These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8872#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 446 fasta sequence [TAGCTTATATCTTTATAAGTAATTTCTGCTCAATGGTTTAAATAGCTGCAGTAATCTGACTGTACTAAGGTAGCATAATCATTAGTTTCTTAATAAGAAACTGGAATGAAGGAATTTTAAAATTATTAAATTTTTATTAATTTTTTAAAGTTATATTTAAAGTGAAAATACTTTATTTGAATTATTAGACGATAAGACCCTATAAATCTTAAATTAAATTTTATTTGGGGTAAATAAAATAATTTTTAAATTATTTAGTTAAG-TTACTTTAGGGTTAACAGGGTAATTATAATATTAAGATCTTATTAGTATTGTTGTTTACTACCTCGATGTTGGATCATTATACTAATTAAGTAGAGTTAATTAATTTTAGTCTGTTAGACTATAAAATTTTACGTGATCTGAGTTTAGACCGATGTAAATTACGTTAGATTTTATCTTTATTA] [-] EMBL CD139552 [TAGCTTATATCTTTATAAGTAATTTCTGCTCAATGGTTTAAATAGCTGCAGTAATCTGACTGTACTAAGGTAGCATAATCATTAGTTTCTTAATAAGAAACTGGAATGAAGGAATTTTAAAATTATTAAATTTTTATTAATTTTTTAAAGTTATATTTAAAGTGAAAATACTTTATTTGAATTATTAGACGATAAGACCCTATAAATCTTAAACTAAATTTTATTTGGGGTAAATAAAATAATTTTTAAATTATTTAGTTAAG TTACTTTAGGGTTAACAGGGTAATTATAATATTAAGATCTTATTAGTATTGTTGTTTACT ] [-] EMBL CD130218 [ AATAGCTGCAGTAATCTGGCTGTTCTAAGGTAGCATAATCATTAGTTTCTTAATAAGAAACTGGAATGAAGGAATTTTAAAATTATTAAATTTTTATTAATTTTTTAAAGTTATATTTAAAGTGAAAATACTTTA ] [-] EMBL CD139669 [ GACTGTACTAAGGTAGCATAATCATTAG TTCTTAATAAGAAACTGGAATGAAGGAATTTTAAAATCATTAAATTTTTATTAATTTTTTAAAGTTATATTTAAAGTGAAAATACTTTATTTGAATTATTAGACGATAAGACCCTATAAATCTTAAATTAAATTTTATTTGGGGTAAATAAAATAATTTTTAAATTATTTAGTTAAG TTACTTTAGGGTTAACAGGGTAATTATAATATTAAGATCTTATTAGTATTGTTGTTTACT ] [-] EMBL CD135317 [ TAATCATTAGTTTCTTAATAAGAAACTGGAATGAAGGAATTTTAAAATTATTAAATTTTTATTAATTTTTTAAAGTTATATTTAAAGTGAAAATACTTTATTTGAATTATTAGACGATAAGACCCTATAAATCTTAAATTAAATTTTATTTGGGGTAAATAAAATAATTTTTAAATTATTTAGTTAAG TTACTTTAGGGTTAACAGGGTAATTATAATATTAAGATCTTATTAGTATTGTTGTTTACTACCTCGATGTTGGATCATTAT ] [+] EMBL CD135796 [ TTAAAATTATGGGAGTTTTATTAATTTTTTGAAGATATATTTAAAGTGAAAATACTTTATTTGAATTATTAGACGATAAGACCCTATAAATCTTAAATTAAATTTTATTTGGGGTAAATAAAATAATTTTTAAATTATTTAGTTAAGACTACTTTAGGGTTAACAGGGTAATTATAATATTAAGATCTTATTAATATTGTTGTTTACTA ] [+] EMBL CD135789 [ TTAAAATTATTAAATTGTTATTAATTTTTTGAAGTTATATTTAAAGTGAAAATACTTTATTTGAATTATTAGACGATAAGACCCTATAAATCTTAAATTAAATTTTATTTGGGGTAAATAAAATAATTTTTAAATTATTTAGTTAAG TTACTTTAGGGTTAACAGGGTAATTATAATATTAAGATCTTATTAGTATTGTTGTTTACTACCTCGATGTTGGATCATTATACTAATTAAGTAGAGTTAATTAATTTTAGTCTGTTAGACTATAAAATTTTACGTGATCTGAGTTTAGACCGATGTAAATTACGTTAGATTTTATCTTTATTA] [-] EMBL CD139652 [ TATTAGACGATAAGACCCTATAAATCTTAAATTAAATTTTATTTGGGGTAAATAAAATAATTTTTAGATTATTTAGTTAAG TTACTTTAGGGTTAACAGGGTAATTATAATATTAAGATCTTATTAGTATTGTTGTTTACT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||