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Schistosoma mansoni
cluster # 8868 cluster # 8868       Sequences # 7       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8868#0 length = 1030 sequences # 7  
consensusID : consensus_8868#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1030
fasta sequence 
                              [CTGGTTAACTGCTTATACTATTCAGGCTTTAAATAGAAATATAAAAATTGGTGATTATAGTGCATCTGTAACAGATTTTCTGACTAGTCCTTCACGTAGCCCTGTCGATCGTCATATCGACTCAAAGACTGGTGTGGTCATGCCATATGGTAAAAAAATTATTGATTTATACTCAGATGGATTCATAAATGATGCAGATTTTCATCATTTAGCTTCTATTCTATCTAGTGGCATGTGTGTAGAATTTCGAGATTGTCACTTGACATGGTATGAGGCCCTAAACATTAGTCAAACAGATATATCTTGGAAACCTTGTCTCTCTGATTGGTTATCTGCTGGTGCGTACAATCCAAATACACGACGTTTACGTGTCAGTTTACTGAAGTCTGGAAAAGGCAATAGCAAAAGTAAATCATCGAATAATTCATTAGTGTTCGCTGAAAATGAATTAACAATCAGAGATGCAATTAAAAATGGACTTCTGGACAATACTGTCCCAGAAGTTATTGTCCCTGTTGAAAACCAGGTGGGTGGTAACCATGCTACCTCTTATCGACGTGTCAGTCTGTCTGAAGCTGTTCAAATAGGTCTTGTTGATGATGTGTCTGGTTATTGGCTCGGATCAAGTTCATCTTCCAGTCGAACGAAAGTTGGCGTGGAAGTGGCTCAAGCTGCTGGCTTATTAACTAAAGCTCCTTGTCTAGCTGAAATAGTCTTATCTGGACTTATATCGTTTACTGCTCCGAACATGAGCGAAATACATCCTAAAAGCAATGTGGGTATTCTTGATGCCCACACTGGTCAATATGTATTGTTTCCAGAGGCAAATAAACGTGGATTGATAGTTGGAAATCAACCAGCCATAATTCTTATGCAATCCCATCCCAATCAAGTATTGACTTTAGCCGAAGCTCTGAATACAAATCTAATCACGCCGTCCGGATTTATAATTTTGGAAAATAAACCTATGAATTTGTGGGATGCGGNTAACATAATTATATCCGACTTATATATACTANATCGTATCCAC]

[+] EMBL CD122955             [CTGGTTAACTGCTTATACTATTCAGGCTTTAAATAGAAATATAAAAATTGGTGATTATAGTGCATCTGTAACAGATTTTCTGACTAGTCCTTCACGTAGCCCTGTCGATCGTCATATCGACTCAAAGACTGGTGTGGTCATGCCATATGGTAAAAAAATTATTGATTTATACTCAGATGGATTCATAAATGATGCAGATTTTCATCATTTAGCTTCTATTCTATCTAGTGGCATGTGTGTAGAATTTCGAGATTGTCACTTGACATGGTATGAGGCCCTAAACATTAGTCAAACAGATATATCTTGGAAACCTTGTCTCTCTGATTGGTTATCTGCTGGTGCGTACAATCCAAATACACGACGTTTACGTGTCAGTTTACTGAAGTCTGGAAAAGGCAATAGCAAAAGTAAATCATCGAATAATTCATTAGTGTTCGCTGAAAATGAATTAACAATCAGAGATGCAATTAAAAATGGACTTCTGGACAATACTGTCCCAGAAGTTATTGTCCCTGTTGAAAACCAGGTGGGTGGTAACCATGCTACCTCTTATCGACGTGTCAGTCTGTCTGAAGCTGTTCAAATAGGTCTTGGTGATGATGTGTCTGGTTATTGGCTCGGATCAAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD122902             [CTGGTTAACTGCTTATACTATTCAGGCTTTAAATAGAAATATAAAAATTGGTGGTTATAGTGCATCTGTAACAGATTTTCTGACTAGTCCTTCACGTAGCCCTGTCGATCGTCATATCGACTCAAAGACTGGTGTGGTCATGCCATATGGTAAAAAAATTATTGATTTATACTCAGATGGATTCATAAATGATGCAGATTTTCATCATTTAGCTTCTATTCTATCTAGTGGCATGTGTGTAGAATTTCGAGATTGTCACTTGACATGGTATGAGGCCCTAAACATCAGTCAAACAGATATATCTTGGAAACCTTGTCTCTCTGATTGGTTATCTGCTGGTGCGTACAATCCAAATACACGACGTTTACGTGTCAGTTTACTGAAGTCTGGAAAAGGCAATAGCAAAAGTAAATCATCGAATAATTCATTAGTGTTCGCTGAAAATGAATTAACAATCAGAGATGCAATTAAAAATGGACTTCTGGACAATACTGTCCCAGAAGTTATTGTCCCTGTTGAAAACCAGGTGGGTGGTAACCATGCTACCTCTTATCGACGTGTCAGTCTGTCTGAAGCTGTTCAAATAGGTCTTGTTGATGATGTGTCTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD130331             [                  TATTCAGGCTTTGAATAGAAATATAAAAATTGGTGATTATAGTGCATCTGTAACAGATTTTCTGACTAGTCCTTCACGTAGCCCTGTCGATCGTCATATCGACTCAAAGACTGGTGTGGTCATGCCATATGGTAAAAAAATTATTGATTTATACTCAGATGGATTCATAAATGATGCAGATTTTCATCATTTAGCTTCTATTCTATCTAGTGGCATGTGTGTAGAATTTCGAGATTGTCACTTGACATGGTATGAGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD155554             [                                                                                                                                                                                                                                                                                        AACATTAGTCAAACAGATATATCTTGGAAACCTTGTCTCTCTGATTGGTTATCTGCTGGTGCGTACAATCCAAATACACGACGTTTACGTGTCAGTTTACTGAAGTCTGGAAAAGGCAATAGCAAAAGTAAATCATCGAATAATTCATTAGTGTTCGCTGAAAATGAATTAACAATCAGAGATGCAATTAAAAATGGACTTCTGGACAATACTGTCCCAGAAGTTATTGTCCCTGTTGAAAACCAGGTGGGTGGTAACCATGCTACCTCTTATCGACGTGTCAGTCTGTCTGAAGCTGTTCAAATAGGTCTTGTTGATGATGTGTCTGGTTATTGGCTCGGATCAAGTTCATCTTCCAGTCGAACGAAAGTTGGCGTGGAAGTGGCTCAAGCTGCTGGCTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD186649             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CAGAAGTTATTGTCCCTGTTGAAAACCAGGTGGGTGGTAACCATGCTACCTCTNATCGACGTGTCAGTCTGTCTGAAGCTGTTCAAATAGGTCTTGTTGATGATGTGTCTGGTTATTGGCTCGGATCAAGTTCATCTTCCAGTCGAACGAAAGTTGGCGTGGAAGTGGCTCAAGCTGCTGGCTTATTAACTAAAGCTCCTTGTCTAGCTGAAATAGTCTTATCTGGACTTATATCGTTTACTGCTCCGAACATGAGCGAAATACATCCTAAAAGCAATGTGGGTATTCTTGATGCCCACACTGGTCAATATG                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD120711             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTGTTGATGATGTGTCTGGTTATTGGCTCGGATCAAGTTCATCTTCCAGTCGAACGAAAGTTGGCGTGGAAGTGGCTCAAGCTGCTGGCTTATTAACTAAAGCTCCTTGTCTAGCTGAAATAGTCTTATCTGGACTTATATCGTTTACTGCTCCGAACATGAGCGAAATACATCCTAAAAGCAATGTGGGTATTCTTGATGCCCACACTGGTCAATATGTATTGTTTCCAGAGGCAAATAAACGTGGATTGATAGTTGG                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD181476             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATCTGGACTTATATCGTTTACTGCTCCGAACATGAGCGAAATACATCCTAAAAGCAATGTGGGTATTCTTGATGCCCACACTGGTCAATATGTATTGTTTCCAGAGGCAATTAAACGTGGATTGATAGTTGGAAATCAACCAGCCATAATTCTTATGCAATCCCATCCCAATCAAGTATTGACTTTAGCCGAAGCTCTGAATACAAATCTAATCACGCCGTCCGGATTTATAATTTTGGAAAATAAACCTATGAATTTGTGGGATGCGGNTAACATAATTATATCCGACTTATATATACTANATCGTATCCAC]




>consensus_8868#0
CTGGTTAACTGCTTATACTATTCAGGCTTTAAATAGAAATATAAAAATTGGTGATTATAG
TGCATCTGTAACAGATTTTCTGACTAGTCCTTCACGTAGCCCTGTCGATCGTCATATCGA
CTCAAAGACTGGTGTGGTCATGCCATATGGTAAAAAAATTATTGATTTATACTCAGATGG
ATTCATAAATGATGCAGATTTTCATCATTTAGCTTCTATTCTATCTAGTGGCATGTGTGT
AGAATTTCGAGATTGTCACTTGACATGGTATGAGGCCCTAAACATTAGTCAAACAGATAT
ATCTTGGAAACCTTGTCTCTCTGATTGGTTATCTGCTGGTGCGTACAATCCAAATACACG
ACGTTTACGTGTCAGTTTACTGAAGTCTGGAAAAGGCAATAGCAAAAGTAAATCATCGAA
TAATTCATTAGTGTTCGCTGAAAATGAATTAACAATCAGAGATGCAATTAAAAATGGACT
TCTGGACAATACTGTCCCAGAAGTTATTGTCCCTGTTGAAAACCAGGTGGGTGGTAACCA
TGCTACCTCTTATCGACGTGTCAGTCTGTCTGAAGCTGTTCAAATAGGTCTTGTTGATGA
TGTGTCTGGTTATTGGCTCGGATCAAGTTCATCTTCCAGTCGAACGAAAGTTGGCGTGGA
AGTGGCTCAAGCTGCTGGCTTATTAACTAAAGCTCCTTGTCTAGCTGAAATAGTCTTATC
TGGACTTATATCGTTTACTGCTCCGAACATGAGCGAAATACATCCTAAAAGCAATGTGGG
TATTCTTGATGCCCACACTGGTCAATATGTATTGTTTCCAGAGGCAAATAAACGTGGATT
GATAGTTGGAAATCAACCAGCCATAATTCTTATGCAATCCCATCCCAATCAAGTATTGAC
TTTAGCCGAAGCTCTGAATACAAATCTAATCACGCCGTCCGGATTTATAATTTTGGAAAA
TAAACCTATGAATTTGTGGGATGCGGNTAACATAATTATATCCGACTTATATATACTANA
TCGTATCCAC

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)