Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8853 cluster # 8853       Sequences # 7       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8853#0 length = 555 sequences # 7  
consensusID : consensus_8853#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 555
fasta sequence 
                              [CCTGGATGAAGTTCGTGAATTACTTAGCAGTGGAGTCTGTCCAGATGTAGCCAACGAGGATGGATTAACAGCATTACATCAGTGTTGTATTGATAACAATTTGGAAATGTGTCGGTTACTTCTTCGATATGGAGCAAATCCTAATTCTCGTGATACAGAACTATGGACTCCGTTACATGCGTCAGCTACATGTCATCATACAGAGATGTGTAAAATTCTAATTGATCACGGTGCAGATCTACTAGCTATGAATGTTGATGGTAATATGCCTTATGAATGTTGTATGCCTGGACCAACATTGAATTTAGTAGAAACTGAAATGGATAAAAGAGGCATAACACAAGAAGAAATAGATGATTGGCATCGTGTGCCAGAATGTGAAATGCTTGCAGATATGGAAGCCTTATACAAAGCTGGTGCAGACCTTGATCGACTAGATGCACAAGGAGCATCTATGTTACACATCGCAGCTGCTAGTGGCTTTGAAGAAGTTGTTTTGTTTTTGTTAAAACGTGGAGCGAAAATTGATTTACTTGACAAAGATGGTTGGCAAGC]

[+] EMBL CD125458             [CCTGGATGAAGTTCGTGAATTACTTAGCAGTGGAGTCTGTCCAGATGTAGCCAACGAGGATGGATTAACAGCATTACATCAGTGTTGTATTGATAACAATTTGGAAATGTGTCGGTTACTTCTTCGATATGGAGCAAATCCTAATTCTCGTGATACAGAACTATGGACTCCGTTACATGCGTCAGCTACATGTCATCATACAGAGATGTGTAAAATTCTAATTGATCACGGTGCAGATCTACTAGCTATGAATGTTGATGGTAATATGCCTTATGAATGTTGTATGCCTGGACCAACATTGAATTTAGTAGAAACTGAAATGGATAAAAGAGGCATAACACAAGAAGAAATAGATGATTGGCATCGTGTGCCAGAATGTGAAATGCTTGCAGATATGGAAGCCTTATACAAAGCTGGTGCAGACCTTGATCGACTAGATGCACAAGGAGCATCTATGTTACACATCGCAGCTGCTAGTGGCTTTGAAGAAGTTGTTTTGTTTTCGTTAAAACGTGGAGCGAAAATTGATTTACTTGACAAAGATGGTTGGCAAGC]
[+] EMBL CD125455             [CCTGGATGAAGTTCGTGAATTACTTAGCAGTGGAGTCTGTCCAGATGTAGCCAACGAGGATGGATTAACAGCATTACATCAGTGTTGTATTGATAACAATTTGGAAATGTGTCGGTTACTTCTTCGATATGGAGCAAATCCTAATTCTCGTGATACAGAACTATGGACTCCGTTACATGCGTCAGCTACATGTCATCATACAGAGATGTGTAAAATTCTAATTGATCACGGTGCAGATCTACTAGCTATGAATGTTGATGGTAATATGCCTTATGAATGTTGTATGCCTGGACCAACATTGAATTTAGTAGAAACTGAAATGGATAAAAGAGGCATAACACAAGAAGAAATAGATGATTGGCATCGTGTGCCAGAATGTGAAATGCTTGCAGATATGGAAGCCTTATACAAAGCTGGTGCAGACCTTGATCGACTAGATGCACAAGGAGCATCTATGTTACACATCGCAGCTGCTAGTGGCTTTGAAGAAGTTGTTTTGTTTTTGTTANAACGTGGAGCG AAATTGATTTACTTGAC AAGATGGTT       ]
[+] EMBL CD164763             [CCTGGATGAAGTTCGTGAATTACTTAGCAGTGGAGTCTGTCCAGATGTAGCCAACGAGGATGGATTAACAGCATTACATCAGTGTTGTATTGATAACAATTTGGAAATGTGTCGGTTACTTCTTCGATATGGAGCAAATCCTAATTCTCGTGATACAGAACTATGGACTCCGTTACATGCGTCAGCTACATGTCATCATACAGATATGCGTAAAATTCTAATTGATCACGGTGCAGATCTACTAGCTATGAATGTTGATGGTAATATGCCTTATGAATGTTGTATGCCTGGACCAACATTGAATTTAGTAGAAACTGAAATGGATAAAAGAGGCATAACACAAGAAGAAATAGATGATTGGCATCGTGTGCCAGAATGTGAAATGCTTGCAGATATGGAAGCCTTATACAAAGCTGGTGCAGACCTTGATCGACTAGATGCACAAGGAGCATCTAT                                                                                                   ]
[+] EMBL CD139054             [CCTGGATGAAGTTCGTGAATTACTTAGCAGTGGAGTCTGTCCAGATGTAGCCAACGAGGATGGATTAACAGCATTACATCAGTGTTGTATTGATAACAATTTGGAGATGTGTCGGTTACTTCTTCGATATGGAGCAAATCCTAACTCTCGTGATACAGAACTATGGACTCCGTTACATGCGTCAGCTACATGTCATCATACAGAGATGTGTAAAATTCTAATTGATCACGGTGCAGATCTACTAGCTATGAATGTTGATGGTAATATGCCTTATGAATGTTGTATGCCTGGACCAACATTGAATTTAATATAAACTGAAATGGATACAAGAc                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD182759             [CCTGGATGAAGTTCGTGAATTACTTAGCAGTGGAGTCTGTCCAGATGTAGCCAACGAGGATGGATTAACAGCATTACATCAGTGTTGTATTGATAACAATTTGGAAATGTGTCGGTTACTTCTTCGATATGGAGCAAATCCTGATTCTCGTGATACAGAACTGTGGACTCCGTTACATGCGTCAGCTACATGTCATCATACAGAGATGTGTAAAATTCTAATTGATCACGGTGCAGATCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD124371             [  TGGATGAAGTTCGTGAATTACTTAGCAGTGGAGTCTGTCCAGATGTAGCCAACGAGGATGGATTAACAGCATTACATCAGTGTTGTATTGATAACAATTTGGAAATGTGTCGGTTACTTCTTCGATATGGAGCAAATCCTAATTCTCGTGATACAGAACTATGGACTCCGTTACATGCGTCAGCTACATGTCATCATACAGAGATGTGTAAAATTCTAATTGATCACGGTGCAGATCTACTAGCTATGAATGTTGATGGTAATATGCCTTATGAATGTTGTATGCCTGGACCAACATTGAATTTAGTAGAAACTGAAATGGATAAAAGAGGCCTAACACAAGAAGAAATAGATGATTGGCATCGTGTGCCAGAATGTGAAATGCTTGCAGATATGGAAGCCTTATACAAAGCTGGGGCAGACCTTGATCGACTAGATGCACAAGGAGCATCTATGTTACACATCGCAGCTGCTAGTGGCTTTGAAGAAGTTGTTTTGTTTTTG                                                  ]
[-] EMBL CD124455             [   GGATGAAGTTCGTGAATTACTTAGCAGTGGAGTCTGTCCAGATGTAGCCAACGAGGATGGATTAACAGCATTACATCAGTGTTGTATTGATAACAATTTGGAAATGTGTCGGTTACTTCTTCGATATGGAGCAAATCCTAATTCTCGTGATACAGAACTATGGATTCCGTTACATGCGTCAGCTACATGTCATCATACAGAGATGTGTAAAATTCTAATTGATCACGGTGCAGATCTACTAGCTATGAATGTTGATGGTAATATGCCTTATGAATGTTGTATGCCTGGACCAACATTGAATTTAGTAGAAACTGAAATGGATAAAAGAGGCATAACACAAGAAGAAATAGATGATTGGCATCGTGTGCCAGAATGTGAAATGCTTGCAGATATGGAAGCCTTATACAAAGCTGGTGCAGACCTTGATCGACTAGATGCACAAGGAGCATCTATGTTACACATCGCAGCTGCTAGTGGCTTTGAAGAAGTTGTTTTGTTTTTGT                                                 ]




>consensus_8853#0
CCTGGATGAAGTTCGTGAATTACTTAGCAGTGGAGTCTGTCCAGATGTAGCCAACGAGGA
TGGATTAACAGCATTACATCAGTGTTGTATTGATAACAATTTGGAAATGTGTCGGTTACT
TCTTCGATATGGAGCAAATCCTAATTCTCGTGATACAGAACTATGGACTCCGTTACATGC
GTCAGCTACATGTCATCATACAGAGATGTGTAAAATTCTAATTGATCACGGTGCAGATCT
ACTAGCTATGAATGTTGATGGTAATATGCCTTATGAATGTTGTATGCCTGGACCAACATT
GAATTTAGTAGAAACTGAAATGGATAAAAGAGGCATAACACAAGAAGAAATAGATGATTG
GCATCGTGTGCCAGAATGTGAAATGCTTGCAGATATGGAAGCCTTATACAAAGCTGGTGC
AGACCTTGATCGACTAGATGCACAAGGAGCATCTATGTTACACATCGCAGCTGCTAGTGG
CTTTGAAGAAGTTGTTTTGTTTTTGTTAAAACGTGGAGCGAAAATTGATTTACTTGACAA
AGATGGTTGGCAAGC

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)