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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8877#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 726 fasta sequence
[AACAAAAATTGGTTCCTTATGTTAGGAACCCAAACTATGATAACTTTTTCGATATAAAGCGACCCAAGTTAAAAACTGGTTATACTCTCTTGCATTTGTCTCATGTGCTAAACAGTCGATGCTCACTTTTTCAAACTACCCCAGTGTGGAATAGCCTATCTAAACATGTGGATAGTTTTCGTCTAATGATGAGAATTTTCGGACTTGCTCTTTCTGAACAGTGTGACAAATTATTAGTTGAAATCAGAAAAGTTGATGAGTCAGCAATACAGTTGGGGGGATTGGACCCTACAGTGGTGAAAAAGCTAATAAGAATTGTTGATACTTGTGAAACCCGATCCGATGACTCGTCTCTAAAACCAGGAGAACCGCAGGTTCCAAGTGTATCAGATGTAAAATCAGTGCAGAATGAACTTCTGCGTATTCAGGGCGGACCACAATGTACCACACAAAACTTTTTTAAAGTGGTCGAAGAGTTTGTCTTCAATGGAGTAATTAATAACTCAGACTGTATGAAGCAGGAGTTAGAGGCAGTTTCTGATTTGTATGGTAAATTTGATGAAGAACGGAGAAAAGAATACACTGAAGCTGTCAAAATGCAAAAATCTGAAAAGGTTGTTGAAAAAGCCAAAGAAAAATTAAGACAAATCCTAGATAGAGAGGAACAAATTACATACTTCCAGAATGGTACGAAAATAATAAAGGATGCATGGTTAGCGCCTCGAA]
[+] EMBL CD091101 [AACAAAAATTGGTTCCTTATGTTAGGAACCCAAACTATGATAACTTTTTCGATATAAAGCGACCCAAGTTAAAAACTGGTTATACTCTCTTGCATTTGTCTCATGTGCTAAACAGTCGATGCTCACTTTTTCAAACTACCCCAGTGTGGAATAGCCTATCTAAACATGTGGATAGTTTTCGTCTAATGATGAGAATTTTCGGACTTGCTCTTTCTGAACAGTGTGACAAATTATTAGTTGAAATCAGAAAAGTTGATGAGTCAGCAATACAGTTGGGGGGATTGGACCCTACAGTGGTGAAAAAGCTAATAAGAATTGTTGATACTTGTGAAACCCGATCTGATGACTCGTCTCTAAAACCAGGAGAACCGCAGGTTCCAAGTGTATCAGATGTAAAATCAGTGCAGAATGAACTTCTGCGTATTCAGGGCGGACCACAATGT ]
[+] EMBL CD091099 [AACAAAAATTGGTTCCTTATGTTAGGAACCCAAACTATGATAACTTTTTCGATATAAAGCGACCCAAGTTAAAAACTGGTTATACTCTCTTGCATTTGTCTCATGTGCTAAACAGTCGATGCTCACTTTTTCAAACTACCCCAGTGTGGAATAGCCTATCTAAACATGTGGATAGTTTTCGTCTAATGATGAGAATTTTCGGACTTGCTCTTTCTGAACAGTGTGACAAATTATTAGTTGAAATCAGAAAAGTTGATGAGTCAGCAATACAGTTGGGGGGATTGGACCCTACAGTGGTGAAAAAGCTAATAAGAATTGTTGATACTTGTGAAACCCGATCCGATGACTCGTCTCTAAAACCAGGAGAACCGCAGGTTCCAAGTGTATCAGATGTAAAATCAGTGCAGAATGAACTTCTGCGTATTCAGGGCGGACCACAATG ]
[+] EMBL CD091081 [AACAAAAATTGGTTCCTTATGTTAGGAACCCAAACTATGATAACTTTTTCGATATAAAGCGACCCAAGTTAAAAACTGGTTATACTCTCTTGCATTTGTCTCATGTGCTAAACAGTCGATGCTCACTTTTTCAAACTACCCCAGTGTGGAATAGCCTATCTAAACATGTGGATAGTTTTCGTCTAATGATGAGAATTTTCGGACTTGCTCTTTCTGAACAGTGTGACAAATTATTAGTTGAAATCAGAAAAGTTGATGAGTCAGCAATACAGTTGGGGGGATTGGACCCTACAGTGGTGAAAAAGCTAATAAGAATTGTTGATACTTGTGAAACCCGATCCGATGACTCGTCTCTAAAACCAGGAGAACCGCAGGTTCCAAGTGTATCAGATGTAAAATCAGTGCAGAATGAACTTCTGCGTATT ]
[-] EMBL CD091119 [ GAACAGTGTGACAAATTATTAGTTGAAATCAGAAAAGTTGATGAGTCAGCAATACAGTTGGGGGGATTGGACCATACAGTGGTGAAAAAGCTAATAAGAATTGTTGATACTTGTGAAACCCGATCCGATGACTCGTCTCTAAAACCAGGAGAACCGCAGGTTCCAAGTGTATCAGATGTAAAATCAGTGCAGAATGAACTTCTGCGTATTCAGGGCGGACCACAATGTACCACACGAAACTTTTTTAAAGTGGTCGAAGAGTTTGTCTTCAATGGAGTAATTAATAACTCAGACTGTATGAAGCAGGAGTTAGAGGCAGTTTCTGATTTGTATGGTAAATTTGATGAAGAACGGAGAAAAGAATACATTGAAGCTGTCAAAATGCAAAAATCTGAAAAGGTTGTTGAAGAAacgc ]
[-] EMBL CD091096 [ CAGTGTGACAAATTATTAGTTGAAATCAGAAAAGTTGATGAGTCAGCAATACAGTTGGGGGGATTGGACCCTACAGTGGTGAAAAAGCTAATAAGAATTGTTGATACTTGTGAAACCCGATCCGATGACTCGTCTCTAAAACCAGGAGAACCGCAGGTTCCAAGTGTATCAGATGTAAAATCAGTGCAGAATGAACTTCTGCGTATTCAGGGCGGACCACAATGTACCACACAAAACTTTTTTAAAGTGGTCGAAGAGTTTGTCTTCAATGGAGTAATTAATAACTCAGACTGTATGAAGCAGGAGTTAGAGGCAGTTTCTGATTTGTATGGTAAATTTGATGAAGAACGGAGAAAAGAATACACTGAAGCTGTCAAAATGCAAAAATCTGAAAAGGTTGTTGAAAAAGCCAAAGAAAAATTAAGACA ]
[-] EMBL CD160427 [ TGACAAATTATTAGTTGAAATCAGAAAAGTTGATGAGTCAGCAATACAGTTGGGGGGATTGGACCCTACAGTGGTGAAAAAGCTAATAAGAATTGTTGATACTTGTGAAACCCGATCCGATGACTCGTTTATAAAACCAGGAGAACCGCAGGTTCCAAGTGTATCAGATGTAAAATCAGTGCAGAATGAACTTTTGGGTATTCAGGGCGGACCCCAATGTACCACACAAAACTTTTTT AAGTGGTAGAAGAGTTTGTGTTCAATGGAGTAAATAATAACTCAG ]
[+] EMBL CD184357 [ CCACACAAAACTTTTTTAAAGTGGTCGAAGAGTTTGTCTTCAATGGAGTAATTAATAACTCAGACTGTATGAAGCAGGAGTTAGAGGCAGTTTCTGATTTGTATGGTAAATTTGATGAAGAACGGAGAAAAGAATACACTGAAGCTGTCAAAATGCAAAAATCTGAAAAGGTTGTTGAAAAAGCCAAAGAAAAATTAAGACAAATCCTAGATAGAGAGGAACAAATTACATACTTCCAGAATGGTACGAAAATAATAAAGGATGCATGGTTAGCGCCTCGAA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||