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Schistosoma mansoni
cluster # 8852 cluster # 8852       Sequences # 7       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8852#0 length = 564 sequences # 7  
consensusID : consensus_8852#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 564
fasta sequence 
                              [TCGTCTGTTATTGGCGCTTATTGGAGCATGATCTGCTGGAATACAATTTTATTTACATTCAATAAAGCTATTAATAATGAATCAGTTCATAAAAACATGATACTGAGTATTTTTAACGAATTATTTTATAGCTACAACTTTAATTAACACAAGTATTCCGCTAGTCTAACAAAAACTATGCTATGCGAAAATATTTATAAGTTATTTAATCGTTTTATCTACTATGCCACTTTTTTTATGTTCAGAAAACACCGTAATCAGATATTCTTATTTTACTGCTAGTTTTTATACAAATAGAGTGGTTTGCTTTGAGATGGATGAATTTGTTAACGTTTTTGGTTAAAGGGGGAAATGGAGTAAAGGGCTTTGGGAGAATATGGCAGATATTAACTGGTGCGATTACATGAAAATAATGACCTGAGGTTGGTTAGTTAGATTGTAGCTGACAAATGATTTCTGAAGAACTAGTATTTGCATTTTCCTATTCTTTTTTTGAGTTAAATTTGTTCATTGATG-GTAAAAGA-CAAACAACAGTCCAGCCTGTACTGA-TTATANCATGGATAT]

[+] EMBL CD088751             [TCGTCTGTTATTGGCGCTTATTGGAGCATGATCTGCTGGAATACAATTTTATTTACATTCAATAAAGCTGTTAATAATGAATCAGTTCATAAAAACATGATACTGAGTATTTTTAACGAATTATTTTATAGCTACAACTTTAATTAACACAAGTATTCCGCTAGTCTAACAAAAACTATGCTATGCGAAAATATTTATAAGTTATTTAATCGTTTTATCTACTATGCCACTTTTTTTATGTTCAGAAAACACCGTAATCAGATATTCTTATTTTACTGCTAGTTTTTATACAAATAGAGTGGTTTGCTTTGAGATGGATGAATTTGTTAACGTTTTTGGTTAAAGGGGGAAATGGAGTAAAGGGCTTTGGGAGAATATGGCAGATATTAACTGGTGCGATTACATGAAAATAATGACCTGAGGTTGGTTAGTTAGATTGTAGCTGACAAATGATTTCTGAAGAACTAGTATTTGCATTTTCCTATTCTTTTTTTGAGTTAAATTTGTTCATTGATG GTAAAAGA CAAACAACAGTCCAGCCTGTACTGA TTATANCATGGATAT]
[+] EMBL CD088750             [TCGTCTGTTATTGGCGCTTATTGGAGCATGATCTGCTGGAATACAATTTTATTTACATTCAATAAAGCTATTAATAATGAATCAGTTCATAAAAACATGATACTGAGTATTTTTAACGAATTATTTTATAGCTACAACTTTAATTAACACAAGTATTCCGCTAGTCTAACAAAAACTATGCTATGCGAAAATATTTATAAGTTATTTAATCGTTTTATCTACTATGCCACTTTTTTTATGTTCAGAAAACACCGTAATCAGATATTCTTATTTTACTGCTAGTTTTTATACAAATAGAGTGGTTTGCTTTGAGATGGATGAATTTGTTAACGTTTTTGGTTAAAGGGGGAAATGGAGTAAAGGGCTTTGGGAGAATATGGCAGATATTAACTGGTGCGATTACATGAAAATAATGGCCTGAGGTTGGTTAGTTAGATTGTAGCTGACAAATGATTTCTGAAGAACTAGTATTTGCATTTTCCTATTCTTTTTTTGAGTTAAATTTGTTCATTGATG GTAAAAGA CAAACAACAGTCCAGCCTGTACTGA TTATANCATGGATAT]
[+] EMBL CD088824             [TCGTCTGTTATTGGCGCTTATTGGAGCATGATCTGCTGGAATACAATTTTATTTACATTCAATAAAGCTATTAATAATGAATCAGTTCATAAAAACATGATACTGAGTATTTTTAACGAATTATTTTATAGCTACAACTTTAATTAACACAAGTATTCCGCTAGTCTAACAAAAACTATGCTATGCGAAAATATTTATAAGTTATTTAATCGTTTTATCTACTATGCCACTTTTTTTATGTTCAGAAAACACCGTAATCAGATATTCTTATTTTACTGCTAGTTTTTATACAAATAGAGTGGTTTGCTTTGAGATGGATGAATTTGTTAACGTTTTTGGTTAAAGGGGGAAATGGAGTAAAGGGCTTTGGGAGAATATGGCAGATATTAACTGGTGCGATTACATGAAAATAATGACCTGAGGTTGGTTAGTTAGATTGTAGCTGACAAATGATTTCTGAAGAACTAGTATTTGCATTTTCCTATTCTTTTTTTGAGTTAAATTTGTTCATTGATG GTAAAAGA CAAACAACAGTCCAGCCTGTACTGA TTATANCATGGATA ]
[+] EMBL CD088756             [TCGTCTGTTATTGGCGCTTATTGGAGCATGATCTGCTGGAATACAATTTTATTTACATTCAATAAAGCTATTAATAATGAATCAGTTCATAAAAACATGATACTGAGTATTTTTAACGTATTATTTTATAGCTACAACTTTAATTAACACAAGTATTCCGCTAGTCTAACAAAAACTATGCTATGCGAAAATATTTATAAGTTATTTAATCGTTTTATCTACTATGCCACTTTTTTTATGCCCAGAAAACACCGTAATCAGATATTCTTATTTTACTGCTAGTTTTTATACAAATAGAGTGGTTTGCTTTGAGATGGATGAATTTGTTAACGTTTTTGGTTAAAGGGGGAAATGGAGTAAAGGGCTTTGGGAGAATATGGCAGATATTAACTGGTGCGATTACATGAAAATAATGACCTGAGGTTGGTTAGTTAGATTGTAGCTGACAAATGATTTCTGAAGAACTAGTATTTGCATTNTCCTATTCTTTTTTTGAGTTAAATTTGTTCATTGATG GTANAAGACCAAAC ACAGTCCAGCCTGTACTGA TTATACAATGGAT  ]
[+] EMBL CD088834             [TCGTCTGTTATTGGCGCTTATTGGAGCATGATCTGCTGGAATACAATTTTATTTACATTCAATAAAGCTATTAATAATGAATCAGTTCATAAAAACATGATACTGAGTATTTTTAACGAATTATTTTATAGCTACAACTTTAATTAACACAAGTATTCCGCTAGTCTAACAAAAACTATGCTATGCGAAAATATTTATAAGTTATTTAATCGTTTTATCTACTATGCCACTTTTTTTATGTTCAGAAAACACCGTAATCAGATATTCTTATTTTACTGCTAGTTTTTATACAAATAGAGTGGTTTGCTTTGAGATGGATGAATTTGTTAACGTTTTTGGTTAAAGGGGGAAATGGAGTAAAGGGCTTTGGGAGAATATGGCAGATATTAACTGGTGCGATTACATGGAAATAATGACCTGAGGTTGGTTAGTTAGATTGTAGCTGACAAATGGTTTCTGAAGAACTAGTATTTGCATCTTCCTATTCTTTNTTTGAGTTAAATTTGTTCATTGATGNGT AAAGA CAAACAACAGTCCAGCCTGTACTGATTTATA          ]
[+] EMBL CD088833             [TCGTCTGTTATTGGCGCTTATTGGAGCATGATCTGCTGGAATACAATTTTATTTACATTCAATAAAGCTATTAATAATGAATCAGTTCATAAAAACATGATACTGAGTATTTTTAACGAATTATTTTATAGCTACAACTTTAATTAACACAAGTATTCCGCTAGTCTAACAAAAACTATGCTATGCGAAAATATTTATAAGTTATTTAATCGTTTTATCTACTATGCCACTTTTTTTATGTTCAGAAAACACCGTAATCAGATATTCTTATTTTACTGCTAGTTTTTATACAAATAGAGTGGTTTGCTTTGAGATGGATGAATTTGTTAACGTTTTTGGTTAAAGGGGGAAATGGAGTAAAGGGCTTTGGGAGAATATGGCAGATATTAACTGGTGCGATTACATGAAAATAATGACCTGAGGTTGGTTAGTTAGATTGTAGCTGACAAATGATTTCTGAAGAACTAGTATTTGCATTTTCCTATATTTTTTTTGAGTTAAATTTGTTCATTGATG GTAAAAGA CA                                       ]
[+] EMBL CD088739             [TCGTCTGTTATTGGCGCTTATTGGAGCATGATCTGCTGGAATACAATTTTATTTACATTCAATAAAGCTATTAATAATGAATCAGTTCATAAAAACATGATACTGAGTATTTTTAACGAATTATTTTATAGCTACAACTTTAATTAACACAAGTATTCCGCTAGTCTAACAAAAACTATGCTATGCGAAAATATTTATAAGTTATTTAATCGTTTTATCTACTATGCCACTTTTTTTATGTTCAGAAAACACCGTAATCAGATATTCTTATTTTACTGCTAGTTTTTATACAAATAGAGTGGTTTGCTTTGAGATGGATGAATTTGTTAACGTTTTTGGTTAAAGGGGGAAATGGAGTAAAGGGCTTTGGGAGAATATGGCAGATATTAACTGGTGCGATTACATGAAAATAATGACCTGAGGTTGGTTAGTTAGATTGTAGCTGACAAATGATTTCTGAAGAACTAGTATTTGCATTTTCCTATTCTTTTTTTGAGTTAAATTTGTTCATTGATG GTAAAAGA C                                        ]




>consensus_8852#0
TCGTCTGTTATTGGCGCTTATTGGAGCATGATCTGCTGGAATACAATTTTATTTACATTC
AATAAAGCTATTAATAATGAATCAGTTCATAAAAACATGATACTGAGTATTTTTAACGAA
TTATTTTATAGCTACAACTTTAATTAACACAAGTATTCCGCTAGTCTAACAAAAACTATG
CTATGCGAAAATATTTATAAGTTATTTAATCGTTTTATCTACTATGCCACTTTTTTTATG
TTCAGAAAACACCGTAATCAGATATTCTTATTTTACTGCTAGTTTTTATACAAATAGAGT
GGTTTGCTTTGAGATGGATGAATTTGTTAACGTTTTTGGTTAAAGGGGGAAATGGAGTAA
AGGGCTTTGGGAGAATATGGCAGATATTAACTGGTGCGATTACATGAAAATAATGACCTG
AGGTTGGTTAGTTAGATTGTAGCTGACAAATGATTTCTGAAGAACTAGTATTTGCATTTT
CCTATTCTTTTTTTGAGTTAAATTTGTTCATTGATGGTAAAAGACAAACAACAGTCCAGC
CTGTACTGATTATANCATGGATAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)