cluster # 8872

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8872 cluster # 8872 Sequences # 7 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_8872#0 length = 446 sequences # 7

consensusID : consensus_8872#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 446
fasta sequence

                              [TAGCTTATATCTTTATAAGTAATTTCTGCTCAATGGTTTAAATAGCTGCAGTAATCTGACTGTACTAAGGTAGCATAATCATTAGTTTCTTAATAAGAAACTGGAATGAAGGAATTTTAAAATTATTAAATTTTTATTAATTTTTTAAAGTTATATTTAAAGTGAAAATACTTTATTTGAATTATTAGACGATAAGACCCTATAAATCTTAAATTAAATTTTATTTGGGGTAAATAAAATAATTTTTAAATTATTTAGTTAAG-TTACTTTAGGGTTAACAGGGTAATTATAATATTAAGATCTTATTAGTATTGTTGTTTACTACCTCGATGTTGGATCATTATACTAATTAAGTAGAGTTAATTAATTTTAGTCTGTTAGACTATAAAATTTTACGTGATCTGAGTTTAGACCGATGTAAATTACGTTAGATTTTATCTTTATTA]

[-] EMBL CD139552             [TAGCTTATATCTTTATAAGTAATTTCTGCTCAATGGTTTAAATAGCTGCAGTAATCTGACTGTACTAAGGTAGCATAATCATTAGTTTCTTAATAAGAAACTGGAATGAAGGAATTTTAAAATTATTAAATTTTTATTAATTTTTTAAAGTTATATTTAAAGTGAAAATACTTTATTTGAATTATTAGACGATAAGACCCTATAAATCTTAAACTAAATTTTATTTGGGGTAAATAAAATAATTTTTAAATTATTTAGTTAAG TTACTTTAGGGTTAACAGGGTAATTATAATATTAAGATCTTATTAGTATTGTTGTTTACT                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD130218             [                                        AATAGCTGCAGTAATCTGGCTGTTCTAAGGTAGCATAATCATTAGTTTCTTAATAAGAAACTGGAATGAAGGAATTTTAAAATTATTAAATTTTTATTAATTTTTTAAAGTTATATTTAAAGTGAAAATACTTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD139669             [                                                         GACTGTACTAAGGTAGCATAATCATTAG TTCTTAATAAGAAACTGGAATGAAGGAATTTTAAAATCATTAAATTTTTATTAATTTTTTAAAGTTATATTTAAAGTGAAAATACTTTATTTGAATTATTAGACGATAAGACCCTATAAATCTTAAATTAAATTTTATTTGGGGTAAATAAAATAATTTTTAAATTATTTAGTTAAG TTACTTTAGGGTTAACAGGGTAATTATAATATTAAGATCTTATTAGTATTGTTGTTTACT                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD135317             [                                                                           TAATCATTAGTTTCTTAATAAGAAACTGGAATGAAGGAATTTTAAAATTATTAAATTTTTATTAATTTTTTAAAGTTATATTTAAAGTGAAAATACTTTATTTGAATTATTAGACGATAAGACCCTATAAATCTTAAATTAAATTTTATTTGGGGTAAATAAAATAATTTTTAAATTATTTAGTTAAG TTACTTTAGGGTTAACAGGGTAATTATAATATTAAGATCTTATTAGTATTGTTGTTTACTACCTCGATGTTGGATCATTAT                                                                                                      ]
[+] EMBL CD135796             [                                                                                                                    TTAAAATTATGGGAGTTTTATTAATTTTTTGAAGATATATTTAAAGTGAAAATACTTTATTTGAATTATTAGACGATAAGACCCTATAAATCTTAAATTAAATTTTATTTGGGGTAAATAAAATAATTTTTAAATTATTTAGTTAAGACTACTTTAGGGTTAACAGGGTAATTATAATATTAAGATCTTATTAATATTGTTGTTTACTA                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD135789             [                                                                                                                    TTAAAATTATTAAATTGTTATTAATTTTTTGAAGTTATATTTAAAGTGAAAATACTTTATTTGAATTATTAGACGATAAGACCCTATAAATCTTAAATTAAATTTTATTTGGGGTAAATAAAATAATTTTTAAATTATTTAGTTAAG TTACTTTAGGGTTAACAGGGTAATTATAATATTAAGATCTTATTAGTATTGTTGTTTACTACCTCGATGTTGGATCATTATACTAATTAAGTAGAGTTAATTAATTTTAGTCTGTTAGACTATAAAATTTTACGTGATCTGAGTTTAGACCGATGTAAATTACGTTAGATTTTATCTTTATTA]
[-] EMBL CD139652             [                                                                                                                                                                                      TATTAGACGATAAGACCCTATAAATCTTAAATTAAATTTTATTTGGGGTAAATAAAATAATTTTTAGATTATTTAGTTAAG TTACTTTAGGGTTAACAGGGTAATTATAATATTAAGATCTTATTAGTATTGTTGTTTACT                                                                                                                           ]




>consensus_8872#0
TAGCTTATATCTTTATAAGTAATTTCTGCTCAATGGTTTAAATAGCTGCAGTAATCTGAC
TGTACTAAGGTAGCATAATCATTAGTTTCTTAATAAGAAACTGGAATGAAGGAATTTTAA
AATTATTAAATTTTTATTAATTTTTTAAAGTTATATTTAAAGTGAAAATACTTTATTTGA
ATTATTAGACGATAAGACCCTATAAATCTTAAATTAAATTTTATTTGGGGTAAATAAAAT
AATTTTTAAATTATTTAGTTAAGTTACTTTAGGGTTAACAGGGTAATTATAATATTAAGA
TCTTATTAGTATTGTTGTTTACTACCTCGATGTTGGATCATTATACTAATTAAGTAGAGT
TAATTAATTTTAGTCTGTTAGACTATAAAATTTTACGTGATCTGAGTTTAGACCGATGTA
AATTACGTTAGATTTTATCTTTATTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case