTGATGAAATTAAGGATTTTGCTGGGATGTATGTAAAAGATGCGGATAAGTTTATTTGTCAGAATTTGAAAAAACATGGCAAGTTAGTACATCAAAGTACAATTACTCACAGTTATCCATTTTGTTGGAGGTCAGATACTCCATTAATATACAAAGCTATTCCTACTTGGTTTATTCGTGTTGAACAAATGATTGATCGACTGTTGGCTAACAATGAAAAATGTCTATGGGTACCGGATTTTGTACGTGAAGGTAGATTCGCTAATTGGCTACGTGATGCACGTGATTGGGCTGTGTCTAGAAATCGTTTCTGGGGTACACCAATACCAATATGGACAAGTGATGATATGGAAGAAGTGGTTTGTATTGGTTCTATTGGAGAATTGAAACTGTTATCTGGTGTAGAGGTTACGGATTTACACAAAGAATTTGTTGACCCAATCACTATCCCATCATCAACTGGACGAGGTGTTTTACATCGCGTTTCTGAAGTATTTGACTGTTGGTTTGAATCAGGATCCATGCCGTATGCCCAGATACATTATCCATTTGAGAATACAAATGTGTTTCAAGAAGGTTTCCCAGCAGATTTCATCGCTGAAGGTATTGATCAAACACGTGGTTGGTTTTATACATTATTGGTATTATCCACTGCATTATTCGATCAACCGCCATTTCGTAATTTAATTGTTAATGGAATAGTTTTAGCCTCCGATGGACAGAAGATGAGTAAACGCGCTAAAAACTATCCAGATCCAGTTGAAGTTATAAATAAACACGGTGCAGATCCACTACGATTATATTTGATTAATTCACCGGTGGTTCGAGCACAAAATCTACGATTCAGTGAATCTGGTGTACATGAAATTGTAAAAGATGTATTTCTGCCATGGTGTAATGCATTACGATTTTTAATTG]

[-] EMBL CD154933             [CAGTTACTTCATACATCTTAAAAAGGAACGAGGTGCATTTCGTATTTTGTGCGATACTTATGTAACAGAAGATGTTGGTACTGGTGTTGTACACCAAGCTCCCTATTTTGGTGAGGATGATTTTCGTGTGTGTCTGAGAAACGGTATTGTTGGGAAAGATACACCGATGATTTGTCCTGTAAATCCAAACGGTCGATTCACTGATGAAATTAAGGATTTTGCTGGGATGTATGTAAAAGATGCGGATAAGTTTATTTGTCAGAATTTGAAAAAACATGGCAAGTTAGTACATCAAAGTACAATTACTCACAGTTATCCATTTTGTTGGAGGTCAGATACTCCATTAATATACAAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD156416             [                                                                                                                                                                                                                ATTAAGGATTTTGCTGGGATGTATGTAAAAGATGCGGATAAGTTTATTTGTCAGAATTTGAAAAAACATGGCAAGTTAGTACATCAAAGTACAATTACTCACAGTTATCCATTTTGTTGGAGGTCAGATACTCCATTAATATACAAAGCTATTCCTACTTGGTTTATTCGTGTTGAACAAATGATTGATCGACTGTTGGCTAACAATGAAAAATGTCTATGGGTACCGGATTTTGTACGTGAAGGTAGATTCGCTAATTGGCTACGTGATGCACGTGATTGGGCTGTGTCTAGAAATCGTTTCTGGGGTACACCAATACCAATATGGACAAGTGATGATATGGAAGAAGTGGTTTGTATTGGTTCTATTGGAGAATTGAAACTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD156348             [                                                                                                                                                                                                                ATTAAGGATTTTGCTGGGATGTATGTAAAAGATGCGGATAAGTTTATTTGTCAGAATTTGAAAAAACATGGCAAGTTAGTACATCAAAGTACAATTACTCACAGTTATCCATTTTGTTGGAGGTCAGATACTCCATTAATATACAAAGCTATTCCTACTTGGTTTATTCGTGTTGAACAAATGATTGATCGACTGTTGGCTAACAATGAAAAATGTCTATGGGTACCGGATTTTGTACGTGAAGGTAGATTCGCTAATTGGCTACGTGATGCACGTGATTGGGCTGTGTCTAGAAATCGTTTCTGGGGTACACCAATACCAATATGGACAAGTGATGATATGGAAGAAGTGGTTTGTATTGGTTCTATTGGAGAATTGAAACTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD159866             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CGACTGTTGGCTAACAATGAAAAATGTCTATGGGTACCGGATTTTGTACGTGAAGGTAGATTCGCTAATNGGCTACGTGATGCACGTGATTGGGCTGTGTCTAGAAATCGTTTCTGGGGTACACCAATACCAATATGGACAAGTGATGATATGGAAGAAGTGGTTTGTATTGGTTCTATTGGAGAATTGAAACTGTTATCTGGTGTAGAGGTTACGGATTTACACAAAGAATTTGTTGACCCAATCACTATCCCATCATCAACTGGACGAGGTGTTTTACATCGCGTTTCTGAAGTATTTGACTGTTGGTTTGAATCAGGATCCATGCCGTATGCTCAGATACA TATCCATTTGAGAATACAAATGTGTTTCAAGAAGGTTTCCCAGCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD163065             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GGGCTGTGTCTAGAAATCGTTTCTGGGGTACACCAATACCAATATGGACAAGTGATGATATGGAAGAAGTGGTTTGTATTGGTTCTATTGGAGAATTGAAACTGTTATCTGGTGTAGAGGTTACGGATTTACACAAAGAATTTGTTGACCCAATCACTATCCCATCATCAACTGGACGAGGTGTTTTACATCGCGTTTCTGAAGTATTTGACTGTTGGTTTGAATCAGGATCCATGCCGTATGCCCAGATACATTATCCATTTGAGAATACAAATGTGTTTCAAGAAGGTTTCCCAGCAGATTTCATCGCTGAAGGTATTGATCAAACACGTGGTTGGTTTTATACATTATTGGTATTATCCACTGCATTATTCGATCAACCGCCATTTCGTAATTTAATTGTTAATGGAATA                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD160180             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTATTGGTTCTATTGGAGAATTGAAACTGTTATCTGGTGTAGAGGTTACGGATTTACACAAAGAATTTGTTGACCCAATCACTATCCCATCATCAACTGGACGAGGTGTTTTACATCGCGTTTCTGAAGTATTTGACTGTTGGTTTGAATCAGGATCCATGCCGTATGCCCAGATACATTATCCATTTGAGAATACAAATGTGTTTCAAGAAGGTTTCCCAGCAGATCTCATCGCTGAAGGTATTGATCAAACACGTGGTTGGTTTTATACATTATTGGTATTATCCACTGCATTATTCGATCAACCGCCATTTCGTAATTTAATTGTTAATG                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD178678             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ACATTATCCATTTGAGAATACAAATGTGTTTCAAGAAGGTTTCCCAGCAGATTTCATCGCTGAAGGTATTGATCAAACACGTGGTTGGTTTTATACATTATTGGTATTATCCACTGCATTATTCGATCAACCGCCATTTCGTAATTTAATTGTTAATGGAATAGTTTTAGCCTCCGATGGACAGAAGATGAGTAAACGCGCTAAAAACTATCCAGATCCAGTTGAAGTTATAAATAAACACGGTGCAGATCCACTACGATTATATTTGATTAATTCACCGGTGGTTCGAGCACAAAATCTACGATTCAGTGAATCTGGTGTACATGAAATTGTAAAAGATGTATTTCTGCCATGGTGTAATGCATTACGATTTTTAATTG]


>consensus_8848#0 CAGTTACTTCATACATCTTAAAAAGGAACGAGGTGCATTTCGTATTTTGTGCGATACTTA TGTAACAGAAGATGTTGGTACTGGTGTTGTACACCAAGCTCCCTATTTTGGTGAGGATGA TTTTCGTGTGTGTCTGAGAAACGGTATTGTTGGGAAAGATACACCGATGATTTGTCCTGT AAATCCAAACGGTCGATTCACTGATGAAATTAAGGATTTTGCTGGGATGTATGTAAAAGA TGCGGATAAGTTTATTTGTCAGAATTTGAAAAAACATGGCAAGTTAGTACATCAAAGTAC AATTACTCACAGTTATCCATTTTGTTGGAGGTCAGATACTCCATTAATATACAAAGCTAT TCCTACTTGGTTTATTCGTGTTGAACAAATGATTGATCGACTGTTGGCTAACAATGAAAA ATGTCTATGGGTACCGGATTTTGTACGTGAAGGTAGATTCGCTAATTGGCTACGTGATGC ACGTGATTGGGCTGTGTCTAGAAATCGTTTCTGGGGTACACCAATACCAATATGGACAAG TGATGATATGGAAGAAGTGGTTTGTATTGGTTCTATTGGAGAATTGAAACTGTTATCTGG TGTAGAGGTTACGGATTTACACAAAGAATTTGTTGACCCAATCACTATCCCATCATCAAC TGGACGAGGTGTTTTACATCGCGTTTCTGAAGTATTTGACTGTTGGTTTGAATCAGGATC CATGCCGTATGCCCAGATACATTATCCATTTGAGAATACAAATGTGTTTCAAGAAGGTTT CCCAGCAGATTTCATCGCTGAAGGTATTGATCAAACACGTGGTTGGTTTTATACATTATT GGTATTATCCACTGCATTATTCGATCAACCGCCATTTCGTAATTTAATTGTTAATGGAAT AGTTTTAGCCTCCGATGGACAGAAGATGAGTAAACGCGCTAAAAACTATCCAGATCCAGT TGAAGTTATAAATAAACACGGTGCAGATCCACTACGATTATATTTGATTAATTCACCGGT GGTTCGAGCACAAAATCTACGATTCAGTGAATCTGGTGTACATGAAATTGTAAAAGATGT ATTTCTGCCATGGTGTAATGCATTACGATTTTTAATTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)