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Schistosoma mansoni
cluster # 8877 cluster # 8877       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8877#0 length = 726 sequences # 7  

consensusID : consensus_8877#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 726
fasta sequence
                              [AACAAAAATTGGTTCCTTATGTTAGGAACCCAAACTATGATAACTTTTTCGATATAAAGCGACCCAAGTTAAAAACTGGTTATACTCTCTTGCATTTGTCTCATGTGCTAAACAGTCGATGCTCACTTTTTCAAACTACCCCAGTGTGGAATAGCCTATCTAAACATGTGGATAGTTTTCGTCTAATGATGAGAATTTTCGGACTTGCTCTTTCTGAACAGTGTGACAAATTATTAGTTGAAATCAGAAAAGTTGATGAGTCAGCAATACAGTTGGGGGGATTGGACCCTACAGTGGTGAAAAAGCTAATAAGAATTGTTGATACTTGTGAAACCCGATCCGATGACTCGTCTCTAAAACCAGGAGAACCGCAGGTTCCAAGTGTATCAGATGTAAAATCAGTGCAGAATGAACTTCTGCGTATTCAGGGCGGACCACAATGTACCACACAAAACTTTTTTAAAGTGGTCGAAGAGTTTGTCTTCAATGGAGTAATTAATAACTCAGACTGTATGAAGCAGGAGTTAGAGGCAGTTTCTGATTTGTATGGTAAATTTGATGAAGAACGGAGAAAAGAATACACTGAAGCTGTCAAAATGCAAAAATCTGAAAAGGTTGTTGAAAAAGCCAAAGAAAAATTAAGACAAATCCTAGATAGAGAGGAACAAATTACATACTTCCAGAATGGTACGAAAATAATAAAGGATGCATGGTTAGCGCCTCGAA]

[+] EMBL CD091101             [AACAAAAATTGGTTCCTTATGTTAGGAACCCAAACTATGATAACTTTTTCGATATAAAGCGACCCAAGTTAAAAACTGGTTATACTCTCTTGCATTTGTCTCATGTGCTAAACAGTCGATGCTCACTTTTTCAAACTACCCCAGTGTGGAATAGCCTATCTAAACATGTGGATAGTTTTCGTCTAATGATGAGAATTTTCGGACTTGCTCTTTCTGAACAGTGTGACAAATTATTAGTTGAAATCAGAAAAGTTGATGAGTCAGCAATACAGTTGGGGGGATTGGACCCTACAGTGGTGAAAAAGCTAATAAGAATTGTTGATACTTGTGAAACCCGATCTGATGACTCGTCTCTAAAACCAGGAGAACCGCAGGTTCCAAGTGTATCAGATGTAAAATCAGTGCAGAATGAACTTCTGCGTATTCAGGGCGGACCACAATGT                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD091099             [AACAAAAATTGGTTCCTTATGTTAGGAACCCAAACTATGATAACTTTTTCGATATAAAGCGACCCAAGTTAAAAACTGGTTATACTCTCTTGCATTTGTCTCATGTGCTAAACAGTCGATGCTCACTTTTTCAAACTACCCCAGTGTGGAATAGCCTATCTAAACATGTGGATAGTTTTCGTCTAATGATGAGAATTTTCGGACTTGCTCTTTCTGAACAGTGTGACAAATTATTAGTTGAAATCAGAAAAGTTGATGAGTCAGCAATACAGTTGGGGGGATTGGACCCTACAGTGGTGAAAAAGCTAATAAGAATTGTTGATACTTGTGAAACCCGATCCGATGACTCGTCTCTAAAACCAGGAGAACCGCAGGTTCCAAGTGTATCAGATGTAAAATCAGTGCAGAATGAACTTCTGCGTATTCAGGGCGGACCACAATG                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD091081             [AACAAAAATTGGTTCCTTATGTTAGGAACCCAAACTATGATAACTTTTTCGATATAAAGCGACCCAAGTTAAAAACTGGTTATACTCTCTTGCATTTGTCTCATGTGCTAAACAGTCGATGCTCACTTTTTCAAACTACCCCAGTGTGGAATAGCCTATCTAAACATGTGGATAGTTTTCGTCTAATGATGAGAATTTTCGGACTTGCTCTTTCTGAACAGTGTGACAAATTATTAGTTGAAATCAGAAAAGTTGATGAGTCAGCAATACAGTTGGGGGGATTGGACCCTACAGTGGTGAAAAAGCTAATAAGAATTGTTGATACTTGTGAAACCCGATCCGATGACTCGTCTCTAAAACCAGGAGAACCGCAGGTTCCAAGTGTATCAGATGTAAAATCAGTGCAGAATGAACTTCTGCGTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD091119             [                                                                                                                                                                                                                       GAACAGTGTGACAAATTATTAGTTGAAATCAGAAAAGTTGATGAGTCAGCAATACAGTTGGGGGGATTGGACCATACAGTGGTGAAAAAGCTAATAAGAATTGTTGATACTTGTGAAACCCGATCCGATGACTCGTCTCTAAAACCAGGAGAACCGCAGGTTCCAAGTGTATCAGATGTAAAATCAGTGCAGAATGAACTTCTGCGTATTCAGGGCGGACCACAATGTACCACACGAAACTTTTTTAAAGTGGTCGAAGAGTTTGTCTTCAATGGAGTAATTAATAACTCAGACTGTATGAAGCAGGAGTTAGAGGCAGTTTCTGATTTGTATGGTAAATTTGATGAAGAACGGAGAAAAGAATACATTGAAGCTGTCAAAATGCAAAAATCTGAAAAGGTTGTTGAAGAAacgc                                                                                                ]
[-] EMBL CD091096             [                                                                                                                                                                                                                          CAGTGTGACAAATTATTAGTTGAAATCAGAAAAGTTGATGAGTCAGCAATACAGTTGGGGGGATTGGACCCTACAGTGGTGAAAAAGCTAATAAGAATTGTTGATACTTGTGAAACCCGATCCGATGACTCGTCTCTAAAACCAGGAGAACCGCAGGTTCCAAGTGTATCAGATGTAAAATCAGTGCAGAATGAACTTCTGCGTATTCAGGGCGGACCACAATGTACCACACAAAACTTTTTTAAAGTGGTCGAAGAGTTTGTCTTCAATGGAGTAATTAATAACTCAGACTGTATGAAGCAGGAGTTAGAGGCAGTTTCTGATTTGTATGGTAAATTTGATGAAGAACGGAGAAAAGAATACACTGAAGCTGTCAAAATGCAAAAATCTGAAAAGGTTGTTGAAAAAGCCAAAGAAAAATTAAGACA                                                                                ]
[-] EMBL CD160427             [                                                                                                                                                                                                                               TGACAAATTATTAGTTGAAATCAGAAAAGTTGATGAGTCAGCAATACAGTTGGGGGGATTGGACCCTACAGTGGTGAAAAAGCTAATAAGAATTGTTGATACTTGTGAAACCCGATCCGATGACTCGTTTATAAAACCAGGAGAACCGCAGGTTCCAAGTGTATCAGATGTAAAATCAGTGCAGAATGAACTTTTGGGTATTCAGGGCGGACCCCAATGTACCACACAAAACTTTTTT AAGTGGTAGAAGAGTTTGTGTTCAATGGAGTAAATAATAACTCAG                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD184357             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CCACACAAAACTTTTTTAAAGTGGTCGAAGAGTTTGTCTTCAATGGAGTAATTAATAACTCAGACTGTATGAAGCAGGAGTTAGAGGCAGTTTCTGATTTGTATGGTAAATTTGATGAAGAACGGAGAAAAGAATACACTGAAGCTGTCAAAATGCAAAAATCTGAAAAGGTTGTTGAAAAAGCCAAAGAAAAATTAAGACAAATCCTAGATAGAGAGGAACAAATTACATACTTCCAGAATGGTACGAAAATAATAAAGGATGCATGGTTAGCGCCTCGAA]


>consensus_8877#0 AACAAAAATTGGTTCCTTATGTTAGGAACCCAAACTATGATAACTTTTTCGATATAAAGC GACCCAAGTTAAAAACTGGTTATACTCTCTTGCATTTGTCTCATGTGCTAAACAGTCGAT GCTCACTTTTTCAAACTACCCCAGTGTGGAATAGCCTATCTAAACATGTGGATAGTTTTC GTCTAATGATGAGAATTTTCGGACTTGCTCTTTCTGAACAGTGTGACAAATTATTAGTTG AAATCAGAAAAGTTGATGAGTCAGCAATACAGTTGGGGGGATTGGACCCTACAGTGGTGA AAAAGCTAATAAGAATTGTTGATACTTGTGAAACCCGATCCGATGACTCGTCTCTAAAAC CAGGAGAACCGCAGGTTCCAAGTGTATCAGATGTAAAATCAGTGCAGAATGAACTTCTGC GTATTCAGGGCGGACCACAATGTACCACACAAAACTTTTTTAAAGTGGTCGAAGAGTTTG TCTTCAATGGAGTAATTAATAACTCAGACTGTATGAAGCAGGAGTTAGAGGCAGTTTCTG ATTTGTATGGTAAATTTGATGAAGAACGGAGAAAAGAATACACTGAAGCTGTCAAAATGC AAAAATCTGAAAAGGTTGTTGAAAAAGCCAAAGAAAAATTAAGACAAATCCTAGATAGAG AGGAACAAATTACATACTTCCAGAATGGTACGAAAATAATAAAGGATGCATGGTTAGCGC CTCGAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)