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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8856#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1346 fasta sequence
[TCGCGTCAGAGAATGATTGATCGTTGGAGGCGGTTTCCTGATCAAGCATCTAAAGTAGCATGTGAAATACATCCATTGGCAAGTCAAGTTGATACCTGTTGGCCACCATCAAATTTTCAATGTTCTCTGTCGGAATTACAAACAGCT-TGTCTCGAAGAACCACCTACTCCGCAAAGATTATGTGTTAGACCGTTGAACACGACTAAACGGTACTATTATTCTTCAGCGACGAAACAATGCAGAGAATTTGAATATGTTCCTGAATGTCATCTCCGAGCGCTTGTTGCAAATCATCCAATTAGTTTAACCCGGAATGTTTTTAAAGATCGAAACAGTTGTGAACAATTGTGTACAAATAAACAAATTCAAGCTGATGCTGTTTGGAATCCGATTGTTAAAAGAGAAACAGAGAAATTACAGCACAGATGTGAGCAGTCATTAATGAAAGGATCTTTGTGTCAGTCGAATAAAAGATCTTATAGCTGGTATTATGATAAACAAATGAATCGATGTATATCTTTTGAATATCTCGGTTGCTATGGTAACGAGAACAATTTTAGATCAGAAAAGGAATGTATCACTCAATGTGTCTACCGCGATAACACTACAAATGATTCAGATCAATTAAATTTGAAAAACGGTATTCAGAAAACATCACTTTTAAATAATACTAATGATAAGTGGATTCAAATGCCTCAAGAATGTCGGTATACACAATGGACAAATTGGTCAAGTTGCAGTACTACATGTGGACAAGGAATTCAGACACGTGTACGTGAACGCATTTCATCAAAATCAGACAACTGCCAAAAAACTTTACCAGAACTTAAACAACAAATGAGTTGTTTACTTAAGGCTTGTTAACTAATAATCACAATTTAGTCATTTCTGAGTTTTTCCATTTTCCTTATACATTTGTTAAAATATTTTTCACAGTTATTCATTACTACTGATCGAGATATACTACTCGAATAAAAACAAATTATAAATGGATAC-TTTTCAATGATGATATTTACATCGAGTTAATAGTTTCGTTTAAGTACATATACTGTGTTTG-TTTTTTTTTCATTTCCAAATAACCTGTCACTTGTTGACGGTTGTTTACTATTTTATAGTATAAAAGGTTATCAATGTTAAATATTAATCTTTGCATTCCGTTGTTAATTATCTAGCATTTGACTCCAAATTTTTCTTTATATTCATCATTAAATTATCCATTTTGTTCTTGTTATTATTGTTAGTATGGCTGCAATAATTAGTATTGTTATTATTGTAAACTATGAAGTGAATGAATCTTTTAAAAAAAGAAATACAACTTTCAACGAAAAAAAAAGTTAAACAAAAAT]
[+] EMBL CD084263 [TCGCGTCAGAGAATGATTGATCGTTGGAGGCGGTTTCCTGATCAAGCATCTAAAGTAGCATGTGAAATACATCCATTGGCAAGTCAAGTTGATACCTGTTGGCCACCATCAAATTTTCAATGTTCTCTGTCGGAATTACAAACAGCT TGTCTCGAAGAACCACCTACTCCGCAAAGATTATGTGTTAGACCGTTGAACACGACTAAACGGTACTATTATTCTTCAGCGACGAAACAATGCAGAGAATTTGAATATGTTCCTGAATGTCATCTCCGAGCGCTTGTTGCAAATCATCCAATTAGTTTAACCCGGAATGTTTTTAAAGATCGAAACAGTTGTGAACAATTGTGTACAAATAAACAAATTCAA ]
[+] EMBL CD082264 [ TTTCAATGTTCTCTGNCTGAATTACGAACAGCTAACCCTCGAAGAACCACCTACTCCGCAAAGATTATGTGTTAGACCGTTGAACACGACTAAACGGTACTATTATTCTTCAGCGACTAAACAATGCAAAGAATTTGAATATGTTCCTGAATGTCATCTCCGAGCGCTTGTTGCTTTTTATCCAATTAGTTTAACCCGGAATGTTTTTAAAGATCGAAACAGTTGTGAACAATTGTGTACAAATAAACAAATTCAAGCTGATGCTGTTTGGAATCCGATTGTTAAAAGAGAAACAGAGAAATTACAGCACAGATGTGAGCAGTCATTAATGAAAGGATCTTTGTGTCAGTCGAATAAAAGATCTTATAGCTGGTATTATGATAAACAAATGAATCGATGTATATCTTTTGAATATCTCGGTTGCTATGGTAACGAGAACAATTTTAGATCAGAAAAGGAATGTATCACTCAATGTGTCTACCGCGATAACACTACAAATGATTCAGATCAATTAAATTTGAAAAACGGTATTCAGAAAACATCACTTTTAAATAATACTAATGATAAGTGGATTCAAATGCCTCAAGAATGTCGGTATACACAATGGACAAATTGG CAAGTTGCAGTA ]
[+] EMBL CD079389 [ GCAAATCATCCAATTAGTTTAACCCGGAATGTTTTTAAAGATCGAAACAGTTGTGAACAATTGTGTACAAATAAACAAATTCAAGCTGATGCTGTTTGGAATCCGATTGTTAAAAGAGAAACAGAGAAATTACAGCACAGATGTGAGCAGTCATTAATGAAAGGATCTTTGTGTCAGTCGAATAAAAGATCTTATAGCTGGTATTATGATAAACAAATGAATCGATGTATATCTTTTGAATATCTCGGTTGCTATGGTAACGAGAACAATTTTAGATCAGAAAAGGAATGTATCACTCAATGTGTCTACCGCGATAACACTACAAATGATTCAGATCAATTAAATTTGAAAAACGGTATTCAGAAAACATCACTTTTAAATAATACTAATGATAAGTGGATTCAAATGCCTCAAGAATGTCGGTATACACAATGGACAAATTGGTCAAGTTGCAGTACTACATGTGGACAAGGAATTCAGACACGTGTACGTGAACGCATTTCATCAAAATCAGACAACTGCCAAAAAACTTTACCAGAACTTAAACAACAAATGAGTTGTTTACTTAAGGCTTGTTAACTAATAATCACAATTTAGTCATTTCTGAGTTNTTCCATTNTCCTTATACATTTGTTAAAATATTTTTCACAGTTATTCATTACTACTGATCGAGATATACTACTCGAATANAAACAAATTATAAATGGATACNTTTTC ATGATGATATTTACATCG ]
[-] EMBL CD073664 [ AAACATCACTTTTAAATAATACTAATGATAAGTGGATTCAAATGCCTCAAGAATGTCGGTATACACAATGGACAAATTGGTCAAGTTGCAGTACTACATGTGGACAAGGAATTCAGACACGTGTACGTGAACGCATTTCATCAAAATCAGACAACTGCCAAAAAACTTTACCAGAACTTAAACAACAAATGAGTTGTTTACTTAAGGCTTGTTAACTAATAATCACAATTTAGTCATTTTTGAGTTTTTCCATTTTCCTTATACATTTGTTAAAATATTTTTCACAGTTATTCATTACTACTGATCGAGATATACTACTCGAATAAAAACAAATTATAAATGGATAC TTTTCAATGATGATATTTACATCGAGTTAATAGTTTCGTTTAAGTACATATACTGTGTTTG TTTTTTTTTCATTTCCAAATAACCTGTCACTTGTTGACGGTTGTTTACTATTTTATAGTATAAAAGGTTATCAATGTTAAATATTAATCTTTGCATTCCGTTGTTAATTATTTAGCATTTGACTCCAAATTTTTCTTTATATTCATCATTAAATTATCCATTTTGTTCTTGTTATTATTGTTAGTATGGCTGCAATAATTAGTATTGTTATTATTGTAAACTATGGAGTGAATGAATCTTTTAAAAAAAGAAATACAACTTTCAACGAAAAAAAAAGTTAAACAAAAAT]
[-] EMBL CD075871 [ AATTGGTCAAGTTGCAGTACTACATGTGGACAAGGAATTCAGACACGTGTACGTGAACGCATTTCATCAAAATCAGACAACTGCCAAAAAACTTTACCAGAACTTAAACAACAAATGAGTTGTTTACTTAAGGCTTGTTAACTAATAATCACAATTTAGTCATTTCTGAGTTTTTCCATTTTCCTTATACATTTGTTAAAATATTTTTCACAGTTATTCATTACTACTGATCGAGATATACTACTCGAATAAAAACAAATTATAAATGGATAC TTTTCAATGATGATATTTACATCGAGTTAATAGTTTCGTTTAAGTACATATACTGTGTTTG TTTTTTTTTCATTTCCAAATAACCTGTCACTTGTTGACGGTTGTTTACTATTTTATAGTATAAAAGGTTATCAATGTTAAATATTAATCTTTGCATTCCGTTGTTAATTATCTAGCATTTGACTCCAAATTTTTCTTTATATTCATCATTAAATTATCCATTTTGTTCTTGTTATTATTGTTAGTATGGCTGCAATAATTAGTATTGTTATTATTGTAAACTATGAAGTGAATGAATCTTTTAAAGAAAGAAATACAACTTTCAA ]
[+] EMBL CD166681 [ TCAAAATCAGACAACTGCCAAAAAACTTTA CAGAACTTAAACAACAAATGAG TGTTTACTTAAGGC TGTTAACTAATAATCACAATTTAGTCATTTCTGAGTTTTTCCATTTTCCTTATACATTTGTTAAAATATTTTTCACAGTTATTCATTACTACTGATCGAGATATACTACTCGAATAAAAACAAATTATAAATGGATAC TTTTCAATGATGATATTTACATCGAGTTAATAGTTTCGTTTAAGTACATATACTGTGTTTGTTTTTTTTTTCATTTCCAAATAACCTGTCACTTGTTGACGGTTGTTTACTATTTTATAGTATAAAAGGTTATCAATGTTAAATATTAATCTTTGCATTCCGTTGTTAATTATCTAGCATTTGACTCCAAATTTTTCTTTATATTCATCATTAAATTATCCATTTGGTTCTTGTTATTATGGTTAGTATGGCTGCAATAATTAGTATGGTTATTATGGTAAACTATGAAG ]
[-] EMBL CD139754 [ TCGAGATATACTACTCGAATAAAAACAAATTATAAATGGATAC TTTTCAATGATGATATTTACATCGAGTTAATAGTTTCGTTTAAGTACATATACTGTGTTTG TTTTTTTTTCATTTCCAAATAACCTGTCACTTGTTGACGGTTGTTTACTATTTTATAGTATAAAAGGTTATCAATGTTAAATATTAATCTTTGCATTCCGTTGTTAATTATCTAGCATTTGACTCCAAATTTTTCTTTATATTCATCATTAAATTATCCATTTTGTTCTTGTTATTATTGTTAGTATGGCTGCAATAATTAGTA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||