These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8848#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1118 fasta sequence [CAGTTACTTCATACATCTTAAAAAGGAACGAGGTGCATTTCGTATTTTGTGCGATACTTATGTAACAGAAGATGTTGGTACTGGTGTTGTACACCAAGCTCCCTATTTTGGTGAGGATGATTTTCGTGTGTGTCTGAGAAACGGTATTGTTGGGAAAGATACACCGATGATTTGTCCTGTAAATCCAAACGGTCGATTCACTGATGAAATTAAGGATTTTGCTGGGATGTATGTAAAAGATGCGGATAAGTTTATTTGTCAGAATTTGAAAAAACATGGCAAGTTAGTACATCAAAGTACAATTACTCACAGTTATCCATTTTGTTGGAGGTCAGATACTCCATTAATATACAAAGCTATTCCTACTTGGTTTATTCGTGTTGAACAAATGATTGATCGACTGTTGGCTAACAATGAAAAATGTCTATGGGTACCGGATTTTGTACGTGAAGGTAGATTCGCTAATTGGCTACGTGATGCACGTGATTGGGCTGTGTCTAGAAATCGTTTCTGGGGTACACCAATACCAATATGGACAAGTGATGATATGGAAGAAGTGGTTTGTATTGGTTCTATTGGAGAATTGAAACTGTTATCTGGTGTAGAGGTTACGGATTTACACAAAGAATTTGTTGACCCAATCACTATCCCATCATCAACTGGACGAGGTGTTTTACATCGCGTTTCTGAAGTATTTGACTGTTGGTTTGAATCAGGATCCATGCCGTATGCCCAGATACATTATCCATTTGAGAATACAAATGTGTTTCAAGAAGGTTTCCCAGCAGATTTCATCGCTGAAGGTATTGATCAAACACGTGGTTGGTTTTATACATTATTGGTATTATCCACTGCATTATTCGATCAACCGCCATTTCGTAATTTAATTGTTAATGGAATAGTTTTAGCCTCCGATGGACAGAAGATGAGTAAACGCGCTAAAAACTATCCAGATCCAGTTGAAGTTATAAATAAACACGGTGCAGATCCACTACGATTATATTTGATTAATTCACCGGTGGTTCGAGCACAAAATCTACGATTCAGTGAATCTGGTGTACATGAAATTGTAAAAGATGTATTTCTGCCATGGTGTAATGCATTACGATTTTTAATTG] [-] EMBL CD154933 [CAGTTACTTCATACATCTTAAAAAGGAACGAGGTGCATTTCGTATTTTGTGCGATACTTATGTAACAGAAGATGTTGGTACTGGTGTTGTACACCAAGCTCCCTATTTTGGTGAGGATGATTTTCGTGTGTGTCTGAGAAACGGTATTGTTGGGAAAGATACACCGATGATTTGTCCTGTAAATCCAAACGGTCGATTCACTGATGAAATTAAGGATTTTGCTGGGATGTATGTAAAAGATGCGGATAAGTTTATTTGTCAGAATTTGAAAAAACATGGCAAGTTAGTACATCAAAGTACAATTACTCACAGTTATCCATTTTGTTGGAGGTCAGATACTCCATTAATATACAAAG ] [-] EMBL CD156416 [ ATTAAGGATTTTGCTGGGATGTATGTAAAAGATGCGGATAAGTTTATTTGTCAGAATTTGAAAAAACATGGCAAGTTAGTACATCAAAGTACAATTACTCACAGTTATCCATTTTGTTGGAGGTCAGATACTCCATTAATATACAAAGCTATTCCTACTTGGTTTATTCGTGTTGAACAAATGATTGATCGACTGTTGGCTAACAATGAAAAATGTCTATGGGTACCGGATTTTGTACGTGAAGGTAGATTCGCTAATTGGCTACGTGATGCACGTGATTGGGCTGTGTCTAGAAATCGTTTCTGGGGTACACCAATACCAATATGGACAAGTGATGATATGGAAGAAGTGGTTTGTATTGGTTCTATTGGAGAATTGAAACTG ] [-] EMBL CD156348 [ ATTAAGGATTTTGCTGGGATGTATGTAAAAGATGCGGATAAGTTTATTTGTCAGAATTTGAAAAAACATGGCAAGTTAGTACATCAAAGTACAATTACTCACAGTTATCCATTTTGTTGGAGGTCAGATACTCCATTAATATACAAAGCTATTCCTACTTGGTTTATTCGTGTTGAACAAATGATTGATCGACTGTTGGCTAACAATGAAAAATGTCTATGGGTACCGGATTTTGTACGTGAAGGTAGATTCGCTAATTGGCTACGTGATGCACGTGATTGGGCTGTGTCTAGAAATCGTTTCTGGGGTACACCAATACCAATATGGACAAGTGATGATATGGAAGAAGTGGTTTGTATTGGTTCTATTGGAGAATTGAAACTG ] [-] EMBL CD159866 [ CGACTGTTGGCTAACAATGAAAAATGTCTATGGGTACCGGATTTTGTACGTGAAGGTAGATTCGCTAATNGGCTACGTGATGCACGTGATTGGGCTGTGTCTAGAAATCGTTTCTGGGGTACACCAATACCAATATGGACAAGTGATGATATGGAAGAAGTGGTTTGTATTGGTTCTATTGGAGAATTGAAACTGTTATCTGGTGTAGAGGTTACGGATTTACACAAAGAATTTGTTGACCCAATCACTATCCCATCATCAACTGGACGAGGTGTTTTACATCGCGTTTCTGAAGTATTTGACTGTTGGTTTGAATCAGGATCCATGCCGTATGCTCAGATACA TATCCATTTGAGAATACAAATGTGTTTCAAGAAGGTTTCCCAGCAG ] [+] EMBL CD163065 [ GGGCTGTGTCTAGAAATCGTTTCTGGGGTACACCAATACCAATATGGACAAGTGATGATATGGAAGAAGTGGTTTGTATTGGTTCTATTGGAGAATTGAAACTGTTATCTGGTGTAGAGGTTACGGATTTACACAAAGAATTTGTTGACCCAATCACTATCCCATCATCAACTGGACGAGGTGTTTTACATCGCGTTTCTGAAGTATTTGACTGTTGGTTTGAATCAGGATCCATGCCGTATGCCCAGATACATTATCCATTTGAGAATACAAATGTGTTTCAAGAAGGTTTCCCAGCAGATTTCATCGCTGAAGGTATTGATCAAACACGTGGTTGGTTTTATACATTATTGGTATTATCCACTGCATTATTCGATCAACCGCCATTTCGTAATTTAATTGTTAATGGAATA ] [+] EMBL CD160180 [ TGTATTGGTTCTATTGGAGAATTGAAACTGTTATCTGGTGTAGAGGTTACGGATTTACACAAAGAATTTGTTGACCCAATCACTATCCCATCATCAACTGGACGAGGTGTTTTACATCGCGTTTCTGAAGTATTTGACTGTTGGTTTGAATCAGGATCCATGCCGTATGCCCAGATACATTATCCATTTGAGAATACAAATGTGTTTCAAGAAGGTTTCCCAGCAGATCTCATCGCTGAAGGTATTGATCAAACACGTGGTTGGTTTTATACATTATTGGTATTATCCACTGCATTATTCGATCAACCGCCATTTCGTAATTTAATTGTTAATG ] [+] EMBL CD178678 [ ACATTATCCATTTGAGAATACAAATGTGTTTCAAGAAGGTTTCCCAGCAGATTTCATCGCTGAAGGTATTGATCAAACACGTGGTTGGTTTTATACATTATTGGTATTATCCACTGCATTATTCGATCAACCGCCATTTCGTAATTTAATTGTTAATGGAATAGTTTTAGCCTCCGATGGACAGAAGATGAGTAAACGCGCTAAAAACTATCCAGATCCAGTTGAAGTTATAAATAAACACGGTGCAGATCCACTACGATTATATTTGATTAATTCACCGGTGGTTCGAGCACAAAATCTACGATTCAGTGAATCTGGTGTACATGAAATTGTAAAAGATGTATTTCTGCCATGGTGTAATGCATTACGATTTTTAATTG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||